演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

ZBTB18C2H2-171

zinc finger and BTB domain containing 18

ZBTB18 編碼轉錄抑制蛋白,參與骨骼肌生成、腦部發育及神經細胞存活調控;其蛋白質具有 BTB domain 與多個 C2H2 型鋅指區域。

Homo sapiens1q44UniProt Q99592
OFFICIAL SYMBOL
ZBTB18
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q99592
PDB / ALPHAFOLD
8P2P
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

ZBTB18(zinc finger and BTB domain containing 18)是蛋白質編碼基因,產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的 ZBTB18 subfamily。蛋白質長 522 個胺基酸,兼具 BTB domain 與四個 C2H2 型鋅指,並含有數段預測為無序的區域。這些結構特色構成其 DNA 結合與調控相關的分子基礎;來源將其描述為轉錄抑制因子,並指出它參與多種發育過程。

Official symbol
ZBTB18
Gene name
zinc finger and BTB domain containing 18
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13030
UniProt
Q99592
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C2H2-171TAZ-1RP58ZNF238

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q44
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegZBTB18pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr1:244,048,547–244,057,476
Gene span
8,930 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000358704 ★244,051,283–244,057,4762
ENST00000696615244,048,547–244,057,2353
ENST00000914124244,048,923–244,057,4763
ENST00000622512244,048,939–244,057,4762
ENST00000696616244,049,799–244,057,4762
ENST00000696617244,051,276–244,057,4763
ENST00001145065244,051,276–244,057,4762
ENST00000698634244,051,359–244,054,2183
ENST00000696618244,052,236–244,057,4762

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

ZBTB18 是轉錄抑制因子,與肌生成和腦部發育等發育過程有關。在骨骼肌生成中,它直接抑制 ID2 與 ID3 的表現;這兩者會抑制骨骼肌生成,因此 ZBTB18 對此過程具有重要調控作用。

其 DNA 結合具有序列特異性:ZBTB18 可辨識共識序列 5'-[AC]ACATCTG[GT][AC]-3',該序列包含 E box 核心。結合 DNA 後,ZBTB18 會招募染色質重塑多蛋白複合體,藉此執行轉錄抑制。來源未進一步列出該複合體的組成,也未描述其在不同基因上的調控情境。

除肌生成外,ZBTB18 也參與控制前驅細胞的細胞分裂,並調節有絲分裂後皮質神經元的存活。這些作用涵蓋發育期間的細胞增殖與神經元維持,但來源未提供更細的作用機制或條件。ZBTB18 也可能參與細胞核內染色體的組織;此項角色以「可能」描述,仍屬不確定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 244051283 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>ZBTB18 ENST00000358704 GRCh38 chr1:244050283-244051383 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTGCCCGGTACCGGTCAGCCCAGCCCGGGTCGCGTTACAGTTTCATCAGCTATTAGAAAAGACCCACAA
ACTGGCTGAAAAGTTCTCAAACTTACTAGACCTGGCTTCCCCCCACACAAAGATTTTCTTGTGATCATAA
ACATTAGAGTGACCCCCCCCCAAAGAAAAAAAAGATTGTTAAGGGACACAGATCAAGGGGAAGGCAAGGT
TCTGCTTTTTCTGAGCAGAAAGATCAGATATGCAGGTGCAGCATTCATTTTAAGTGACTGGAGCAGGTTG
TATCAGTTTATTAATTGGTCTCGTTGAACTGAAGTACTTTCCAGGATTTCAGAAAGTGCAGTTTCAGCTT
GTTGGTACCGAGAATTGAAATTTGCATTGACTGTGGCAGTGTAAGAAATTTTTCTGAGAAGGTAGTTGTA
GATAAGTAATTACATAAGAGTGAAATAATAAGGTGAACCAGTCTGAAGTAATAGTTCTGAACAAGTCTGC
CAACATTTGAGACATGTATACCATTATCTCAGCAGAAAAAAATAAAAAAGTGCGGTAATAATGTTGAAAT
GGGACTGGAGATGTCAAATGGGTTGGTTTAAAAATATCCCTAAACTGCTTTAGAAACTAAACGTTGGAGT
TGAATAAAAGTGAATCTGGATTTCCTGAATAGCACCGTGGCTTGAGTGTGCTGTCAGTATGTAAGCCAGT
CCACCAACTTAAGACAGAAGTGTTGCTATTCCATAAATACAGTAGAACTCCATATGCTGAGTTTTTCAAT
TTCTTCTGTTAGAAAGTTTGGAAAAAAAGGAAGACTTTGAAGTATTTTGTTTATACTAACAGAAGAGAAA
AGTTCTCCTAAGAAAAAGCTGGTGGCAGGAGTGTAGAGGAGTAGCATATGGCATTAAAAGGAGCACAGCT
GGAGGTAGCATTTCCATCTGAACATGATGTCAGAGCAGCTGACAGCCTGCCATCCCTCAGCCTTTTATTC
TAACACACAGACAGGGAGTTAGTGTGTGCGGATCTGTGGTGGAGAAGGTATCTCATTCCTCTCTAACATC
ATCTCCACTTTGCATCTGTCTCTCTTAGTCTGCTTTTTTTCCACCGATGTA
ZBTB18 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
ZBTB18_2 ↗1:244,048,584正股244,048,535–244,048,594
ZBTB18_3 ↗1:244,048,926正股244,048,877–244,048,936
ZBTB18_1 ↗1:244,051,283正股244,051,234–244,051,293

