演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZBTB21KIAA1227

zinc finger and BTB domain containing 21

ZBTB21 是一種具轉錄抑制作用的蛋白質,屬於含鋅指與 BTB 結構域的蛋白質;其蛋白質結構包含多個 C2H2 型鋅指。

Homo sapiens21q22.3UniProt Q9ULJ3
OFFICIAL SYMBOL
ZBTB21
CHROMOSOME
21
UNIPROT
Q9ULJ3
PDB / ALPHAFOLD
1WJP
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

zinc finger and BTB domain containing 21(ZBTB21)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,基因位於第 21 號染色體。其蛋白質全長 1,066 個胺基酸,名稱所指的兩類結構特徵為 BTB 結構域與鋅指;序列註解列出八個 C2H2 型鋅指,其中兩個標示為非典型。這些結構特徵構成 ZBTB21 的基本分子特性;現有資料另將其主要角色描述為轉錄抑制因子。

Official symbol
ZBTB21
Gene name
zinc finger and BTB domain containing 21
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13083
UniProt
Q9ULJ3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
KIAA1227ZNF295

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.3
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegZBTB21pq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:41,986,293–42,010,387
Gene span
24,095 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000310826 ★41,986,831–42,010,3603
ENST0000039849941,986,293–42,010,3874
ENST0000039851141,986,293–42,010,3872
ENST0000088181541,986,293–42,003,5472
ENST0000093283541,986,293–42,009,9705
ENST0000113147041,986,293–42,010,3873
ENST0000039850541,986,831–42,010,3874
ENST0000042552141,993,740–42,008,0572
ENST0000044994941,993,948–42,010,3574
ENST0000039849741,993,948–42,010,3664

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZBTB21 的已知功能描述為轉錄抑制因子,也就是能抑制轉錄的蛋白質。現有來源僅提供這項概括性功能,沒有進一步說明它所調控的基因、辨識的 DNA 序列,或抑制轉錄所需的分子步驟,因此不宜據此推定特定標的或調控途徑。

資料亦未提供 ZBTB21 在不同細胞或生理條件下的功能差異,也未描述轉錄抑制作用對特定生物學過程的影響。因而目前可確定的功能範圍限於其具有轉錄抑制作用,尚無足夠資訊延伸說明其下游結果或生物學意義。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42010360 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZBTB21 ENST00000310826 GRCh38 chr21:42010260-42011360 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CGCGGAGGGCTCCCTTGAGCGGTCTCCGCCAGCGAGGCTTTCCTCCCGGTCGGTGTTGACAGTGTGGCAT
TTCTGTTATCTAATTTCTGGTTTTGACTGAAAGCGAAGTGAGTTTTCTCATCAGTGGAGTTGTAATATTT
CTGCAAAAAAAAAAAAGATCACAGCCCTCCGATGAGCCGGGCACTATGCGAAGTCTCCGGCTGCCTGCGG
GCCGCTGTGGACGCCCCGGCGGGGGTCAGGACCGACCCCCATCTGCGCGGCGAACGAGCCCGGACGCCCT
GGCCGCGGCCGCCGGGTCCCCGCCCAGGGGCCAGGTGGCCAGGTTGCGTCGGGAGGAGGAAATGGAAGCG
CTCTGAGCGACTAGCGAGCGGCAGGAGCCGCCTCCCGCGGGCTTTCCTCGCGGGCCGGGAGCGTCTGCCG
CCGACCCGAGGACCGCAGGGCCCCGCTCGCCGCCCGCGCCCGTCAGAAAGCCGCGCGTCGCTCCCGTCGC
TGTCGGGGTCGTCGGCTCGGGGAGTCGCCCGCCGTCCACCGGTGAACGGGAGCGCGTCCTCCCCTCCGAG
GGACTAAGCGCTCGCGCCACGCATCCCGCCGCGCCGGAAGCGGGGACTACTGGCGGCCCAGCTGGGCAGG
ACCGCGGCCGAATGACCCGGGGCGACCCCGCAGCAAGGGCGCCTCCGGCAGGCGGCAAAGTCCCCTGAGA
ATCGGCGCGCTCCTCGCCGCGACGGACTCCACCCGGCCGGGGCGCTCAGCCTCCTCGCCGTGGCCCCCAG
CCCGGCCGCCTCCCCTAACGGCCGCCGCAGGCTCCCCTCATGGACCGAGAGCGCGGGCTTGCAGCGCGGC
AGCGTCCGTTCGGCGCGCGGCTCCGGGCAGGCCCGCCCTCCCCCGTCCCCCTGCGCCGCGAGGCCCCCCC
CCCGCCCCGCCCTCCGGCGCCCGGCGCCCAATCAGAGTGCCGCGCACGTGACGAGCGATGCCTGCGATGA
CCTCATCCCTGGTGTGGGATGACGTCAAATTCAAGATGGATGGAATCACAGCGGCAGCGGCGGCTGCGGC
GCGCGCGAGCCGAGTGTGAGCGGAAAGGGGCCCGGCGTCTGCCTCGAGACT
ZBTB21 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZBTB21_1 ↗21:42,010,354負股42,010,344–42,010,403

