基因總覽
zinc finger and BTB domain containing 21(ZBTB21)是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質,基因位於第 21 號染色體。其蛋白質全長 1,066 個胺基酸,名稱所指的兩類結構特徵為 BTB 結構域與鋅指;序列註解列出八個 C2H2 型鋅指,其中兩個標示為非典型。這些結構特徵構成 ZBTB21 的基本分子特性;現有資料另將其主要角色描述為轉錄抑制因子。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000310826 ★ | 41,986,831–42,010,360 | 3 |
| ENST00000398499 | 41,986,293–42,010,387 | 4 |
| ENST00000398511 | 41,986,293–42,010,387 | 2 |
| ENST00000881815 | 41,986,293–42,003,547 | 2 |
| ENST00000932835 | 41,986,293–42,009,970 | 5 |
| ENST00001131470 | 41,986,293–42,010,387 | 3 |
| ENST00000398505 | 41,986,831–42,010,387 | 4 |
| ENST00000425521 | 41,993,740–42,008,057 | 2 |
| ENST00000449949 | 41,993,948–42,010,357 | 4 |
| ENST00000398497 | 41,993,948–42,010,366 | 4 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZBTB21 的已知功能描述為轉錄抑制因子,也就是能抑制轉錄的蛋白質。現有來源僅提供這項概括性功能,沒有進一步說明它所調控的基因、辨識的 DNA 序列,或抑制轉錄所需的分子步驟,因此不宜據此推定特定標的或調控途徑。
資料亦未提供 ZBTB21 在不同細胞或生理條件下的功能差異,也未描述轉錄抑制作用對特定生物學過程的影響。因而目前可確定的功能範圍限於其具有轉錄抑制作用,尚無足夠資訊延伸說明其下游結果或生物學意義。
Promoter 與基因調控
>ZBTB21 ENST00000310826 GRCh38 chr21:42010260-42011360 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGCGGAGGGCTCCCTTGAGCGGTCTCCGCCAGCGAGGCTTTCCTCCCGGTCGGTGTTGACAGTGTGGCAT TTCTGTTATCTAATTTCTGGTTTTGACTGAAAGCGAAGTGAGTTTTCTCATCAGTGGAGTTGTAATATTT CTGCAAAAAAAAAAAAGATCACAGCCCTCCGATGAGCCGGGCACTATGCGAAGTCTCCGGCTGCCTGCGG GCCGCTGTGGACGCCCCGGCGGGGGTCAGGACCGACCCCCATCTGCGCGGCGAACGAGCCCGGACGCCCT GGCCGCGGCCGCCGGGTCCCCGCCCAGGGGCCAGGTGGCCAGGTTGCGTCGGGAGGAGGAAATGGAAGCG CTCTGAGCGACTAGCGAGCGGCAGGAGCCGCCTCCCGCGGGCTTTCCTCGCGGGCCGGGAGCGTCTGCCG CCGACCCGAGGACCGCAGGGCCCCGCTCGCCGCCCGCGCCCGTCAGAAAGCCGCGCGTCGCTCCCGTCGC TGTCGGGGTCGTCGGCTCGGGGAGTCGCCCGCCGTCCACCGGTGAACGGGAGCGCGTCCTCCCCTCCGAG GGACTAAGCGCTCGCGCCACGCATCCCGCCGCGCCGGAAGCGGGGACTACTGGCGGCCCAGCTGGGCAGG ACCGCGGCCGAATGACCCGGGGCGACCCCGCAGCAAGGGCGCCTCCGGCAGGCGGCAAAGTCCCCTGAGA ATCGGCGCGCTCCTCGCCGCGACGGACTCCACCCGGCCGGGGCGCTCAGCCTCCTCGCCGTGGCCCCCAG CCCGGCCGCCTCCCCTAACGGCCGCCGCAGGCTCCCCTCATGGACCGAGAGCGCGGGCTTGCAGCGCGGC AGCGTCCGTTCGGCGCGCGGCTCCGGGCAGGCCCGCCCTCCCCCGTCCCCCTGCGCCGCGAGGCCCCCCC CCCGCCCCGCCCTCCGGCGCCCGGCGCCCAATCAGAGTGCCGCGCACGTGACGAGCGATGCCTGCGATGA CCTCATCCCTGGTGTGGGATGACGTCAAATTCAAGATGGATGGAATCACAGCGGCAGCGGCGGCTGCGGC GCGCGCGAGCCGAGTGTGAGCGGAAAGGGGCCCGGCGTCTGCCTCGAGACT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZBTB21_1 ↗ | 21:42,010,354 | 負股 | 42,010,344–42,010,403 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR21_BBC4P · promoter · 42008690–42009504 · regulatory
ENSR21_BBC4S · enhancer · 42009505–42010346 · regulatory
ENSR21_5CTR9L · CTCF_binding_site · 42009531–42009552 · regulatory
ENSR21_BBC4W · promoter · 42010347–42010877 · regulatory
ENSR21_5CTRGW · CTCF_binding_site · 42010670–42010691 · regulatory
· motif · 42007681–42007694 · motif
· motif · 42007681–42007694 · motif
· motif · 42008771–42008783 · motif
· motif · 42009036–42009051 · motif
· motif · 42009149–42009164 · motif
· motif · 42009150–42009165 · motif
· motif · 42009254–42009269 · motif
· motif · 42009254–42009271 · motif
· motif · 42009293–42009306 · motif
· motif · 42009293–42009308 · motif
