基因總覽
YWHAB 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta。其產物屬於 14-3-3 family，是一種 adapter protein，可與多種細胞內蛋白質夥伴互動。來源指出，這類互動通常涉及辨識夥伴上的 phosphoserine 或 phosphothreonine 基序；結合後常會調節夥伴的活性。這些特性使 YWHAB 能參與廣泛的一般性與專一性訊息傳遞調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000353703 ★ | 44,885,705–44,908,532 | 6 |
| ENST00000372839 | 44,885,676–44,908,715 | 7 |
| ENST00000879921 | 44,885,676–44,908,715 | 7 |
| ENST00000879923 | 44,885,676–44,908,715 | 6 |
| ENST00000879925 | 44,885,676–44,908,715 | 7 |
| ENST00000879926 | 44,885,676–44,906,527 | 6 |
| ENST00000879927 | 44,885,676–44,908,715 | 6 |
| ENST00000920367 | 44,885,676–44,908,715 | 8 |
| ENST00000920368 | 44,885,676–44,908,715 | 5 |
| ENST00000957067 | 44,885,676–44,908,715 | 7 |
| ENST00000957068 | 44,885,676–44,908,715 | 5 |
| ENST00000957069 | 44,885,676–44,908,715 | 8 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
YWHAB 參與調節多種一般性與專一性訊息傳遞途徑。它作為 adapter protein，通常辨識夥伴蛋白上的 phosphoserine 或 phosphothreonine 基序；結合後往往會調節該夥伴的活性。來源未將這種調節限定為單一作用方向，而是指出其作用取決於所結合的夥伴及相關訊息途徑。
在骨生成方面，YWHAB 被描述為負向調節因子。它也能限制 SRPK2 相關的神經元凋亡途徑：當 SRPK2 經 AKT1 磷酸化後，YWHAB 與之互動並阻止其進入細胞核，進而拮抗 SRPK2 對 cyclin D1 表現的刺激作用。來源指出，這一連串作用會阻止由 SRPK2 引發的神經元凋亡。
此外，YWHAB 是經由 AKAP13 促進 MAP kinases 活化之訊息級聯的負向調節因子。這些作用顯示，YWHAB 可依不同訊息情境調整夥伴活性或限制特定訊息傳遞結果；現有資料支持其參與多類調控，但未進一步界定所有途徑的分子細節。
Promoter 與基因調控
>YWHAB ENST00000353703 GRCh38 chr20:44884705-44885805 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTGACACTGCCTGGGCGACAGAAAGAGACTCTGTCTCAAAAACAGAAAACAAAACAAAACAAAACAAAAC AAAATCAACTACCTTCAGAGGAGTAGAATGTTGGTAATTGTGAGAGCAGTCATGGAGGGGAGGGGAGCCA TGGAGGCCTGTTTCCTTCCCTGAACTTCCTCAACGAGGGGGCATCTTAAAGAAGAAATCATGTACACAGA TTTTTGTGGGTTTTTTTTGGAGACAGGGTCTCACTCTGTCTCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCATGACCAT AGCTCACTGCAGCCTACAACTCCCGGCCTCAAGCAATCCTCTCACCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGAGATT ACAGGCGCGAACCACTGCGCTCGACCCTACACAGGTTTTTTAAAAAGACGTTTGTGCATTGGATTCCTGG CACTTCACGTGGCCTCTTCAGTCTACCAAAGAAGGAAAAGGTAAGTACCCTGAAGGATTGAAAGGATTAA ATGAACATTGAGGGATGAGCAATTTCTGTTCTTCCCTGGCTCCAGCATTACCAAAGCACACAGTAAGAGG ACTGACATCGGCCTCCGACCCAGTGAGGATTACTTTCGGGGTGGAGGGGGAACTGCTAAACCTCGAATCT CCGGGACTGGCCCTGGCGCGTTTCCAGTCCCAGCAGAAAGGGCAATCCCCATCCAGACCACACTCCTAGT CCTCCTTATTCCCACACAGCCCGTATCTTGACCACCCCCAGCTCCGCCCTCTCTCCTCCCACCTCCTTTT CCCGCTCCCCCGCCCCATTTCCTTCTTCTCCGCCCACCTCCTCCTGGGTCCCTCCCCCGGCCATCCGCCC TGCCCCGGCCCCTGCAACCCTGCCTTTCGCTCTTCTTCCTCCTCCCTTCCGTCTGCGCCCCTCCCGTGGG GCCGTGGCAACCCCGTGCCTCGCTTGCCCAATGAGAACACGGTTTGGGGCGGGGCGCGGCCAGGACCGGA GCGGAAGTGGCGATCGGAGCGGAAGTGGAGCTACCGCCACCGCCGCCGCCGATTCCGGAGCCGGGGTAGT CGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCAGCCACTGCAGGCACCGCTGCCGCCGCCTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| YWHAB_1 ↗ | 20:44,885,717 | 正股 | 44,885,668–44,885,727 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_BBWHR · enhancer · 44884755–44885593 · regulatory
