基因總覽
XPOT 是蛋白質編碼基因，其產物 exportin for tRNA 屬於 exportin 家族。此蛋白質的主要角色與 tRNA 的核輸出有關；其運輸活動涉及 Ran，並在核孔複合體處與 nucleoporins 發生作用。來源描述的功能重點是運送氨醯化 tRNA，未提供更詳細的基因產物結構或其他基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000332707 ★ | 64,404,392–64,451,125 | 25 |
| ENST00000936969 | 64,404,168–64,451,130 | 25 |
| ENST00000904846 | 64,404,322–64,451,130 | 24 |
| ENST00000904847 | 64,404,322–64,451,130 | 24 |
| ENST00000904848 | 64,404,322–64,451,130 | 25 |
| ENST00000904849 | 64,404,322–64,451,130 | 26 |
| ENST00000936970 | 64,404,322–64,451,130 | 25 |
| ENST00000936971 | 64,404,322–64,451,130 | 25 |
| ENST00000936972 | 64,404,322–64,451,130 | 25 |
| ENST00000936973 | 64,404,322–64,451,130 | 24 |
| ENST00000936974 | 64,404,322–64,451,130 | 24 |
| ENST00000936975 | 64,404,322–64,451,130 | 23 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
XPOT 介導氨醯化 tRNA 從細胞核輸出至細胞質。運輸開始時，XPOT 在細胞核內與 tRNA 及活化態、帶有 GTP 的 Ran 結合，形成三元複合體。此複合體與核孔複合體的停靠，則由其和 nucleoporins 的結合促成。
複合體通過核孔進入細胞質後會解離，tRNA 因而從輸出受體 XPOT 釋出。Ran-GTP 水解為 Ran-GDP 也參與促成這一釋放過程；來源指出，該水解分別由 RANBP1 與 RANGAP1 誘導。完成一次輸出後，XPOT 返回細胞核，可再進行下一輪運輸。
核輸出的方向性被認為與 Ran 的 GTP 結合型和 GDP 結合型在細胞核、細胞質之間呈不對稱分布有關。這項描述指出其可能提供運輸方向性的依據，但以「被認為」表述，並非確定性結論。
Promoter 與基因調控
>XPOT ENST00000332707 GRCh38 chr12:64403392-64404492 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCCTTTGAGGTCGGTACTATTAACAATCCCCATTTTACATACGAGTAAACTGAAGCATGGATAGACTAAA GTAAAGTGCCTGAGGTCAACTAGTGAGGAGGCGGAGTGGCAGTCAAGTCGAGGCAGCCTAAGCCTACACT GCCTCTATGTTGCATTAATAAATTAATAAATCTGTGACCAAATAAATGAAGTGACATTTAGTAGCATCGA AAGATCCCGTGAGTAGGACTTCCTAAGAATGCTCTCCTTCTTTTCATGGACAAAATTTTAGTCTGTTTAA AATAAATTTTGGACCGGACACCGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGA TCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGTCCAACATGGTGCAACCCTGTCTCTACGAAAAATACAA AAATTAGCTGGGTATGGTGGCGCGCGCCTGTCATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGATGCAGGAGAACTGCT TGAACCCCGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCCAAGATCTCGCCATTGCACCCCATCCTGGGCGACAGAGCG AGACTCCGTCTCAAAGAATAAATAAATAAATTAATTAATTAATTTTGAAAACCTGTCAGCACTCATCAGA GCTTTACACTGCTGTACTCGGGACACTTGGGGCCGTAGACAAGCAATTAAATTGACTCACACGTGGTTAG AACCACGTCATCCTGATTCGTGAATCCGTACTCTCAACTACTAGAAGCCCTTTGTGGAATGCTCGGGGCG AACCTGACGCTTGAGCTCTGACACCACGCAGACACAGCCGGGGATTTAGGAGCTGGGTAGGGACTCCTGG GCCGGATGCCTCATCCCGGCATGCACCTCAAGCCCCGGTGACCACGCCTTCCGGCGAGCGCCAGGGAGCG CGTGTGCGCCTCGCCGCCCGGAAGCGCCGGCCGCTCCCTGCATGCTGGGAGTTGTAGGCCTCCGGCGTCA GCCCGCGGGCTGCCGCCCGCACTCTCCAAGAGACTGCTGGCGCCGGCGCCCGCCCGCGCGGCACCGACGC GGGGAGCGCGCTTCGCGCTGACTCAGCGGCGGCGGCGGCTGCGGCGGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_9XK6C · enhancer · 64400131–64400420 · regulatory
ENSR12_BGR4P · enhancer · 64403705–64404242 · regulatory
ENSR12_5K627W · CTCF_binding_site · 64404040–64404061 · regulatory
ENSR12_83W5F2 · promoter · 64404243–64404402 · regulatory
ENSR12_C8DJX · enhancer · 64404403–64405942 · regulatory
ENSR12_5K62D3 · CTCF_binding_site · 64404940–64404961 · regulatory
· motif · 64403332–64403342 · motif
· motif · 64404042–64404058 · motif
· motif · 64404079–64404088 · motif
· motif · 64404079–64404088 · motif
· motif · 64404298–64404309 · motif
· motif · 64404298–64404309 · motif
· motif · 64404300–64404311 · motif
· motif · 64404318–64404327 · motif
· motif · 64404456–64404470 · motif
· motif · 64404456–64404470 · motif
· motif · 64404740–64404756 · motif
· motif · 64404839–64404855 · motif
· motif · 64404839–64404855 · motif
· motif · 64404860–64404871 · motif
· motif · 64404933–64404943 · motif
· motif · 64404942–64404958 · motif
· motif · 64405146–64405154 · motif