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:522 aa

1 aa522 aa結構域功能區域鋅指
依 Q99592 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

ZBTB18 蛋白質長 522 個胺基酸,屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family 的 ZBTB18 subfamily。其 BTB domain 位於第 24–91 個胺基酸,另有四個 C2H2 型鋅指區域,分別位於第 370–392、410–432、438–460 與 466–489 個胺基酸。第 121–164 與 190–221 個胺基酸區段被註記為無序區;第 310–427 個胺基酸區域與 DNMT3A 交互作用相關。

結構域BTB24–91 aa
鋅指C2H2-type 1370–392 aa
鋅指C2H2-type 2410–432 aa
鋅指C2H2-type 3438–460 aa
鋅指C2H2-type 4466–489 aa
功能區域Disordered121–164 aa
功能區域Disordered190–221 aa
功能區域Interaction with DNMT3A310–427 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 8P2P…

PDB · 8P2P

X-ray · 4.15 A · A/B/C/D/E/F/G/H=1-149

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus

ZBTB18 位於細胞核,並與凝縮染色質相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 5 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C2H2-171ZBTB18CTBP1CTBP2MYLIPPIK3R3ZBTB2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

ZBTB18 與 DNMT3A 有交互作用;來源未進一步說明此關係是否涉及特定複合體或其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

ZBTB18 相關變異可造成常染色體顯性智能發展障礙 22(MRD22)。此病症的特徵包括一般智力功能顯著低於平均,並伴隨適應行為受損,且於發育期間表現。患者可能有有限或缺乏言語能力,並出現多樣但具特徵性的臉部表現;其他可能特徵包括肌張力低下、生長不良、小頭畸形、胼胝體缺如及癲癇。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能ZBTB18 是參與肌生成與腦部發育等過程的轉錄抑制因子;它直接抑制骨骼肌生成抑制因子 ID2、ID3 的表現,也參與控制前驅細胞分裂及調節有絲分裂後皮質神經元存活。它會結合包含 E box 核心的特定共識 DNA 序列,並藉招募染色質重塑多蛋白複合體作用;另可能參與細胞核內染色體組織。含實驗來源
證據與來源

