基因總覽
XPNPEP1（X-prolyl aminopeptidase 1）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 peptidase M24B 家族，為金屬胺基肽酶。此蛋白質能辨識胜肽 N 端與脯胺酸相連的胺基酸殘基；每個次單元可結合兩個錳離子。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000502935 ★ | 109,864,766–109,923,511 | 21 |
| ENST00000369683 | 109,864,494–109,923,511 | 19 |
| ENST00000322238 | 109,864,494–109,923,553 | 20 |
| ENST00000891174 | 109,864,494–109,923,553 | 20 |
| ENST00000891175 | 109,864,494–109,923,553 | 20 |
| ENST00000891176 | 109,864,494–109,923,553 | 20 |
| ENST00000891177 | 109,864,494–109,923,553 | 19 |
| ENST00000891178 | 109,864,494–109,923,553 | 22 |
| ENST00000927702 | 109,864,494–109,923,553 | 18 |
| ENST00000927703 | 109,864,494–109,923,553 | 19 |
| ENST00000927704 | 109,864,494–109,923,553 | 19 |
| ENST00000927705 | 109,864,494–109,923,553 | 22 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
XPNPEP1 的產物是金屬胺基肽酶，能從胜肽 N 端切除與脯胺酸相連的末端殘基。其作用特性不限於切除脯胺酸本身：只要 N 端胺基酸與脯胺酸相連，即可被釋出；底物甚至可以是二肽或三肽。
此酵素可作用於含有脯胺酸的短胜肽，例如 Arg-Pro-Pro。對這類底物的處理，反映其辨識重點是 N 端殘基與脯胺酸之間的連結，而非限定某一種 N 端胺基酸。來源指出，每個次單元結合兩個錳離子，並將其歸類為金屬胺基肽酶。
XPNPEP1 也參與 bradykinin 的降解。此功能說明它能參與胜肽的分解，但現有資料未進一步界定該過程的條件或其對其他生物學結果的影響。
Promoter 與基因調控
>XPNPEP1 ENST00000502935 GRCh38 chr10:109923411-109924511 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTTCAGCTGAAGAAGAGTGAGGAAGGTGAGAACAGGAGGAAATGTGGCTGGGGGTAGATCAAATGGAGC TTTTATGCTGCGTGAAACGAGAAATTAATGGAAAGTGCTGAGCAAAGAAGTGACCTGGTGTCACGCTTCA AAGGACTGGTCTGGCGGCTTTGTTCAGGCTGGACTGTGCAGGTGCGGGATGGTGAGGGGATATTTGGGGG GCTGCTGTAACCACACGGGTGGGGTGGTACAACCCTCTGATGCACATCAGAGGGTAGGAGGTGGAGGTGG TGTGACACGGCCAGATTAGGGGTCTATTTTGGAGGCAGGGCCAACAAGATTTTGCTGGCAGATTAGATGT GGGGTGTGAAAGAGAAGAGGCAGGGAGGATTCCTAAATTTTGCCTCTTAAGAATAGAGTAGCCATTGATT GAGATGGCAAAGAAGACTGGTGGAGAACGTTTTTGCTTTGCTTCGGTGCATTGGGAGTTCCAGGAGTTCC GTTTGGACGTTAAGTTTGAAGGGGCTATTTACTATCCAAGCGGAGCGGAGAGCTGGATTTTGAAGCTCTC TGGGAACATACTTTTGGGGACATTTCTAAAGCTTGAGACCCTGTTCCAAAGCCTCGAAGACCCTGTCGAG GTTCTTCCGGAGCCGGCCACGTCCCTCTCTTCTCAGCCCTCCTAAATTAAGCCGGAAAATCCCTGGGACA GTAGCCCCTTTATTCGGCAAAGCCCTTTTTCCTCTTTGAGGAATGACGACAAAAACGAACAAAAATGAAG ACACTCAGCAGCACTGCGTCCTTTCCCCGCTCGCTGCAGGGAGAGGCAATGCGGACTGGTGTGGAAGGGC AGGCCCCGCTCTGGGCCGCAGGCGCTGCGGCCGCGAACCCCAGGTCCGGGAGTGTGGGCGGGGCCTGCGT GTGGGCGGGGCCGCGGCGCCAGCGCCCGCCACGGGCGAGGGCGTGGCCGACCCGGCGCTAGCCCGCCCGC CCGCCCGCCGGCTCTCGCGCCTCCTTCGCGCCGGCCCTTCCGCGGGTGATCAGCTGGTCTGCGCTCCCCT GACGTGGGCTGGGGCACGTCACCGCCGAATGGCAGCCTCCAGAAAGCCACC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| XPNPEP1_1 ↗ | 10:109,923,508 | 負股 | 109,923,498–109,923,557 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_CDWHK · enhancer · 109922105–109923500 · regulatory
ENSR10_BRS2B · promoter · 109923501–109924043 · regulatory
ENSR10_BRS2P · enhancer · 109926135–109926668 · regulatory
