基因總覽
ZBTB25 的正式名稱為 zinc finger and BTB domain containing 25,屬於蛋白質編碼基因。其產物名稱為 Zinc finger and BTB domain-containing protein 25,資料所列的可能角色與轉錄調控有關;現有資訊未進一步說明其調控對象或作用方式。蛋白質序列含有 BTB domain 及兩個 C2H2 型鋅指區域,構成其名稱所反映的結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000608382 ★ | 64,478,051–64,503,838 | 3 |
| ENST00001113207 | 64,430,818–64,504,006 | 3 |
| ENST00001095149 | 64,448,802–64,504,006 | 3 |
| ENST00000555220 | 64,449,106–64,505,213 | 3 |
| ENST00000555424 | 64,449,330–64,490,533 | 3 |
| ENST00001126620 | 64,449,332–64,503,642 | 3 |
| ENST00001131162 | 64,455,674–64,504,006 | 3 |
| ENST00001138117 | 64,478,051–64,504,006 | 3 |
| ENST00000957083 | 64,484,015–64,504,006 | 4 |
| ENST00000957091 | 64,485,491–64,500,454 | 3 |
| ENST00000922501 | 64,485,495–64,505,213 | 3 |
| ENST00000922510 | 64,485,495–64,495,974 | 3 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZBTB25 的蛋白質產物可能參與轉錄調控。現有資料僅指出這項可能性,未說明其調控的基因或轉錄過程,也未提供可據以判定具體作用方式的細節,因此不能進一步界定其在轉錄調控中的角色。
Promoter 與基因調控
>ZBTB25 ENST00000608382 GRCh38 chr14:64503738-64504838 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCGCGGCGCTCGGCGCTCGGGCTGGGCTGCGCGGAGAGGCTCTGGCTCTGCCAGGGACTGTGCTGCAACA AAGGACTTCCGCTGCCGCACAGCCGCGCCTGCCGCACCGCACTGAGCCGGCCCCGCTTACGCGGCGACTC CGGGTCTGCCCACCAGTTCGCTGCGGCGTCCGCCAGCCTTCCCCTCCCTCTCGCCCGCCCACCCACTCTG CCGCTGGCTGCTAGGGGCACCCGCGGTCGCCTGTTTGTTGCAACAAGTTTCTGCGTCGAGCTCCGAGGAG GCTGGCGCAACCCGCACCGCGGGGGCCGTCGCGGCGGCGGCGGCTTGACCACCCCTCTTGCCCCTCTCAA GGGTAGGCTTGGGACCTCCTCCTCCTCCTGTTTGCACAGCTGGATGGAACTGGGCTCCTCCCGACTCCCC AGGGCAGGATGCGAGGCTGCTTTCCCACTCCGTCCAGATGTCAGACCCCTGCCCGTTGGGCCCAGCAGCT GGGCCGTCACTCGCGGTCCGCCTCGAGTGCTCCGGCAACCTCGCCCTGCCCCGTCGGTTCAGGGTCGCCC AGTCCCCGCGCCCCCCCGACCCCACCTTCCGTGGGCCTGCTGCCTCTGGCCCTGAGTCACTTCCCCCGCC ATGCCCCACCTCGCCCAGTCCGCCTCTCCACCCAGGCTCCCGCGGCTCGGCCTCCCTGGCCCCGCGCCCT CATCCCTTCCCCAGCGAACACGCGGGCGCATCCTTCCCCACCCCCACCTTCACCCCAGAACTGAGGGGGT GCCTGTGCTTTTGCACACCCTGGGGAAAGTCCCCGGGTCACGCGGTTGTTTGTGGGGAGCCTGTGACGCT CAGGCTTGTCCCTATGCTTCCGCCTACAGAGTCACAACTGCGAACTGTGGCGGCGGCACTCAGAGCGCGG GCCGACCCCCGCCCGGCCACTGAGGCGGGCGGGCGGGAGGGCGCGCACGTACGCACGCACGCACGCACGC ACACCCCGGCCCTGGCGCCCCTCTTTCCCCTGCTACCAGACACGCGGTCACGTGGGGCCATCGCGGGCTG CCGGCGCGGGAAGCCGCGCGAGAGGCGGCCGAGGGGTGCGTGAGCCGGCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZBTB25_2 ↗ | 14:64,503,616 | 負股 | 64,503,606–64,503,665 |
| ZBTB25_1 ↗ | 14:64,503,821 | 負股 | 64,503,811–64,503,870 |
| ZBTB25_3 ↗ | 14:64,505,204 | 負股 | 64,505,194–64,505,253 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR14_5K6M5W · CTCF_binding_site · 64502757–64502778 · regulatory
ENSR14_83W7JM · promoter · 64503828–64503995 · regulatory
ENSR14_BGRM8 · promoter · 64504084–64504780 · regulatory
ENSR14_9XL9M · enhancer · 64504781–64505202 · regulatory
ENSR14_9XL9Q · promoter · 64505203–64505703 · regulatory
ENSR14_BGRML · enhancer · 64506548–64507249 · regulatory
ENSR14_9XLBD · enhancer · 64507427–64507795 · regulatory
ENSR14_9XLBM · enhancer · 64508313–64508696 · regulatory
· motif · 64500580–64500592 · motif
· motif · 64500582–64500589 · motif
· motif · 64500582–64500595 · motif
· motif · 64500781–64500793 · motif
· motif · 64500833–64500845 · motif
· motif · 64500835–64500842 · motif
· motif · 64500835–64500850 · motif
· motif · 64501531–64501546 · motif
· motif · 64501717–64501726 · motif
· motif · 64502759–64502775 · motif
· motif · 64502945–64502958 · motif
· motif · 64502945–64502958 · motif
· motif · 64502972–64502985 · motif
· motif · 64502972–64502985 · motif
· motif · 64503213–64503229 · motif
· motif · 64503213–64503229 · motif
· motif · 64503716–64503731 · motif
