基因總覽
zinc finger and BTB domain containing 35(ZBTB35)是蛋白質編碼基因,其產物為轉錄因子,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。來源將它與免疫細胞發育、胚胎發育、器官形成及成人中樞神經系統正常功能維持相連結;其中這些生物學角色的描述標註為依序列相似性推定。另有資料指出,ZBTB35 可能參與 ESR1/ER-alpha 訊號的轉錄抑制調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000682664 ★ | 43,120,914–43,176,322 | 7 |
| ENST00000933525 | 43,066,410–43,176,326 | 8 |
| ENST00000507393 | 43,068,057–43,122,147 | 4 |
| ENST00000515326 | 43,120,883–43,161,773 | 6 |
| ENST00000874855 | 43,120,905–43,175,734 | 7 |
| ENST00000874856 | 43,120,905–43,175,734 | 5 |
| ENST00000874857 | 43,120,905–43,175,734 | 5 |
| ENST00001099046 | 43,120,905–43,139,465 | 4 |
| ENST00001121328 | 43,120,905–43,137,046 | 4 |
| ENST00001134688 | 43,120,905–43,176,322 | 7 |
| ENST00000306938 | 43,121,151–43,175,719 | 8 |
| ENST00000874854 | 43,121,151–43,176,248 | 7 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZBTB35 是一種轉錄因子,來源指出它在免疫細胞發育中具有重要角色,尤其與 T 細胞成熟及早期 B 細胞分化有關。這些免疫發育功能是依序列相似性推定,並非此處來源所述的直接實驗結論。
除免疫細胞發育外,ZBTB35 也被描述為參與胚胎發育與器官形成,並與維持成人中樞神經系統的正常功能有關。這些角色同樣標註為依序列相似性推定;來源未進一步說明其作用的細胞類型、發育階段或分子機制,因此不宜將其解讀為已確立的直接調控路徑。
在轉錄調控方面,ZBTB35 可能作為抑制因子,參與 ESR1/ER-alpha 訊號的調控。此作用以「可能參與」描述,表示其調控角色仍帶有不確定性。來源未提供抑制發生的具體方式,也未詳述其對相關生物過程或表型的影響。
Promoter 與基因調控
>ZBTB35 ENST00000682664 GRCh38 chr5:43119914-43121014 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTAATACAGATGGGGTCTCGCTATGTGCCCAGGCTGGCCTCAAACTCCTGGGCTGAACTCCTCCTCCCCA ACTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCGCGCCCGCCCACATCTCTTCTTACAGGT CAACTGGCTTTCCTTGACACCCAGTTACTTCGTTCTTCAGGTGTTGCAAAACTCATCAGCAAGCACCTAG GCAATTACTGTTCAAAATATCTATGCAGTCTACTAGACTTAAGATTCAGAAAGGCAGAAACCACATATAC CTTGTTCACAGCTGGACTTCTCAGTGTCTAGTACTAGGATTCTCAATACATATCTGTTGAAGTTATGATG ACATTATTACCATATAGCTATTTGAGTTCCTCCGTAATCCCAATTCTCAAGTTCTTTGAGAGAAAAAAAT AAGTAAATCTCAATTATAGAATTATCCTCAAAATGTATTTATATATAATATTTCTTTGGAGGAATTAAGG AAGCAGTCACATGCAGCTGACTGTGGGTCACTGGACTTTTTTTTTTTTTTGAGACGTTGTCTCGCTCTGT CGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACTACCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCCGCTTCAAGCTATTC TCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCATTCCCGGCTAATTTTTGTATTT TTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTTTCGAACTCCTGACCTCATGTGCTCCACCCG CCCAGGCCTCTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCGGCCTGGACTCTTTAAAGGAGTG GGGAAGGCCTGCACTAACGGGATCCGGTGTAAATAATTCTGAGCAGCTCCAGGTCCTGAGCCCAGCAAGC ACGTGCTGCGGCAGGGCGCGGGGAGGGCGCGCTTCGCGGAGGAAGATTCCGGGCGGCCCGAACGTGCTCG CGCCCGTAGCTGCCGCTGCCGGGGCCGCGGCCGCCCGGGTGCCCAACCGAACGCACGTGCGCCAGCGGGG CCCGAGCAGAAGGGGAGCCCCGGCTCTCACGAAGAAAATGGAGGGCGACCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZNF131_2 ↗ | 5:43,065,134 | 正股 | 43,065,085–43,065,144 |
| ZNF131_4 ↗ | 5:43,067,561 | 正股 | 43,067,512–43,067,571 |
| ZNF131_1 ↗ | 5:43,120,914 | 正股 | 43,120,865–43,120,924 |
| ZNF131_3 ↗ | 5:43,121,542 | 正股 | 43,121,493–43,121,552 |
| ZNF131_6 ↗ | 5:43,122,027 | 正股 | 43,121,978–43,122,037 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_5D5S3L · CTCF_binding_site · 43116311–43116332 · regulatory
ENSR5_9M553 · promoter · 43120424–43120924 · regulatory
ENSR5_C69JB · promoter · 43121018–43122049 · regulatory
ENSR5_5D5STZ · CTCF_binding_site · 43121146–43121167 · regulatory
· motif · 43116313–43116329 · motif
· motif · 43120607–43120618 · motif
· motif · 43120654–43120669 · motif
· motif · 43120659–43120671 · motif
· motif · 43120662–43120669 · motif
· motif · 43120662–43120677 · motif
· motif · 43120803–43120816 · motif
· motif · 43120821–43120830 · motif
