基因總覽
YES1（YES proto-oncogene 1, Src family tyrosine kinase）是蛋白質編碼基因，其產物 Tyrosine-protein kinase Yes 為非受體型蛋白酪胺酸激酶，屬於蛋白激酶超家族中的酪胺酸蛋白激酶家族及 SRC 次家族。蛋白質長 543 個胺基酸，包含 SH3、SH2 與蛋白激酶結構域；其 N 端另有一段被註記為無序區域。這些特徵構成 YES1 的基本分子架構，而其在細胞中的具體作用依不同訊號與生物學過程而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000314574 ★ | 721,588–812,242 | 12 |
| ENST00000577961 | 721,588–775,266 | 12 |
| ENST00000584307 | 721,588–812,546 | 12 |
| ENST00000892684 | 721,588–813,004 | 12 |
| ENST00000892685 | 721,588–812,578 | 12 |
| ENST00000892686 | 721,588–812,357 | 11 |
| ENST00000892687 | 721,588–812,284 | 13 |
| ENST00000892688 | 721,588–812,979 | 12 |
| ENST00000892689 | 721,588–812,570 | 11 |
| ENST00000925072 | 721,588–812,875 | 11 |
| ENST00000925073 | 721,588–812,561 | 11 |
| ENST00000925074 | 721,588–812,322 | 12 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
YES1 是非受體型蛋白酪胺酸激酶，可透過催化蛋白質酪胺酸磷酸化，參與細胞生長與存活、凋亡、細胞間黏附、細胞骨架重塑及分化等過程。包括 EGFR、PDGFR、CSF1R 與 FGFR 在內的受體酪胺酸激酶受到刺激後，YES1 會被募集至磷酸化受體，接著活化並磷酸化下游受質。其催化反應以 ATP 作為磷酸基來源，並產生 ADP。
在細胞連結調控方面，EGFR 活化後，YES1 可促進 PARD3 磷酸化，有利於上皮細胞緊密連結組裝。在細胞間接觸處，YES1 也可刺激 FYN 與 FER，參與 CTNND1 等特定連結成分的磷酸化。這些作用將受體訊號與細胞連結的組成及組裝相連結。
YES1 亦參與細胞移動相關訊號。CXCL12 刺激 T 細胞時，YES1 磷酸化 collapsin response mediator protein 2／DPYSL2，並誘導 T 細胞移動；它也參與 CD95L/FASLG 訊號路徑，並介導 AKT 相關的細胞移動。這些資料指出 YES1 在特定刺激條件下，與細胞移動反應有關。
在細胞週期中，YES1 磷酸化 cyclin-dependent kinase 4（CDK4），藉此調節 G1 期；它也參與 G2/M 期進程與細胞質分裂。此外，YES1 可磷酸化有機陽離子轉運蛋白 OCT2，並促使其轉運活性增加。這些作用顯示 YES1 的受質不只涉及訊號與細胞結構調控，也包括細胞週期蛋白及膜轉運蛋白。
Promoter 與基因調控
>YES1 ENST00000314574 GRCh38 chr18:812142-813242 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAGGTGCGTGTATTCAGACGGACACGATTCCAGCTGTGGCTCCTCCACTTTCAGGGTCGCTGTTTCCAC AGTTGACAAGCAGGAGAACCATACTTGTTGCACTTCCCTCACTGGGCTGCCGCCAGCATCATATAGAAAA ACGCTGTCCCAACATAAGCCAAAGCCACCATGACTGGGATAGTCGCCAAACAGAACTCAGCTTCGGTTCC CCTCCCGGCAAGGCTGGTTCGACCTACAGTCAACAGGAAGCTCCTGGGGGCAGGGACAGGATCCCTGCCT CGGAAGGAGGCAAGACGTGAACGTTTTTTGGACGGCGATCAGGATGGTGATGAGGGTGTGAGTAACGCCC CCGGCTCACGCGGTTGGGCTTGAGATTTTACTACCAACGACAAAGGGTGCGGAAGCGTAGCGCTGAGAAG CAAACAGCCAACCAAAAAAACTCAACCCCGTCCTCCCCCACAAAAGCAAGCCCCAAAGCCCTGGCCACTA CTGAGAGCTGGGCCAAGGAACAGAGAAAGGCAGAGGGGCAGAATCGGAGCGCTCCATTCAATCTCCGCGG CAGCCGAGCGTCGGTGGGTTCGCGGGTGGGAAGGGACGCCGCGGGCCTGCTCTCCGGGCAGGGAAGCACC TCCTCCTCACGCCCCCTCGGCCTGCACCGCCCCCGGGAATCCGCCCCGGACCCCGCCGCCATGTTGGGTC GGGAGAAGTGACACGGACCGGTCGCCTATCCTGACCACAGCAAAGCGGCCCGGAGCCCGCGGAGGGGACC TGACGGGGGCGTAGGCGCCGGAAGGCTGGGGGCCCCGGAGCCGGGCCGGCGTGGCCCGAGTTCCGGTGAG CGGACGGCGGCGCGCGCAGGTACCCGCAGCCCCCGCCCCCGCTAGAAGTCAGGGGGCGGGGCCGGGGGGG GGGGGCGGAGGAGGTGGAGAGTGAGGCCGAGGCGTGGGGAGCCCGGGAACTCCCTCCTCCTGAAGTAACG CGTCCCGGGCCGGCTCTGCCGTCGTTGCTGCCGCCGGGCGCCCCGGGACGAGGAGGTGGAGGAGGGAGAG GGCCCGCGGGCCTCGCCTCCGCCCTCCGCCACCTCGAGCTGCGGTAGCAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR18_B6BX · enhancer · 807820–808842 · regulatory
ENSR18_9BNH · enhancer · 810219–810597 · regulatory
ENSR18_C46N · enhancer · 810744–812231 · regulatory
ENSR18_57692 · CTCF_binding_site · 812150–812171 · regulatory
ENSR18_9BP3 · promoter · 812232–812507 · regulatory
ENSR18_576BF · CTCF_binding_site · 812458–812479 · regulatory
ENSR18_9BP6 · promoter · 812536–813036 · regulatory
ENSR18_9BPQ · enhancer · 814594–814965 · regulatory
· motif · 807288–807303 · motif
· motif · 807424–807436 · motif
· motif · 807426–807433 · motif
· motif · 809025–809038 · motif
· motif · 809025–809038 · motif
· motif · 809880–809895 · motif
· motif · 810483–810491 · motif
