基因總覽
ZFP92 zinc finger protein 是由 ZFP92 編碼的蛋白質,屬於含 KRAB domain 的鋅指蛋白。依相似性資料,ZFP92 可抑制 B1/Alu SINE 轉座元件,並以組織特異的方式調節鄰近基因轉錄。其功能描述亦涉及胰島與脂肪組織、肌肉中的基因表現調控;相關具體作用及代謝脈絡見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000338647 ★ | 153,411,472–153,426,481 | 6 |
| ENST00000881745 | 153,411,434–153,426,481 | 5 |
| ENST00001132158 | 153,411,434–153,426,481 | 6 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
依相似性資料,ZFP92 是含 KRAB domain 的鋅指蛋白,可抑制 B1/Alu SINE 轉座元件,並調節附近基因的轉錄。此轉錄調節具有組織特異性,來源並未進一步說明其作用方式或哪些鄰近基因會在其他組織受到調控。
ZFP92 也與葡萄糖恆定及脂質代謝的調節有關。其作用涉及改變不同組織中調控因子的表現:在胰島中,ZFP92 調節界定內分泌細胞的轉錄因子 MAFB;在脂肪組織與肌肉中,則調節脂肪代謝調節因子 ACACB 的表現。來源指出的是透過調節這些因子的表現來參與代謝調控,並未提供更細的分子機制或實驗條件。
Promoter 與基因調控
>ZFP92 ENST00000338647 GRCh38 chrX:153410472-153411572 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GACTCCCTGCCTCTGCGCCGGGAAAGGGGCTCCGAAGCTCTCCCTGCACTGGGCCCCCTGGGGGCCCTGC TCCCTGCAACCGGAGGTTCCCTGAGCAGCGTCCTCGCCCTTCCCCTATGCCCCAGATGGACGGCTTTTGT TCTGGGAGCGCAGGCTTGCCGAGGGCTCCTTGCTGCGGGCTAAGTGCTCCTGGCCAGGGCCCAGGGTCTC TGAAGAAAAGAAACCCCTGAACTCTGGTTCAAAGGCCAAGGAGGCTCCCGCCTCGTGCTCAGTTCCCAGT GGCCGGGGCTGGGATATGTGATGTGGCTGATTTTTCCCTGTTGCTTTTCTTTTACGGTCTTTTTCATACG CTTCACTATTTGTCAAAGGTCTCACAATTGTCATCAGAGCAATATCCCAACCAACCTTGGATTTCACTCC CTGCTCTACCACGTGGAGCATGACCCTTTGGAAAATGACAAACTCCAGGTGCGATCCCCTCCGGTAACCT GAGGGAAAGCCAGATGCACCCAGAGGGTCTTGGCTTCTTGCACTTCCCTGACCTCCTTTTTCCCCTCCTC GTGTCTCCACACCATGCTCCCTGAGTCACCTTTCACCTCTTCCCCGCTCTCTGATCCTTGCCATCCTGGG TCACTCCTTTACTGAGTGACCATGGCCGGGGTACTTGGTGCTAGCTGCCCTGCAGAGGTCCCGGGGACCC CAGCGAGATGAATAACTGAATGAATGGACGTAATAACGCCCAGGGGTCTAGCCCATGGGAGGTGTTCTGC CAACGCGGGTCCCTCCCGTCCCCTTCAGGAGCCGCGGTGCGCTGACCACTTCGACCCCAGCCTTCAGAGC AGCCCAGACAGAAAGCGGAAGTGCCTCGGGGCGCGTGGGGAGCCAGGCCAGACGCCCCTGTGGGGCGGGC GCGGGGCGGGCCGCCATCCCTCTGCGCCGCGCATGCTCCATGCCCCCCCCACAACGCGCCCCGTTCCCAC GCTGCCGCCGCCCCGGCCCCGCCCGCTCCCGGCCCGCTCGTCGGCGCACCAGACTGAGACTCCCCTTCAG GACGCTCTTCGCGAGCGGTACCCAGAGGCGAAGTCGAGACAAGCCCAGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_948W3S · promoter · 153411060–153411482 · regulatory
ENSRX_B35G2Z · enhancer · 153411483–153412066 · regulatory
ENSRX_86HR82 · enhancer · 153415230–153415445 · regulatory
· motif · 153409907–153409920 · motif
· motif · 153409907–153409921 · motif
· motif · 153409907–153409922 · motif
· motif · 153409946–153409961 · motif
· motif · 153410058–153410073 · motif
· motif · 153410908–153410920 · motif
· motif · 153411009–153411016 · motif