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_BBC4P · promoter · 42008690–42009504 · regulatory

ENSR21_BBC4S · enhancer · 42009505–42010346 · regulatory

ENSR21_5CTR9L · CTCF_binding_site · 42009531–42009552 · regulatory

ENSR21_BBC4W · promoter · 42010347–42010877 · regulatory

ENSR21_5CTRGW · CTCF_binding_site · 42010670–42010691 · regulatory

· motif · 42007681–42007694 · motif

· motif · 42007681–42007694 · motif

· motif · 42008771–42008783 · motif

· motif · 42009036–42009051 · motif

· motif · 42009149–42009164 · motif

· motif · 42009150–42009165 · motif

· motif · 42009254–42009269 · motif

· motif · 42009254–42009271 · motif

· motif · 42009293–42009306 · motif

· motif · 42009293–42009308 · motif

· motif · 42009439–42009454 · motif

· motif · 42009533–42009549 · motif

· motif · 42009683–42009699 · motif

· motif · 42009755–42009772 · motif

· motif · 42009759–42009768 · motif

· motif · 42009886–42009902 · motif

· motif · 42009886–42009902 · motif

· motif · 42009973–42009984 · motif

· motif · 42009973–42009984 · motif

· motif · 42009979–42009990 · motif

· motif · 42009979–42009990 · motif

· motif · 42010014–42010025 · motif

· motif · 42010014–42010025 · motif

· motif · 42010086–42010097 · motif

· motif · 42010086–42010097 · motif

· motif · 42010109–42010124 · motif

· motif · 42010156–42010169 · motif

· motif · 42010156–42010169 · motif

· motif · 42010174–42010189 · motif

· motif · 42010351–42010364 · motif

· motif · 42010351–42010364 · motif

· motif · 42010373–42010386 · motif

· motif · 42010373–42010386 · motif

· motif · 42010377–42010384 · motif

· motif · 42010399–42010408 · motif

· motif · 42010399–42010408 · motif

· motif · 42010401–42010417 · motif

· motif · 42010401–42010417 · motif

· motif · 42010659–42010672 · motif

· motif · 42010659–42010672 · motif

· motif · 42010672–42010688 · motif

· motif · 42010759–42010768 · motif

· motif · 42011122–42011129 · motif

· motif · 42012159–42012171 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1066 aa

1 aa1066 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9ULJ3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZBTB21 蛋白質長 1,066 個胺基酸;N 端第 30–96 位含 BTB 結構域,並註記此區域介導同源二聚化。序列另含八個 C2H2 型鋅指,其中第 748–770 位與第 909–932 位標為非典型。資料也註記多段預測為無序區域,分布於蛋白質序列中。

