基因總覽
zinc finger AN1-type containing 5（ZFAND5）是由人類蛋白質編碼基因產生的蛋白質，長度為 213 個胺基酸，屬於含有 zinc finger 結構的蛋白質。其序列包含 A20-type zinc finger 與 AN1-type zinc finger，兩個結構域分布於蛋白質不同區段；中間一段則被註記為無序區域。這些結構特色與 ZFAND5 的蛋白質互作及其參與細胞內蛋白質調控的角色相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376962 ★ | 72,351,413–72,365,208 | 7 |
| ENST00000376960 | 72,350,313–72,365,785 | 6 |
| ENST00000343431 | 72,350,313–72,364,633 | 7 |
| ENST00000237937 | 72,350,313–72,364,633 | 6 |
| ENST00000896944 | 72,350,313–72,365,214 | 5 |
| ENST00000896945 | 72,350,313–72,365,251 | 6 |
| ENST00000896946 | 72,350,313–72,365,785 | 7 |
| ENST00000896947 | 72,350,313–72,365,785 | 6 |
| ENST00000896948 | 72,350,313–72,365,785 | 3 |
| ENST00000896949 | 72,350,313–72,365,785 | 5 |
| ENST00000916941 | 72,350,313–72,365,785 | 6 |
| ENST00000962950 | 72,350,313–72,365,785 | 7 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZFAND5 參與 ubiquitin-proteasome system 介導的蛋白質降解。它可能透過將已泛素化的蛋白質錨定至 proteasome，協助底物進入降解途徑；來源將這種錨定作用描述為可能機制，而非確定的唯一作用方式。ZFAND5 也參與肌肉萎縮期間由 ubiquitin 介導的蛋白質降解，顯示其功能與特定生理狀態下的蛋白質周轉有關。
除了蛋白質降解，ZFAND5 也參與調節 NF-kappa-B 活化與細胞凋亡。它可抑制因 RIPK1 或 TRAF6 過量表現所引發的 NF-kappa-B 活化，但對 RELA 過量表現所引發的活化沒有相同抑制作用。此差異表示其抑制效果會依引發 NF-kappa-B 活化的因子而異，不能概括為對所有相關刺激均有相同作用。
ZFAND5 亦能以劑量依賴方式抑制由 tumor necrosis factor（TNF）、IL-1 及 TLR4 誘導的 NF-kappa-B 活化。這些結果指出，ZFAND5 可在多種刺激條件下限制此訊息反應，但抑制程度與劑量相關。來源未進一步界定這些刺激下的完整分子機制。
在細胞凋亡方面，ZFAND5 過量表現會使細胞對 TNF 誘導的凋亡更敏感。這項結果描述的是過量表現條件下的細胞反應，不代表 ZFAND5 在所有情境中都會促進凋亡。此外，ZFAND5 是破骨細胞分化的強效抑制因子，指出它也能影響細胞分化過程。來源未提供此作用的詳細機制，亦未說明其與蛋白質降解或 NF-kappa-B 調控之間的因果關係。
Promoter 與基因調控
>ZFAND5 ENST00000376962 GRCh38 chr9:72365108-72366208 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTACTAGAAAATTTCAGAAGTCCTTTCCGACTTAGTAATTTTGTTATTTTGAGTTGAACTGAAATTCAC TTGGAGCGGTCAGTTGAAAATGTTTTTTGTTTGTGCTCTGAAAAGGTTCCCAGTGTTCCGGGTAAAGTCA TCCTTTCACCCATGGGGGACCTGTGCCTCGTGCCTGAACTGCCCGCCTAGTACCTCCCCCCTTGAACTTC CTCTCGCAAGCCTCCTCCTCCCGCTTCATCTGGGCCTCGGGTCTAGCTTGTTTTGTCCCTTCGCGGCTTT TGAGTAGAACATTTGGTGCTTTCCCAGTTCACGACGCTTTGCTGGAATCGTCAATTTCCAGGGATTTCAC AGGCTGGCCAAAACAGTTTGTTCAGAACAGCGCCGCCGGGGCATTGGCAGCCCTGGGCGGCCGCGCGTTT CCTCACTCCGCACAACCACCCGTGACCTTGGGCGAGCGAACGCACGCCGCCAGCTGCGTCAGGGCCACGC TCGGGCTGGACTTCGGAGCTCAAAATGGGTGTGGGGAGTGAGGAGGTTTCATAAACAGAAAAGACCTCGA AGCCATAAGGCAATTCTTTTCCTTTTCTGGGGGTGAATCCTTACGATTCTTGGGGGAGGGAATGTCTGCC CAGGGCTGGAGACAAAGCGTGAGAACTAGGATGGCGAAAAACGGGTTTGAATGAGAAAATCCGAAGGAGG GAGGCTGAGGGCGGACAATTGGGTTAAAAATAGAAACGCATCCTCCACAGGACTCGCTCTTCCCAGCTCC ACCCTAGGGGCCGACTGCCAGGCCAGTGGCTGGGCTCCGCGAGAAGGCACAGCAACCCGTCTCGGCCCCG CCTCCTGGACCTACTGACAGGGCACCGGGGGCGTGGCCTTGGGCCCGCGACGTCACCGCGCTCCCCGCCG CCGCCGCCGCCGCCGGGGTTTTCGCTGACGCACGGGTCCCGCCCCCTCCCCCTCTTTTCCCTCACAGCCC GGGCGCCGGGCGGCGAGTGCGTTAGTCGGCCGGGACGCGGAGCTGTGTGCATCTCCTACGCGGGCTCGCT CGCTCCCGGGAGCCGCGCAGCTTCCCCGGCGGTGGCAGGAGCGGCGAAGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZFAND5_1 ↗ | 9:72,365,208 | 負股 | 72,365,198–72,365,257 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_845FXS · enhancer · 72361314–72361547 · regulatory
