演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZBTB20ODA-8S

zinc finger and BTB domain containing 20

ZBTB20(zinc finger and BTB domain containing 20)是蛋白質編碼基因,其產物可能參與轉錄調控,並與造血、免疫反應及出生後肌肉生成相關。

Homo sapiens3q13.31UniProt Q9HC78
OFFICIAL SYMBOL
ZBTB20
CHROMOSOME
3
UNIPROT
Q9HC78
PDB / ALPHAFOLD
9JZT
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZBTB20(zinc finger and BTB domain containing 20)是位於人類第 3 號染色體的蛋白質編碼基因,產物為 Zinc finger and BTB domain-containing protein 20。其名稱反映蛋白質含有 BTB 結構域與鋅指結構;來源將其描述為可能具有轉錄因子功能。現有資料指出,ZBTB20與造血、腫瘤發生及免疫反應有關,也涉及出生後肌肉生成。關於後者及衛星細胞自我更新調控的敘述標示為相似性推論,應視為推測性功能,而非已確立的直接作用機制。

Official symbol
ZBTB20
Gene name
zinc finger and BTB domain containing 20
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13503
UniProt
Q9HC78
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
ODA-8SDKFZp566F123DPZFZNF288

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 33q13.31
chr3 · 198,295,559 bp · GRCh38chr3p26.3 · 1–2800000 · gpos50chr3p26.2 · 2800001–4000000 · gnegchr3p26.1 · 4000001–8100000 · gpos50chr3p25.3 · 8100001–11600000 · gnegchr3p25.2 · 11600001–13200000 · gpos25chr3p25.1 · 13200001–16300000 · gnegchr3p24.3 · 16300001–23800000 · gpos100chr3p24.2 · 23800001–26300000 · gnegchr3p24.1 · 26300001–30800000 · gpos75chr3p23 · 30800001–32000000 · gnegchr3p22.3 · 32000001–36400000 · gpos50chr3p22.2 · 36400001–39300000 · gnegchr3p22.1 · 39300001–43600000 · gpos75chr3p21.33 · 43600001–44100000 · gnegchr3p21.32 · 44100001–44200000 · gpos50chr3p21.31 · 44200001–50600000 · gnegchr3p21.2 · 50600001–52300000 · gpos25chr3p21.1 · 52300001–54400000 · gnegchr3p14.3 · 54400001–58600000 · gpos50chr3p14.2 · 58600001–63800000 · gnegchr3p14.1 · 63800001–69700000 · gpos50chr3p13 · 69700001–74100000 · gnegchr3p12.3 · 74100001–79800000 · gpos75chr3p12.2 · 79800001–83500000 · gnegchr3p12.1 · 83500001–87100000 · gpos75chr3p11.2 · 87100001–87800000 · gnegchr3p11.1 · 87800001–90900000 · acenchr3q11.1 · 90900001–94000000 · acenchr3q11.2 · 94000001–98600000 · gvarchr3q12.1 · 98600001–100300000 · gnegchr3q12.2 · 100300001–101200000 · gpos25chr3q12.3 · 101200001–103100000 · gnegchr3q13.11 · 103100001–106500000 · gpos75chr3q13.12 · 106500001–108200000 · gnegchr3q13.13 · 108200001–111600000 · gpos50chr3q13.2 · 111600001–113700000 · gnegchr3q13.31 · 113700001–117600000 · gpos75chr3q13.32 · 117600001–119300000 · gnegchr3q13.33 · 119300001–122200000 · gpos75chr3q21.1 · 122200001–124100000 · gnegchr3q21.2 · 124100001–126100000 · gpos25chr3q21.3 · 126100001–129500000 · gnegchr3q22.1 · 129500001–134000000 · gpos25chr3q22.2 · 134000001–136000000 · gnegchr3q22.3 · 136000001–139000000 · gpos25chr3q23 · 139000001–143100000 · gnegchr3q24 · 143100001–149200000 · gpos100chr3q25.1 · 149200001–152300000 · gnegchr3q25.2 · 152300001–155300000 · gpos50chr3q25.31 · 155300001–157300000 · gnegchr3q25.32 · 157300001–159300000 · gpos50chr3q25.33 · 159300001–161000000 · gnegchr3q26.1 · 161000001–167900000 · gpos100chr3q26.2 · 167900001–171200000 · gnegchr3q26.31 · 171200001–176000000 · gpos75chr3q26.32 · 176000001–179300000 · gnegchr3q26.33 · 179300001–183000000 · gpos75chr3q27.1 · 183000001–184800000 · gnegchr3q27.2 · 184800001–186300000 · gpos25chr3q27.3 · 186300001–188200000 · gnegchr3q28 · 188200001–192600000 · gpos75chr3q29 · 192600001–198295559 · gnegZBTB20pq1 bp198,295,559 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr3:114,314,500–115,147,356
Gene span
832,857 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000675478 ★114,314,500–115,147,28812
ENST00000357258114,314,500–115,147,27110
ENST00000704358114,314,500–115,147,35613
ENST00000462705114,314,500–115,071,37512
ENST00000481632114,314,500–114,624,2066
ENST00000471418114,314,500–114,759,2717
ENST00000474710114,314,500–115,147,35614
ENST00000464560114,314,500–114,758,9408
ENST00000676079114,314,500–114,625,0507
ENST00000895172114,314,500–115,147,35614
ENST00000895173114,314,500–115,147,35613
ENST00000895174114,314,500–115,147,35615

