基因總覽
XPO1 是蛋白質編碼基因，其產物 exportin 1 屬於 exportin 家族。這種運輸受體參與細胞核與細胞質之間的分子運送，可辨識帶有富含 leucine 的核輸出訊號（NES）的蛋白質貨物，也可運送 RNA。除了細胞一般的核輸出功能，exportin 1 亦與病毒 RNA 及病毒蛋白質的核外運送有關。其蛋白質序列包含多個 HEAT 重複，以及 Importin N-terminal 區域；資料亦註記了與 Ran、RANBP3 和病毒蛋白質互動相關的區段。這些特徵概述了 exportin 1 作為核輸出受體的分子身分；不同貨物如何被辨識與運送，則取決於各自的訊號及複合體組成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000401558 ★ | 61,477,849–61,538,356 | 25 |
| ENST00000677476 | 61,477,689–61,500,568 | 19 |
| ENST00000677933 | 61,477,689–61,534,246 | 24 |
| ENST00000678877 | 61,477,689–61,535,870 | 22 |
| ENST00000676667 | 61,477,689–61,535,870 | 25 |
| ENST00000676999 | 61,477,689–61,537,110 | 24 |
| ENST00000677813 | 61,477,689–61,537,084 | 25 |
| ENST00000677417 | 61,477,689–61,537,117 | 25 |
| ENST00000676889 | 61,477,689–61,538,753 | 23 |
| ENST00000678081 | 61,477,689–61,538,753 | 24 |
| ENST00000677150 | 61,477,689–61,538,356 | 27 |
| ENST00000678182 | 61,477,689–61,538,227 | 26 |
顯示 12/69 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
exportin 1 介導細胞蛋白質與 RNA 的核輸出。對蛋白質貨物而言，它辨識富含 leucine 的核輸出訊號（NES）。在細胞核內，exportin 1 與 RANBP3 協同結合目標蛋白的 NES，以及處於活性 GTP 結合狀態的 GTPase RAN（Ran-GTP），形成核輸出複合體。
複合體與核孔複合體（NPC）的對接，則透過與 nucleoporins 的結合進行。當核輸出複合體通過核孔進入細胞質後，複合體解離；Ran-GTP 水解為 Ran-GDP，促使貨物從輸出受體釋放。來源指出，這項運輸的方向性被認為與 Ran-GTP 和 Ran-GDP 在細胞核及細胞質間的不對稱分布有關。
exportin 1 也參與 U3 snoRNA 從 Cajal bodies 運送至 nucleoli，並結合帶有 TMG cap 的晚期前驅 U3 snoRNA。這顯示其貨物不只包括帶有 NES 的蛋白質，也涵蓋特定 RNA；來源未進一步說明此 RNA 運輸過程的其他步驟。
在病毒感染相關情境中，exportin 1 介導 HIV-1、HTLV-1 與 influenza A 等病毒的未剪接或未完全剪接 RNA 離開細胞核；它也與 HIV-1 Rev 及 HTLV-1 Rex 蛋白質互動並促進其核輸出，且參與 HTLV-1 Rex 多聚化。這些描述指出其核輸出功能亦可被病毒利用，但未將此作用延伸至未列出的病毒或分子。
Promoter 與基因調控
>XPO1 ENST00000401558 GRCh38 chr2:61538256-61539356 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GATCAAGGGCACCAGGTGGGACGCAGTTGGCATGCAAGCTCAGCCAGCCAAAACATGCGCTGTCAAACCA ATCACTTGGGATTACAATGTTTTGGTTTTCAGGAAAGGTTGCTTGTTGAAGCAGCCAAATTCCAGCCTGG AGAGACAGAGTTGAAATTTTAAGGAGACTTTCCCAAGAAGTATTTCGATATCTTTTCCGACACCCTGAGA AGATCACGAGGCGCCAAGAATGCACGCCCTGCGCCTCACCCCAACCCCTCTCTCAGCTACCTGGCCCCAA AACCAGGCCTCTAAAATGGATTAGAGAGGTCTGGGGCCTAAAATTGGCCTCGGAAGCGTTCTTTTTCCCT CTTTTCTCCACCCCTTCCAGAGTTCAAAACTGGGTGTGCCCTCCCTTTTCCGAACGCAGCCCCCATCCGA AGGGCGGATCCTGATTCCCGCGGGCTCAGGCCCCCGCAGGTTGGCGGGAGCCGGTGGGGGCGGGCCGGCC GAGTCCGGGGGAAGCAAAGAGAACGCTGCCGCGCGCCCCGATCAAACTCGCGCCGCCACCAGCTCACGAG CTGCGCCCCACCCTCTCCGTCACCGAAGAGGCCCAGCCAATGAGCGGGCGAGAAAGGCCGGGCCTGCGAA CTAGGCACCGGGAGGGAGAGGGCCGCAGGGGGAAGGGAAGTCGAGAGCTCGAGGGCGGGCTGCTCTTGAT TGACAGCTCGTTCGAACGAATCCTCCACGCGGCTTTCCTTCGCTCTCTTTTCTACTCATCCCTGCTCTTC GTCCCACCTCCTCCTCCTCCACCCCTCTCCTCTTGCCTTTCGACCCTCCCCACTTCCCCTCCCCCACTCT GCGGGCAAATCGCTGCTGAAAAGAGGTAGGGGCCGAAGCGGCGGGCTCGTGTGGAGCCGTGAGGCGGGAT TGACTGGCGCTCGGGCCAATGAGAGATAGGCTCATGGCGCGGCTGTAGCTGGAACTGACCAATAGGAGGG CGGGCTGGGGGCGGAGGCCCAGGTTCCAAACGCTCCGCGGCGCCATGGGCTGAAAACTCAACCGAGATGG AATCTCCCAGTCTGAACCGGTTTCAACCGGTTCCGAGTTTGAGGCACTAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| XPO1_1 ↗ | 2:61,538,246 | 負股 | 61,538,236–61,538,295 |
