演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZFP37ZNF906

ZFP37 zinc finger protein

ZFP37 zinc finger protein 屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族,可能參與轉錄調控。

Homo sapiens9q32UniProt Q9Y6Q3
OFFICIAL SYMBOL
ZFP37
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q9Y6Q3
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZFP37 zinc finger protein 是由 ZFP37 編碼的蛋白質,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。其序列具有 KRAB 結構域及多個 C2H2 型 zinc finger,其中一個被註記為非典型。這些結構特色構成此蛋白質的基本分子特徵;現有資料將其可能角色概述為參與轉錄調控,但未提供更具體的作用對象或調控方式。

Official symbol
ZFP37
Gene name
ZFP37 zinc finger protein
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12863
UniProt
Q9Y6Q3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF906

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q32
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegZFP37pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr9:113,038,377–113,056,802
Gene span
18,426 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000374227 ★113,038,377–113,056,7244
ENST00000555206113,038,377–113,056,8024
ENST00000940564113,038,377–113,056,8023
ENST00000948256113,038,377–113,056,8024
ENST00001137337113,038,377–113,056,8024
ENST00000553380113,042,694–113,056,6884

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前資料指出,ZFP37 zinc finger protein 可能參與轉錄調控。此敘述屬於可能性描述,並未進一步界定其調控的是哪些基因、作用於何種細胞或生物學情境,也沒有說明它促進或抑制轉錄。因此,現有資訊支持的功能範圍僅限於其可能涉及轉錄調控,尚不足以據此描述更細緻的分子作用方式或生物學結果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 113056724 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZFP37 ENST00000374227 GRCh38 chr9:113056624-113057724 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGCATGCACAGTGCAATAATCACATCATGGAAAATGGGGTATCTATCCCCTCAAGCATTTATCTTCTGTG
TTACAATCCATTTATACTTTGTTATTTCGAAATGTACAACTAAATTATTATTGGATATATACACCTGTAG
TGCTATCAAATACTAGGTCTTATTCCTTCTTTCTTTTCTTTTTTTTTAAAAACCCGTTAAGTATCCCCAC
TTCCCTCCCACCTTTTCTTTTTTCTTGAGCTGGGACATTCATCTTCTGCCTTTTGACATTGGAGACCCTG
GTTTTCTGGCCTTTGGACTCTGGACTTACATCATCCCTACCCCTCTCCACTCTTTTTCCAGTACCTTGCA
TAGCGCAGCACCTAACCTGCACATATTCAATGAATGCAATTAATGCATGAAATGGCGCATTAAGGAATTA
TTTCTCCAAGTGCTTGATTATTCTGGTGAAATATCTTCACCAAACCCGGGCTCTCACGGAGGAGTGGTGT
GTTTACTTAAGTTTCTGTTTCAGTTTTTCTTATTGTTCTTATACTATATATGAAAAGATTTATCGTATAT
CTCAAAGATTAACGTCCTCTCCCTATAAAATAATGTTATTTGTTCGATCAGGCTTTTCTCCGTTATGCTT
CCAATTTCTCGCATCCTGCCTTTCTAAAGTCCGCACTAAGCGTTGTGATTCCCGGACTTCTAGCCGCTGG
CCGCACTGACATGTATTCGGAAAAGCAATTCCAAATTCTGTAAAATATCTTCCGGCAGTGATGCGATCCG
AACTCCGGCAGTGGGTTGTCAGGCCCAGGTCAGTCCTGTAGTGCGTAACGGAACTCGGTTCCGGCTGGCT
CTGATCGCATCACTCCTGCATCCTGCAAGTAACGCCCTCGCCAGCTTCCACCTCCCGATCTAATTGTCCC
AGAAGTCCCCGCACTTCCGCTGTACGGCTGAGTGTTTGCCAAGATGGCCGCGCCCGTGCGCTATTACCGA
AGGGCGCCGCCATCGCGGCTGCCGGACCCGCTAAGGCCGCCCTCCGGGTAGCCGCCATGTCGGTCTCCAG
CGGCGTCCAGATTCTGACAAAGCCAGAGACCGTGGACCGGAGGAGAAGTGC
ZFP37 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZFP37_1 ↗9:113,056,724負股113,056,714–113,056,773

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_BSFRL · promoter · 113056678–113057249 · regulatory