顯示 12/348 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZBTB20可能是一種轉錄因子,並可能參與造血、腫瘤發生及免疫反應。現有資料未進一步說明其調控的標的基因、分子機制或各過程中的具體作用,因此這些關聯不宜延伸解讀為已確認的調控路徑。

在出生後肌肉生成方面,資料指出ZBTB20具有作用;此外,它可能參與調節衛星細胞的自我更新。這項功能來自相似性推論,證據層級與直接實驗確認不同,故應保留「可能」的限定。依現有敘述,ZBTB20與肌肉生成及衛星細胞維持相關,但尚無足夠資訊界定它在細胞更新或肌肉形成中的具體步驟。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 115147288 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZBTB20 ENST00000675478 GRCh38 chr3:115147188-115148288 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CACTGGGGACCCGGTCTGGCAACCTGCGCCCCATTCCGCGGGAATCAAGCGTGACCCGGTGCGGCCTTGC
GCGCTGCCGCCAGCCAGACCCTCCCTCCGGCTTTCCCACCCACCGCCCGGGATCCAGCCTCCATCCCGCT
GCCTCAGCTGTCCAAGACAGCGACACCCCCCTCTCCGCTCCCGCGGCTCCCCCGGCGCAGCTCGCCGCGC
CAGACAGCGGGTAACCGCCGCCTCCGCTGGGGCATCCCGGCTCCACAGGCCCAGCGCGCTCCAGACACCT
GCCTCTCACTGGCCACCGCCGCTGCCCCTCACCCCGCAGCCCTCTCGGCAATTGGCCCCAGGCCGCCGCT
CGTCATCCTCAGCCTTCTCCTAGAGTACCGCCTCCGTCGCCGGGTCATTTAAGTTTATCACAAATAAATA
AATAAAGGAGGAAATAGAAATGCGTAGAAAGTAAAAGCAGTAGGGGGTGGGGGAGATGGGGCGTGGAGGA
AAAGGAGGGAGGAGCGGAGGAGTAAGCAACCTAACCTGATTGCGCCTGTGTCGACCAATCATGGCTCACT
CCAGTCCGGTCTGACGGGCTCCCTGAACCAATAGCCTTCCACCTCCCGGATCACTGAACAACGAGATACG
ATTGACCTTTTCAGAAAGGGTGAAGGTGCGGCGGGGGGAGGGGGTTGTGGGGGTGGGCGAAGTGGAAGGA
TTGTCCACCAATCGCCTGTTAATACTTCTCTGAGCGAAGTTTCCGCGTCCCAATGGATGTTTGAGATAGC
GGATTGGGCCTCTTTTAGCCCAATCGAAGGTGACAGAGATGAGGGAAGAGGAAGAAAGGGGCGGGGACGG
GGGGGCGGAGGGGAGAAGGAAGAGTGCATTTTGTTTATGGGCGGCAACCTCACGAGGGGCGTCCCATTCT
CATTGGCTCACTGAAGCCAAGATTGGCGTGAGAGCTATCCTATAGCGGGGAGAGATAGAGGGTTCGCGGA
GTGAAGCGTCCAATGTGGGCCTTCTGCCGAAGAAGTAGGGGCGGGGGGAAGTTTAGGAGTTGAGGAAAGA
AGATTAAAGAGCGCGAGGAGGTAATGCCACAAACTCTAATTTGTTGTGGGA
ZBTB20 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 6 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZBTB20_3 ↗3:114,409,153負股114,409,143–114,409,202
ZBTB20_4 ↗3:114,624,209負股114,624,199–114,624,258
ZBTB20_1 ↗3:114,624,945負股114,624,935–114,624,994
ZBTB20_5 ↗3:114,758,991負股114,758,981–114,759,040
ZBTB20_6 ↗3:115,071,343負股115,071,333–115,071,392
ZBTB20_2 ↗3:115,147,260負股115,147,250–115,147,309

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:741 aa

1 aa741 aa結構域功能區域鋅指
依 Q9HC78 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Zinc finger and BTB domain-containing protein 20長741個胺基酸。其BTB結構域位於第104至167位;另有五個C2H2型鋅指,分別位於第578至600、606至628、634至656、662至684及715至737位。資料亦註記第1至32、203至235及350至440位為無序區。

