基因總覽
ZBTB17（zinc finger and BTB domain containing 17）是蛋白質編碼基因，產物屬於 krueppel C2H2-type zinc-finger protein family。其蛋白質具有 BTB 結構域與多個 C2H2 型鋅指，並可作為轉錄因子；其轉錄調控方向並非固定，會依結合夥伴而有所不同。這些家族與結構特徵構成辨識其分子性質的基礎；其在特定發育過程中的作用及對基因轉錄的調節，則見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375743 ★ | 15,941,869–15,976,101 | 16 |
| ENST00000537142 | 15,940,148–15,976,079 | 15 |
| ENST00000375733 | 15,940,148–15,976,132 | 16 |
| ENST00000894622 | 15,940,148–15,976,132 | 15 |
| ENST00000894623 | 15,940,148–15,976,132 | 16 |
| ENST00000894624 | 15,940,148–15,976,132 | 15 |
| ENST00000894625 | 15,940,148–15,976,132 | 16 |
| ENST00000894626 | 15,940,148–15,976,132 | 15 |
| ENST00000894627 | 15,940,148–15,976,132 | 16 |
| ENST00000894628 | 15,940,148–15,976,132 | 16 |
| ENST00000894629 | 15,940,148–15,976,132 | 14 |
| ENST00000894630 | 15,940,148–15,976,132 | 17 |
顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
ZBTB17 是轉錄因子，可活化或抑制轉錄；作用方向會受到結合夥伴影響，也與其是否將作用指向細胞週期進程的負向調節因子有關。因此，不能將它概括為只會促進或只會抑制基因表現的調控者。
在淋巴細胞早期發育中，ZBTB17 對淋巴前驅細胞避免凋亡至關重要。這使前驅細胞能在 IL7 的作用下存活，並進行適當的譜系承諾。這項功能將細胞存活與早期淋巴細胞發育相連，但來源未進一步指出其如何在分子層級阻止凋亡。
ZBTB17 也參與胚胎早期發育；來源指出，它在原腸形成期間為必需。這項發育功能與其轉錄因子身分一致，但現有資料未詳述相關的下游基因或細胞機制。
在特定啟動子上的調控例子中，ZBTB17 可結合腺病毒主要晚期蛋白與 cyclin D1 的啟動子，並活化轉錄。另一方面，它會抑制 RB1 的轉錄，而與 ZBTB49 isoform 3/ZNF509S1 互作可阻斷這種抑制。這些結果顯示，ZBTB17 對不同靶基因的調控結果可能不同，也會受到互作分子調節。
Promoter 與基因調控
>ZBTB17 ENST00000375743 GRCh38 chr1:15976001-15977101 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAGTGAACCGAGACAGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGAAGACAGAGTGAGACTCTGTCTCCAAAAAAAAA AAAAAAACCTAAAGACAAGAAGGGGTGAAGTCAACTGCTGGGCTTTTTTGTTTCTCTAGCCATTGTGAAG ACAGGAGTGAGTTGCCAGATTGGCATATGTTGCATCCCACTGAAGGCTAGTGGACATGAATCTCTAGGGA ACAGTCTCCCCACTGCATACTTTCTTCAGCTGTGCTTGGCTGTTTGGGAGCTAACAAAGAGAAAAGGTGC ATTTGGATTCACACAGCGTTGGTATTCTTACCAAATCCATGTGACAAAAAGGCAAGGGGGCAAAAGAGCT TACAGTAGTGGCAAGAGTGTTGTTAAAATTATAGATTATGGAAAATATGCAGGCCTAGAAGTAAACAAAG GAGAAAGCCCTCAGACTGTGAGAAAGTGGAGAAGTCAGTGGCCTAGAGCTACCAAAAAGGTAGAAGAGGG GCCACGGAGGGGCCATGCAAGTCTGCAGACACTTTTGTTTTCAGACACCTTTATTCACGTCCAAGACAAT CAGGGAAGGGGATAATGTTCGGTTTAGAAGGTAGAAAAACACAACTGGGATCTGCAGCTTTGAAGCCACA AGTAGATTCATATCTCCGGTCCACCACTTACAAGATATGTGACCATGGACATTGATTTACACTTTTTGAG TCTGTTTTCCCTTTTTTAAAATTAGGAGAATAATACTATCTTATAATTGGTGTGAGGATTTAAAGAGATA ATGCATGTAAAGCGCTTAACACAGTGCCTGGCACACAGTAAGAGCTGAACACATGATGTTACTGTTATAT TTGGAAGAGAAACCAAGGCAGGGGTACAATGAGGACAACTCTGAGCGCCGAAGTACTGTAAGGTGGAACT TTTGGATAGCTAGGCGCATGCGTCTGTCTATGGGCGCTCTCCTAGCGAGGACGCTGCGCATGCGCCGGAA GTTGCAGCCGGGAAGCCTGCGAGGTCGGTTCCGCCCGACTCTAACATGGCGGCGCCCTTTGTCTGCTCTG GAGTGCCGTCCCCGGCCTTCTCGCGGCCGTGATGCACCTCCCTCTGCGGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZBTB17_1 ↗ | 1:15,976,079 | 負股 | 15,976,069–15,976,128 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_C3KRM · enhancer · 15974837–15976068 · regulatory
