基因總覽
ZEB1（zinc finger E-box binding homeobox 1）是由蛋白質編碼基因產生的轉錄調控蛋白，屬於 delta-EF1/ZFH-1 C2H2-type zinc-finger family。蛋白質具有多個 C2H2-type zinc finger，並含有 atypical homeobox DNA-binding 區域，呈現多種 DNA 結合結構特色。其基本角色是參與轉錄調控；不同基因與細胞背景下，調控結果並不完全相同。以下功能說明其具體作用方式與相關生物學過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000424869 ★ | 31,319,216–31,529,804 | 9 |
| ENST00000320985 | 31,319,125–31,529,813 | 9 |
| ENST00000560721 | 31,319,125–31,529,813 | 8 |
| ENST00000542815 | 31,319,125–31,529,813 | 8 |
| ENST00000860471 | 31,319,125–31,529,813 | 9 |
| ENST00000860472 | 31,319,125–31,529,813 | 5 |
| ENST00001116759 | 31,319,125–31,390,047 | 2 |
| ENST00000558440 | 31,319,213–31,520,421 | 5 |
| ENST00001137715 | 31,319,216–31,529,813 | 9 |
| ENST00000561212 | 31,320,126–31,520,811 | 7 |
| ENST00000446923 | 31,321,152–31,529,813 | 9 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZEB1 主要作為轉錄抑制因子，能透過結合 E box（5'-CANNTG-3'）抑制轉錄。其調控作用涉及多種基因，但方向與結果會依靶基因、細胞類型及特定條件而異，因此不能將其作用概括為對所有基因都相同的抑制效果。
在特定基因調控中，ZEB1 抑制 interleukin-2（IL-2）基因表現，也能抑制 E-cadherin 啟動子。抑制 E-cadherin 啟動子時，ZEB1 會招募 SMARCA4/BRG1，並誘導上皮—間質轉化（EMT）。此外，在有共抑制因子 CTBP1 存在時，ZEB1 會抑制 BCL6 的轉錄；這項作用帶有明確的共抑制因子條件。
ZEB1 對 ATP1A1 基因啟動子活性的影響可增強也可抑制，取決於 cDNA 的量以及細胞類型。這表示其對該啟動子的調控方向，不能脫離表現量和細胞背景來判定。對 COL1A2，來源描述在缺少 TGFB1 時，ZEB1 會結合上游增強子區域的 E box，並抑制其轉錄；此項敘述標示為相似性推論。
在神經相關過程中，ZEB1 正向調控神經元分化；另一方面，在神經生成期間，它會抑制 RCOR1 的轉錄活化。這些資料指出 ZEB1 可參與不同生物學過程中的轉錄調節，但現有描述未提供各作用之間更完整的先後關係或共同機制。
Promoter 與基因調控
>ZEB1 ENST00000424869 GRCh38 chr10:31318216-31319316 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGCACGGCGATGACCGCTCATTTAGGAAGGAATTCATGGCCTGTGGATACCTTAGCTCTGAGTCCTGCC ACCTAGGATCCCACGGTTCTACGCGAGGAAGAGGGCGGGGAGCGCGGACCGGGTGTGGGAGGCCGAGGTG ACAGCAGGTGAGGGCCGGGTGCGGATGGGGAAGTGAGACAAGCACCGTGTGGGTATTACTCATTCCGCTC TACTAAGGAGGCTGCTGGCAAGCGGAACTTCTAGCCTCTCTTTCAATCCAGCTGAAGTTCAATCTCATTG AAGTCACTTCCCATCCCGGTTCGCTTGGGGGGAAACCAGGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGAAGGGAGTCCG GGCTGCGCGGGTCAGGTAGCCTCTCTCCGGTCGCCGCGTGTCCTCGCCGTCCCCAAACCTGCCCTTCCCC TCATCAAGGGAACTCCCCGGGGAGTCCAGACCGCGATCCCTTTCCTTGGCCCCGGGGTGCGGGGGGCGGA CACGCGAGGCGTGGGACTGATGGTAGCCCTGCCTCCAGGAAGCAGGCAGGCGGGGACCTCTGGGCGCTCG GAGGGGCAGCTCCGAGGGCACAGGGTACAGGGAGAATCAGCCAGATCCCTCCCTGCCCCGGGCAGCCGCG GCGGGTGTGGCCAGCGCGGAGGCAGGACGCCGCCGAGCCTCCAACTTTACCTTTCCAACTCCGACAGCCC GTCGCCTTTCTGACCGCGTCCCTACGGTTTCCCGGCATCCGCCTCCCTCTCCCCACCACACCTGAGGAAA ACTTTTCCCTCGCCCCTCAATTCAAATTCAGCAGTGCCCACGGTTGCCGCAAACCGCCCGGTCCCTAGCA ACAAGGTTCCGGCCGTAGAGCGAGAGCCTCTAGGTGTAAGGAAGGTGATGTCGTAAAGCCGGGAGTGTCG TAAACCAGGTGCGGTGGGGAGGGGGGAGGGGTGGAGGCGGAGGGGTGGGGGGGAAGGGGGAGGGAGGGGG AGGAGGTGACTCGAGCATTTAGACACAAGCGAGAGGATCATGGCGGATGGCCCCAGGTGTAAGCGCAGAA AGCAGGCGAACCCGCGGCGCAATAACGGTGAGTGGCGGAGGGGACCGGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 4 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZEB1_2 ↗ | 10:31,318,417 | 正股 | 31,318,368–31,318,427 |
| ZEB1_3 ↗ | 10:31,318,818 | 正股 | 31,318,769–31,318,828 |