· motif · 64405970–64405983 · motif
· motif · 64405970–64405983 · motif
· motif · 64406864–64406875 · motif
· motif · 64408730–64408739 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：962 aa
XPOT 蛋白質長 962 個胺基酸，屬於 exportin 家族。第 1–385 位胺基酸區域對 Ran 交互作用、核定位與核輸入為必要；第 443–962 位區域則對 tRNA 結合、細胞質定位與核輸出為必要。
蛋白質三維結構
細胞內定位
XPOT 可在細胞核與細胞質之間穿梭。 當它在細胞核內結合 tRNA 和 Ran 後，該複合體會轉移至細胞質；來源未描述其他定位條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- KRT75O95678 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POU6F2P78424 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RANP62826 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRA2AQ13595 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
XPOT 與 Ran、tRNA 形成複合體，且與兩者的交互作用依賴 GTP。XPOT 也被描述為可能與 nucleoporins 形成複合體；此關係帶有「可能」的不確定性。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | XPOT 介導氨醯化 tRNA 的核輸出；它在細胞核內與 tRNA 及 GTP 結合型 Ran 結合，並透過 nucleoporins 停靠於核孔複合體。複合體進入細胞質後解離，Ran-GTP 水解為 Ran-GDP促使 tRNA 釋出；XPOT 隨後返回細胞核。核輸出的方向性被認為與 Ran 兩種核苷酸結合型態在核、質間的不對稱分布有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates the nuclear export of aminoacylated tRNAs. In the nucleus binds to tRNA and to the GTPase Ran in its active GTP-bound form. Docking of this trimeric complex to the nuclear pore complex (NPC) is mediated through binding to nucleoporins. Upon transit of a nuclear export complex into the cytoplasm, disassembling of the complex and hydrolysis of Ran-GTP to Ran-GDP (induced by RANBP1 and RANGAP1, respectively) cause release of the tRNA from the export receptor. XPOT then return to the nuclear compartment and mediate another round of transport. The directionality of nuclear export is thought to be conferred by an asymmetric distribution of the GTP- and GDP-bound forms of Ran between the cytoplasm and nucleus PMID 12138183 ↗ · PMID 9512417 ↗ · PMID 9660920 ↗ |
| 交互作用 | XPOT 與 Ran、tRNA 同處於一個複合體中，並以 GTP 依賴方式與 Ran 和 tRNA 交互作用。XPOT 也可能與 nucleoporins 形成複合體；此項複合體關係在來源中以可能性描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Found in a complex with XPOT, Ran and tRNA. Probably found in a complex with nucleoporins. Interacts with Ran and tRNA in a GTP-dependent manner PMID 12138183 ↗ · PMID 9512417 ↗ · PMID 9660920 ↗ |
| 細胞定位 | XPOT 位於細胞核與細胞質，並在兩者之間穿梭。它在細胞核內結合 tRNA 和 Ran 後，所形成的複合體會轉移至細胞質。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm; Nuclear, once bound to tRNA and Ran the complex translocates to the cytoplasm. Shuttles between the nucleus and the cytoplasm |
核酸與蛋白質序列
ACTCTCCAAGAGACTGCTGGCGCCGGCGCCCGCCCGCGCG40GCACCGACGCGGGGAGCGCGCTTCGCGCTGACTCAGCGGC80GGCGGCGGCTGCGGCGGCGGCGGCGGCGTTAGCCGGCCCT120CGCGCTCTTTCCCTTCCTGGGGCGCCGACCCCGCCCGCTT160GCTTGCTTGCTTGCTTGCCTGCCTGCCTGCCTGCCCGGCG200CCACGCAAGAGAAGGTGCCAGGGGACGCAGAGCGACTAGA240GGCGCGCGGTCCCGGCCAGCACCGTCTCTGGCGTTGTAGC280TGCGGCCGTGGCGGAGGACTACGGCGACAAGGACGAGGGC320CGCTCTCCCAGCTCTCTGCGTGCCGCGCCGCTCCGCTCCG360CTGGCTGACCATCTGGAGTGCAGGCTGGGAGGCGGGATGG400AGTGATAGGGAAGATGTTTATAAATTCTTCTGTGGGATCA440GAGGGCACGCCTATTACAACCAGAAAACTACAAGTATAAC480AGCGAGGATGGATGAACAGGCTCTATTAGGGCTAAATCCA520AATGCTGATTCAGACTTTAGACAAAGGGCCCTGGCCTATT560TTGAGCAGTTAAAAATTTCCCCAGATGCCTGGCAGGTGTG600TGCAGAAGCTCTAGCCCAGAGGACATACAGTGATGATCAT640GTGAAGTTTTTCTGCTTTCAAGTACTGGAACATCAAGTTA680AATACAAATACTCAGAACTAACCACTGTTCAACAACAGCT720AATTAGGGAGACGCTCATATCATGGCTGCAAGCTCAGATG760CTGAATCCCCAACCAGAGAAGACCTTTATACGAAATAAAG800CCGCCCAAGTCTTCGCCTTGCTTTTTGTTACAGAGTATCT840CACTAAGTGGCCCAAGTTTTTTTTTGACATTCTCTCAGTA880GTGGACCTAAATCCAAGGGGAGTAGATCTCTACCTGCGAA920TCCTCATGGCTATTGATTCAGAGTTGGTGGATCGTGATGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。