基因總覽
YWHAG(tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein gamma)是位於人類第 7 號染色體的蛋白質編碼基因,產物屬於 14-3-3 家族。這種蛋白質具有多個結合夥伴,通常辨識對方蛋白質上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序;結合後可調節夥伴的活性。它也能與自身或其他 14-3-3 家族成員形成二聚體。這些特性使 YWHAG 成為多種訊號路徑中的適配蛋白。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000307630 ★ | 76,326,799–76,358,991 | 2 |
| ENST00001139738 | 76,326,799–76,359,022 | 2 |
| ENST00001124344 | 76,347,224–76,359,022 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
YWHAG 產物作為適配蛋白,參與廣泛的一般性與專一性訊號路徑調控。它通常辨識結合夥伴上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序;結合後,常會改變夥伴的活性。因此,YWHAG 可依互作對象與其磷酸化狀態,參與不同的調控情境,而非只作用於單一訊號途徑。
在 GATOR2 複合體中,YWHAG 與磷酸化的 WDR24 結合,促進 WDR24 失活。這項作用顯示,YWHAG 可透過辨識經磷酸化的蛋白質,調節複合體組成成員的功能。
YWHAG 也參與神經傳遞相關調控。它與 BEST1 互作,促進 L-glutamate 分泌,並藉此正向調節 NMDA 麩胺酸受體活性。來源描述的是由 BEST1 互作、L-glutamate 分泌到受體活性調節的關聯,不宜延伸為其他未提及的神經機制。
在角質形成細胞中,YWHAG 與 PKP1 互作並使其滯留於細胞質,降低 PKP1 併入橋粒的程度,因而減弱細胞間黏附。這個例子說明,YWHAG 對夥伴蛋白位置與細胞結構功能的調節,可能影響組織細胞間的連結。
此外,YWHAG 參與粒線體蛋白質分解代謝過程 MALM;該過程促進粒線體內受損蛋白質降解。YWHAG 在此過程中的角色與其他訊號調節作用並列,來源未進一步界定其在蛋白質降解步驟中的具體機制。
Promoter 與基因調控
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| YWHAG_1 ↗ | 7:76,358,989 | 負股 | 76,358,979–76,359,038 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_D5R9R · enhancer · 76356756–76358980 · regulatory
ENSR7_5MXWTF · CTCF_binding_site · 76357592–76357613 · regulatory
ENSR7_935BBN · promoter · 76358981–76359481 · regulatory
· motif · 76355210–76355219 · motif
· motif · 76355210–76355219 · motif
· motif · 76355806–76355817 · motif
· motif · 76356207–76356218 · motif
· motif · 76357594–76357610 · motif
· motif · 76357842–76357853 · motif
· motif · 76358132–76358152 · motif
· motif · 76358311–76358324 · motif
· motif · 76358339–76358352 · motif
· motif · 76358393–76358406 · motif
· motif · 76358428–76358441 · motif
· motif · 76358621–76358631 · motif
· motif · 76358937–76358950 · motif
· motif · 76359031–76359044 · motif
· motif · 76359060–76359073 · motif
· motif · 76359177–76359190 · motif
· motif · 76359294–76359307 · motif
· motif · 76359375–76359388 · motif
· motif · 76359392–76359403 · motif
· motif · 76359392–76359403 · motif
· motif · 76360392–76360401 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:247 aa
YWHAG 蛋白長 247 個胺基酸,屬於 14-3-3 家族。序列註解指出,第 2 至 247 位區域與 SPATA18/MIEAP 互作;第 2 至 166 位區域則是與 SPATA18/MIEAP isoform 2 互作所必需,但對結合 isoform 1 並非必要。
蛋白質三維結構
細胞內定位
YWHAG 位於細胞質與胞質溶膠,也可出現在粒線體基質。 MALM(粒線體蛋白質分解代謝過程)誘導後,YWHAG 會轉移至粒線體基質,顯示其定位會隨此過程啟動而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 166 個夥伴
- ABL1P00519 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- ACAP1Q15027 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ACOT13Q9NPJ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANKHD1Q8IWZ3-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARHGEF9O43307 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARL6IP4Q66PJ3-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASB1Q9Y576 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAATQ14032 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BADQ92934 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- BAGEQ13072 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C16orf87Q6PH81 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CASP3P42574 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CBLP22681 