ENSR9_C96TK · enhancer · 72361894–72363672 · regulatory
ENSR9_BJCQC · enhancer · 72363783–72364581 · regulatory
ENSR9_BJCQG · promoter · 72364582–72365116 · regulatory
ENSR9_845G33 · promoter · 72365198–72365356 · regulatory
ENSR9_C96TR · enhancer · 72365357–72366403 · regulatory
ENSR9_5M2KBZ · CTCF_binding_site · 72365386–72365407 · regulatory
· motif · 72362201–72362212 · motif
· motif · 72362208–72362216 · motif
· motif · 72362355–72362377 · motif
· motif · 72362355–72362377 · motif
· motif · 72362367–72362379 · motif
· motif · 72362578–72362590 · motif
· motif · 72362729–72362740 · motif
· motif · 72362829–72362845 · motif
· motif · 72362910–72362921 · motif
· motif · 72364198–72364206 · motif
· motif · 72364267–72364280 · motif
· motif · 72364274–72364287 · motif
· motif · 72364396–72364409 · motif
· motif · 72364420–72364433 · motif
· motif · 72364521–72364534 · motif
· motif · 72364600–72364610 · motif
· motif · 72364637–72364650 · motif
· motif · 72364794–72364807 · motif
· motif · 72364967–72364984 · motif
· motif · 72365100–72365110 · motif
· motif · 72365192–72365208 · motif
· motif · 72365247–72365257 · motif
· motif · 72365253–72365263 · motif
· motif · 72365270–72365281 · motif
· motif · 72365299–72365316 · motif
· motif · 72365329–72365342 · motif
· motif · 72365332–72365342 · motif
· motif · 72365364–72365374 · motif
· motif · 72365388–72365404 · motif
· motif · 72365475–72365486 · motif
· motif · 72365587–72365597 · motif
· motif · 72365684–72365694 · motif
· motif · 72365699–72365714 · motif
· motif · 72365710–72365726 · motif
· motif · 72365758–72365770 · motif
· motif · 72365760–72365773 · motif
· motif · 72366048–72366064 · motif
· motif · 72367604–72367617 · motif
· motif · 72367704–72367719 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：213 aa
ZFAND5 長 213 個胺基酸，含有位於第 8–42 位的 A20-type zinc finger，以及第 148–194 位的 AN1-type zinc finger。第 39–149 位另被註記為無序區域，與兩個 zinc finger 區段部分重疊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZFAND5 的定位資料為細胞質；來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CETN1Q12798 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- UBCP0CG48 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZFAND5 與 ubiquitin 及多泛素化蛋白質互作。依相似性推定，它曾被辨識為包含 ubiquitin 與 SQSTM1 的異源三聚體複合體成員，其中 ZFAND5 與 SQSTM1 均與同一個 ubiquitin 分子互作；此複合體關係帶有 By similarity 的證據限制。