ENSR20_83BM3H · promoter · 44885594–44885721 · regulatory
ENSR20_C6G8Z · enhancer · 44885722–44887278 · regulatory
ENSR20_5DK3JK · CTCF_binding_site · 44886208–44886229 · regulatory
ENSR20_9MS3M · enhancer · 44888590–44888974 · regulatory
· motif · 44885353–44885367 · motif
· motif · 44885464–44885478 · motif
· motif · 44885475–44885485 · motif
· motif · 44885481–44885491 · motif
· motif · 44885522–44885532 · motif
· motif · 44885588–44885602 · motif
· motif · 44885659–44885669 · motif
· motif · 44885679–44885693 · motif
· motif · 44885682–44885693 · motif
· motif · 44885684–44885693 · motif
· motif · 44885697–44885711 · motif
· motif · 44885700–44885711 · motif
· motif · 44885702–44885711 · motif
· motif · 44885703–44885717 · motif
· motif · 44885827–44885834 · motif
· motif · 44886061–44886070 · motif
· motif · 44886210–44886226 · motif
· motif · 44887239–44887252 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：246 aa
YWHAB 的蛋白質產物屬於 14-3-3 family。所提供的蛋白質家族資料未列出特定結構域、序列區段或其他結構註解，因此不據此延伸描述其蛋白質架構。
蛋白質三維結構
細胞內定位
YWHAB 位於細胞質；質譜分析也在黑色素體分餾樣本中檢出此蛋白，涵蓋 stage I 至 stage IV。 Chlamydia trachomatis 感染時，YWHAB 與病原體所在的液泡膜相關，並與 IncG 共定位；此定位情境限於感染條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Melanosome；Vacuole membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 48 個夥伴
- ADAM22Q9P0K1-3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- AKAP13Q12802 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- AKT1S1Q96B36 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ALS2A0A0S2Z5Q7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- BADQ92934 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- BRAFP15056 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- CBLP22681 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- CBX4O00257 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC25AP30304 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- CDC25BP30305 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CDC25CP30307 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CDK14O94921 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- CHEK1O14757 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRTC2Q53ET0 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- DACT1Q9NYF0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- DYRK1AQ13627-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAB2Q9UQC2 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- GEMP55040 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- HDAC4P56524 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- LRRK2Q5S007 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MAP3K3Q99759 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MAP3K5Q99683 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