· motif · 153411052–153411060 · motif
· motif · 153411057–153411070 · motif
· motif · 153411321–153411334 · motif
· motif · 153411323–153411334 · motif
· motif · 153411323–153411334 · motif
· motif · 153411325–153411334 · motif
· motif · 153411409–153411420 · motif
· motif · 153411409–153411420 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:416 aa
ZFP92 zinc finger protein 長 416 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 KRAB domain 位於第 14–85 位;第 152–370 位區間註記有八個 C2H2-type zinc finger。另有兩段被註記為無序區,分別位於第 86–125 位及第 368–416 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZFP92 的定位資料為細胞核;此資訊依相似性證據提供,並非此處直接描述的實驗定位結果。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 依相似性資料,ZFP92 是含 KRAB domain 的鋅指蛋白,可抑制 B1/Alu SINE 轉座元件,並以組織特異方式調節鄰近基因轉錄;它也透過調節胰島中的 MAFB,以及脂肪組織與肌肉中的 ACACB 表現,參與葡萄糖恆定與脂質代謝。 | 推論支持 | 證據與來源KRAB domain-containing zinc-finger protein that represses B1/Alu SINE transposable elements and modulates the transcription of nearby genes in a tissue-specific manner. It regulates glucose homeostasis and lipid metabolism by modulating the expression of the endocrine cell-defining transcription factor, MAFB, in pancreatic islets and, the fat metabolism regulator, ACACB, in adipose tissue and muscle |
| 細胞定位 | 依相似性資料,ZFP92 定位於細胞核;此定位描述具有相似性證據的限制。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCCCGCTCCCGGCCCGCTCGTCGGCGCACCAGACTGAGAC40TCCCCTTCAGGACGCTCTTCGCGAGCGGTACCCAGAGGCG80AAGTCGAGACAAGCCCAGGAGCCCCCACCCCCCGCCCGCG120TTTCCTGGGGACGCGGCCTCGGAGGGCTTCTAGGAGGAGG160CGGCGGCCTTGGCCTCGGGCCTGCCGGGAGCAGGAAGGGA200GGCCGACTCCCTCGGCTGCCCGCCGAGCCCAGCCACCGGT240CCCGAGGCTGGCTAAAGAGCATCCTGTCGCTGATCTGCCT280GCTCCTCTGCGCCCTGGTGATGGCAGCCATTCTCCTGACC320ACGAGACCCAAGGTGCCAGTATCTTTTGAGGATGTGTCCG360TGTACTTCACAAAGACAGAATGGAAGCTTCTGGACCTCAG400ACAAAAGGTCCTCTACAAGCGGGTGATGCTGGAGAACTAT440AGCCATTTGGTGTCACTGGGATTTTCCTTCTCCAAGCCTC480ACCTGATCTCCCAATTGGAACGAGGGGAAGGACCCTGGGT520AGCAGACATCCCCAGAACCTGGGCCACCGCAGGATTGCAC560ATAGGTGACAGAACACAGAGCAAGACGTCGACTTCAACGC600AGAAGCATTCTGGACGACAACTCCCCGGGGCCGATCCACA640AGGTGGCAAGGAGGGGCAGGCGGCGAGGTCGTCTGTGCTC680CAGAGAGGTGCCCAGGGCTTGGGGCAGAGTTCGGCTGCGG720GGCCGCAGGGCCCCAAAGGCGCGGAGAAGCGGTACCTGTG760CCAGCAGTGTGGGAAGGCCTTCAGCCGCAGCTCCAACCTC800ATCAAGCACCGCATCATCCACAGTGGCGAGAAGCCTTACG840CGTGCCCCGAGTGCGGCAAGCTGTTTCGCCGCAGCTTCGC880GCTCCTGGAGCACCAGCGCATCCACAGCGGCGAGAAGCCC920TACGCCTGCCCCGAGTGCAGCAAGACCTTCACGCGCAGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。