基因總覽
YBEY 是蛋白質編碼基因，其產物名稱為 ybeY metalloendoribonuclease，屬於 Endoribonuclease YbeY 家族。來源將此蛋白質描述為單股專一性金屬內切核糖核酸酶，並指出它參與 rRNA 成熟；另有資料註明其可結合一個鋅離子。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000397701 ★ | 46,286,342–46,297,751 | 5 |
| ENST00000397694 | 46,285,831–46,297,723 | 5 |
| ENST00000397692 | 46,285,831–46,297,751 | 4 |
| ENST00000903442 | 46,285,831–46,297,751 | 6 |
| ENST00000903443 | 46,285,831–46,297,722 | 4 |
| ENST00000921777 | 46,285,831–46,297,723 | 4 |
| ENST00000921778 | 46,285,831–46,297,723 | 5 |
| ENST00000921779 | 46,285,831–46,297,732 | 5 |
| ENST00000921780 | 46,285,831–46,297,723 | 3 |
| ENST00000921781 | 46,285,831–46,297,720 | 5 |
| ENST00000949821 | 46,285,831–46,297,720 | 5 |
| ENST00001059507 | 46,285,831–46,297,732 | 4 |
顯示 12/35 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
YBEY 產物是參與 rRNA 成熟的內切核糖核酸酶。其作用具有單股專一性，亦即來源所述的核酸底物特異性指向單股形式；但現有資料未進一步說明它切割 rRNA 的位置、反應步驟或作用時機，因此不宜據此補述更細的成熟機制。
該酶被歸為金屬內切核糖核酸酶，並有結合一個鋅離子的註記。這些資訊指出其金屬離子結合特性及其參與 rRNA 成熟的角色，但未提供鋅離子在催化中的具體作用，也未說明該結合與酶活性之間的關係。
Promoter 與基因調控
>YBEY ENST00000397701 GRCh38 chr21:46285342-46286442 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTCCTGAAACAGCCTGTAGCACTAGGGAGTTCCCCTTCGTCTTTAGAACAAGCTGAAAGAGAAAAATTC AGATCATCATAGCTATGTTCTGCTACAAGTCTAAGAAAAGAATTTTTGAACACTGTCATACTAAAAGGAT AACTATTTCAAAGGCAGGCAAAGGGTTATTATTTTCTGAGAGCCGATAGGTTATTTTGTTGGAGGGTGGG GTAGAGAGTGGTACAAATAATTACTTTGTTACAGAGGTTTAAAGCGTGATCCTTTAAGATTAAAAAAAAA AAAGCCGAATCTTTTTACTGAGTTAGTAAATTCATGAAAAACCTCCATTGGCAGTAAGAAAATGAATGCT GTTCCACCTTACAACTTAGAGACGAATTTCTCCCGACTTCCTCCAATCTCTACAGCCGGAGAATTCACTG TAACGCTGTCAAAACCTTAGCGTTTCGGGATCTCCTCCCACCTGGCTTCCCTCGGAGCGGCTGGAGCGCT AAGCACTTTCTCACATTCCTTCATCGCGCCCTGGCGGCCACCCTCGAGCGGGCTGGAAGGACGAGGGCGC TGCCACGAAGCTGAGGCCTCTCGGCGGGGACGGCGTGCCCGGGGAGCCTAATCTTCCACCCAGCACAGCC CGAAACGGCGGAGGCCACGCGCTGGGCCCAGGCCGGCCTGGCCACTGTCCCGCCCCGGGCTCGCCAGGGG TCGCCGGCGCCGCAACGCTCCGTTAGCGACGATGTGGAGGCCCGGGCGCGCGGAGCTGCGTGGGGGAAGG AAACGGCGCCCCTGGCGCCGGCCCAGCCCCCACGCTCACCGTCTCGCCCCAGGACCCCGAGGCCCGCGCT GCCCACTGGCCCCTCGGAAAGACTTGAGGCGCAAGCACAGGCTGCTGCCGCGACACTCAGCGCTGCGCAC CGCGGGCAGAAAACGCCGCGGACCGACTTCCGGTTCGCTCAGCACTACCGGATTCCGCCCCGCCCGCTGC GATCCGGTTCCGCTCCCCACAACCCGCTCTGTGGCGGGGCTTCCGGTCGGGAGGGTCCGCCCGCTCTCGC GTCCTTTGCTGGGTCCAGACACCGGTACGTCCGGGCGGGTTTTTAGTCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| YBEY_1 ↗ | 21:46,286,394 | 正股 | 46,286,345–46,286,404 |
| YBEY_2 ↗ | 21:46,286,648 | 正股 | 46,286,599–46,286,658 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR21_9ND2W · promoter · 46285601–46286101 · regulatory
