基因總覽
XPO7 的正式名稱為 exportin 7，屬於蛋白質編碼基因。其產物是 exportin 家族成員，具有廣泛的蛋白質貨物辨識範圍，參與細胞核與細胞質之間的運輸。現有資料支持其作為核輸出受體的基本角色，但未提供足以描述其他結構特色的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000252512 ★ | 21,919,662–22,006,585 | 28 |
| ENST00000879830 | 21,919,641–22,006,585 | 27 |
| ENST00000879831 | 21,919,641–22,006,585 | 27 |
| ENST00000879832 | 21,919,641–22,006,585 | 28 |
| ENST00000879833 | 21,919,641–22,006,585 | 27 |
| ENST00000929054 | 21,919,641–22,006,585 | 25 |
| ENST00001059754 | 21,919,641–22,006,585 | 28 |
| ENST00001139549 | 21,919,641–22,006,585 | 28 |
| ENST00000521303 | 21,919,757–21,974,705 | 6 |
| ENST00000433566 | 21,966,238–22,006,585 | 28 |
| ENST00000517551 | 21,991,726–21,999,674 | 6 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
XPO7 介導多種蛋白質貨物由細胞核輸出至細胞質，底物範圍廣。在細胞核內，XPO7 會與貨物及活化型、GTP 結合狀態的 Ran 協同結合，形成三元複合體。
此輸出複合體與核孔複合體的停靠，則透過 XPO7 與核孔蛋白的結合來介導。複合體穿越核孔進入細胞質後會解離；RANBP1 與 RANGAP1 分別促進 Ran-GTP 水解為 Ran-GDP，並使貨物從輸出受體釋出。
貨物釋放後，XPO7 返回細胞核，可再進行下一輪運輸。核輸出的方向性被認為與 Ran-GTP 和 Ran-GDP 在細胞核、細胞質之間的不對稱分布有關；來源將此描述為推測機制。
Promoter 與基因調控
>XPO7 ENST00000252512 GRCh38 chr8:21918662-21919762 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCAAACAATCAGTGCTCTCAGAATCCAGCTATGATCTAACCTGGGGGCCTTAAAAGGAAGCCACAGTGG AATCCAATGGAAAACAGGAACCGGCATTATCTAACAGATAATTCCTAGTGAGGAAGACTGGAATTGGCCT CAGCATGCAGGGGCTGACCTTATCTGACCCAGAGAGATGGCTTTCCCACTCATACCTCCACAAGACCGAG CCTAGGGGTCCTAACCACCAGCCCCGCTGCCTCTTCCAGCATCTGACCCTCTCGGGAGGCAGTCTAGAGT ATTGGCAACGAGGACAATGTCTTTGGGAAGCCAGAACTGTGCCTTCGTATGTTTTGATCATCACCACCAT TCGGTGGTTATTTCCATGAATGTTTATCAAGGACGAAAGGACAGAAATGAAAAACACGAGATCAACCACT GGGGTTGCTGGTGAAATCCAGACCAGAGAGCGATGGCCCTGGTCCAGAAAGCTAGACAGACACAAGCACA GAATCGGCCCCCGTTGAGTAGAGGGCATTGGAAAGTAAGGAATCTCGCAGGCAGCCTAGGTGGGGTGTGG GGGGTCCCCGTAGCTGCAGGGTGGGGTGGGGGTGGGGGTGGGAGACGTCCAGGGGCGAGTCAAGGGGGAA GACGGTTGGGAAGAGAGGAAGCCACTGGGTGCAGGGGTCCCGGGGCGGCGACAGACCTCGGCCCCCATCC AGGAGCCCTCACCACGCAAACGAGCAGAAGGCAGCGCCAACTCCCACTCCAGCGCCCGCCTGCCGGAGCG AGCGCGGCCCCTTTAAAAACCATGTAAACAAAGCTTTGTTCCCCCAGCTGCCCCTCCTTCGCGCTCCCCC GGCCCGCTCCTTCCTCCCACCCGGCGTCTCCGGGCCGCTGACGTTGCCCGCGCCTTTACGCCGTCCCAGC GGTGCTGCGCATTCTCCAACCACGGCCCGGGCCGCCGGGGCCTGCGCAGCTGAGCGGCGCTACGCCACGA GCGCAGCGCGACGAGTCCCCAGCGCGCAGGCGCAGCGGCGACGGCGTCGGCGGCGGCGGCGGCAGCGGCT CCGGCCGAGGTGCGCGCTGGGGGGGAGGGGGGGCCGGAGAGGAGCATGAAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| XPO7_1 ↗ | 8:21,919,747 | 正股 | 21,919,698–21,919,757 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_B6CFM · enhancer · 21914920–21915913 · regulatory
ENSR8_5766RL · CTCF_binding_site · 21915485–21915506 · regulatory
ENSR8_9BNWF · promoter · 21919172–21919672 · regulatory
ENSR8_C46PN · enhancer · 21919673–21921019 · regulatory
ENSR8_B6CGL · enhancer · 21921863–21922473 · regulatory
ENSR8_5767XL · CTCF_binding_site · 21922174–21922195 · regulatory
· motif · 21915487–21915503 · motif
· motif · 21915912–21915923 · motif
· motif · 21918460–21918473 · motif
· motif · 21918531–21918542 · motif
· motif · 21918551–21918562 · motif
· motif · 21918623–21918636 · motif
· motif · 21918741–21918754 · motif
· motif · 21919577–21919588 · motif
· motif · 21919608–21919619 · motif
· motif · 21919664–21919675 · motif
· motif · 21919664–21919675 · motif
· motif · 21919769–21919779 · motif
· motif · 21920734–21920747 · motif
· motif · 21920920–21920935 · motif
· motif · 21922176–21922192 · motif