Transcriptional repressor that plays a role in various developmental processes such as myogenesis and brain development. Plays a key role in myogenesis by directly repressing the expression of ID2 and ID3, 2 inhibitors of skeletal myogenesis. Also involved in controlling cell division of progenitor cells and regulating the survival of postmitotic cortical neurons. Specifically binds the consensus DNA sequence 5'-[AC]ACATCTG[GT][AC]-3' which contains the E box core, and acts by recruiting chromatin remodeling multiprotein complexes. May also play a role in the organization of chromosomes in the nucleus

PMID 9756912 ↗

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交互作用ZBTB18 與 DNMT3A 有交互作用。含實驗來源
證據與來源

Interacts with DNMT3A

PMID 11350943 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位ZBTB18 位於細胞核,並與凝縮染色質相關。資料庫紀錄
證據與來源

Nucleus; Associates with condensed chromatin

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 ZBTB18 的變異可造成常染色體顯性智能發展障礙 22(MRD22)。此病於發育期間表現,患者一般智力功能顯著低於平均且適應行為受損;可能有有限或缺乏言語能力,以及多樣但具特徵性的臉部表現。其他可能特徵包括肌張力低下、生長不良、小頭畸形、胼胝體缺如與癲癇。含實驗來源
證據與來源

Intellectual developmental disorder, autosomal dominant 22 MRD22 A disorder characterized by significantly below average general intellectual functioning associated with impairments in adaptive behavior and manifested during the developmental period. Additional MRD22 patients have limited or no speech, and variable but characteristic facial features, including round face, prominent forehead, flat nasal bridge, hypertelorism, epicanthal folds, and low-set ears. Other features may include hypotonia, poor growth, microcephaly, agenesis of the corpus callosum, and seizures. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 612337

PMID 24193349 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000358704 · 3,851 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTGTGTGCGGATCTGTGGTGGAGAAGGTATCTCATTCCT40
41CTCTAACATCATCTCCACTTTGCATCTGTCTCTCTTAGTC80
81TGCTTTTTTTCCACCGATGTAACAGACCTGGAGCCAGCAG120
121GACTCAGAGGAAAGGACTTAATCAGGTTTATGTGTCCTAA160
161AGGTTATGAAGACAGTATGGAGTTTCCAGACCATAGTAGA200
201CATTTGCTACAGTGTCTGAGCGAGCAGAGACACCAGGGTT240
241TTCTTTGTGACTGCACTGTTCTGGTGGGAGATGCCCAGTT280
281CCGAGCGCACCGAGCTGTACTGGCTTCATGCAGCATGTAT320
321TTCCACCTCTTTTACAAGGACCAGCTGGACAAAAGAGACA360
361TTGTTCATCTGAACAGCGACATTGTTACAGCCCCCGCTTT400
401CGCTCTCCTGCTTGAATTCATGTATGAAGGGAAACTCCAG440
441TTCAAAGACTTGCCCATTGAAGACGTGCTAGCAGCTGCCA480
481GTTATCTCCACATGTATGACATTGTCAAAGTCTGCAAAAA520
521GAAGCTGAAAGAGAAAGCCACCACGGAGGCAGACAGCACC560
561AAAAAGGAAGAAGATGCTTCAAGTTGTTCGGACAAAGTCG600
601AGAGTCTCTCCGATGGCAGCAGCCACATAGCAGGCGATTT640
641GCCCAGTGATGAAGATGAAGGAGAAGATGAAAAATTGAAC680
681ATCCTGCCCAGCAAAAGGGACTTGGCGGCCGAGCCTGGGA720
721ACATGTGGATGCGATTGCCCTCAGACTCAGCAGGCATCCC760
761CCAGGCTGGCGGAGAGGCAGAGCCACACGCCACAGCAGCT800
801GGAAAAACAGTAGCCAGCCCCTGCAGCTCAACAGAGTCTT840
841TGTCCCAGAGGTCTGTCACCTCCGTGAGGGATTCGGCAGA880
881TGTTGACTGTGTGCTGGACCTGTCTGTCAAGTCCAGCCTT920
921TCAGGAGTTGAAAATCTGAACAGCTCTTATTTCTCTTCAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。