| ZEB1_1 ↗ | 10:31,319,216 | 正股 | 31,319,167–31,319,226 |
| ZEB1_4 ↗ | 10:31,321,201 | 正股 | 31,321,152–31,321,211 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_B87RL · enhancer · 31315307–31315853 · regulatory
ENSR10_C54WH · enhancer · 31317929–31319013 · regulatory
ENSR10_8WT9H · promoter · 31319014–31319232 · regulatory
ENSR10_C54WL · enhancer · 31319233–31320436 · regulatory
ENSR10_59CW9S · CTCF_binding_site · 31319520–31319541 · regulatory
ENSR10_9GFMN · promoter · 31320437–31320937 · regulatory
ENSR10_59CWHT · CTCF_binding_site · 31320822–31320843 · regulatory
ENSR10_8WTC7 · enhancer · 31321938–31322169 · regulatory
ENSR10_9GFNB · enhancer · 31322598–31323015 · regulatory
ENSR10_59CWTC · CTCF_binding_site · 31322876–31322897 · regulatory
· motif · 31318169–31318182 · motif
· motif · 31318377–31318390 · motif
· motif · 31318410–31318418 · motif
· motif · 31318442–31318455 · motif
· motif · 31318519–31318530 · motif
· motif · 31318647–31318660 · motif
· motif · 31318647–31318660 · motif
· motif · 31318789–31318802 · motif
· motif · 31319020–31319037 · motif
· motif · 31319029–31319044 · motif
· motif · 31319129–31319138 · motif
· motif · 31319186–31319199 · motif
· motif · 31319233–31319243 · motif
· motif · 31319247–31319256 · motif
· motif · 31319255–31319270 · motif
· motif · 31319522–31319538 · motif
· motif · 31319580–31319593 · motif
· motif · 31320378–31320398 · motif
· motif · 31320824–31320840 · motif
· motif · 31320827–31320840 · motif
· motif · 31320933–31320948 · motif
· motif · 31321139–31321161 · motif
· motif · 31321139–31321161 · motif
· motif · 31321919–31321932 · motif
· motif · 31321919–31321932 · motif
· motif · 31322878–31322894 · motif
· motif · 31324068–31324080 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1124 aa
ZEB1 蛋白質長 1124 個胺基酸，屬於 delta-EF1/ZFH-1 C2H2-type zinc-finger family。註解列出七個 C2H2-type zinc finger，其中第 4 與第 7 個為 atypical；另有 atypical homeobox DNA-binding 區域。序列中也標示多段預測為無序的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZEB1 的定位註解為細胞核；來源未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
ZEB1 透過 N 端與 SMARCA4/BRG1 互作。來源支持兩者之間的互作，並未在此處說明更廣泛的複合體組成。
疾病與遺傳關聯
影響 ZEB1 的變異與兩種角膜疾病相關。後部多形性角膜失養症第 3 型（PPCD3）是後部角膜失養症的一種，患者通常無症狀；Descemet 膜可出現囊泡、混濁或帶狀病灶。Fuchs 角膜內皮失養症第 6 型（FECD6）涉及中央角膜內皮流失，可見由 Descemet 膜發生的局部疣狀滴狀病灶、上皮水泡、視力下降與疼痛，且該膜會因異常膠原沉積而增厚。來源將兩者描述為受影響基因變異所致，未提供特定變異細節。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZEB1 主要作為轉錄抑制因子，能結合 E box（5'-CANNTG-3'）抑制轉錄，並抑制 IL-2、E-cadherin 啟動子、BCL6 與 RCOR1 的相關轉錄活動；抑制 BCL6 需有共抑制因子 CTBP1。對 ATP1A1 啟動子的作用可增強或抑制，取決於 cDNA 量與細胞類型。招募 SMARCA4/BRG1 時可誘導 EMT，並正向調控神經元分化。