· motif · 43120821–43120830 · motif
· motif · 43120821–43120830 · motif
· motif · 43120821–43120830 · motif
· motif · 43120901–43120915 · motif
· motif · 43120945–43120954 · motif
· motif · 43120945–43120954 · motif
· motif · 43121016–43121029 · motif
· motif · 43121021–43121033 · motif
· motif · 43121023–43121030 · motif
· motif · 43121148–43121164 · motif
· motif · 43121272–43121285 · motif
· motif · 43121279–43121292 · motif
· motif · 43121379–43121401 · motif
· motif · 43121379–43121401 · motif
· motif · 43121537–43121548 · motif
· motif · 43123090–43123103 · motif
· motif · 43123090–43123103 · motif
· motif · 43124112–43124125 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:623 aa
ZBTB35 蛋白質長 623 個胺基酸,含有位於第 34–98 位的 BTB 結構域,以及六個 C2H2 型鋅指,其中第四個被註記為退化型。第 573–623 位為無序區域;另有兩個核定位訊號,分別位於第 137–148 位與第 317–328 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源指出,SUMO 化不影響其核定位;資料未描述此定位變化所需的其他條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- FHL2Q14192 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FHL5Q5TD97 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- MORN4Q8NDC4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIP4K2BP78356-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VHLP40337-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZBTB35 與 ZBTB33 互相作用;來源指出,此互作會調節兩種蛋白質的轉錄活性,但未進一步說明其形成複合體的情形或調節方向。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZBTB35 是轉錄因子,依序列相似性推定參與免疫細胞發育,特別是 T 細胞成熟與早期 B 細胞分化;也依序列相似性推定參與胚胎發育、器官形成及成人中樞神經系統正常功能維持。此外,它可能作為抑制因子參與 ESR1/ER-alpha 訊號的轉錄調控。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor that plays a key role in immune cell development, particularly in T-cell maturation and early B-cell differentiation (By similarity). It also contributes to embryonic development and organogenesis, and is involved in maintaining normal function of the adult central nervous system (By similarity). May be involved in transcriptional regulation as a repressor of ESR1/ER-alpha signaling PMID 18847501 ↗ · PMID 22467880 ↗ |
| 交互作用 | ZBTB35 與 ZBTB33 互相作用;此互作會調節兩種蛋白質的轉錄活性。來源未指出調節方向或具體作用方式。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with ZBTB33; this interaction modulates transcriptional activity of both proteins |
| 細胞定位 | ZBTB35 位於細胞核;SUMO 化不會影響其核定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Sumoylation does not affect nuclear localization PMID 17306895 ↗ · PMID 22467880 ↗ · PMID 23404503 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGGGCCGCGGCCGCCCGGGTGCCCAACCGAACGCACGTGC40GCCAGCGGGGCCCGAGCAGAAGGGGAGCCCCGGCTCTCAC80GAAGAAAATGGAGGGCGACCCACGGGTTAGGGGTCAGGAA120AGGCGTGGGGCGCATTATGCCCTGGGAGGGGAAAGCACGG160AACAAGAGGCTCTGAGGGACGGAGAGGAAGGAGGGCGACC200CACGAGCTAGAGCAGCCCGACGGCCATGGAGGCTGAAGAG240ACGATGGAATGCCTTCAGGAGTTCCCTGAACATCATAAAA280TGATCCTCGACCGATTGAATGAACAGCGAGAGCAGGACCG320GTTTACTGACATCACCCTAATTGTCGACGGACACCATTTT360AAGGCTCACAAGGCTGTTTTGGCTGCTTGTAGTAAGTTCT400TCTACAAATTCTTTCAGGAGTTTACCCAAGAACCATTGGT440GGAGATAGAAGGTGTTAGTAAAATGGCCTTTCGCCATTTA480ATTGAGTTCACATATACAGCAAAATTAATGATACAAGGAG520AAGAAGAAGCCAATGATGTATGGAAAGCAGCAGAGTTTCT560ACAAATGCTAGAAGCTATCAAAGCCCTTGAAGTCAGGAAC600AAAGAAAACTCAGCTCCCTTAGAGGAAAATACCACAGGAA640AAAATGAGGCCAAAAAAAGGAAGATTGCAGAAACTTCAAA680TGTTATCACTGAGTCATTGCCATCTGCAGAATCAGAACCT720GTTGAAATTGAGGTAGAGATTGCCGAAGGCACCATTGAAG760TGGAAGATGAAGGCATCGAAACATTAGAGGAAGTGGCTTC800TGCCAAGCAGTCCGTAAAGTACATACAGAGCACAGGTTCC840TCTGATGATTCTGCTCTAGCACTGTTGGCAGATATTACCA880GCAAGTACCGTCAAGGTGACAGAAAAGGGCAGATTAAAGA920AGATGGCTGTCCATCTGACCCCACGAGCAAACAGGTAGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。