| XPO1_2 ↗ | 2:61,538,349 | 負股 | 61,538,339–61,538,398 |
| XPO1_3 ↗ | 2:61,538,612 | 負股 | 61,538,602–61,538,661 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_9WFGB · enhancer · 61535061–61535325 · regulatory
ENSR2_BG7PS · enhancer · 61535987–61536779 · regulatory
ENSR2_BG7PX · promoter · 61536780–61537607 · regulatory
ENSR2_C84TK · promoter · 61537770–61539231 · regulatory
ENSR2_5JGS3D · CTCF_binding_site · 61539554–61539575 · regulatory
· motif · 61536228–61536238 · motif
· motif · 61537115–61537131 · motif
· motif · 61537115–61537131 · motif
· motif · 61537124–61537133 · motif
· motif · 61537124–61537133 · motif
· motif · 61537904–61537919 · motif
· motif · 61538227–61538244 · motif
· motif · 61538247–61538257 · motif
· motif · 61538360–61538370 · motif
· motif · 61538522–61538532 · motif
· motif · 61538535–61538545 · motif
· motif · 61538782–61538792 · motif
· motif · 61538871–61538881 · motif
· motif · 61538873–61538886 · motif
· motif · 61538886–61538897 · motif
· motif · 61538897–61538910 · motif
· motif · 61539454–61539470 · motif
· motif · 61539454–61539470 · motif
· motif · 61539556–61539572 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1071 aa
exportin 1 長 1071 個胺基酸，屬於 exportin 家族，含有 Importin N-terminal 區域及多個 HEAT 重複。註記的功能區段包括與 Ran 及核輸出複合體形成相關的區域、RANBP3 互動區，以及與 HIV-1 Rev 互動的區段；另有區域與 HTLV-1 Rex 介導的 RNA 輸出及 Rex 多聚化相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
exportin 1 位於細胞質，也見於細胞核的核質、Cajal bodies 與 nucleoli，並可在細胞核／核仁與細胞質之間穿梭。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 13 個夥伴
- BIRC5O15392 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DHX9Q08211 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERBB2P04626 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LRPPRCP42704 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- NR4A1P22736 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PHB1P35232 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PKIAP61925 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RCC1P18754 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SNUPNO95149 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAZP63104 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- revP04618 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Q9WMX2Q9WMX2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
exportin 1 參與多種核輸出複合體，包括含 RANBP3 與 RAN 的複合體，以及含 NMD3、RAN 的 60S 核糖體次單元輸出複合體；另與多種核孔蛋白及其他蛋白質互動。病毒感染相關互動包括 HIV-1 Rev、HTLV-1 Rex、influenza A nucleoprotein 與 Epstein-Barr virus protein BMLF1。另有報告指出，exportin 1、importin alpha/beta 二聚體與 Venezuelan equine encephalitis virus（VEEV）capsid 組成四聚體複合體，該複合體會阻斷受體介導的核孔運輸。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 10 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | exportin 1 將帶有富含 leucine 的 NES 的細胞蛋白質及 RNA 輸出細胞核。它與 RANBP3 協同結合目標 NES 和 Ran-GTP，並透過 nucleoporins 對接核孔；進入細胞質後，複合體解離及 Ran-GTP 水解促使貨物釋出。輸出方向性被認為與 Ran 核苷酸狀態的分布不對稱有關；它亦參與帶 TMG cap 的晚期前驅 U3 snoRNA 運送。