基因總覽
YWHAE 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein epsilon，其產物屬於 14-3-3 family。14-3-3 protein epsilon 是接頭蛋白，能與多種夥伴結合，並參與一般及專一性訊息傳遞途徑的調節。其互作常涉及辨識夥伴上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序；結合後通常會調節該夥伴的活性。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000264335 ★ | 1,344,275–1,400,222 | 6 |
| ENST00000571732 | 1,344,275–1,400,220 | 7 |
| ENST00000573026 | 1,344,275–1,400,326 | 2 |
| ENST00000575977 | 1,344,275–1,400,326 | 3 |
| ENST00000928923 | 1,344,275–1,400,326 | 6 |
| ENST00000928925 | 1,344,275–1,400,326 | 6 |
| ENST00000928926 | 1,344,275–1,400,326 | 6 |
| ENST00000928927 | 1,344,275–1,400,326 | 5 |
| ENST00000946803 | 1,344,275–1,400,326 | 6 |
| ENST00000979192 | 1,344,275–1,400,326 | 5 |
| ENST00001090571 | 1,344,275–1,400,326 | 6 |
| ENST00001138722 | 1,344,275–1,400,326 | 6 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
14-3-3 protein epsilon 作為接頭蛋白，參與多種一般及專一性訊息傳遞途徑的調節。它可與大量夥伴結合，通常藉由辨識夥伴上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序；這類結合通常會調節夥伴的活性，但此作用描述依據序列相似性推定。
在熱休克反應相關調控中，YWHAE 正向調節已磷酸化的 HSF1 由細胞核輸出至細胞質；另有資料指出，YWHAE 與磷酸化 HSF1 的互作可在 ERK 依賴的情況下促進其滯留於細胞質。這些描述指出 YWHAE 可透過調節蛋白質的位置，參與訊息調控。
在抗病毒反應中，YWHAE 透過與 RIGI 互作，正向參與位於 TBK1 上游的訊息傳遞。其作用方式包括促使 RIGI 從細胞質重新分布至粒線體相關膜，使 RIGI 能在病毒感染期間介導依賴 MAVS 的先天免疫訊息傳遞。
YWHAE 也與細胞增殖抑制及細胞週期停滯相關。它可促使 HNRNPC 從細胞核輸出至細胞質，並使 HNRNPC 經泛素化而降解。這項作用將蛋白質位置改變與降解連結起來，來源所述結果是抑制增殖並促進細胞週期停滯。
Promoter 與基因調控
>YWHAE ENST00000264335 GRCh38 chr17:1400122-1401222 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTGTAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATGACAGGC ATGCACCACCATGCCAAGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTATATTGGCCAGGCT GGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCTCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATGACAGGCATGAGC CGCCGCGCCCGGCCAGGGCCCGGTTCGTTACCCTGAGTCTAAAAGTGTCTGAAAAAGGCCCATGACCAGG CTTGGCCGAGAAAACTAGGACGTGGGCTGGGCGCGGTGGCTCACCCCTGGAATCCCAGCGCTTTGGGAGG CCGAGGGGGGGCGGATCATCTGAGGTCGGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCT CTATTAAAAATACAAAAGCTGGGGGTGGTGGCGGGGGCCTGAAATCCCAGCTACTCGAGAGGCTGAGGCA GCAGAATCACTTGAACCCGGGAAGGCGGACGTTGTGGTAACCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTG GGGAACAAGAGGGAAACTCCGTCTCAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAACCAGGGCGC GGTAGTGACAGCCTCAGATTTCGGGAAAGAAGACCTGCCATGACAGAAACCGTTACAGCCTCCGTCGTTC TTTTCCGCAGGTCGGGCCTCGGGCCCCGGTCTGACCCAGGTCTCTCGCTGGCTTTTTTCAGGAGCAGTCC CGGCCGGCCCCGCCTCAGCCCTTCTCGTTCCCCGGGGGCCGCTCCCTTTCGGCAGTCGCAGTTCCCGCCT CTGGGCTCCGGCGCCCGCTGAGCCGACAGAGGAGAGGCGTCTCGTGCGCTCGTTCCAGCCGCTTCGGGCG CCGAGTTCCAGGACCCGCCCCCCGCGCCAGTTGCCAGGGAGCGGTTGCCATAGAGCTGAGCAGTTGTCCG CGTGCGCAGGCGGAAGTCCCGGATTGAGGCGCCGCCATTTTTGCTGCCCGGACGCGGAGCGAGAGGCTGA GAGAGTCGGAGACACTATCCGCTTCCATCCGTCGCGCAGACCCTGCCGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| YWHAE_1 ↗ | 17:1,400,199 | 負股 | 1,400,189–1,400,248 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_D3TL · enhancer · 1398068–1400170 · regulatory
ENSR17_B9HL · promoter · 1400171–1400712 · regulatory
· motif · 1395901–1395913 · motif
· motif · 1395903–1395910 · motif
· motif · 1395903–1395918 · motif
· motif · 1398644–1398652 · motif
· motif · 1398644–1398661 · motif
· motif · 1399570–1399580 · motif
· motif · 1399729–1399739 · motif
· motif · 1399777–1399787 · motif
· motif · 1399864–1399873 · motif
· motif · 1399911–1399922 · motif
· motif · 1399959–1399969 · motif
· motif · 1400030–1400041 · motif
· motif · 1400098–1400114 · motif
· motif · 1400140–1400160 · motif
· motif · 1400203–1400213 · motif
· motif · 1400225–1400236 · motif
· motif · 1400225–1400236 · motif
· motif · 1400229–1400240 · motif
· motif · 1400229–1400240 · motif
· motif · 1400235–1400246 · motif
· motif · 1400235–1400246 · motif