YWHAB 可形成同源二聚體，並與 SFN、YWHAG 或 YWHAQ 形成異源二聚體（By similarity）。另有多種蛋白質互作紀錄；例如，YWHAB 與 AKAP13 互作，且與 AKT1 磷酸化的 SRPK2 結合。與 ABL1 的互作則與 ABL1 位於細胞質及抑制 cABL-mediated apoptosis 有關。感染情境下，YWHAB 與 herpes simplex virus 1 蛋白 UL46 互作；與 Chlamydia trachomatis 蛋白 IncG 的互作則標示為可能。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | YWHAB 是參與廣泛一般性與專一性訊息傳遞調節的 adapter protein，通常透過辨識夥伴的 phosphoserine 或 phosphothreonine 基序結合，並調節夥伴活性。它負向調節骨生成及經 AKAP13 介導、促進 MAP kinases 活化的訊息級聯；此外會阻止 AKT1 磷酸化的 SRPK2 進入細胞核，拮抗其促進 cyclin D1 表現的作用，因而阻止 SRPK2 引發的神經元凋亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adapter protein implicated in the regulation of a large spectrum of both general and specialized signaling pathways. Binds to a large number of partners, usually by recognition of a phosphoserine or phosphothreonine motif. Binding generally results in the modulation of the activity of the binding partner. Negative regulator of osteogenesis. Blocks the nuclear translocation of the phosphorylated form (by AKT1) of SRPK2 and antagonizes its stimulatory effect on cyclin D1 expression resulting in blockage of neuronal apoptosis elicited by SRPK2. Negative regulator of signaling cascades that mediate activation of MAP kinases via AKAP13 PMID 17717073 ↗ · PMID 19592491 ↗ · PMID 21224381 ↗ |
| 交互作用 | YWHAB 可形成同源二聚體，並與 SFN、YWHAG、YWHAQ 形成異源二聚體（By similarity）；另與多種蛋白質互作。特定結果包括：與 ABL1 結合使其位於細胞質並抑制 cABL-mediated apoptosis；與 ROR2 二聚體互作後，YWHAB 會在酪胺酸殘基上磷酸化；與 TESK1 的結合依賴 TESK1 Ser-437 磷酸化，並抑制 TESK1 kinase 活性。部分互作取決於夥伴的磷酸化或特定條件，例如 AKT1 磷酸化的 SRPK2、chemokine 依賴的 RIPOR2 isoform 2，以及與 SYNPO2 互作時和 ACTN2 競爭。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Forms heterodimers with SFN, YWHAG or YWHAQ (By similarity). Interacts with SAMSN1 and PRKCE (By similarity). Interacts with AKAP13. Interacts with SSH1 and TORC2/CRTC2. Interacts with ABL1; the interaction results in cytoplasmic location of ABL1 and inhibition of cABL-mediated apoptosis. Interacts with ROR2 (dimer); the interaction results in phosphorylation of YWHAB on tyrosine residues. Interacts with GAB2. Interacts with YAP1 (phosphorylated form). Interacts with the phosphorylated (by AKT1) form of SRPK2. Interacts with PKA-phosphorylated AANAT. Interacts with MYO1C. Interacts with SIRT2. Interacts with the 'Thr-369' phosphorylated form of DAPK2. Interacts with PI4KB, TBC1D22A and TBC1D22B. Interacts with the 'Ser-1134' and 'Ser-1161' phosphorylated form of SOS1. Interacts (via phosphorylated form) with YWHAB; this interaction occurs in a protein kinase AKT1-dependent manner. Interacts with SLITRK1. Interacts with SYNPO2 (phosphorylated form); YWHAB competes with ACTN2 for interaction with SYNPO2 (By similarity). Interacts with RIPOR2 (via phosphorylated form) isoform 2; this interaction occurs in