ENSR21_5DTXK7 · CTCF_binding_site · 46286028–46286049 · regulatory
ENSR21_9ND34 · promoter · 46286287–46286655 · regulatory
· motif · 46284231–46284242 · motif
· motif · 46284231–46284242 · motif
· motif · 46284743–46284754 · motif
· motif · 46284905–46284918 · motif
· motif · 46286030–46286046 · motif
· motif · 46286276–46286285 · motif
· motif · 46286276–46286287 · motif
· motif · 46286276–46286287 · motif
· motif · 46286276–46286290 · motif
· motif · 46286326–46286340 · motif
· motif · 46286359–46286368 · motif
· motif · 46286500–46286510 · motif
· motif · 46286534–46286544 · motif
· motif · 46286573–46286583 · motif
· motif · 46286625–46286635 · motif
· motif · 46288575–46288589 · motif
· motif · 46290424–46290439 · motif
· motif · 46290426–46290439 · motif
· motif · 46290429–46290441 · motif
· motif · 46290432–46290439 · motif
· motif · 46290432–46290447 · motif
· motif · 46290691–46290703 · motif
· motif · 46290693–46290700 · motif
· motif · 46290693–46290708 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：167 aa
ybeY metalloendoribonuclease 屬於 Endoribonuclease YbeY 家族。現有蛋白質家族資料未提供結構域、序列區段或其他結構特徵的描述。
蛋白質三維結構
細胞內定位
現有資料未描述不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- BCAT2O15382 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | YBEY 的產物被描述為單股專一性金屬內切核糖核酸酶，並參與 rRNA 成熟。資料未進一步指出其切割位置、反應步驟或作用時機。 | 推論支持 | |
| 分子活性 | YBEY 蛋白質可結合一個鋅離子。此註記未說明鋅離子在酶反應中的具體作用，也未提供其與蛋白質活性關係的資訊。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | YBEY 蛋白質的細胞內定位為細胞核。此定位資料未提供其在不同條件下是否改變，也未指出異構型之間的定位差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AACCCGCTCTGTGGCGGGGCTTCCGGTCGGGAGGGTCCGC40CCGCTCTCGCGTCCTTTGCTGGGTCCAGACACCGGTTCCG80TTGCAAACATTTTTAAAGGGCTGGTTATTCTTCCTGAAAT120GAGTTTGGTGATTAGAAATCTGCAGCGAGTCATCCCCATC160AGGAGAGCGCCACTTCGCAGTAAGATCGAGATTGTAAGGA200GGATTTTAGGAGTGCAGAAATTTGACCTGGGGATCATCTG240TGTTGACAACAAGAATATTCAGCACATTAATAGAATCTAC280AGAGATAGAAATGTCCCAACCGATGTGCTTTCTTTTCCAT320TTCATGAGCATCTGAAAGCAGGTGAATTTCCCCAGCCTGA360TTTTCCAGATGACTACAATTTGGGAGACATTTTCCTAGGA400GTGGAGTATATCTTCCATCAGTGTAAAGAAAATGAAGATT440ACAATGACGTCCTGACTGTGACGGCCACCCACGGACTCTG480TCACTTGCTGGGATTCACACACGGCACGGAGGCAGAGTGG520CAGCAGATGTTCCAGAAGGAGAAGGCGGTGCTGGACGAGC560TGGGCCGACGCACGGGGACCCGGCTGCAGCCCCTGACCCG600GGGCCTCTTCGGAGGGAGCTGAGGGCCGCGTTCCTTCTGA640AAGCGGGACGCGGGAGGGGTGGAGGCTGCGGGGAGCCGGG680GTCGCACACGAATAAATAACGAATGAACGTACGAGGGGAA720CCTCCTCTTATTTCCTTCA739cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。