ENSR10_BRS32 · enhancer · 109928337–109928990 · regulatory
· motif · 109919432–109919444 · motif
· motif · 109920061–109920073 · motif
· motif · 109922638–109922651 · motif
· motif · 109922638–109922651 · motif
· motif · 109923019–109923034 · motif
· motif · 109923112–109923125 · motif
· motif · 109923242–109923256 · motif
· motif · 109923629–109923644 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
XPNPEP1 的定位記載為細胞質與細胞質溶膠。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GORASP2Q9H8Y8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HBG2P69892 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RHOHQ15669 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
XPNPEP1 以同源二聚體形式存在；此記載描述其由相同蛋白質次單元組成，不表示其他互作或複合體關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | XPNPEP1 是金屬胺基肽酶，可從胜肽 N 端切除緊接在末端脯胺酸之前的殘基，例如 Arg-Pro-Pro；並參與 bradykinin 的降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Metalloaminopeptidase that catalyzes the removal of a penultimate prolyl residue from the N-termini of peptides, such as Arg-Pro-Pro. Contributes to the degradation of bradykinin PMID 11106490 ↗ · PMID 18515364 ↗ · PMID 35165443 ↗ |
| 分子活性 | XPNPEP1 可釋出與脯胺酸相連的 N 端胺基酸，包含脯胺酸本身；即使底物只有二肽或三肽，也能進行此作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Release of any N-terminal amino acid, including proline, that is linked to proline, even from a dipeptide or tripeptide. PMID 11106490 ↗ · PMID 18515364 ↗ · PMID 35165443 ↗ |
| 分子活性 | 每個 XPNPEP1 蛋白質次單元可結合兩個錳離子。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | Homodimer | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | XPNPEP1 的定位記載於細胞質及細胞質溶膠。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCCTTCGCGCCGGCCCTTCCGCGGGTGATCAGCTGGTCT40GCGCTCCCCTGACGTGGGCTGGGGCACGTCACCGCCGAAT80GGCAGCCTCCAGAAAGCCACCGCGAGTAAGGGTGAATCAC120CAGGATTTTCAACTGAGAAATTTAAGAATAATTGAACCTA160ACGAGGTGACACACTCAGGAGACACAGGTGTGGAAACAGA200CGGCAGAATGCCTCCAAAGGTGACTTCAGAGCTGCTTCGG240CAGCTGAGACAAGCCATGAGGAACTCTGAGTATGTGACCG280AACCGATCCAGGCCTACATCATCCCATCGGGAGATGCTCA320TCAGAGTGAGTATATTGCTCCATGTGACTGTCGGCGGGCT360TTTGTCTCTGGATTCGATGGCTCTGCGGGCACAGCCATCA400TCACAGAAGAGCATGCAGCCATGTGGACTGACGGGCGCTA440CTTTCTCCAGGCTGCCAAGCAAATGGACAGCAACTGGACA480CTTATGAAGATGGGTCTGAAGGACACACCAACTCAGGAAG520ACTGGCTGGTGAGTGTGCTTCCTGAAGGATCCAGGGTTGG560TGTGGACCCCTTGATCATTCCTACAGATTATTGGAAGAAA600ATGGCCAAAGTTCTGAGAAGTGCCGGCCATCACCTCATTC640CTGTCAAGGAGAACCTCGTTGACAAAATCTGGACAGACCG680TCCTGAGCGCCCTTGCAAGCCTCTCCTCACACTGGGCCTG720GATTACACAGGCATCTCCTGGAAGGACAAGGTTGCAGACC760TTCGGTTGAAAATGGCTGAGAGGAACGTCATGTGGTTTGT800GGTCACTGCCTTGGATGAGATTGCGTGGCTATTTAATCTC840CGAGGATCAGATGTGGAGCACAATCCAGTATTTTTCTCCT880ACGCAATCATAGGACTAGAGACGATCATGCTCTTCATTGA920TGGTGACCGCATAGACGCCCCCAGTGTGAAGGAGCACCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。