演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZBTB35ZNF131

zinc finger and BTB domain containing 35

ZBTB35 是一種 C2H2 型鋅指轉錄因子,與免疫細胞發育、胚胎發育及 ESR1/ER-alpha 訊號調控有關;部分功能依序列相似性推定。

Homo sapiens5p12UniProt P52739
OFFICIAL SYMBOL
ZBTB35
CHROMOSOME
5
UNIPROT
P52739
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

zinc finger and BTB domain containing 35(ZBTB35)是蛋白質編碼基因,其產物為轉錄因子,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein 家族。來源將它與免疫細胞發育、胚胎發育、器官形成及成人中樞神經系統正常功能維持相連結;其中這些生物學角色的描述標註為依序列相似性推定。另有資料指出,ZBTB35 可能參與 ESR1/ER-alpha 訊號的轉錄抑制調控。

Official symbol
ZBTB35
Gene name
zinc finger and BTB domain containing 35
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12915
UniProt
P52739
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ZNF131

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55p12
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegZBTB35pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:43,065,176–43,192,021
Gene span
126,846 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000682664 ★43,120,914–43,176,3227
ENST0000093352543,066,410–43,176,3268
ENST0000050739343,068,057–43,122,1474
ENST0000051532643,120,883–43,161,7736
ENST0000087485543,120,905–43,175,7347
ENST0000087485643,120,905–43,175,7345
ENST0000087485743,120,905–43,175,7345
ENST0000109904643,120,905–43,139,4654
ENST0000112132843,120,905–43,137,0464
ENST0000113468843,120,905–43,176,3227
ENST0000030693843,121,151–43,175,7198
ENST0000087485443,121,151–43,176,2487

顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZBTB35 是一種轉錄因子,來源指出它在免疫細胞發育中具有重要角色,尤其與 T 細胞成熟及早期 B 細胞分化有關。這些免疫發育功能是依序列相似性推定,並非此處來源所述的直接實驗結論。

除免疫細胞發育外,ZBTB35 也被描述為參與胚胎發育與器官形成,並與維持成人中樞神經系統的正常功能有關。這些角色同樣標註為依序列相似性推定;來源未進一步說明其作用的細胞類型、發育階段或分子機制,因此不宜將其解讀為已確立的直接調控路徑。

在轉錄調控方面,ZBTB35 可能作為抑制因子,參與 ESR1/ER-alpha 訊號的調控。此作用以「可能參與」描述,表示其調控角色仍帶有不確定性。來源未提供抑制發生的具體方式,也未詳述其對相關生物過程或表型的影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43120914 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZBTB35 ENST00000682664 GRCh38 chr5:43119914-43121014 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTAATACAGATGGGGTCTCGCTATGTGCCCAGGCTGGCCTCAAACTCCTGGGCTGAACTCCTCCTCCCCA
ACTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTGAGCCACCGCGCCCGCCCACATCTCTTCTTACAGGT
CAACTGGCTTTCCTTGACACCCAGTTACTTCGTTCTTCAGGTGTTGCAAAACTCATCAGCAAGCACCTAG
GCAATTACTGTTCAAAATATCTATGCAGTCTACTAGACTTAAGATTCAGAAAGGCAGAAACCACATATAC
CTTGTTCACAGCTGGACTTCTCAGTGTCTAGTACTAGGATTCTCAATACATATCTGTTGAAGTTATGATG
ACATTATTACCATATAGCTATTTGAGTTCCTCCGTAATCCCAATTCTCAAGTTCTTTGAGAGAAAAAAAT
AAGTAAATCTCAATTATAGAATTATCCTCAAAATGTATTTATATATAATATTTCTTTGGAGGAATTAAGG
AAGCAGTCACATGCAGCTGACTGTGGGTCACTGGACTTTTTTTTTTTTTTGAGACGTTGTCTCGCTCTGT
CGCCCAGGCTGGAATGCAGTGGCACTACCTCAGCTCACTACAACCTCCACCTCCCCGCTTCAAGCTATTC
TCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCATTCCCGGCTAATTTTTGTATTT
TTAGTAGAGACGGGGTTTCGCCATGTTGCCCAGGCTGGTTTCGAACTCCTGACCTCATGTGCTCCACCCG
CCCAGGCCTCTCAAAGTGTTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCGCCGGCCTGGACTCTTTAAAGGAGTG
GGGAAGGCCTGCACTAACGGGATCCGGTGTAAATAATTCTGAGCAGCTCCAGGTCCTGAGCCCAGCAAGC
ACGTGCTGCGGCAGGGCGCGGGGAGGGCGCGCTTCGCGGAGGAAGATTCCGGGCGGCCCGAACGTGCTCG
CGCCCGTAGCTGCCGCTGCCGGGGCCGCGGCCGCCCGGGTGCCCAACCGAACGCACGTGCGCCAGCGGGG
CCCGAGCAGAAGGGGAGCCCCGGCTCTCACGAAGAAAATGGAGGGCGACCC
ZBTB35 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 5 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZNF131_2 ↗5:43,065,134正股43,065,085–43,065,144
ZNF131_4 ↗5:43,067,561正股43,067,512–43,067,571
ZNF131_1 ↗5:43,120,914正股43,120,865–43,120,924
ZNF131_3 ↗5:43,121,542正股43,121,493–43,121,552
ZNF131_6 ↗5:43,122,027正股43,121,978–43,122,037