· motif · 810483–810500 · motif
· motif · 811602–811610 · motif
· motif · 812152–812168 · motif
· motif · 812168–812181 · motif
· motif · 812318–812331 · motif
· motif · 812324–812337 · motif
· motif · 812337–812350 · motif
· motif · 812343–812356 · motif
· motif · 812358–812371 · motif
· motif · 812406–812415 · motif
· motif · 812454–812467 · motif
· motif · 812460–812473 · motif
· motif · 812460–812476 · motif
· motif · 812549–812559 · motif
· motif · 812574–812587 · motif
· motif · 812592–812605 · motif
· motif · 812779–812792 · motif
· motif · 812834–812847 · motif
· motif · 812836–812847 · motif
· motif · 812877–812894 · motif
· motif · 812886–812899 · motif
· motif · 812898–812910 · motif
· motif · 813025–813045 · motif
· motif · 813164–813177 · motif
· motif · 813283–813294 · motif
· motif · 813283–813294 · motif
· motif · 813285–813294 · motif
· motif · 813396–813409 · motif
· motif · 813409–813420 · motif
· motif · 813454–813469 · motif
· motif · 813461–813469 · motif
· motif · 813555–813570 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：543 aa
YES1 蛋白長 543 個胺基酸，屬於蛋白激酶超家族中的酪胺酸蛋白激酶家族及 SRC 次家族。其 SH3 結構域位於第 91–152 位、SH2 結構域位於第 158–255 位，蛋白激酶結構域位於第 277–530 位；第 1–45 位則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
YES1 可位於細胞膜、細胞質、細胞骨架相關區域、微管組織中心、中心體及細胞連結。 新合成的蛋白質會先在高基氏體區域累積，再經由胞吐途徑運送至質膜；在有 SNAIL1 時，YES1 會以小型斑點分布於細胞質與細胞膜。 後述定位與 SNAIL1 的存在相關，證據註記為相似性推論。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Cell junction。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 63 個夥伴
- ADAM10O14672 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ALOX5P09917 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- AMOTL2Q9Y2J4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARP10275 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- BCAR1P56945 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BICD2Q8TD16-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C1orf94Q6P1W5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CARD9Q9H257-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBLBQ13191 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CBLCQ9ULV8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CDCP1Q9H5V8 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CEP57L1Q8IYX8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CEP83Q9Y592-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHMP1AQ9HD42 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CPSF6Q16630-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CRKLP46109 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DENND2CQ68D51-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DESP17661 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DOK2O60496 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DTX3Q8N9I9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFSO43281-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
YES1 與 YAP1、CSF1R 的互作依相似性推論；它也與 CTNND1 互作，該互作可使 YES1 介導 FYN 與 FER 活化，進而促進 CTNND1 磷酸化。YES1 另與 FASLG 及 IL6ST/gp130 互作。當 YES1 處於閉合構形時，SCRIB 可與其互作並促進 YES1 自體磷酸化。來源未將上述所有互作都描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | YES1 是非受體型蛋白酪胺酸激酶，參與調節細胞生長與存活、凋亡、細胞間黏附、細胞骨架重塑及分化。