演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZFP92ZNF897

ZFP92 zinc finger protein

ZFP92 是含 KRAB domain 的 C2H2 型鋅指蛋白;依相似性資料,它可抑制特定轉座元件,並以組織特異方式調節鄰近基因轉錄。

Homo sapiensXq28UniProt A6NM28
OFFICIAL SYMBOL
ZFP92
CHROMOSOME
X
UNIPROT
A6NM28
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZFP92 zinc finger protein 是由 ZFP92 編碼的蛋白質,屬於含 KRAB domain 的鋅指蛋白。依相似性資料,ZFP92 可抑制 B1/Alu SINE 轉座元件,並以組織特異的方式調節鄰近基因轉錄。其功能描述亦涉及胰島與脂肪組織、肌肉中的基因表現調控;相關具體作用及代謝脈絡見功能說明。

Official symbol
ZFP92
Gene name
ZFP92 zinc finger protein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12865
UniProt
A6NM28
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF897

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome XXq28
chrX · 156,040,895 bp · GRCh38chrXp22.33 · 1–4400000 · gnegchrXp22.32 · 4400001–6100000 · gpos50chrXp22.31 · 6100001–9600000 · gnegchrXp22.2 · 9600001–17400000 · gpos50chrXp22.13 · 17400001–19200000 · gnegchrXp22.12 · 19200001–21900000 · gpos50chrXp22.11 · 21900001–24900000 · gnegchrXp21.3 · 24900001–29300000 · gpos100chrXp21.2 · 29300001–31500000 · gnegchrXp21.1 · 31500001–37800000 · gpos100chrXp11.4 · 37800001–42500000 · gnegchrXp11.3 · 42500001–47600000 · gpos75chrXp11.23 · 47600001–50100000 · gnegchrXp11.22 · 50100001–54800000 · gpos25chrXp11.21 · 54800001–58100000 · gnegchrXp11.1 · 58100001–61000000 · acenchrXq11.1 · 61000001–63800000 · acenchrXq11.2 · 63800001–65400000 · gnegchrXq12 · 65400001–68500000 · gpos50chrXq13.1 · 68500001–73000000 · gnegchrXq13.2 · 73000001–74700000 · gpos50chrXq13.3 · 74700001–76800000 · gnegchrXq21.1 · 76800001–85400000 · gpos100chrXq21.2 · 85400001–87000000 · gnegchrXq21.31 · 87000001–92700000 · gpos100chrXq21.32 · 92700001–94300000 · gnegchrXq21.33 · 94300001–99100000 · gpos75chrXq22.1 · 99100001–103300000 · gnegchrXq22.2 · 103300001–104500000 · gpos50chrXq22.3 · 104500001–109400000 · gnegchrXq23 · 109400001–117400000 · gpos75chrXq24 · 117400001–121800000 · gnegchrXq25 · 121800001–129500000 · gpos100chrXq26.1 · 129500001–131300000 · gnegchrXq26.2 · 131300001–134500000 · gpos25chrXq26.3 · 134500001–138900000 · gnegchrXq27.1 · 138900001–141200000 · gpos75chrXq27.2 · 141200001–143000000 · gnegchrXq27.3 · 143000001–148000000 · gpos100chrXq28 · 148000001–156040895 · gnegZFP92pq1 bp156,040,895 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chrX:153,411,434–153,426,481
Gene span
15,048 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000338647 ★153,411,472–153,426,4816
ENST00000881745153,411,434–153,426,4815
ENST00001132158153,411,434–153,426,4816

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

依相似性資料,ZFP92 是含 KRAB domain 的鋅指蛋白,可抑制 B1/Alu SINE 轉座元件,並調節附近基因的轉錄。此轉錄調節具有組織特異性,來源並未進一步說明其作用方式或哪些鄰近基因會在其他組織受到調控。

