基因總覽
ZBTB22(zinc finger and BTB domain containing 22)是蛋白質編碼基因,其產物為 Zinc finger and BTB domain-containing protein 22。此蛋白質屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family,具有 BTB 結構域及多個鋅指區域,並包含數段被註解為無序的區域。這些結構特色構成其蛋白質基本輪廓;其可能的生物學角色與功能證據仍須依現有資料審慎描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000431845 ★ | 33,314,418–33,317,744 | 2 |
| ENST00000441117 | 33,314,406–33,318,021 | 2 |
| ENST00000898257 | 33,314,406–33,317,752 | 2 |
| ENST00000913338 | 33,314,406–33,317,432 | 2 |
| ENST00001138203 | 33,314,406–33,317,752 | 2 |
| ENST00000898258 | 33,314,419–33,317,752 | 2 |
| ENST00000913337 | 33,314,419–33,318,021 | 2 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZBTB22 的功能資料指出,它可能參與轉錄調控。這項描述表達的是可能性,並未提供足以判定其作用方向、調控對象或具體分子步驟的資訊,因此不宜將其解讀為已確認的轉錄活化或抑制作用。
現有資料也沒有說明 ZBTB22 如何影響轉錄、是否直接與 DNA 結合,或是否透過其他分子執行調控;同樣未提供相關基因、細胞過程或實驗條件。因此,目前可支持的功能性結論僅限於它可能參與轉錄調控,不能據此延伸出特定機制或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>ZBTB22 ENST00000431845 GRCh38 chr6:33317644-33318744 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGCTGCCTCCCCTTCTCCCTGCCTCCAGAATGTTCTGGGATAACATTTGGAGGAAGGTGGGAAGCAGATG ACTGAGGAAGGGATGGACTAAGCTAATCCCCTTTTGGTGGTGTTTCTTTAAAAAAAAAAAAAAGCTTAAG TTTTACACAGAAACATTAATAAACAATAAAGTTCTTTTCTTACTGTATCACTGTCTTTTTCTTGTCCTTC TACTGTTACAGATTGGCATTAGCTGTCCCCTTGCTCAGGGTTAGCCCAGTATCCCCGGGGTAGTCCCGCT CTGTCCTTTCTAGCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTCTCGCTGTGTCGCCCAGGCCAGGGT GCAGTGGTGAGATCACAGCTCACTGCAGCCTGGACCTCCCAGTCTCAAGCGATAATGCCTCAGCCTCCCG AGTAGCCGGGACTACAGGCGCGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTTTTTGTTGTTTGTATTTTTTGT AGAGACGGGGTTTCGCCACGTTGTTCAGGCAGTACTTTTTTTTTTTTTTAAGTGCTTCAGCCGCCTTAAC GCACTTTACTTTTTCACTTCGTGCAGTAGGAGTGAGAAAGCCAATGAGGGGCCGACTCAAGGTTATTTAG CCAATCCAGGCCCGGAGAAAGGGGGCGGGGCTTCAGTGGGACTGTAAGGAGCTAGGAAGAGGGCGATTAG ATCCCACCAACCAGCTAATGGTCACAGCTCAGAGGCGGAGCCTGGGGAACGATACCTGGACCCATCGCCA ATGGGAAAAGGCAGGCTTATAGCTTTAAAGGGGAATAAATGCTTCGGCCGAACCAAGTCCTGAGCTCCCA GCGGAGGAGGGGACCTGATCTTTTAAGGTGGAATGTGGCGATGTTTCTTTAAAGGCAAAGTGGCCGAGTC GGCCGAGTATTGCCCAGCGGCACGGGCGGGGTGCCCGGCTGTGCCTTTAAAGGCGGAGGGGCGGGAGGCG GAGCGGAGGCGGAGGGCGGAGGGAGTCGGCGCAAGATGGCGGCGGGAGGGGCCCAGGTTGCTGCTCTGGC CGCCGAGTGAGGGGCGGGGGGGGCCCGGGGGCGCGCGGCCCGGTAAGCGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZBTB22_1 ↗ | 6:33,317,744 | 負股 | 33,317,734–33,317,793 |
| ZBTB22_2 ↗ | 6:33,318,046 | 負股 | 33,318,036–33,318,095 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_B8LHH · enhancer · 33312134–33312798 · regulatory
ENSR6_9H827 · promoter · 33312799–33313299 · regulatory
ENSR6_B8LHQ · promoter · 33313746–33314757 · regulatory
ENSR6_59SKGC · CTCF_binding_site · 33315041–33315062 · regulatory
ENSR6_59SKTG · CTCF_binding_site · 33317444–33317465 · regulatory
ENSR6_59SKWQ · CTCF_binding_site · 33317720–33317741 · regulatory
ENSR6_B8LJB · promoter · 33317734–33318431 · regulatory
· motif · 33313005–33313025 · motif
· motif · 33313096–33313116 · motif
· motif · 33313603–33313618 · motif
· motif · 33313677–33313690 · motif
· motif · 33313677–33313690 · motif
· motif · 33313737–33313754 · motif
· motif · 33314073–33314086 · motif
· motif · 33314294–33314307 · motif
· motif · 33314496–33314509 · motif
· motif · 33314531–33314542 · motif
· motif · 33314679–33314691 · motif
· motif · 33314682–33314689 · motif
· motif · 33314683–33314696 · motif
· motif · 33314686–33314698 · motif
· motif · 33314689–33314704 · motif