· motif · 21922442–21922448 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1087 aa
XPO7 蛋白長 1,087 個胺基酸，屬於 exportin 家族。序列註解標示其第 30 至 96 個胺基酸區段具有 Importin N-terminal 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
XPO7 位於細胞核與細胞質之間，並在兩者間穿梭。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CUTCQ9NTM9 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RANP62826 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- USO1O60763 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
XPO7 可與核孔蛋白結合，並以 GTP 依賴方式與 Ran 及貨物蛋白互作。資料亦記載其與 ARHGAP1、SFN 互作，並與 EIF4A1、ARHGAP1、VPS26A、VPS29、VPS35 及 SFN 同處一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | XPO7 具有廣泛的底物範圍，可介導蛋白質貨物由細胞核輸出。它在細胞核內協同結合貨物與活化型 Ran，並透過核孔蛋白停靠核孔複合體；進入細胞質後，複合體解離及 Ran-GTP 水解促使貨物釋出。XPO7 隨後返回細胞核。輸出方向性被認為與 Ran 不同核苷酸狀態在兩區域的不對稱分布有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates the nuclear export of proteins (cargos) with broad substrate specificity. In the nucleus binds cooperatively to its cargo and to the GTPase Ran in its active GTP-bound form. Docking of this trimeric complex to the nuclear pore complex (NPC) is mediated through binding to nucleoporins. Upon transit of a nuclear export complex into the cytoplasm, disassembling of the complex and hydrolysis of Ran-GTP to Ran-GDP (induced by RANBP1 and RANGAP1, respectively) cause release of the cargo from the export receptor. XPO7 then return to the nuclear compartment and mediate another round of transport. The directionality of nuclear export is thought to be conferred by an asymmetric distribution of the GTP- and GDP-bound forms of Ran between the cytoplasm and nucleus PMID 11024021 ↗ · PMID 15282546 ↗ |
| 交互作用 | XPO7 與核孔蛋白結合，並以 GTP 依賴方式與 Ran 及貨物蛋白互作。資料記載 XPO7 與 ARHGAP1、SFN 互作，也指出它與 EIF4A1、ARHGAP1、VPS26A、VPS29、VPS35 及 SFN 一同出現在複合體中。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds to nucleoporins. Found in a complex with XPO7, EIF4A1, ARHGAP1, VPS26A, VPS29, VPS35 and SFN. Interacts with ARHGAP1 and SFN. Interacts with Ran and cargo proteins in a GTP-dependent manner PMID 11024021 ↗ · PMID 15282546 ↗ |
| 細胞定位 | XPO7 位於細胞核及細胞質，並會在這兩個區域之間穿梭。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Shuttles between the nucleus and the cytoplasm PMID 11024021 ↗ · PMID 22509282 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCGCGCAGGCGCAGCGGCGACGGCGTCGGCGGCGGCGGC40GGCAGCGGCTCCGGCCGAGGTGCGCGCTGGGGGGGAGGGG80GGGCCGGAGAGGAGCATGAATGGAGCAAAATGGCGGATCA120TGTGCAGAGCCTGGCCCAACTAGAGAATCTGTGCAAACAG160CTGTATGAAACCACAGACACAACCACTCGACTCCAGGCAG200AGAAAGCCTTGGTTGAATTTACCAACAGCCCTGATTGCCT240GAGCAAGTGCCAGCTACTCCTCGAAAGAGGAAGTTCCTCT280TACTCCCAGTTACTGGCAGCTACATGCCTTACCAAGCTTG320TATCACGCACAAACAACCCCCTACCATTGGAACAGCGAAT360AGATATTCGGAACTATGTGCTCAACTACCTTGCCACTCGG400CCGAAGTTGGCTACTTTCGTGACACAAGCACTTATTCAGT440TATATGCCAGAATCACAAAACTGGGCTGGTTTGACTGTCA480GAAGGATGACTATGTCTTCAGAAATGCAATCACAGACGTC520ACAAGGTTTTTACAGGATAGTGTTGAATACTGCATCATTG560GTGTCACAATTTTATCTCAGCTAACCAATGAAATTAATCA600AGCAGACACCACCCATCCTTTAACCAAGCACAGAAAAATA640GCCTCTTCTTTTCGCGATTCATCATTATTTGATATCTTCA680CACTTTCCTGCAATTTACTAAAACAGGCTTCAGGAAAGAA720TCTAAACTTGAATGATGAAAGTCAGCATGGCTTGCTCATG760CAACTGCTCAAGCTCACTCATAACTGCCTCAACTTTGACT800TCATCGGCACTTCCACTGATGAGTCCTCAGACGACCTGTG840TACAGTGCAGATTCCCACCAGCTGGAGATCAGCCTTCTTA880GATTCTTCAACCTTGCAGCTGTTTTTTGACCTGTATCATT920CCATCCCTCCTTCATTTTCACCTCTGGTATTATCCTGCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。