· motif · 42009439–42009454 · motif
· motif · 42009533–42009549 · motif
· motif · 42009683–42009699 · motif
· motif · 42009755–42009772 · motif
· motif · 42009759–42009768 · motif
· motif · 42009886–42009902 · motif
· motif · 42009886–42009902 · motif
· motif · 42009973–42009984 · motif
· motif · 42009973–42009984 · motif
· motif · 42009979–42009990 · motif
· motif · 42009979–42009990 · motif
· motif · 42010014–42010025 · motif
· motif · 42010014–42010025 · motif
· motif · 42010086–42010097 · motif
· motif · 42010086–42010097 · motif
· motif · 42010109–42010124 · motif
· motif · 42010156–42010169 · motif
· motif · 42010156–42010169 · motif
· motif · 42010174–42010189 · motif
· motif · 42010351–42010364 · motif
· motif · 42010351–42010364 · motif
· motif · 42010373–42010386 · motif
· motif · 42010373–42010386 · motif
· motif · 42010377–42010384 · motif
· motif · 42010399–42010408 · motif
· motif · 42010399–42010408 · motif
· motif · 42010401–42010417 · motif
· motif · 42010401–42010417 · motif
· motif · 42010659–42010672 · motif
· motif · 42010659–42010672 · motif
· motif · 42010672–42010688 · motif
· motif · 42010759–42010768 · motif
· motif · 42011122–42011129 · motif
· motif · 42012159–42012171 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1066 aa
ZBTB21 蛋白質長 1,066 個胺基酸;N 端第 30–96 位含 BTB 結構域,並註記此區域介導同源二聚化。序列另含八個 C2H2 型鋅指,其中第 748–770 位與第 909–932 位標為非典型。資料也註記多段預測為無序區域,分布於蛋白質序列中。
蛋白質三維結構
細胞內定位
在 HEK293 細胞中,ZBTB21 與 ZBTB14 於細胞核共定位;此觀察描述的是兩者在該細胞系中的位置重合。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- ABTB1Q969K4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
ZBTB21 可形成同源二聚體,且與 ZBTB14 有交互作用。資料未進一步界定 ZBTB21 與 ZBTB14 的交互作用是否構成特定複合體,也未說明其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZBTB21 具有轉錄抑制作用;現有敘述未指出其調控標的、作用條件或具體分子機制。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | ZBTB21 可形成同源二聚體,並與 ZBTB14 交互作用;敘述未提供交互作用的條件或功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | ZBTB21 位於細胞核,並在 HEK293 細胞中與 ZBTB14 於細胞核共定位;此定位描述限於該細胞系。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GACGTCAAATTCAAGATGGATGGAATCACAGCGGCAGCGG40CGGCTGCGGCGCGCGCGAGCCGAGTGTGAGCGGAAAGGGG80CCCGGCGTCTGCCTCGAGACTGAAGACCGAAGACATGAAG120TAGAAACAATCCAGGAAGGCTTTGGGAAGCTATTTGTGTG160CGAGGATCAAAGTGATAAACTCAAGCCATGGAGGGATTAC200TGCATTACATCAACCCTGCACACGCCATTTCTCTCCTAAG240TGCCCTGAATGAGGAGCGTCTCAAAGGACAGCTGTGTGAT280GTGCTGCTGATTGTTGGAGACCAAAAGTTCCGAGCTCATA320AAAACGTCTTGGCTGCCAGCAGCGAATACTTTCAGAGTTT360ATTCACAAATAAGGAAAATGAGTCACAAACTGTATTTCAG400CTTGACTTCTGTGAGCCAGATGCTTTTGATAATGTTTTAA440ACTACATTTATTCTTCCTCTCTATTTGTTGAGAAGAGCAG480CCTTGCTGCTGTGCAAGAACTTGGCTATAGTCTTGGGATT520TCCTTTCTGACTAACATCGTTTCTAAAACACCTCAAGCCC560CCTTTCCAACGTGTCCTAATAGAAAAAAAGTGTTTGTAGA600AGATGATGAAAACAGTTCTCAAAAGAGAAGTGTCATTGTT640TGTCAAAGTAGAAACGAAGCGCAAGGAAAAACTGTTAGTC680AAAATCAACCCGATGTAAGCCATACTTCCCGGCCCTCTCC720TAGCATTGCAGTCAAGGCCAATACCAATAAGCCACATGTC760CCAAAACCAATAGAACCACTTCATAATTTGTCATTAACTG800AAAAGAGTTGGCCGAAAGATAGTTCTGTGGTATATGCAAA840GTCTCTTGAGCATTCTGGATCTTTGGATGATCCTAATAGA880ATCAGTTTGGTGAAAAGAAATGCAGTGTTGCCTTCAAAGC920CTCTGCAAGACAGAGAAGCTATGGATGATAAACCAGGTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。