EGFR、PDGFR、CSF1R、FGFR 等受體酪胺酸激酶受刺激後，可募集 YES1 並使其活化，進而磷酸化下游受質；其他作用包括調節細胞連結、細胞移動、細胞週期，以及 OCT2 的轉運活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Non-receptor protein tyrosine kinase that is involved in the regulation of cell growth and survival, apoptosis, cell-cell adhesion, cytoskeleton remodeling, and differentiation. Stimulation by receptor tyrosine kinases (RTKs) including EGFR, PDGFR, CSF1R and FGFR leads to recruitment of YES1 to the phosphorylated receptor, and activation and phosphorylation of downstream substrates. Upon EGFR activation, promotes the phosphorylation of PARD3 to favor epithelial tight junction assembly. Participates in the phosphorylation of specific junctional components such as CTNND1 by stimulating the FYN and FER tyrosine kinases at cell-cell contacts. Upon T-cell stimulation by CXCL12, phosphorylates collapsin response mediator protein 2/DPYSL2 and induces T-cell migration. Participates in CD95L/FASLG signaling pathway and mediates AKT-mediated cell migration. Plays a role in cell cycle progression by phosphorylating the cyclin-dependent kinase 4/CDK4 thus regulating the G1 phase. Also involved in G2/M progression and cytokinesis. Catalyzes phosphorylation of organic cation transporter OCT2 which induces its transport activity PMID 11901164 ↗ · PMID 18479465 ↗ · PMID 19276087 ↗ · PMID 21566460 ↗ · PMID 21713032 ↗ · PMID 26979622 ↗ |
| 分子活性 | L-tyrosyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-tyrosyl-[protein] + ADP + H(+) | 推論支持 | |
| 交互作用 | YES1 與 YAP1、CSF1R 的互作屬相似性推論；它與 CTNND1 的互作可促進 FYN、FER 活化及 CTNND1 磷酸化。YES1 也與 FASLG、IL6ST/gp130 互作；在 YES1 處於閉合構形時，SCRIB 與其互作並促進 YES1 自體磷酸化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with YAP1 and CSF1R (By similarity). Interacts with CTNND1; this interaction allows YES1-mediated activation of FYN and FER and subsequent phosphorylation of CTNND1 (By similarity). Interacts with FASLG. Interacts with IL6ST/gp130. Interacts with SCRIB, when YES1 is in a closed conformation; the interaction facilitates YES1 autophosphorylation PMID 19807924 ↗ · PMID 25731159 ↗ · PMID 33730553 ↗ |
| 細胞定位 | YES1 可位於細胞膜、細胞質、細胞骨架相關區域、微管組織中心、中心體及細胞連結。新合成的 YES1 先在高基氏體區域累積，再經胞吐途徑前往質膜；有 SNAIL1 時，YES1 會以小型斑點分布於細胞質和細胞膜，此定位描述依相似性推論。 | 推論支持 | 證據與來源Cell membrane; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytosol; Cell junction; Newly synthesized protein initially accumulates in the Golgi region and traffics to the plasma membrane through the exocytic pathway. Localized to small puncta throughout the cytoplasm and cell membrane when in the presence of SNAIL1 (By similarity) |
核酸與蛋白質序列
GTCGTTGCTGCCGCCGGGCGCCCCGGGACGAGGAGGTGGA40GGAGGGAGAGGGCCCGCGGGCCTCGCCTCCGCCCTCCGCC80ACCTCGAGCTGCGGTAGCAGCGACTCATGAGAGCGCGGCC120GGAGGACAGATTTGATAATGGGCTGCATTAAAAGTAAAGA160AAACAAAAGTCCAGCCATTAAATACAGACCTGAAAATACT200CCAGAGCCTGTCAGTACAAGTGTGAGCCATTATGGAGCAG240AACCCACTACAGTGTCACCATGTCCGTCATCTTCAGCAAA280GGGAACAGCAGTTAATTTCAGCAGTCTTTCCATGACACCA320TTTGGAGGATCCTCAGGGGTAACGCCTTTTGGAGGTGCAT360CTTCCTCATTTTCAGTGGTGCCAAGTTCATATCCTGCTGG400TTTAACAGGTGGTGTTACTATATTTGTGGCCTTATATGAT440TATGAAGCTAGAACTACAGAAGACCTTTCATTTAAGAAGG480GTGAAAGATTTCAAATAATTAACAATACGGAAGGAGATTG520GTGGGAAGCAAGATCAATCGCTACAGGAAAGAATGGTTAT560ATCCCGAGCAATTATGTAGCGCCTGCAGATTCCATTCAGG600CAGAAGAATGGTATTTTGGCAAAATGGGGAGAAAAGATGC640TGAAAGATTACTTTTGAATCCTGGAAATCAACGAGGTATT680TTCTTAGTAAGAGAGAGTGAAACAACTAAAGGTGCTTATT720CCCTTTCTATTCGTGATTGGGATGAGATAAGGGGTGACAA760TGTGAAACACTACAAAATTAGGAAACTTGACAATGGTGGA800TACTATATCACAACCAGAGCACAATTTGATACTCTGCAGA840AATTGGTGAAACACTACACAGAACATGCTGATGGTTTATG880CCACAAGTTGACAACTGTGTGTCCAACTGTGAAACCTCAG920ACTCAAGGTCTAGCAAAAGATGCTTGGGAAATCCCTCGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。