結構域BTB104–167 aa
鋅指C2H2-type 1578–600 aa
鋅指C2H2-type 2606–628 aa
鋅指C2H2-type 3634–656 aa
鋅指C2H2-type 4662–684 aa
鋅指C2H2-type 5715–737 aa
功能區域Disordered1–32 aa
功能區域Disordered203–235 aa
功能區域Disordered350–440 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 9JZT…

PDB · 9JZT

X-ray · 3.10 A · A=576-689

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZBTB20的定位資料標示為細胞核。 來源未提供定位變化的條件、細胞狀態或異構型間差異,因此無法進一步描述其動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
ODA-8SZBTB20
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZBTB20可形成同源二聚體,並可結合DNA。資料未列出其他互作蛋白或特定複合體,也未說明DNA結合與轉錄調控之間的具體關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

影響ZBTB20的基因變異與Primrose syndrome(PRIMS)相關;來源將該病描述為由影響此基因的變異所致。其特徵包括頭圍過大、智能障礙、行為異常、特殊顏面特徵、異位鈣化、耳廓增大並鈣化,以及進行性肌肉萎縮。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZBTB20可能是轉錄因子,可能參與造血、腫瘤發生與免疫反應;資料另指出它在出生後肌肉生成中具有作用,並可能參與調節衛星細胞自我更新,後兩項功能為相似性推論。含實驗來源
證據與來源

May be a transcription factor that may be involved in hematopoiesis, oncogenesis, and immune responses. Plays a role in postnatal myogenesis, may be involved in the regulation of satellite cells self-renewal (By similarity)

PMID 11352661 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用ZBTB20能與自身形成同源二聚體,也能結合DNA;資料未進一步說明其DNA標的或結合後的功能結果。資料庫紀錄
證據與來源

Can homodimerize. Binds to DNA

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZBTB20定位於細胞核。推論支持
證據與來源

Nucleus

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響ZBTB20的基因變異與Primrose syndrome(PRIMS)相關。該病可見頭圍過大、智能障礙、行為異常、特殊顏面特徵、異位鈣化、增大且鈣化的耳廓,以及進行性肌肉萎縮。含實驗來源
證據與來源

Primrose syndrome PRIMS A disease characterized by macrocephaly, intellectual disability, disturbed behavior, dysmorphic facial features, ectopic calcifications, large calcified ear auricles, and progressive muscle wasting. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 259050

PMID 25017102 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000675478 · 27,503 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CTTCTGCCGAAGAAGTAGGGGCGGGGGGAAGTTTAGGAGT40
41TGAGGAAAGAAGATTAAAGAGCGCGAGGAGGCACTGCCAG80
81GACTTACCGTACAACACTCCTTGGCTTCTGGAATTTTATC120
121TCTGCTCACAGTCTACATTACAACATTAGTTCATTCTGGG160
161CACTTTAGCTTCCTTGAATCTCCAGTTGATCTCACACCCA200
201TGCCTATGATATTCTTCTCCTGGTTAATCAAGAATTCTCT240
241ATTTCTGCTCCGTCATCCATGCCACTACAAATAAAAAGAA280
281GTGTTAAGAATTGCCTTTGGGACTCTGAAGGCTGAAGAAT320
321TGATGAATTGCAAGTTTGTGCCCCATAGCTGCACAGACTG360
361CCTGAAGTTACATTTAGAGACTGAAATCACTGCACCTTAA400
401AAACAAAAGATTGAGCTGCACTGTATTCCTAATGTTTCAT440
441CATTACTAACAGGATATTCCTCATGACATTGCTGTCTGAT480
481CTTTGACCATCAGTCTGTGACCTGCCCCTTCTCTTTACAT520
521GCAGCCGCTCTCTGCTCCCTGCCCCAATGAACATCTGCAC560
561TAGGCCCAAGCCTTGGAGTAATTTACCTGAAGAGTGACAC600
601CATTGATTTTGAAACTACTATGAGGAAACTGAAGCCCAGA640
641GAGGTGAAGTGAGGTGCCCAAGGCCACACAGCAAGTTAGA680
681GGCACAGCTAGTACGGTAGCTCAAGTCTCCTGACTCCCAG720
721TCCAGTGCTCCTCCCATTACTCCACGAGTCCTGTCTCTAA760
761GCTTCCTGACAAATGCTAGAACGGAAGAAACCCAAGACAG800
801CTGAAAACCAGAAGGCATCTGAGGAGAATGAGATTACTCA840
841GCCGGGTGGATCCAGCGCCAAGCCGGGCCTTCCCTGCCTG880
881AACTTTGAAGCTGTTTTGTCTCCAGACCCAGCCCTCATCC920
921ACTCAACACATTCACTGACAAACTCTCACGCTCACACCGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。