a chemokine-dependent manner and does not compete for binding of RIPOR2 with RHOA nor blocks inhibition of RIPOR2-mediated RHOA activity. Interacts with MARK2 and MARK3. Interacts with TESK1; the interaction is dependent on the phosphorylation of TESK1 'Ser-437' and inhibits TESK1 kinase activity. Interacts with MEFV. Interacts with HDAC4. Interacts with ADAM22 (via C-terminus) PMID 11427721 ↗ · PMID 11555644 ↗ · PMID 15159416 ↗ · PMID 15454081 ↗ · PMID 15538381 ↗ · PMID 15696159 ↗ · PMID 15882968 ↗ · PMID 16959763 ↗ · PMID 17085597 ↗ · PMID 17717073 ↗ · PMID 17974916 ↗ · PMID 18249187 ↗ · PMID 19172738 ↗ · PMID 19592491 ↗ · PMID 19640509 ↗ · PMID 21224381 ↗ · PMID 22827337 ↗ · PMID 23572552 ↗ · PMID 24636949 ↗ · PMID 25588844 ↗ · PMID 26047703 ↗ · PMID 27030597 ↗ · PMID 33537682 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，YWHAB 與 herpes simplex virus 1 蛋白 UL46 互作。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，YWHAB 可能與 Chlamydia trachomatis 蛋白 IncG 互作；來源將此互作標示為可能，而非確定。 | 推論支持 | 證據與來源(Microbial infection) Probably interacts with Chlamydia trachomatis protein IncG PMID 11260479 ↗ |
| 細胞定位 | YWHAB 位於細胞質，並以質譜方式在 stage I 至 stage IV 的黑色素體分餾樣本中檢出。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Melanosome; Identified by mass spectrometry in melanosome fractions from stage I to stage IV PMID 17081065 ↗ |
| 細胞定位 | Chlamydia trachomatis 感染時，YWHAB 與病原體所在的液泡膜相關，並在該處與 IncG 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Vacuole membrane; (Microbial infection) Upon infection with Chlamydia trachomatis, this protein is associated with the pathogen-containing vacuole membrane where it colocalizes with IncG PMID 11260479 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGAAGTGGAGCTACCGCCACCGCCGCCGCCGATTCCGGAG40CCGGGGTAGTCGCCGCCGCCGCCGCCGCTGCAGCCACTGC80AGGCACCGCTGCCGCCGCCTGAGTAGTGGGCTTAGGAAGG120AAGAGGTCATCTCGCTCGGAGCTTCGCTCGGAAGGGTCTT160TGTTCCCTGCAGCCCTCCCACGGGAATGACAATGGATAAA200AGTGAGCTGGTACAGAAAGCCAAACTCGCTGAGCAGGCTG240AGCGATATGATGATATGGCTGCAGCCATGAAGGCAGTCAC280AGAACAGGGGCATGAACTCTCCAACGAAGAGAGAAATCTG320CTCTCTGTTGCCTACAAGAATGTGGTAGGCGCCCGCCGCT360CTTCCTGGCGTGTCATCTCCAGCATTGAGCAGAAAACAGA400GAGGAATGAGAAGAAGCAGCAGATGGGCAAAGAGTACCGT440GAGAAGATAGAGGCAGAACTGCAGGACATCTGCAATGATG480TTCTGGAGCTGTTGGACAAATATCTTATTCCCAATGCTAC520ACAACCAGAAAGTAAGGTGTTCTACTTGAAAATGAAAGGA560GATTATTTTAGGTATCTTTCTGAAGTGGCATCTGGAGACA600ACAAACAAACCACTGTGTCGAACTCCCAGCAGGCTTACCA640GGAAGCATTTGAAATTAGTAAGAAAGAAATGCAGCCTACA680CACCCAATTCGTCTTGGTCTGGCACTAAATTTCTCAGTCT720TTTACTATGAGATTCTAAACTCTCCTGAAAAGGCCTGTAG760CCTGGCAAAAACGGCATTTGATGAAGCAATTGCTGAATTG800GATACGCTGAATGAAGAGTCTTATAAAGACAGCACTCTGA840TCATGCAGTTACTTAGGGACAATCTCACTCTGTGGACATC880GGAAAACCAGGGAGACGAAGGAGACGCTGGGGAGGGAGAG920AACTAATGTTTCTCGTGCTTTGTGATCTGTTCAGTGTCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。