· motif · 64503794–64503810 · motif
· motif · 64503794–64503810 · motif
· motif · 64503803–64503812 · motif
· motif · 64503803–64503812 · motif
· motif · 64503973–64503984 · motif
· motif · 64503973–64503984 · motif
· motif · 64504021–64504038 · motif
· motif · 64504041–64504054 · motif
· motif · 64504041–64504054 · motif
· motif · 64504050–64504065 · motif
· motif · 64504120–64504133 · motif
· motif · 64504219–64504227 · motif
· motif · 64504256–64504271 · motif
· motif · 64504412–64504425 · motif
· motif · 64504518–64504531 · motif
· motif · 64504530–64504543 · motif
· motif · 64504628–64504641 · motif
· motif · 64504632–64504645 · motif
· motif · 64504710–64504723 · motif
· motif · 64504756–64504765 · motif
· motif · 64504929–64504943 · motif
· motif · 64504973–64504982 · motif
· motif · 64505476–64505489 · motif
· motif · 64506934–64506947 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:435 aa
ZBTB25 蛋白質長 435 個胺基酸。其 N 端第 1–107 個胺基酸區段註記為 BTB domain;另有兩個 C2H2 型鋅指區域,分別位於第 238–260 與第 349–371 個胺基酸。這些區域依序列特徵註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZBTB25 蛋白質的定位資料列為細胞核。 來源未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 26 個夥伴
- APIPQ96GX9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRACR2BQ8N4Y2-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT3P35638-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSBP1O75506 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTRA2O43464 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JPH3Q8WXH2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCTD1Q719H9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCTD9Q7L273 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP17-1Q9BYP8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LZTS2Q9BRK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PNMA5Q96PV4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- SEPHS1P49903 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TARDBPQ13148 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBC1D5Q92609 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TNIP1Q15025 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TRAF2Q12933 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- TRAF6Q9Y4K3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TSSK3Q96PN8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VCPP55072 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VMACQ2NL98 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZBTB1Q9Y2K1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTCTTTCCCCTGCTACCAGACACGCGGTCACGTGGGGCCA40TCGCGGGCTGCCGGCGCGGGAAGCCGCGCGAGAGGCGGCC80GAGGGGTGCGTGAGCCGGCGCCACTGCTTGCAGTGCGCGG120CTTGGGAGCCCGCCCCTCCTGCACGGAGGAGTCGGCCTGC160CGCCGCGGCGGCATCTGGAACCACAATGGACACTGCCAGC200CATAGCCTTGTTCTTCTCCAGCAGCTGAACATGCAGCGAG240AATTTGGTTTTCTGTGTGATTGCACAGTTGCAATTGGAGA280TGTTTACTTCAAAGCCCACAGAGCAGTGCTTGCTGCTTTT320TCTAACTATTTCAAGATGATATTTATTCACCAAACAAGTG360AATGCATAAAAATACAACCAACTGACATCCAACCTGACAT400ATTCAGCTATTTGTTGCACATTATGTACACGGGGAAAGGG440CCAAAACAGATTGTGGATCATAGTCGTTTGGAGGAAGGGA480TTCGATTTCTTCACGCCGACTACCTTTCTCACATTGCAAC520TGAAATGAATCAAGTGTTCTCACCAGAGACTGTGCAGTCC560TCAAATTTATATGGCATTCAGATCTCAACAACCCAAAAAA600CAGTTGTCAAACAAGGACTGGAGGTCAAAGAAGCTCCTTC640CAGTAACAGTGGAAACAGAGCTGCTGTCCAGGGTGACCAC680CCCCAGTTGCAGTTGTCTCTTGCTATTGGTCTGGATGATG720GCACTGCAGACCAGCAGAGGGCCTGTCCTGCCACCCAGGC760CCTGGAGGAGCACCAGAAGCCCCCAGTTTCCATCAAGCAG800GAGAGATGTGACCCAGAATCTGTGATCTCCCAGAGCCACC840CCTCACCCTCATCAGAGGTGACAGGCCCCACTTTTACTGA880AAACAGTGTCAAAATACACTTATGCCATTACTGTGGGGAA920CGTTTTGATTCCCGTAGTAACCTAAGGCAACATCTCCATA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。