ENSR1_B56LD · promoter · 15976069–15976622 · regulatory
· motif · 15971966–15971978 · motif
· motif · 15973782–15973794 · motif
· motif · 15974049–15974064 · motif
· motif · 15974931–15974942 · motif
· motif · 15975334–15975346 · motif
· motif · 15975625–15975640 · motif
· motif · 15975634–15975647 · motif
· motif · 15975655–15975667 · motif
· motif · 15975657–15975664 · motif
· motif · 15975657–15975670 · motif
· motif · 15975657–15975672 · motif
· motif · 15975682–15975695 · motif
· motif · 15975737–15975750 · motif
· motif · 15975765–15975778 · motif
· motif · 15975877–15975890 · motif
· motif · 15975925–15975938 · motif
· motif · 15976068–15976078 · motif
· motif · 15976119–15976128 · motif
· motif · 15976119–15976130 · motif
· motif · 15976126–15976137 · motif
· motif · 15976126–15976137 · motif
· motif · 15976168–15976179 · motif
· motif · 15976168–15976179 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：803 aa
ZBTB17 蛋白質長 803 個胺基酸，N 端含 BTB 結構域（第 1–104 位），其後有多段預測為無序的區域。蛋白質具有 13 個 C2H2 型鋅指：12 個位於第 306–637 位，另 1 個位於第 717–739 位。資料亦標示與 MYC 及 HCFC1 互作的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 ZBTB17 定位於細胞核，未提供不同條件或異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- APBB2Q92870-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HCFC1P51610 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- MAGEA4P43358 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MYCP01106 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- MYCNP04198 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TOPBP1Q92547 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZBTB8AQ96BR9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Gfi1Q07120 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
ZBTB17 可透過 BTB/POZ 結構域形成同源寡聚體，且多聚化是其 DNA 結合所必需。它與 GIF1 的 C 端鋅指介導互作，促使 MYB 被招募至 CDKN1A/p21 與 CDKN1B 啟動子並抑制轉錄；與 TRAF2 互作則干擾 UBC13 和 TRAF2 結合，抑制 TRAF2 的 E3 ligase 活性。MYC 與 BCL6 的互作會抑制 ZBTB17 的轉錄活化作用；MYC 也會抑制其生長停滯活性，並使其在細胞核內不溶。ZBTB49 isoform 3/ZNF509S1 可阻斷 ZBTB17 對 RB1 的轉錄抑制。另有 HCFC1、MAGEA4 與 TMPRSS11A 互作紀錄，來源未說明其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | ZBTB17 是轉錄因子，會依結合夥伴及其作用目標而活化或抑制轉錄，並可作用於細胞週期負向調節因子。它對淋巴細胞早期發育重要，可協助淋巴前驅細胞避免凋亡，使其能在 IL7 作用下存活並適當進行譜系承諾；此外，它在胚胎原腸形成期間為必需。ZBTB17 可結合腺病毒主要晚期蛋白與 cyclin D1 的啟動子並活化轉錄，也會抑制 RB1 轉錄；與 ZBTB49 isoform 3/ZNF509S1 互作可阻斷此抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Transcription factor that can function as an activator or repressor depending on its binding partners, and by targeting negative regulators of cell cycle progression. Plays a critical role in early lymphocyte development, where it is essential to prevent apoptosis in lymphoid precursors, allowing them to survive in response to IL7 and undergo proper lineage commitment. Has been shown to bind to the promoters of adenovirus major late protein and cyclin D1 and activate transcription. Required for early embryonic development during gastrulation. Represses RB1 transcription; this repression can be blocked by interaction with ZBTB49 isoform 3/ZNF509S1 PMID 16142238 ↗ · PMID 19164764 ↗ · PMID 25245946 ↗ · PMID 9308237 ↗ · PMID 9312026 ↗ |