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_5D5S3L · CTCF_binding_site · 43116311–43116332 · regulatory

ENSR5_9M553 · promoter · 43120424–43120924 · regulatory

ENSR5_C69JB · promoter · 43121018–43122049 · regulatory

ENSR5_5D5STZ · CTCF_binding_site · 43121146–43121167 · regulatory

· motif · 43116313–43116329 · motif

· motif · 43120607–43120618 · motif

· motif · 43120654–43120669 · motif

· motif · 43120659–43120671 · motif

· motif · 43120662–43120669 · motif

· motif · 43120662–43120677 · motif

· motif · 43120803–43120816 · motif

· motif · 43120821–43120830 · motif

· motif · 43120821–43120830 · motif

· motif · 43120821–43120830 · motif

· motif · 43120821–43120830 · motif

· motif · 43120901–43120915 · motif

· motif · 43120945–43120954 · motif

· motif · 43120945–43120954 · motif

· motif · 43121016–43121029 · motif

· motif · 43121021–43121033 · motif

· motif · 43121023–43121030 · motif

· motif · 43121148–43121164 · motif

· motif · 43121272–43121285 · motif

· motif · 43121279–43121292 · motif

· motif · 43121379–43121401 · motif

· motif · 43121379–43121401 · motif

· motif · 43121537–43121548 · motif

· motif · 43123090–43123103 · motif

· motif · 43123090–43123103 · motif

· motif · 43124112–43124125 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:623 aa

1 aa623 aa結構域功能區域基序鋅指
依 P52739 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZBTB35 蛋白質長 623 個胺基酸,含有位於第 34–98 位的 BTB 結構域,以及六個 C2H2 型鋅指,其中第四個被註記為退化型。第 573–623 位為無序區域;另有兩個核定位訊號,分別位於第 137–148 位與第 317–328 位。

結構域BTB34–98 aa
鋅指C2H2-type 1261–283 aa
鋅指C2H2-type 2288–311 aa
鋅指C2H2-type 3328–350 aa
鋅指C2H2-type 4; degenerate356–381 aa
鋅指C2H2-type 5392–414 aa
鋅指C2H2-type 6420–443 aa
功能區域Disordered573–623 aa
基序Nuclear localization signal 1137–148 aa
基序Nuclear localization signal 2317–328 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P52739…

