基因總覽
ZFP3 zinc finger protein 是由 ZFP3 基因編碼的蛋白質,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其序列含有多個 C2H2-type zinc finger,是此蛋白質的主要結構特色;目前來源對其基本性質的描述有限,僅指出它可能參與轉錄調控,未提供更具體的分子作用或生物學過程資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000318833 ★ | 5,078,467–5,096,374 | 2 |
| ENST00001141465 | 5,078,241–5,096,376 | 2 |
| ENST00000902904 | 5,078,467–5,096,376 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZFP3 zinc finger protein 可能參與轉錄調控。這項描述指出它可能與基因轉錄的調節有關,但來源未說明其作用方向、調控的基因或轉錄過程中的具體步驟,因此不能據此判定它會促進或抑制特定基因的表現。
現有資訊也未提供 ZFP3 zinc finger protein 如何影響轉錄的分子機制,或是否透過與特定 DNA 序列、蛋白質或其他分子互作來發揮作用。其參與轉錄調控的可能性,因而仍屬概括性的功能描述;來源沒有列出相關的細胞情境、調控條件或實驗結果,也未指出這項可能功能對特定生物學過程的影響。
Promoter 與基因調控
>ZFP3 ENST00000318833 GRCh38 chr17:5077467-5078567 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CACTTTGGGAGGCCGAGGCGGCCGGATCACCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGACCAAAATGGAG AAAACCCGTCTCTACCTAAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGCACATGCTTGTAATCCCAGTTACTC GGGGAGGCTGAAGTAGGAGAATCGCTTGAATCCGGGAGGCGGAGGTTGCGGTGAGCGGAGATGGCGCCAT CGCACTCCAGCCTGGACAACAAGAGCGAAACTCCATCTCAAAAAACAAACAAACAAGAAAACAAGCTGGC TGTGCAAAATTACAGAGGAAGTAACAAGGAAAGGTTCTGAGGTGAGAATGGGCCAAGCTTGCTCAGGGAA CCCAGGAAGGCTAGCTGCAGAATGCTGTTTCCGTGGCCTCGGCAGCTTAACCTAGGCCTTTACTCTTAAC CTTGGTAATTCCCACGCAATCTTGAGATTTCAGGCCAAACGTCACTCCTGCAAGCCCTTCCGGAACTCAA AGCATGTCTCCCTTCGCTCCCGCCGAGGAGAGACCTGTTCCCAGGATCTGCAGCCCTGTGCTTATCAGAC CCACGGAGTCTGTGGAAAGGAAGGATGGGATAAGAACGATGCGGGTTGGGAGAGTTAAAAGGGTCGCGCA AACGGTCCCCGCGGGAATGCGAAGCGGATTCTCGAGTTCTTGAGCCTAGAGCAATGCTTGGGGAGCGACA CGAGGGCGCAGAGCGGCAGATCGCGGAGCGGAAGTTCATCCCCGGAGCCGTTCTAGGAAACCCGGAGGAC TCAGGTCGTCAATGATTCCGGGGCTGAAGTGGGCATCGACGGGTGCACTTTGCTGTTCCAGGGAGCCGGC TCGGCAGGCGGCGGCGACGTGGAACTTGGGCTAGGGCTAGAACCGGCGAAAAGCAAGCCGGAAAAGGCAA GGGGGCGTCGGTGCGCTGACCACCTGTTCCTCCAGCGGAGTGCGACGCGCGCCGATTGGCTGGAGTGCCG CCCGGGTACCGGAAGTGGCCGATGCCCGTCGCCAGTGACACCGGGACAACAGCTGCGGGCTCTGTGCGAG CGGCCCAGCAGCGCGGAGCCTCAGCGGAGTGAGCGAGCGCGGGGCAGTAGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZFP3_2 ↗ | 17:5,078,250 | 正股 | 5,078,201–5,078,260 |
| ZFP3_3 ↗ | 17:5,078,467 | 正股 | 5,078,418–5,078,477 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_942DJ · enhancer · 5075065–5075492 · regulatory
ENSR17_942FB · enhancer · 5077726–5078102 · regulatory
ENSR17_942FF · promoter · 5078103–5078477 · regulatory
ENSR17_B327R · enhancer · 5078478–5079205 · regulatory
· motif · 5077894–5077905 · motif
· motif · 5078101–5078114 · motif
· motif · 5078101–5078114 · motif
· motif · 5078191–5078202 · motif
· motif · 5078193–5078202 · motif
· motif · 5078395–5078404 · motif
· motif · 5078452–5078463 · motif
· motif · 5078452–5078463 · motif
· motif · 5078454–5078463 · motif
· motif · 5078564–5078579 · motif
· motif · 5078575–5078590 · motif
· motif · 5078628–5078641 · motif
· motif · 5078628–5078641 · motif
· motif · 5078742–5078751 · motif
· motif · 5078867–5078884 · motif
· motif · 5078869–5078882 · motif
· motif · 5078876–5078884 · motif
· motif · 5078922–5078932 · motif
· motif · 5079149–5079171 · motif
· motif · 5079149–5079171 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:502 aa
ZFP3 zinc finger protein 長 502 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。蛋白質序列包含 13 個 C2H2-type zinc finger,分布於第 141–499 位胺基酸;另有兩段預測為無序區域,分別位於第 1–26 位及第 47–103 位胺基酸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZFP3 zinc finger protein 定位於細胞核。 來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- YJU2BP13994 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GATGCCCGTCGCCAGTGACACCGGGACAACAGCTGCGGGC40TCTGTGCGAGCGGCCCAGCAGCGCGGAGCCTCAGCGGAGT80GAGCGAGCGCGGGGCAGTAGCGGCCTGCGATTGTGAGATG120GGGACTGAGAACAAGGAGGTGATTCCCAAGGAAGAAATTT160CTGAAGAATCTGAGCCACATGGGTCATTATTAGAAAAATT200TCCAAAAGTGGTTTACCAAGGTCATGAGTTTGGAGCAGGA240TGTGAAGAAGACATGTTGGAGGGACATTCGAGAGAGTCCA280TGGAAGAGGTTATAGAGCAGATGTCTCCTCAGGAGAGAGA320CTTTCCATCAGGGTTGATGATCTTTAAGAAATCACCCTCA360AGTGAGAAAGACCGGGAGAATAATGAGAGTGAGAGAGGCT400GCAGTCCCAGCCCAAATCTGGTTACACATCAGGGAGATAC440AACAGAGGGAGTTAGTGCATTTGCTACCTCTGGCCAAAAC480TTCCTAGAGATTTTAGAATCTAACAAAACACAGAGAAGTT520CTGTGGGAGAAAAGCCTCATACATGTAAAGAATGTGGGAA560AGCCTTTAATCAGAACTCACATCTCATCCAGCATATGAGA600GTTCATAGTGGAGAAAAACCCTTTGAATGTAAAGAATGTG640GAAAGACATTTGGAACTAATTCAAGCCTTCGACGGCACCT680GAGAATTCATGCTGGAGAAAAACCCTTTGCTTGTAATGAA720TGTGGAAAGGCCTTCATTCAGAGTTCACACCTTATTCACC760ATCATAGAATTCATACTGGAGAGAGACCCTATAAATGTGA800AGAATGTGGTAAAGCCTTCAGTCAAAATTCAGCCCTTATT840CTACACCAGAGAATCCATACTGGAGAGAAACCATATGAAT880GTAATGAATGTGGGAAGACCTTTAGGGTTAGTTCACAGCT920TATTCAGCATCAGAGAATTCATACTGAAGAAAGATACCAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。