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CCDC34Q96HJ3-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC47Q96A33 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC74BQ96LY2-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC90BQ9GZT6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC25BP30305 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CENPVQ7Z7K6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP76Q8TAP6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP95Q96GE4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CGNL1Q0VF96 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CHCHD3Q9NX63 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHEK1O14757 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
YWHAG 可形成同源二聚體,並與 SFN、YWHAB 或 YWHAQ 形成異源二聚體;後者為相似性推論。它也與多種蛋白質互作,包括 RAF1、ABL1、MDM4、WDR24、BEST1、PKP1 及 SPATA18/MIEAP。與 ABL1 的互作涉及其磷酸化形式,且可使 YWHAG 留在細胞質;與 LRRK2 的互作則依賴 LRRK2 磷酸化。YWHAG 亦是含 DSG3、PKP1、YAP1 的複合體成員,該複合體對角質形成細胞中 DSG3 與 YAP1 定位至細胞膜是必要的。來源另指出,YWHAG 與磷酸化 MDM4 互作會負向調節 MDM4 對 TP53 的活性。
疾病與遺傳關聯
YWHAG 基因變異與發育性及癲癇性腦病 56(DEE56)相關;來源將此病描述為常染色體顯性疾病。DEE56 屬於嚴重且早發的癲癇性腦病,患者在癲癇發作前發育正常,發作後可能出現認知與動作發展遲緩;其特徵包括難治性發作、神經發育受損及預後不佳。此處疾病資訊將致病變異歸於影響 YWHAG 的變異。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | YWHAG 是參與多種一般性與專一性訊號路徑調控的適配蛋白,通常辨識夥伴上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序,結合後多會調節夥伴活性。它與磷酸化 WDR24 結合可促進其失活;與 BEST1 互作可促進 L-glutamate 分泌並正向調節 NMDA 麩胺酸受體活性。於角質形成細胞中,YWHAG 使 PKP1 滯留於細胞質,減少其併入橋粒並降低細胞間黏附;另參與促進粒線體內受損蛋白質降解的 MALM 過程。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adapter protein implicated in the regulation of a large spectrum of both general and specialized signaling pathways. Binds to a large number of partners, usually by recognition of a phosphoserine or phosphothreonine motif. Binding generally results in the modulation of the activity of the binding partner. Promotes inactivation of WDR24 component of the GATOR2 complex by binding to phosphorylated WDR24. Participates in the positive regulation of NMDA glutamate receptor activity by promoting the L-glutamate secretion through interaction with BEST1. Reduces keratinocyte intercellular adhesion, via interacting with PKP1 and sequestering it in the cytoplasm, thereby reducing its incorporation into desmosomes. Plays a role in mitochondrial protein catabolic process (also named MALM) that promotes the degradation of damaged proteins inside mitochondria PMID 15696159 ↗ · PMID 16511572 ↗ · PMID 22532927 ↗ · PMID 29121962 ↗ · PMID 29678907 ↗ · PMID 36732624 ↗ |
| 交互作用 | YWHAG 可形成同源二聚體,並依相似性推論與 SFN、YWHAB 或 YWHAQ 形成異源二聚體。它與多種蛋白質互作,部分互作受磷酸化狀態影響,例如與磷酸化 LRRK2 的互作依賴 LRRK2 磷酸化。YWHAG 是含 DSG3、PKP1、YAP1 的複合體成員,該複合體有助於角質形成細胞中 DSG3 與 YAP1 定位至細胞膜;與 ABL1 互作可使 YWHAG 留於細胞質,與磷酸化 MDM4 互作則負向調節其對 TP53 的活性。它也與 BEST1、PKP1、WDR24 及 SPATA18/MIEAP 等互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Forms heterodimers with SFN, YWHAB or YWHAQ (By similarity). Part of a complex that contains DSG3, PKP1, YAP1 and YWHAG; the complex is required for localization of DSG3 and YAP1 to the cell membrane in keratinocytes. Interacts with YAP1 (By similarity). Interacts with SAMSN1 (By similarity). Interacts with RAF1, SSH1 and CRTC2/TORC2. Interacts with ABL1 (phosphorylated form); the interaction retains it in the cytoplasm. Interacts with GAB2. Interacts with MDM4 (phosphorylated); negatively regulates MDM4 activity toward TP53. Interacts with PKA-phosphorylated AANAT and SIRT2. Interacts with the 'Thr-369' phosphorylated form of DAPK2. Interacts with PI4KB, TBC1D22A and TBC1D22B. Interacts with SLITRK1. Interacts with LRRK2; this interaction is dependent on LRRK2 phosphorylation. Interacts with MARK2 and MARK3. Interacts with MEFV. Interacts with ENDOG, TSC2 and PIK3C3; interaction with ENDOG weakens its interaction with TSC2 and PIK3C3. Interacts with (phosphorylated) WDR24. Interacts with BEST1; this interaction promotes L-glutamate channel activity leading to the positive regulation of NMDA glutamate receptor activity through the L-glutamate secretion. Interacts with PKP1 (when phosphorylated); the interaction results in translocation of PKP1 to the cytoplasm and loss of intercellular adhesion in keratinocytes. Interacts with SPATA18/MIEAP (isoforms 1 and 2); a protein that also plays a role in MALM PMID 10433554 ↗ · PMID 11427721 ↗ · PMID 15159416 ↗ · PMID 15454081 ↗ · PMID 15696159 ↗ · PMID 16511572 ↗ · PMID 16959763 ↗ · PMID 17085597 ↗ · PMID 18249187 ↗ · PMID 19172738 ↗ · PMID 19640509 ↗ · PMID 22532927 ↗ · PMID 23572552 ↗ · PMID 26047703 ↗ · PMID 27030597 ↗ · PMID 28202711 ↗ · PMID 29121962 ↗ · PMID 29678907 ↗ · PMID 31835537 ↗ · PMID 33473107 ↗ · PMID 36732624 ↗ |
| 細胞定位 | YWHAG 位於細胞質、胞質溶膠與粒線體基質;MALM(粒線體蛋白質分解代謝過程)誘導後,YWHAG 會轉移至粒線體基質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytosol; Mitochondrion matrix; Translocates to the mitochondrial matrix following induction of MALM (mitochondrial protein catabolic process) PMID 22532927 ↗ |
| 疾病關聯 | YWHAG 基因變異與發育性及癲癇性腦病 56(DEE56)相關,該病為常染色體顯性疾病。DEE56 是嚴重的早發癲癇性腦病,患者在癲癇發作前發育正常,發作後出現認知與動作發展遲緩;其特徵包括難治性發作、神經發育受損及預後不佳。 | 含實驗來源 | 證據與來源Developmental and epileptic encephalopathy 56 DEE56 A form of epileptic encephalopathy, a heterogeneous group of severe early-onset epilepsies characterized by refractory seizures, neurodevelopmental impairment, and poor prognosis. Development is normal prior to seizure onset, after which cognitive and motor delays become apparent. DEE56 is an autosomal dominant condition. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617665 PMID 28777935 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCAGCCGCCTCGCGCCCGGTCCCGCGGTCGCAGCTCCAGC40CGCCTCCTCCGCGCAGCCGCCGCCTCAGCTGCTCGCTCTG80TGGGTCGGTCCTCTCCGGCACTTGGGCTCCAGTCGCGCCC120TCCAAGCCCTTCAGGCCGCCCCAGTGTCCTCCTCCTTCTC160CGGCCAGACCCAGCCCCGCGAAGATGGTGGACCGCGAGCA200ACTGGTGCAGAAAGCCCGGCTGGCCGAGCAGGCGGAGCGC240TACGACGACATGGCCGCGGCCATGAAGAACGTGACAGAGC280TGAATGAGCCACTGTCGAATGAGGAACGAAACCTTCTGTC320TGTGGCCTACAAGAACGTTGTGGGGGCACGCCGCTCTTCC360TGGAGGGTCATCAGTAGCATTGAGCAGAAGACATCTGCAG400ACGGCAATGAGAAGAAGATTGAGATGGTCCGTGCGTACCG440GGAGAAGATAGAGAAGGAGTTGGAGGCTGTGTGCCAGGAT480GTGCTGAGCCTGCTGGATAACTACCTGATCAAGAATTGCA520GCGAGACCCAGTACGAGAGCAAAGTGTTCTACCTGAAGAT560GAAAGGGGACTACTACCGCTACCTGGCTGAAGTGGCCACC600GGAGAGAAAAGGGCGACGGTGGTGGAGTCCTCCGAGAAGG640CCTACAGCGAAGCCCACGAGATCAGCAAAGAGCACATGCA680GCCCACCCACCCCATCCGATTAGGCCTGGCTCTTAACTAC720TCCGTCTTCTACTATGAGATCCAGAACGCCCCAGAGCAAG760CGTGCCACTTGGCCAAGACCGCGTTCGACGACGCCATCGC800CGAGCTTGACACCCTCAACGAGGACTCCTACAAGGACTCC840ACGCTCATCATGCAGCTCCTCCGCGACAACCTCACGCTCT880GGACGAGCGACCAGCAGGACGACGATGGCGGCGAAGGCAA920CAATTAAGGCCCCAGGGGAACTGGCAGCGCACGCGGATGC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。