| 交互作用 | ZBTB17 透過 BTB/POZ 結構域形成同源寡聚體，而多聚化是 DNA 結合所必需。它透過 C 端鋅指與 GIF1 互作，促使 MYB 被招募至 CDKN1A/p21 和 CDKN1B 啟動子並抑制轉錄；與 TRAF2 互作會干擾 UBC13 結合 TRAF2，進而抑制 TRAF2 E3 ligase 活性。MYC 透過 C 端 helix-loop-helix motif 與其互作，抑制 ZBTB17 的轉錄活化與生長停滯活性，並使其在細胞核內不溶。ZBTB17 也與 HCFC1、MAGEA4、TMPRSS11A 及 BCL6 互作；BCL6 會抑制其對細胞週期停滯相關靶基因的轉錄活化。ZBTB49 isoform 3/ZNF509S1 則阻斷 ZBTB17 對 RB1 的轉錄抑制。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homooligomerizes (via the BTB/POZ domain), multimerization is required for DNA binding. Interacts (via the C-terminal zinc fingers) with GIF1; the interaction results in the recruitment of MYB to the CDKN1A/p21 and CDKN1B promoters and repression of transcription. Interacts with TRAF2, interfering with the binding of UBC13 to TRAF2, and inhibiting TRAF2 E3 ligase activity. Interacts with MYC (via the C-terminal helix-loop-helix motif); the interaction inhibits ZBTB17 transactivation and growth arrest activities and renders it insoluble in the nucleus. Also interacts with HCFC1, MAGEA4 and TMPRSS11A. Interacts with BCL6; the interaction inhibits ZBTB17 transactivation activity on target genes involved in cell cycle arrest. Interacts with ZBTB49 isoform 3/ZNF509S1; this interaction blocks ZBTB17-mediated repression of RB1 PMID 12244100 ↗ · PMID 12545156 ↗ · PMID 14739298 ↗ · PMID 15095404 ↗ · PMID 16142238 ↗ · PMID 17880999 ↗ · PMID 25245946 ↗ · PMID 9312026 ↗ |
| 細胞定位 | ZBTB17 定位於細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGGTCGGTTCCGCCCGACTCTAACATGGCGGCGCCCTTT40GTCTGCTCTGGAGTGCCGTCCCCGGCCTTCTCGCGGCCGT80GATGCACCTCCCTCTGCGGTGGGGTCCGGGACATGGCAGG120TAATGAGCCGGACGAGGGGAGCCAAGCTGGAGTTTACACA160GGCAAACTGTCAGAAAAGAGTAGCCTGGGCTGTCTGGAAA200TCTGAGCCATGGACTTTCCCCAGCACAGCCAGCATGTCTT240GGAACAGCTGAACCAGCAGCGGCAGCTGGGGCTTCTCTGT280GACTGCACCTTTGTGGTGGACGGTGTTCACTTTAAGGCTC320ATAAAGCAGTGCTGGCGGCCTGCAGCGAGTACTTCAAGAT360GCTCTTCGTGGACCAGAAGGACGTGGTGCACCTGGACATC400AGTAACGCGGCAGGCCTGGGGCAGGTGCTGGAGTTTATGT440ACACGGCCAAGCTGAGCCTGAGCCCTGAGAACGTGGATGA480TGTGCTGGCCGTGGCCACTTTCCTCCAAATGCAGGACATC520ATCACGGCCTGCCATGCCCTCAAGTCACTTGCTGAGCCGG560CTACCAGCCCTGGGGGAAATGCGGAGGCCTTGGCCACAGA600AGGAGGGGACAAGAGAGCCAAAGAGGAGAAGGTGGCCACC640AGCACGCTGAGCAGGCTGGAGCAGGCAGGACGCAGCACAC680CCATAGGCCCCAGCAGGGACCTCAAGGAGGAGCGCGGCGG720TCAGGCCCAGAGTGCGGCCAGCGGTGCAGAGCAGACAGAG760AAAGCCGATGCGCCCCGGGAGCCGCCGCCTGTGGAGCTCA800AGCCAGACCCCACGAGTGGCATGGCTGCTGCAGAAGCTGA840GGCCGCTTTGTCCGAGAGCTCGGAGCAAGAAATGGAGGTG880GAGCCCGCCCGGAAAGGGGAAGAGGAGCAAAAGGAGCAAG920AGGAGCAAGAGGAGGAGGGCGCAGGGCCAGCTGAGGTCAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。