· motif · 1400729–1400743 · motif
· motif · 1400729–1400743 · motif
· motif · 1402391–1402404 · motif
· motif · 1402391–1402404 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：255 aa
14-3-3 protein epsilon 屬於 14-3-3 family，蛋白質長度為 255 個胺基酸。序列第 234–255 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
14-3-3 protein epsilon 見於細胞核與細胞質；另在第一至第四期的黑色素體分餾樣本中，經質譜分析辨識到此蛋白質。 來源未提供其定位隨條件改變的具體動態。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Melanosome。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 199 個夥伴
- ABL1P00519 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ABLIM1O14639 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ABTB2Q8N961 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ACDQ96AP0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ALPK1Q96QP1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APAF1O14727 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARAFP10398 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- ARHGEF16Q5VV41 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARHGEF2Q92974 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ATAT1Q5SQI0 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- BADQ92934 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- BAIAP2Q9UQB8 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- BMPR2Q13873 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BMXP51813 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BRAFP15056 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- BRSK2Q8IWQ3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BUB1BO60566 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CAMK2AQ9UQM7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CAMK2DQ13557 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CAMKK1Q8N5S9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBLP22681 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CBX4O00257-3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CBY1Q9Y3M2 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CCDC125Q86Z20 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
YWHAE 可形成同源二聚體，也會與 YWHAZ 形成異源二聚體。它與多種蛋白質有互作，包括 RIGI、TRIM25、HSF1、HNRNPC、ATP2B1 與 ATP2B3；部分互作具有磷酸化條件，例如磷酸化型 ABL1 與 HSF1。功能關係方面，YWHAE 與 RIGI 的互作參與抗病毒訊息傳遞；與 HSF1、HNRNPC 的互作則分別關聯於 HSF1 的細胞質滯留，以及 HNRNPC 的輸出與降解。病毒感染時，YWHAE 亦與 HCV core protein 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | YWHAE 是參與多種一般及專一性訊息傳遞調節的接頭蛋白，通常辨識夥伴上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序，結合後一般會調節夥伴活性。它可促進磷酸化 HSF1 輸出至細胞質，並透過 RIGI 參與 TBK1 上游的抗病毒訊息；同時促使 RIGI 移至粒線體相關膜以介導依賴 MAVS 的先天免疫訊息。YWHAE 也會促使 HNRNPC 移至細胞質並經泛素化降解，與增殖抑制及細胞週期停滯相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adapter protein implicated in the regulation of a large spectrum of both general and specialized signaling pathways. Binds to a large number of partners, usually by recognition of a phosphoserine or phosphothreonine motif. Binding generally results in the modulation of the activity of the binding partner (By similarity). Positively regulates phosphorylated protein HSF1 nuclear export to the cytoplasm. Plays a positive role in the antiviral signaling pathway upstream of TBK1 via interaction with RIGI. Mechanistically, directs RIGI redistribution from the cytosol to mitochondrial associated membranes where it mediates MAVS-dependent innate immune signaling during viral infection. Plays a role in proliferation inhibition and cell cycle arrest by exporting HNRNPC from the nucleus to the cytoplasm to be degraded by ubiquitination PMID 12917326 ↗ · PMID 21189250 ↗ · PMID 22607805 ↗ · PMID 35343654 ↗ · PMID 37555661 ↗ · PMID 37599448 ↗ |