在 TGFB1 缺失時抑制 COL1A2 的作用屬相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a transcriptional repressor. Inhibits interleukin-2 (IL-2) gene expression. Enhances or represses the promoter activity of the ATP1A1 gene depending on the quantity of cDNA and on the cell type. Represses E-cadherin promoter and induces an epithelial-mesenchymal transition (EMT) by recruiting SMARCA4/BRG1. Represses BCL6 transcription in the presence of the corepressor CTBP1. Positively regulates neuronal differentiation. Represses RCOR1 transcription activation during neurogenesis. Represses transcription by binding to the E box (5'-CANNTG-3'). In the absence of TGFB1, acts as a repressor of COL1A2 transcription via binding to the E-box in the upstream enhancer region (By similarity) PMID 19935649 ↗ · PMID 20175752 ↗ · PMID 20418909 ↗ |
| 交互作用 | ZEB1 透過其 N 端與 SMARCA4/BRG1 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZEB1 定位於細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 ZEB1 的變異與後部多形性角膜失養症第 3 型（PPCD3）相關。此病是後部角膜失養症的一種，可在裂隙燈檢查與鏡面顯微鏡下見到 Descemet 膜的囊泡、混濁或帶狀病灶；患者通常沒有症狀。 | 含實驗來源 | 證據與來源Corneal dystrophy, posterior polymorphous, 3 PPCD3 A subtype of posterior corneal dystrophy, a disease characterized by alterations of Descemet membrane presenting as vesicles, opacities or band-like lesions on slit-lamp examination and specular microscopy. Affected patient typically are asymptomatic. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 609141 PMID 16252232 ↗ · PMID 23599324 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 ZEB1 的變異與 Fuchs 角膜內皮失養症第 6 型（FECD6）相關。此角膜疾病由中央角膜內皮流失所致，特徵包括 Descemet 膜形成並向中央角膜發展的局部疣狀滴狀病灶、上皮水泡、視力下降與疼痛；Descemet 膜會因異常膠原沉積而增厚。 | 含實驗來源 | 證據與來源Corneal dystrophy, Fuchs endothelial, 6 FECD6 A corneal disease caused by loss of endothelium of the central cornea. It is characterized by focal wart-like guttata that arise from Descemet membrane and develop in the central cornea, epithelial blisters, reduced vision and pain. Descemet membrane is thickened by abnormal collagenous deposition. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613270 PMID 20036349 ↗ · PMID 23599324 ↗ · PMID 25190660 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACACAAGCGAGAGGATCATGGCGGATGGCCCCAGGTGT40AAGCGCAGAAAGCAGGCGAACCCGCGGCGCAATAACGTTA80CAAATTATAATACTGTGGTAGAAACAAATTCAGATTCAGA120TGATGAAGACAAACTGCATATTGTGGAAGAAGAAAGTGTT160ACAGATGCAGCTGACTGTGAAGGTGTACCAGAGGATGACC200TGCCAACAGACCAGACAGTGTTACCAGGGAGGAGCAGTGA240AAGAGAAGGGAATGCTAAGAACTGCTGGGAGGATGACACA280GGAAAGGAAGGGCAAGAAATCCTGGGGCCTGAAGCTCAGG320CAGATGAAGCAGGATGTACAGTAAAAGATGATGAATGCGA360GTCAGATGCAGAAAATGAGCAAAACCATGATCCTAATGTT400GAAGAGTTTCTACAACAACAAGACACTGCTGTCATTTTTC440CTGAGGCACCTGAAGAGGACCAGAGGCAGGGCACACCAGA480AGCCAGTGGTCATGATGAAAATGGAACACCAGATGCATTT520TCACAATTACTCACCTGTCCATATTGTGATAGAGGCTATA560AACGCTTTACCTCTCTGAAAGAACACATTAAATATCGTCA600TGAAAAGAATGAAGATAACTTTAGTTGCTCCCTGTGCAGT640TACACCTTTGCATACAGAACCCAACTTGAACGTCACATGA680CATCACATAAATCAGGAAGAGATCAAAGACATGTGACGCA720GTCTGGGTGTAATCGTAAATTCAAATGCACTGAGTGTGGA760AAAGCTTTCAAATACAAACATCACCTAAAAGAGCACTTAA800GAATTCACAGTGGAGAGAAGCCATATGAATGCCCAAACTG840CAAGAAACGCTTTTCCCATTCTGGCTCCTATAGCTCACAC880ATAAGCAGTAAGAAATGTATCAGCTTGATACCTGTGAATG920GGCGACCAAGAACAGGACTCAAGACATCTCAGTGTTCTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。