ZFP92 也與葡萄糖恆定及脂質代謝的調節有關。其作用涉及改變不同組織中調控因子的表現:在胰島中,ZFP92 調節界定內分泌細胞的轉錄因子 MAFB;在脂肪組織與肌肉中,則調節脂肪代謝調節因子 ACACB 的表現。來源指出的是透過調節這些因子的表現來參與代謝調控,並未提供更細的分子機制或實驗條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 153411472 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZFP92 ENST00000338647 GRCh38 chrX:153410472-153411572 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GACTCCCTGCCTCTGCGCCGGGAAAGGGGCTCCGAAGCTCTCCCTGCACTGGGCCCCCTGGGGGCCCTGC
TCCCTGCAACCGGAGGTTCCCTGAGCAGCGTCCTCGCCCTTCCCCTATGCCCCAGATGGACGGCTTTTGT
TCTGGGAGCGCAGGCTTGCCGAGGGCTCCTTGCTGCGGGCTAAGTGCTCCTGGCCAGGGCCCAGGGTCTC
TGAAGAAAAGAAACCCCTGAACTCTGGTTCAAAGGCCAAGGAGGCTCCCGCCTCGTGCTCAGTTCCCAGT
GGCCGGGGCTGGGATATGTGATGTGGCTGATTTTTCCCTGTTGCTTTTCTTTTACGGTCTTTTTCATACG
CTTCACTATTTGTCAAAGGTCTCACAATTGTCATCAGAGCAATATCCCAACCAACCTTGGATTTCACTCC
CTGCTCTACCACGTGGAGCATGACCCTTTGGAAAATGACAAACTCCAGGTGCGATCCCCTCCGGTAACCT
GAGGGAAAGCCAGATGCACCCAGAGGGTCTTGGCTTCTTGCACTTCCCTGACCTCCTTTTTCCCCTCCTC
GTGTCTCCACACCATGCTCCCTGAGTCACCTTTCACCTCTTCCCCGCTCTCTGATCCTTGCCATCCTGGG
TCACTCCTTTACTGAGTGACCATGGCCGGGGTACTTGGTGCTAGCTGCCCTGCAGAGGTCCCGGGGACCC
CAGCGAGATGAATAACTGAATGAATGGACGTAATAACGCCCAGGGGTCTAGCCCATGGGAGGTGTTCTGC
CAACGCGGGTCCCTCCCGTCCCCTTCAGGAGCCGCGGTGCGCTGACCACTTCGACCCCAGCCTTCAGAGC
AGCCCAGACAGAAAGCGGAAGTGCCTCGGGGCGCGTGGGGAGCCAGGCCAGACGCCCCTGTGGGGCGGGC
GCGGGGCGGGCCGCCATCCCTCTGCGCCGCGCATGCTCCATGCCCCCCCCACAACGCGCCCCGTTCCCAC
GCTGCCGCCGCCCCGGCCCCGCCCGCTCCCGGCCCGCTCGTCGGCGCACCAGACTGAGACTCCCCTTCAG
GACGCTCTTCGCGAGCGGTACCCAGAGGCGAAGTCGAGACAAGCCCAGGAG
ZFP92 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSRX_948W3S · promoter · 153411060–153411482 · regulatory

ENSRX_B35G2Z · enhancer · 153411483–153412066 · regulatory

ENSRX_86HR82 · enhancer · 153415230–153415445 · regulatory

· motif · 153409907–153409920 · motif

· motif · 153409907–153409921 · motif

· motif · 153409907–153409922 · motif

· motif · 153409946–153409961 · motif

· motif · 153410058–153410073 · motif

· motif · 153410908–153410920 · motif

· motif · 153411009–153411016 · motif

· motif · 153411052–153411060 · motif

· motif · 153411057–153411070 · motif

· motif · 153411321–153411334 · motif

· motif · 153411323–153411334 · motif

· motif · 153411323–153411334 · motif

· motif · 153411325–153411334 · motif

· motif · 153411409–153411420 · motif

· motif · 153411409–153411420 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:416 aa

1 aa416 aa結構域功能區域鋅指
依 A6NM28 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZFP92 zinc finger protein 長 416 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 KRAB domain 位於第 14–85 位;第 152–370 位區間註記有八個 C2H2-type zinc finger。另有兩段被註記為無序區,分別位於第 86–125 位及第 368–416 位。