結構域BTB30–96 aa
鋅指C2H2-type 1546–569 aa
鋅指C2H2-type 2575–598 aa
鋅指C2H2-type 3670–692 aa
鋅指C2H2-type 4; atypical748–770 aa
鋅指C2H2-type 5775–798 aa
鋅指C2H2-type 6; atypical909–932 aa
鋅指C2H2-type 7937–959 aa
鋅指C2H2-type 81043–1065 aa
功能區域Mediates homodimerization30–96 aa
功能區域Disordered154–196 aa
功能區域Disordered388–442 aa
功能區域Disordered454–485 aa
功能區域Disordered498–525 aa
功能區域Disordered806–840 aa
功能區域Disordered879–906 aa
功能區域Disordered963–1014 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1WJP…

PDB · 1WJP

NMR · - · A=713-806

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

在 HEK293 細胞中,ZBTB21 與 ZBTB14 於細胞核共定位;此觀察描述的是兩者在該細胞系中的位置重合。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
KIAA1227ZBTB21ABTB1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZBTB21 可形成同源二聚體,且與 ZBTB14 有交互作用。資料未進一步界定 ZBTB21 與 ZBTB14 的交互作用是否構成特定複合體,也未說明其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZBTB21 具有轉錄抑制作用;現有敘述未指出其調控標的、作用條件或具體分子機制。含實驗來源
證據與來源

Acts as a transcription repressor

PMID 15629158 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZBTB21 可形成同源二聚體,並與 ZBTB14 交互作用;敘述未提供交互作用的條件或功能結果。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with ZBTB14

PMID 15629158 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZBTB21 位於細胞核,並在 HEK293 細胞中與 ZBTB14 於細胞核共定位;此定位描述限於該細胞系。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Colocalizes with ZBTB14 in nucleus in HEK293 cells

PMID 15629158 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000310826 · 7,452 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACGTCAAATTCAAGATGGATGGAATCACAGCGGCAGCGG40
41CGGCTGCGGCGCGCGCGAGCCGAGTGTGAGCGGAAAGGGG80
81CCCGGCGTCTGCCTCGAGACTGAAGACCGAAGACATGAAG120
121TAGAAACAATCCAGGAAGGCTTTGGGAAGCTATTTGTGTG160
161CGAGGATCAAAGTGATAAACTCAAGCCATGGAGGGATTAC200
201TGCATTACATCAACCCTGCACACGCCATTTCTCTCCTAAG240
241TGCCCTGAATGAGGAGCGTCTCAAAGGACAGCTGTGTGAT280
281GTGCTGCTGATTGTTGGAGACCAAAAGTTCCGAGCTCATA320
321AAAACGTCTTGGCTGCCAGCAGCGAATACTTTCAGAGTTT360
361ATTCACAAATAAGGAAAATGAGTCACAAACTGTATTTCAG400
401CTTGACTTCTGTGAGCCAGATGCTTTTGATAATGTTTTAA440
441ACTACATTTATTCTTCCTCTCTATTTGTTGAGAAGAGCAG480
481CCTTGCTGCTGTGCAAGAACTTGGCTATAGTCTTGGGATT520
521TCCTTTCTGACTAACATCGTTTCTAAAACACCTCAAGCCC560
561CCTTTCCAACGTGTCCTAATAGAAAAAAAGTGTTTGTAGA600
601AGATGATGAAAACAGTTCTCAAAAGAGAAGTGTCATTGTT640
641TGTCAAAGTAGAAACGAAGCGCAAGGAAAAACTGTTAGTC680
681AAAATCAACCCGATGTAAGCCATACTTCCCGGCCCTCTCC720
721TAGCATTGCAGTCAAGGCCAATACCAATAAGCCACATGTC760
761CCAAAACCAATAGAACCACTTCATAATTTGTCATTAACTG800
801AAAAGAGTTGGCCGAAAGATAGTTCTGTGGTATATGCAAA840
841GTCTCTTGAGCATTCTGGATCTTTGGATGATCCTAATAGA880
881ATCAGTTTGGTGAAAAGAAATGCAGTGTTGCCTTCAAAGC920
921CTCTGCAAGACAGAGAAGCTATGGATGATAAACCAGGTGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。