AlphaFold · P52739

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

來源指出,SUMO 化不影響其核定位;資料未描述此定位變化所需的其他條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ZBTB35ZBTB35FHL2FHL5MORN4PIP4K2BVHL
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZBTB35 與 ZBTB33 互相作用;來源指出,此互作會調節兩種蛋白質的轉錄活性,但未進一步說明其形成複合體的情形或調節方向。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZBTB35 是轉錄因子,依序列相似性推定參與免疫細胞發育,特別是 T 細胞成熟與早期 B 細胞分化;也依序列相似性推定參與胚胎發育、器官形成及成人中樞神經系統正常功能維持。此外,它可能作為抑制因子參與 ESR1/ER-alpha 訊號的轉錄調控。含實驗來源
證據與來源

Transcription factor that plays a key role in immune cell development, particularly in T-cell maturation and early B-cell differentiation (By similarity). It also contributes to embryonic development and organogenesis, and is involved in maintaining normal function of the adult central nervous system (By similarity). May be involved in transcriptional regulation as a repressor of ESR1/ER-alpha signaling

PMID 18847501 ↗ · PMID 22467880 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZBTB35 與 ZBTB33 互相作用;此互作會調節兩種蛋白質的轉錄活性。來源未指出調節方向或具體作用方式。推論支持
證據與來源

Interacts with ZBTB33; this interaction modulates transcriptional activity of both proteins

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZBTB35 位於細胞核;SUMO 化不會影響其核定位。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Sumoylation does not affect nuclear localization

PMID 17306895 ↗ · PMID 22467880 ↗ · PMID 23404503 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000682664 · 3,286 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGGGCCGCGGCCGCCCGGGTGCCCAACCGAACGCACGTGC40
41GCCAGCGGGGCCCGAGCAGAAGGGGAGCCCCGGCTCTCAC80
81GAAGAAAATGGAGGGCGACCCACGGGTTAGGGGTCAGGAA120
121AGGCGTGGGGCGCATTATGCCCTGGGAGGGGAAAGCACGG160
161AACAAGAGGCTCTGAGGGACGGAGAGGAAGGAGGGCGACC200
201CACGAGCTAGAGCAGCCCGACGGCCATGGAGGCTGAAGAG240
241ACGATGGAATGCCTTCAGGAGTTCCCTGAACATCATAAAA280
281TGATCCTCGACCGATTGAATGAACAGCGAGAGCAGGACCG320
321GTTTACTGACATCACCCTAATTGTCGACGGACACCATTTT360
361AAGGCTCACAAGGCTGTTTTGGCTGCTTGTAGTAAGTTCT400
401TCTACAAATTCTTTCAGGAGTTTACCCAAGAACCATTGGT440
441GGAGATAGAAGGTGTTAGTAAAATGGCCTTTCGCCATTTA480
481ATTGAGTTCACATATACAGCAAAATTAATGATACAAGGAG520
521AAGAAGAAGCCAATGATGTATGGAAAGCAGCAGAGTTTCT560
561ACAAATGCTAGAAGCTATCAAAGCCCTTGAAGTCAGGAAC600
601AAAGAAAACTCAGCTCCCTTAGAGGAAAATACCACAGGAA640
641AAAATGAGGCCAAAAAAAGGAAGATTGCAGAAACTTCAAA680
681TGTTATCACTGAGTCATTGCCATCTGCAGAATCAGAACCT720
721GTTGAAATTGAGGTAGAGATTGCCGAAGGCACCATTGAAG760
761TGGAAGATGAAGGCATCGAAACATTAGAGGAAGTGGCTTC800
801TGCCAAGCAGTCCGTAAAGTACATACAGAGCACAGGTTCC840
841TCTGATGATTCTGCTCTAGCACTGTTGGCAGATATTACCA880
881GCAAGTACCGTCAAGGTGACAGAAAAGGGCAGATTAAAGA920
921AGATGGCTGTCCATCTGACCCCACGAGCAAACAGGTAGAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。