| 交互作用 | YWHAE 可形成同源二聚體，並與 YWHAZ 形成異源二聚體；它也與多種蛋白質互作，包括 AANAT、ABL1、HSF1、RIGI、TRIM25、HNRNPC、ATP2B1 及 ATP2B3 等。若干互作依賴磷酸化狀態或特定位點，例如磷酸化型 HSF1、ABL1、GRB10、SRPK2、SOS1、ZFP36，以及特定位點磷酸化的 DAPK2 與 CRTC2/CRTC3。部分互作伴隨特定功能關係，如影響 HSF1 或 KLHL22 的定位、抑制 ATP2B1/ATP2B3 的鈣運輸 ATPase 活性，或促進 GPR15 的內質網至高基氏體運輸。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Heterodimerizes with YWHAZ. Interacts with PKA-phosphorylated AANAT. Interacts with ABL1 (phosphorylated form); the interaction retains it in the cytoplasm. Interacts with ARHGEF28 (By similarity). Interacts with BEX3 (By similarity). Weakly interacts with CDKN1B. Interacts with the 'Thr-369' phosphorylated form of DAPK2. Interacts with DENND1A. Interacts with GAB2. Interacts with phosphorylated GRB10. Interacts with KSR1. Interacts with NDEL1 (By similarity). Interacts with PI4KB, TBC1D22A and TBC1D22B. Interacts with the phosphorylated (by AKT1) form of SRPK2. Interacts with TIAM2. Interacts with the 'Ser-1134' and 'Ser-1161' phosphorylated form of SOS1 (By similarity). Interacts with ZFP36 (via phosphorylated form) (By similarity). Interacts with SLITRK1. Interacts with HSF1 (via phosphorylated form); this interaction promotes HSF1 sequestration in the cytoplasm in a ERK-dependent manner. Interacts with RIPOR2 isoform 2. Interacts with KLHL22; required for the nuclear localization of KLHL22 upon amino acid starvation. Interacts with CRTC1. Interacts with CRTC2 (probably when phosphorylated at 'Ser-171'). Interacts with CRTC3 (probably when phosphorylated at 'Ser-162' and/or 'Ser-273'). Interacts with ATP2B1 and ATP2B3; this interaction inhibits calcium-transporting ATPase activity. Interacts with MEFV. Interacts with RIGI. Interacts with TRIM25. Interacts with HNRNPC. Interacts with RNF115. Interacts with GPR15; this interaction promotes ER-to-Golgi transport of GPR15 PMID 10409742 ↗ · PMID 11427721 ↗ · PMID 12042314 ↗ · PMID 12917326 ↗ · PMID 15696159 ↗ · PMID 15722337 ↗ · PMID 16376338 ↗ · PMID 17085597 ↗ · PMID 18029012 ↗ · PMID 19172738 ↗ · PMID 19592491 ↗ · PMID 19640509 ↗ · PMID 21189250 ↗ · PMID 22607805 ↗ · PMID 23572552 ↗ · PMID 25588844 ↗ · PMID 26047703 ↗ · PMID 26055712 ↗ · PMID 27030597 ↗ · PMID 29769719 ↗ · PMID 30611118 ↗ · PMID 35343654 ↗ · PMID 37555661 ↗ · PMID 37599448 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染的情境下，YWHAE 與 HCV core protein 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | YWHAE 位於細胞核與細胞質；此外，在第一至第四期的黑色素體分餾樣本中，曾以質譜分析辨識到此蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Melanosome; Identified by mass spectrometry in melanosome fractions from stage I to stage IV PMID 12917326 ↗ · PMID 37599448 ↗ · PMID 12042314 ↗ · PMID 17081065 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGATTGAGGCGCCGCCATTTTTGCTGCCCGGACGCGGAGC40GAGAGGCTGAGAGAGTCGGAGACACTATCCGCTTCCATCC80GTCGCGCAGACCCTGCCGGAGCCGCTGCCGCTATGGATGA120TCGAGAGGATCTGGTGTACCAGGCGAAGCTGGCCGAGCAG160GCTGAGCGATACGACGAAATGGTGGAGTCAATGAAGAAAG200TAGCAGGGATGGATGTGGAGCTGACAGTTGAAGAAAGAAA240CCTCCTATCTGTTGCATATAAGAATGTGATTGGAGCTAGA280AGAGCCTCCTGGAGAATAATCAGCAGCATTGAACAGAAAG320AAGAAAACAAGGGAGGAGAAGACAAGCTAAAAATGATTCG360GGAATATCGGCAAATGGTTGAGACTGAGCTAAAGTTAATC400TGTTGTGACATTCTGGATGTACTGGACAAACACCTCATTC440CAGCAGCTAACACTGGCGAGTCCAAGGTTTTCTATTATAA480AATGAAAGGGGACTACCACAGGTATCTGGCAGAATTTGCC520ACAGGAAACGACAGGAAGGAGGCTGCGGAGAACAGCCTAG560TGGCTTATAAAGCTGCTAGTGATATTGCAATGACAGAACT600TCCACCAACGCATCCTATTCGCTTAGGTCTTGCTCTCAAT640TTTTCCGTATTCTACTACGAAATTCTTAATTCCCCTGACC680GTGCCTGCAGGTTGGCAAAAGCAGCTTTTGATGATGCAAT720TGCAGAACTGGATACGCTGAGTGAAGAAAGCTATAAGGAC760TCTACACTTATCATGCAGTTGTTACGTGATAATCTGACAC800TATGGACTTCAGACATGCAGGGTGACGGTGAAGAGCAGAA840TAAAGAAGCGCTGCAGGACGTGGAAGACGAAAATCAGTGA880GACATAAGCCAACAAGAGAAACCATCTCTGACCACCCCCT920CCTCCCCATCCCACCCTTTGGAAACTCCCCATTGTCACTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。