ENSR9_93MTM4 · enhancer · 113059701–113060038 · regulatory

· motif · 113056520–113056537 · motif

· motif · 113056617–113056628 · motif

· motif · 113056685–113056695 · motif

· motif · 113056730–113056740 · motif

· motif · 113056792–113056803 · motif

· motif · 113056792–113056803 · motif

· motif · 113056794–113056803 · motif

· motif · 113057019–113057034 · motif

· motif · 113057418–113057432 · motif

· motif · 113057418–113057433 · motif

· motif · 113057418–113057433 · motif

· motif · 113057425–113057438 · motif

· motif · 113057425–113057439 · motif

· motif · 113057425–113057440 · motif

· motif · 113057425–113057440 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:630 aa

1 aa630 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9Y6Q3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZFP37 zinc finger protein 長 630 個胺基酸,屬於 Krueppel C2H2 型鋅指蛋白家族。蛋白質含有 KRAB 結構域,以及 12 個 C2H2 型 zinc finger;其中第 3 個被註記為非典型。此外,序列註解列出三段無序區域,分別位於胺基酸 1–45、77–172 與 193–285。

結構域KRAB32–103 aa
鋅指C2H2-type 1293–315 aa
鋅指C2H2-type 2321–343 aa
鋅指C2H2-type 3; atypical349–367 aa
鋅指C2H2-type 4377–399 aa
鋅指C2H2-type 5405–427 aa
鋅指C2H2-type 6433–455 aa
鋅指C2H2-type 7461–483 aa
鋅指C2H2-type 8489–511 aa
鋅指C2H2-type 9517–539 aa
鋅指C2H2-type 10545–567 aa
鋅指C2H2-type 11573–595 aa
鋅指C2H2-type 12601–623 aa
功能區域Disordered1–45 aa
功能區域Disordered77–172 aa
功能區域Disordered193–285 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y6Q3…

AlphaFold · Q9Y6Q3

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

資料將 ZFP37 zinc finger protein 註記於細胞核。 此項定位資訊未提供其他細胞區室或條件相關的定位變化。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZNF906ZFP37
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZFP37 zinc finger protein 可能參與轉錄調控;來源以可能性描述其功能,未指出調控的基因、作用方向或具體分子機制,因此不宜將此功能表述為已確立的特定調控作用。資料庫紀錄
證據與來源

May be involved in transcriptional regulation

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZFP37 zinc finger protein 的定位資料標示為細胞核;此項註記僅提供核內定位資訊,沒有附帶其他細胞位置、條件或異構型差異的說明。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000374227 · 6,277 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCCGGACCCGCTAAGGCCGCCCTCCGGGTAGCCGCCATGT40
41CGGTCTCCAGCGGCGTCCAGATTCTGACAAAGCCAGAGAC80
81CGTGGACCGGAGGAGAAGTGCGGAAACGACCAAAGAGGCC120
121GGGCGACCACTGGAGATGGCTGTGTCCGAGCCCGAGGCCA160
161GCGCCGCGGAATGGAAGCAACTGGATCCTGCTCAGAGCAA200
201CCTGTATAATGATGTGATGCTGGAGAACTACTGCAACCAA240
241GCCTCAATGGGGTGTCAAGCTCCCAAACCAGACATGATCT280
281CCAAGTTGGAAAAAGGAGAAGCACCATGGTTGGGGAAGGG320
321GAAAAGACCCAGTCAAGGTTGTCCAAGTAAAATAGCAAGA360
361CCCAAGCAAAAAGAAACTGATGGAAAAGTCCAGAAAGATG400
401ATGACCAGCTTGAAAATATCCAGAAATCTCAAAACAAACT440
441CCTCAGGGAAGTTGCAGTCAAGAAGAAAACTCAAGCTAAG480
481AAGAATGGCAGTGACTGTGGTTCACTGGGGAAAAAAAATA520
521ATTTGCATAAAAAACATGTTCCTTCAAAGAAAAGGCTTCT560
561TAAATTTGAGTCATGTGGAAAAATTTTGAAACAGAATTTA600
601GATTTACCTGATCACTCAAGAAACTGTGTAAAAAGGAAAT640
641CTGATGCAGCTAAAGAACACAAGAAGTCATTCAACCATAG680
681CTTATCTGATACAAGGAAAGGCAAAAAGCAAACTGGAAAG720
721AAACATGAGAAATTATCCAGCCATAGCTCATCTGATAAGT760
761GTAACAAAACTGGCAAAAAACATGACAAATTATGCTGTCA800
801TAGTTCATCCCATATTAAACAGGACAAAATTCAAACTGGA840
841GAGAAACATGAGAAATCACCCAGCCTTAGCTCATCTACTA880
881AGCATGAAAAACCTCAAGCTTGTGTGAAACCCTATGAATG920
921TAATCAATGTGGAAAGGTTCTCAGCCATAAACAAGGACTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。