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates the nuclear export of cellular proteins (cargos) bearing a leucine-rich nuclear export signal (NES) and of RNAs. In the nucleus, in association with RANBP3, binds cooperatively to the NES on its target protein and to the GTPase RAN in its active GTP-bound form (Ran-GTP). Docking of this complex to the nuclear pore complex (NPC) is mediated through binding to nucleoporins. Upon transit of a nuclear export complex into the cytoplasm, disassembling of the complex and hydrolysis of Ran-GTP to Ran-GDP (induced by RANBP1 and RANGAP1, respectively) cause release of the cargo from the export receptor. The directionality of nuclear export is thought to be conferred by an asymmetric distribution of the GTP- and GDP-bound forms of Ran between the cytoplasm and nucleus. Involved in U3 snoRNA transport from Cajal bodies to nucleoli. Binds to late precursor U3 snoRNA bearing a TMG cap PMID 15574332 ↗ · PMID 20921223 ↗ · PMID 9311922 ↗ · PMID 9323133 ↗ |
| 功能 | 在病毒感染相關情境中，exportin 1 介導 HIV-1、HTLV-1 與 influenza A 的未剪接或未完全剪接 RNA 離開細胞核。它也與 HIV-1 Rev、HTLV-1 Rex 互動並介導這些蛋白質的核輸出，且參與 HTLV-1 Rex 多聚化。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Mediates the export of unspliced or incompletely spliced RNAs out of the nucleus from different viruses including HIV-1, HTLV-1 and influenza A. Interacts with, and mediates the nuclear export of HIV-1 Rev and HTLV-1 Rex proteins. Involved in HTLV-1 Rex multimerization PMID 14612415 ↗ · PMID 9837918 ↗ |
| 交互作用 | exportin 1 參與多種核輸出複合體，包含 U snRNA 輸出複合體（該組成為相似性推定）、含 KPNB1、RAN、SNUPN 的受體複合體、含 RANBP3 與 RAN 的複合體，以及含 NMD3、RAN 的 60S 核糖體次單元輸出複合體。它也與多種蛋白質互動；部分互動涉及 DTNBP1、SERTAD2、BOK 或 LRPPRC 相關的運輸或 mRNA 輸出。 | 含實驗來源 | 證據與來源Found in a U snRNA export complex with PHAX/RNUXA, NCBP1/CBP80, NCBP2/CBP20, RAN, XPO1 and m7G-capped RNA (By similarity). Component of a nuclear export receptor complex composed of KPNB1, RAN, SNUPN and XPO1. Found in a trimeric export complex with SNUPN, RAN and XPO1. Found in a nuclear export complex with RANBP3 and RAN. Found in a 60S ribosomal subunit export complex with NMD3, RAN, XPO1. Interacts with DDX3X, NMD3, NUP42, NUP88, NUP214, RANBP3 and TERT. Interacts with NEMF (via its N-terminus). Interacts with the monomeric form of BIRC5/survivin deacetylated at 'Lys-129'. Interacts with DTNBP1 and SERTAD2; the interactions translocate DTNBP1 and SERTAD2 out of the nucleus. Interacts with ATF2. Interacts with SLC35G1 and STIM1. Interacts with DCAF8. Interacts with CPEB3. Interacts with HAX1. Interacts with BOK; translocates to the cytoplasm. Interacts with HSP90AB1. Interacts with LRPPRC; interacts with LRPPRC alone and also when LRPPRC is in complex with EIF4E and with EIF4E sensitivity element (4ESE)-containing mRNAs to form an EIF4E-dependent mRNA export complex PMID 10209022 ↗ · PMID 10358091 ↗ · PMID 11425870 ↗ · PMID 11571268 ↗ · PMID 11932251 ↗ · PMID 12724356 ↗ · PMID 12808100 ↗ · PMID 14612415 ↗ · PMID 15507209 ↗ · PMID 15574331 ↗ · PMID 16103875 ↗ · PMID 16302269 ↗ · PMID 18316374 ↗ · PMID 20826784 ↗ · PMID 20921223 ↗ · PMID 22022502 ↗ · PMID 22084111 ↗ · PMID 22275354 ↗ · PMID 22500989 ↗ · PMID 22730302 ↗ · PMID 23164465 ↗ · PMID 28325843 ↗ · PMID 9049309 ↗ · PMID 9323133 ↗ |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中，exportin 1 與 HIV-1 Rev 蛋白質互動。