基因總覽
ZAN 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 zonadhesin,產物 Zonadhesin 為單次跨膜蛋白。其結構包含大型細胞外區域,以及較短的跨膜區段與細胞質區域;細胞外部分可見多個 MAM、TIL、VWFC 與 VWFD 結構域,另有黏蛋白樣區域。來源指出,zonadhesin 位於精子頭部頂端,並以物種特異性的方式結合卵子的透明帶。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000613979 ★ | 100,733,595–100,797,797 | 48 |
| ENST00000620596 | 100,733,595–100,797,797 | 46 |
| ENST00000546292 | 100,734,021–100,797,797 | 45 |
| ENST00000618565 | 100,734,021–100,797,797 | 47 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
zonadhesin 會以物種特異性的方式結合卵子的透明帶。這項描述指出其結合具有物種差異性,但未提供不同物種間結合情形的比較,也未說明辨識所依據的分子特徵或結合步驟,因此不能據此推定其作用機制或適用範圍。
來源另指出,zonadhesin 可能參與配子辨識和/或訊號傳遞。這兩項可能性涉及不同的功能面向:配子辨識關乎精子與卵子之間的辨認,訊號傳遞則可能涉及細胞間的訊息作用;但目前提供的敘述沒有進一步說明其參與方式,也未確定兩者是否皆由 zonadhesin 執行。故其在受精相關過程中的具體作用,仍應保留為可能性,而非視為已確立的機制。
Promoter 與基因調控
>ZAN ENST00000613979 GRCh38 chr7:100732595-100733695 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTAGCCTCAAGCGGTCCTACCATCTCGGCCTCCAAAAAGCACTTGGGATTACCAGCATGAGCCACTGCAC CTGGCCACCAACCTACAGTCTTATCATCACTGAGTTCGTATCTACCTGCATCCTGTCCAATACTCCGTAC TACCAATCTTTCAAATTTTTGTCGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATTCCAGCACTTTGGAAGGC CAAGGCAGGCAGACTGCTTGAGCCCAGGAGTTTAAGACCAGCCCGGGAGACATGGCAAAACCCCATTTCT GCAAAATATACAAAAATTAGCTGGGCTTGGTGGCATGCACTGGTAGTCCCAGCTACTCCAGAGGCTAAGA TGGGAAGATCACCTGACCCCGGGGGTTTGAGGCTGTAATGAGCCAAGTCATGCTGCTGCGCTCCAGCCTG GGTGACAGAACGAGGCCCTGTCTCAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTTTTTTTGGTCAATATAAGAGTCATA GTTTTGATTAGCATTTCCCTTATTACTAGTGAAGCAGAACAGCTTTTCAAATGTTTGCTGCCTGTTTGTA TCTCTTCCTCTGTGACTTATCTTTCTCCGTGATTTGCCAGTAGGCATTTGCAGTCCTTTTTTTCTTTTTT TTTTGACTTGGAGTCTCGCGATCTCGGCTCACTACAACCTCCGCCTACCAAGTTCAAGTGATTCTTGCGC CTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTATGAGCATGTGCCACCACCCCTAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGT AGAGATGGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCGCCTTG GCCTCCCAAATGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACGTCCAGCCGTTTGCAGTCCTTCCTTCACCTAA CTCTCCAGTTGCCACTGTTGCCAGTTATAGAATTTTAGGTTTGAAATGGTTTTCTGTTGGAATTCTGCAG ACAATGTTCCACTGGCTCTTAGACTCCATGGTTGCTATTGAAAAGCTGGATGCCATGTTGATTTCTGATC CTTGGTATATGACTTGTTATTTTCTATCTGAAAGTGTTTCAGATCTTCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZAN_1 ↗ | 7:100,733,595 | 正股 | 100,733,546–100,733,605 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:2812 aa
Zonadhesin 長 2812 個胺基酸。其 N 端含訊號胜肽,細胞外區域包含多個 MAM、TIL、VWFC 與 VWFD 結構域,以及一段黏蛋白樣區域;C 端附近有單次跨膜螺旋,之後為細胞質區域。另註有 EGF-like 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Zonadhesin 是細胞膜上的單次跨膜第一型膜蛋白,且僅位於精子頭部的頂端區域。 來源未提供定位隨條件或時間改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
Zonadhesin 可能形成共價寡聚體;來源以推測方式描述此情形,未指出寡聚體的組成或其他結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | zonadhesin 以物種特異性的方式結合卵子的透明帶,並可能參與配子辨識和/或訊號傳遞;來源未明確界定其參與方式,也未將這些可能性描述為已確立的功能。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Binds in a species-specific manner to the zona pellucida of the egg. May be involved in gamete recognition and/or signaling |
| 交互作用 | zonadhesin 可能形成共價寡聚體。此描述帶有推測性,來源沒有進一步說明寡聚體的組成或形成條件。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | zonadhesin 是細胞膜上的單次跨膜第一型膜蛋白,且僅定位於精子頭部頂端區域;此定位描述針對 zonadhesin 本身。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Exclusively on the apical region of the sperm head |
核酸與蛋白質序列
AGACTCCATGGTTGCTATTGAAAAGCTGGATGCCATGTTG40ATTTCTGATCCTTGAGCTTTTCTGTGTTTCTCTGTTCATT80CTTCATGGCATCCTTGGAAGGATGCCAAGCTAAGGAGGCC120AGGGGGGAATAAAAGGAGTCCAGGCTCCCAACTGTGCCCT160TCCCCTCTCCCCTGGGAGCAACCACTTAGGGTCCTCATGG200TTCCTCCAGTCTGGACTCTGCTGCTTCTGGTGGGGGCTGC240CCTTTTCAGGAAAGAGAAGCCTCCGGACCAGAAGCTGGTT280GTTCGCAGCTCTAGGGACAACTATGTCCTCACCCAGTGTG320ATTTTGAGGATGACGCCAAACCCCTCTGTGACTGGTCCCA360AGTGTCCGCAGACGATGAAGACTGGGTTCGAGCCAGTGGG400CCCTCTCCCACCGGCTCCACCGGGGCCCCCGGGGGGTACC440CTAACGGAGAGGGCAGCTATCTGCATATGGAATCGAACAG480CTTCCACCGTGGGGGAGTGGCCCGCCTGCTCAGCCCCGAC520CTATGGGAGCAAGGCCCCCTCTGTGTGCACTTTGCCCACC560ACATGTTCGGGCTGTCTTGGGGCGCCCAGCTCAGGCTGCT600GCTGCTCTCGGGTGAAGAGGGCCGCCGCCCCGATGTGCTC640TGGAAACACTGGAACACCCAGAGACCCTCCTGGATGCTCA680CCACCGTCACTGTGCCCGCAGGGTTCACCCTGCCCACCCG720GCTGATGTTTGAGGGAACACGGGGTAGCACTGCCTACCTG760GACATCGCCCTGGATGCCCTCTCTATCCGCCGGGGCTCCT800GTAATCGCGTCTGTATGATGCAAACATGCAGCTTTGACAT840TCCAAATGACCTCTGTGACTGGACCTGGATCCCAACTGCC880TCCGGGGCCAAGTGGACTCAGAAGAAAGGGTCATCAGGAA920AGCCAGGCGTGGGGCCTGATGGCGACTTCTCTAGCCCTGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。