結構域KRAB14–85 aa
鋅指C2H2-type 1152–174 aa
鋅指C2H2-type 2180–202 aa
鋅指C2H2-type 3208–230 aa
鋅指C2H2-type 4236–258 aa
鋅指C2H2-type 5264–286 aa
鋅指C2H2-type 6292–314 aa
鋅指C2H2-type 7320–342 aa
鋅指C2H2-type 8348–370 aa
功能區域Disordered86–125 aa
功能區域Disordered368–416 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · A6NM28…

AlphaFold · A6NM28

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZFP92 的定位資料為細胞核;此資訊依相似性證據提供,並非此處直接描述的實驗定位結果。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF897ZFP92
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能依相似性資料,ZFP92 是含 KRAB domain 的鋅指蛋白,可抑制 B1/Alu SINE 轉座元件,並以組織特異方式調節鄰近基因轉錄;它也透過調節胰島中的 MAFB,以及脂肪組織與肌肉中的 ACACB 表現,參與葡萄糖恆定與脂質代謝。推論支持
證據與來源

KRAB domain-containing zinc-finger protein that represses B1/Alu SINE transposable elements and modulates the transcription of nearby genes in a tissue-specific manner. It regulates glucose homeostasis and lipid metabolism by modulating the expression of the endocrine cell-defining transcription factor, MAFB, in pancreatic islets and, the fat metabolism regulator, ACACB, in adipose tissue and muscle

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位依相似性資料,ZFP92 定位於細胞核;此定位描述具有相似性證據的限制。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000338647 · 6,403 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCCGCTCCCGGCCCGCTCGTCGGCGCACCAGACTGAGAC40
41TCCCCTTCAGGACGCTCTTCGCGAGCGGTACCCAGAGGCG80
81AAGTCGAGACAAGCCCAGGAGCCCCCACCCCCCGCCCGCG120
121TTTCCTGGGGACGCGGCCTCGGAGGGCTTCTAGGAGGAGG160
161CGGCGGCCTTGGCCTCGGGCCTGCCGGGAGCAGGAAGGGA200
201GGCCGACTCCCTCGGCTGCCCGCCGAGCCCAGCCACCGGT240
241CCCGAGGCTGGCTAAAGAGCATCCTGTCGCTGATCTGCCT280
281GCTCCTCTGCGCCCTGGTGATGGCAGCCATTCTCCTGACC320
321ACGAGACCCAAGGTGCCAGTATCTTTTGAGGATGTGTCCG360
361TGTACTTCACAAAGACAGAATGGAAGCTTCTGGACCTCAG400
401ACAAAAGGTCCTCTACAAGCGGGTGATGCTGGAGAACTAT440
441AGCCATTTGGTGTCACTGGGATTTTCCTTCTCCAAGCCTC480
481ACCTGATCTCCCAATTGGAACGAGGGGAAGGACCCTGGGT520
521AGCAGACATCCCCAGAACCTGGGCCACCGCAGGATTGCAC560
561ATAGGTGACAGAACACAGAGCAAGACGTCGACTTCAACGC600
601AGAAGCATTCTGGACGACAACTCCCCGGGGCCGATCCACA640
641AGGTGGCAAGGAGGGGCAGGCGGCGAGGTCGTCTGTGCTC680
681CAGAGAGGTGCCCAGGGCTTGGGGCAGAGTTCGGCTGCGG720
721GGCCGCAGGGCCCCAAAGGCGCGGAGAAGCGGTACCTGTG760
761CCAGCAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCCGCAGCTCCAACCTC800
801ATCAAGCACCGCATCATCCACAGTGGCGAGAAGCCTTACG840
841CGTGCCCCGAGTGCGGCAAGCTGTTTCGCCGCAGCTTCGC880
881GCTCCTGGAGCACCAGCGCATCCACAGCGGCGAGAAGCCC920
921TACGCCTGCCCCGAGTGCAGCAAGACCTTCACGCGCAGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。