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with HIV-1 Rev PMID 12134013 ↗ · PMID 15632073 ↗ · PMID 9837918 ↗ |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中，exportin 1 與 HTLV-1 Rex 蛋白質互動。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中，exportin 1 與 influenza A nucleoprotein 互動。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中，exportin 1 與 Epstein-Barr virus protein BMLF1 互動。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | exportin 1 與 importin alpha/beta 二聚體及 Venezuelan equine encephalitis virus（VEEV）capsid 組成四聚體複合體；該複合體會阻斷受體介導的核孔運輸。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Part of a tetrameric complex composed of CRM1, importin alpha/beta dimer and the Venezuelan equine encephalitis virus (VEEV) capsid; this complex blocks the receptor-mediated transport through the nuclear pore PMID 20147401 ↗ |
| 交互作用 | 在病毒感染相關情境中，exportin 1 與 SARS-CoV 病毒蛋白 ORF9b 互動；此互動介導 ORF9b 蛋白質離開細胞核。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with SARS-CoV virus protein ORF9b; this interaction mediates protein ORF9b export out of the nucleus PMID 21637748 ↗ |
| 細胞定位 | exportin 1 位於細胞質，以及細胞核的核質、Cajal bodies 與 nucleoli，並在細胞核／核仁和細胞質之間穿梭。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus, nucleoplasm; Nucleus, Cajal body; Nucleus, nucleolus; Located in the nucleoplasm, Cajal bodies and nucleoli. Shuttles between the nucleus/nucleolus and the cytoplasm |
核酸與蛋白質序列
AGGTTCCAAACGCTCCGCGGCGCCATGGGCTGAAAACTCA40ACCGAGATGGAATCTCCCAGTCTGAACCGGTTTCAACCGG80TTCCGAGTTTGAGGCACTAGGAGGAGGGGGAGAAGCGGCT120GCAGCGGCCGCGGCAGGAGCAGCGGGAGCTACAGCATCAG160CAAGAGCAACAGTAGCTACAGCCCCGGCGGCGGTGCCTGT200TCCAGTCTTTGCTGCTGCAGTCCGTGCAACCACCCAGAGG240GGGAGGGGGGAACCACCAGTCGCTGAGGAACAAGAGAAGG280GGGGAAAGTTTAGGCGAGCCTTGGGGGGGGGGGGGCCAGC320GCCGGAGCCGCGTGAGAGAGGGAGCCGTGTTTTGGTAGGG360GGGAGTCGGACTGCAACTGGCAGCAGAGCGTCTCCCCGGC400CGTGTGGACTCTACACCCCCTACTCCTGCCGCTTCTGCTG440CTGCCTGTGGCTGGAGGGTCCCCCTGGGGCTGAATCTTTG480GGACTTGACCCCGTTCCCTCCCCCTTCCCTCACTCCCCAG520CCGGGCGGGAGCATTTATTCCCCAGATTAATTCCCCTTTT560GGGGGGGGGCGGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT600GTGTTGGGGGAAGCGTCCCTGAAATAGTAAATATTATTGA640GCTCTTTTTGCCCTTTTCCTGTCCGTTTTTTTAATTTCCT680TTTTTGAGGTGGGAAAACTGAAACCCACCTTGATTCGTCC720CCTCTCCCCCCTCCCCACCTTCCCTCGCCCTAATCCCCCA760ACGAGGAAGGAAGGAGCAGTTGGTTCAATCTCTGGTAATC800TATGCCAGCAATTATGACAATGTTAGCAGACCATGCAGCT840CGTCAGCTGCTTGATTTCAGCCAAAAACTGGATATCAACT880TATTAGATAATGTGGTGAATTGCTTATACCATGGAGAAGG920AGCCCAGCAAAGAATGGCTCAAGAAGTACTGACACATTTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。