ZFAND5 也可形成同源寡聚體及／或異源寡聚體，並透過 A20-type domain 與 IKBKG、RIPK1 互作，透過 AN1-type domain 與 TRAF6 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZFAND5 參與 ubiquitin-proteasome system 介導的蛋白質降解，可能藉由將已泛素化蛋白質錨定至 proteasome 發揮作用，也參與肌肉萎縮期間的 ubiquitin 介導蛋白質降解。它會抑制由 RIPK1 或 TRAF6 過量表現引起、但非由 RELA 過量表現引起的 NF-kappa-B 活化，並以劑量依賴方式抑制 TNF、IL-1 與 TLR4 誘導的活化。過量表現會提高細胞對 TNF 誘導凋亡的敏感性，且 ZFAND5 是破骨細胞分化的強效抑制因子。 | 含實驗來源 | 證據與來源Involved in protein degradation via the ubiquitin-proteasome system. May act by anchoring ubiquitinated proteins to the proteasome. Plays a role in ubiquitin-mediated protein degradation during muscle atrophy. Plays a role in the regulation of NF-kappa-B activation and apoptosis. Inhibits NF-kappa-B activation triggered by overexpression of RIPK1 and TRAF6 but not of RELA. Also inhibits tumor necrosis factor (TNF), IL-1 and TLR4-induced NF-kappa-B activation in a dose-dependent manner. Overexpression sensitizes cells to TNF-induced apoptosis. Is a potent inhibitory factor for osteoclast differentiation PMID 14754897 ↗ |
| 交互作用 | ZFAND5 與 ubiquitin 及多泛素化蛋白質互作。依相似性推定，它與 ubiquitin、SQSTM1 被辨識於異源三聚體複合體中，ZFAND5 和 SQSTM1 都與同一 ubiquitin 分子互作。ZFAND5 可形成同源寡聚體及／或異源寡聚體；它透過 A20-type domain 與 IKBKG、RIPK1 互作，並透過 AN1-type domain 與 TRAF6 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with ubiquitin and polyubiquitinated proteins. Identified in a heterotrimeric complex with ubiquitin and SQSTM1, where ZFAND5 and SQSTM1 both interact with the same ubiquitin molecule (By similarity). Homooligomer and/or heterooligomer. Interacts (via A20-type domain) with IKBKG and RIPK1 and with TRAF6 (via AN1-type domain) PMID 14754897 ↗ |
| 細胞定位 | ZFAND5 位於細胞質。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GTTAGTCGGCCGGGACGCGGAGCTGTGTGCATCTCCTACG40CGGGCTCGCTCGCTCCCGGGAGCCGCGCAGCTTCCCCGGC80GGTGGCAGGAGCGGCGAAGAGCGCCATCAGCGGGCCCTTA120CGGCCCCAGGCCTCGCGGCGCGCGGTCCGCTCGCCCTCCT160CGTCCGCCCAACCTGCGGCCTGTGGAGGCGTGAGGCGACG200ACAGGCGAGCGCCTCGAGCAGCGTTAGCCGCTGCGGCCGC240CGGTCCTCCCTCCACCTCCTCCTCGGCCCCCCCTCGCTTC280CCTCCTCCCACTTCCCGAGCTCCGGCGTGTCCCGGCCACG320CTCGACGCTGCTGCAGGAACAAAGGAAGACCCCGCGGCGG360CGGCGGCGCCACCTCCGCCTGCTGCTCCGACCCGCTCCCG400GCCCGCGGCGGCGGCACCAGGGCGCCCGGCTCAGCCTTCC440CGGAGGCCTCGGCCCGGCCTCATCGTGCCGGCTTCGCGCG480CGAACCCGGCTTTCGCATTTGGGACCCTGCAGGGCCCTGA520AAAGGAGCCTTTAAAAGTCAATTCTACTCCATTTGGCAAA560GAGGGAACTGAAATCTGGAAAGTAAGGACTTGCCCAAGGT600CACTGACTTAGTGGCAGACTAGAGACTTGAACTCAGGTCT640CCATTCCCAGCAGAAAAATATGGCTCAGGAGACTAACCAG680ACCCCGGGGCCCATGCTGTGTAGCACAGGATGTGGCTTTT720ATGGAAATCCTAGGACAAATGGAATGTGTTCAGTTTGCTA760CAAAGAACATCTTCAGAGGCAGCAAAATAGTGGCAGAATG800AGCCCAATGGGAACAGCTAGTGGTTCCAACAGTCCTACCT840CAGATTCTGCATCTGTACAGAGAGCAGACACTAGCTTAAA880CAACTGTGAAGGTGCTGCTGGCAGCACATCTGAAAAATCA920AGAAATGTGCCTGTGGCTGCCTTGCCTGTAACTCAGCAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。