· motif · 33314716–33314729 · motif
· motif · 33314816–33314827 · motif
· motif · 33314922–33314937 · motif
· motif · 33315043–33315059 · motif
· motif · 33315166–33315179 · motif
· motif · 33315166–33315179 · motif
· motif · 33315719–33315727 · motif
· motif · 33317446–33317462 · motif
· motif · 33317565–33317578 · motif
· motif · 33317569–33317582 · motif
· motif · 33317612–33317623 · motif
· motif · 33317638–33317651 · motif
· motif · 33317671–33317684 · motif
· motif · 33317713–33317723 · motif
· motif · 33317721–33317731 · motif
· motif · 33317722–33317738 · motif
· motif · 33317752–33317765 · motif
· motif · 33317768–33317778 · motif
· motif · 33317777–33317787 · motif
· motif · 33317892–33317902 · motif
· motif · 33318084–33318094 · motif
· motif · 33318146–33318168 · motif
· motif · 33318146–33318168 · motif
· motif · 33318376–33318391 · motif
· motif · 33318881–33318892 · motif
· motif · 33322216–33322225 · motif
· motif · 33322224–33322244 · motif
· motif · 33322238–33322249 · motif
· motif · 33322693–33322704 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:634 aa
ZBTB22 蛋白質長 634 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其 BTB 結構域位於第 57–121 個胺基酸;另有三個 C2H2 型鋅指,分別位於第 486–507、513–535 與 541–562 個胺基酸,其中第一個註記為 atypical。第 167–247、308–461 及 568–634 個胺基酸區段被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
ZBTB22 蛋白質的細胞內定位註記為細胞核。 現有資料未提供定位改變的條件或不同異構型之間的差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- CCDC13Q8IYE1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FXR2P51116 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GABARAPL1Q9H0R8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- GAS8O95995 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MCRS1Q96EZ8 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MEMO1Q9Y316 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MLLT6Q6P2C6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PIN1Q13526 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RBM39Q14498-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCEA2Q15560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VAPAQ9P0L0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VAPBO95292 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- A8KA83A8KA83 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GGGAGTCGGCGCAAGATGGCGGCGGGAGGGGCCCAGGTTG40CTGCTCTGGCCGCCGAGTGAGGGGCGGGGGGGGCCCGGGG80GCGCGCGGCCCGAGACCCCCCCGGCCGCCCTCCTCCTTTC120TTTGTTCCTGTGGCTGGGGGGGTATCCCCTCCCTCCACAA160CATGGAGCCATCTCCTCTGTCTCCCAGTGGGGCAGCACTT200CCCCTGCCGCTGTCGCTGGCTCCGCCCCCACTACCCCTGC240CAGCAGCTGCAGTGGTACATGTGTCCTTCCCTGAGGTGAC280CAGTGCCCTCTTGGAGTCCCTCAATCAGCAGCGTCTGCAG320GGCCAGCTCTGCGATGTATCTATCAGAGTGCAGGGCCGGG360AGTTCCGGGCTCATCGGGCTGTCCTGGCTGCCTCCTCCCC400TTACTTCCATGATCAGGTCCTACTCAAAGGCATGACCTCC440ATCTCGCTGCCCAGTGTCATGGACCCAGGCGCCTTTGAGA480CTGTCCTAGCCTCCGCTTACACTGGCCGCCTCAGCATGGC520TGCTGCTGACATTGTCAACTTCCTTACAGTGGGGTCTGTG560CTCCAAATGTGGCACATTGTGGACAAGTGCACTGAACTAC600TCCGAGAAGGCCGGGCCTCAGCTACCACCACCATCACTAC640TGCTGCAGCCACCTCTGTCACTGTCCCTGGTGCTGGGGTG680CCATCCGGGAGTGGGGGCACTGTGGCCCCTGCTACCATGG720GCTCTGCGCGCTCCCATGCCTCCAGCCGGGCCAGTGAGAA760TCAATCTCCCAGCAGCAGCAACTACTTCAGCCCCAGGGAG800TCCACTGATTTCTCATCTTCCTCCCAAGAGGCATTTGCAG840CTTCTGCAGTGGGCAGTGGGGAGCGTCGAGGAGGTGGCCC880TGTATTCCCAGCCCCTGTCGTTGGCAGTGGAGGGGCCACA920TCTGGAAAGCTGCTGCTGGAGGCAGATGAGCTGTGCGATG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。