基因總覽
ZFP37 zinc finger protein 是由 ZFP37 編碼的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列具有 KRAB 結構域及多個 C2H2 型 zinc finger,其中一個被註記為非典型。這些結構特色構成此蛋白質的基本分子特徵;現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或調控方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374227 ★ | 113,038,377–113,056,724 | 4 |
| ENST00000555206 | 113,038,377–113,056,802 | 4 |
| ENST00000940564 | 113,038,377–113,056,802 | 3 |
| ENST00000948256 | 113,038,377–113,056,802 | 4 |
| ENST00001137337 | 113,038,377–113,056,802 | 4 |
| ENST00000553380 | 113,042,694–113,056,688 | 4 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前資料指出,ZFP37 zinc finger protein 可能參與轉錄調控。此敘述屬於可能性描述,並未進一步界定其調控的是哪些基因、作用於何種細胞或生物學情境,也沒有說明它促進或抑制轉錄。因此,現有資訊支持的功能範圍僅限於其可能涉及轉錄調控,尚不足以據此描述更細緻的分子作用方式或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>ZFP37 ENST00000374227 GRCh38 chr9:113056624-113057724 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGCATGCACAGTGCAATAATCACATCATGGAAAATGGGGTATCTATCCCCTCAAGCATTTATCTTCTGTG TTACAATCCATTTATACTTTGTTATTTCGAAATGTACAACTAAATTATTATTGGATATATACACCTGTAG TGCTATCAAATACTAGGTCTTATTCCTTCTTTCTTTTCTTTTTTTTTAAAAACCCGTTAAGTATCCCCAC TTCCCTCCCACCTTTTCTTTTTTCTTGAGCTGGGACATTCATCTTCTGCCTTTTGACATTGGAGACCCTG GTTTTCTGGCCTTTGGACTCTGGACTTACATCATCCCTACCCCTCTCCACTCTTTTTCCAGTACCTTGCA TAGCGCAGCACCTAACCTGCACATATTCAATGAATGCAATTAATGCATGAAATGGCGCATTAAGGAATTA TTTCTCCAAGTGCTTGATTATTCTGGTGAAATATCTTCACCAAACCCGGGCTCTCACGGAGGAGTGGTGT GTTTACTTAAGTTTCTGTTTCAGTTTTTCTTATTGTTCTTATACTATATATGAAAAGATTTATCGTATAT CTCAAAGATTAACGTCCTCTCCCTATAAAATAATGTTATTTGTTCGATCAGGCTTTTCTCCGTTATGCTT CCAATTTCTCGCATCCTGCCTTTCTAAAGTCCGCACTAAGCGTTGTGATTCCCGGACTTCTAGCCGCTGG CCGCACTGACATGTATTCGGAAAAGCAATTCCAAATTCTGTAAAATATCTTCCGGCAGTGATGCGATCCG AACTCCGGCAGTGGGTTGTCAGGCCCAGGTCAGTCCTGTAGTGCGTAACGGAACTCGGTTCCGGCTGGCT CTGATCGCATCACTCCTGCATCCTGCAAGTAACGCCCTCGCCAGCTTCCACCTCCCGATCTAATTGTCCC AGAAGTCCCCGCACTTCCGCTGTACGGCTGAGTGTTTGCCAAGATGGCCGCGCCCGTGCGCTATTACCGA AGGGCGCCGCCATCGCGGCTGCCGGACCCGCTAAGGCCGCCCTCCGGGTAGCCGCCATGTCGGTCTCCAG CGGCGTCCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZFP37_1 ↗ | 9:113,056,724 | 負股 | 113,056,714–113,056,773 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_BSFRL · promoter · 113056678–113057249 · regulatory
ENSR9_93MTM4 · enhancer · 113059701–113060038 · regulatory
· motif · 113056520–113056537 · motif
· motif · 113056617–113056628 · motif
· motif · 113056685–113056695 · motif
· motif · 113056730–113056740 · motif
· motif · 113056792–113056803 · motif
· motif · 113056792–113056803 · motif
· motif · 113056794–113056803 · motif
· motif · 113057019–113057034 · motif
· motif · 113057418–113057432 · motif
· motif · 113057418–113057433 · motif
· motif · 113057418–113057433 · motif
· motif · 113057425–113057438 · motif
· motif · 113057425–113057439 · motif
· motif · 113057425–113057440 · motif
· motif · 113057425–113057440 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:630 aa
ZFP37 zinc finger protein 長 630 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質含有 KRAB 結構域,以及 12 個 C2H2 型 zinc finger;其中第 3 個被註記為非典型。此外,序列註解列出三段無序區域,分別位於胺基酸 1–45、77–172 與 193–285。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZFP37 zinc finger protein 註記於細胞核。 此項定位資訊未提供其他細胞區室或條件相關的定位變化。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GCCGGACCCGCTAAGGCCGCCCTCCGGGTAGCCGCCATGT40CGGTCTCCAGCGGCGTCCAGATTCTGACAAAGCCAGAGAC80CGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGACCAAAGAGGCC120GGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCA160GCGCCGCGGAATGGAAGCAACTGGATCCTGCTCAGAGCAA200CCTGTATAATGATGTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAA240GCCTCAATGGGGTGTCAAGCTCCCAAACCAGACATGATCT280CCAAGTTGGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGG320GAAAAGACCCAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGA360CCCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATG400ATGACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAACAAACT440CCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCTAAG480AAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGGGAAAAAAAATA520ATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAAAAGGCTTCT560TAAATTTGAGTCATGTGGAAAAATTTTGAAACAGAATTTA600GATTTACCTGATCACTCAAGAAACTGTGTAAAAAGGAAAT640CTGATGCAGCTAAAGAACACAAGAAGTCATTCAACCATAG680CTTATCTGATACAAGGAAAGGCAAAAAGCAAACTGGAAAG720AAACATGAGAAATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGT760GTAACAAAACTGGCAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCA800TAGTTCATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGA840GAGAAACATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACTA880AGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATG920TAATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACAAGGACTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。