基因總覽
XCL1（X-C motif chemokine ligand 1）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 intercrine gamma family。這種趨化因子具有訊號胜肽，蛋白質全長為 114 個胺基酸；其主要生物學角色與免疫細胞的移動及胸腺中的免疫調節相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367818 ★ | 168,576,605–168,582,069 | 3 |
| ENST00001101069 | 168,576,596–168,582,069 | 3 |
| ENST00001144405 | 168,576,596–168,582,069 | 3 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
XCL1 對淋巴球具有趨化活性，能促使這類細胞移動；來源指出，這項活性並未觀察於單核球或嗜中性球。因此，來源所描述的細胞趨化作用具有細胞類型上的區別，不能概括為對所有白血球皆有相同效果。
在胸腺中，XCL1 介導胸腺樹突細胞在髓質區的累積，並有助於調節性 T 細胞的發育。這些作用與胸腺內免疫細胞的分布及調節性 T 細胞形成相關，來源並指出 XCL1 在建立自身耐受方面具有作用。現有資料未進一步說明其分子作用機制或各過程之間的細節，因此不對此作延伸推論。
Promoter 與基因調控
>XCL1 ENST00000367818 GRCh38 chr1:168575605-168576705 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCTACTCCTGGTTATTAAAGGGAAATAATTCGGTGTGTATTAATGAAATTGACCTTACAGTTCTGATCT TTATAATAAGTTATAAGAAAATGGTTTAATGTGTATGTGTATATATTTACTTGAAGTAGAAATATGAACG CTAAAAAATGGGAAGATATTTAAGTTGGTGTTAAAACAGCATTTAAAATTACCACAATTATGAGAACACA TGTATGCCAATGCAGATTCACTGGAAAAATATTGAAAATGAAAACTGTCAGATGGTAAGATTATAATTTT ATTTCTTTTTTAATTTGAAATAAGTTGGTACAGCACAGCTTTTCAAAAGCTTCTATAAATGTGTATGTTA AGTTGTAATAAAGCAAACACATGCATGTAGACATGCTTAAACAGTTATTTAATTGTTTCTTGGGTACCTG GGGAGATGGGGTGAAGAAAGGGGGGTGACTTGAATGAAGGTGGAGGAGAAAAATGAGAACCAAGAAAGCA AAGGATCGAGAAGCTCAGTGTGGCAGCAGCCTCTCTTCCCCTCCTGAGAGAGTCAAAGGGTGGCATCAGG GACTCATGATCCATGGTTGTGGAAGCCTCATGTCACACTGGATGTCACATGAGGTGGGATGGAACACAGT GACCACCCCACCTCATTTCCTTTACAGCTTCCGTGGTGGGCCATGGCAGTGAACAGCCTTCAGGCATGTC TACGGTGGAAGATCTGAATTCAGGCTGGTGGCAGGAGACAACACAACCACGTTTTCTTTTATGCATGCAT TTGGTTTAATTGACACATTAACCACAGACAAAGGGGTAAAGGCCACAAGGCGTTAGGTTAGTATGAACAG GGAAAGGGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAGAAAAATAAAAGCATCAGTATTGCAAAGACTTTCCATGA TCCTACACCCACCTCGAAAGCCCCCTCTCACCACAGGAAGTGCACTGACCACTGGAGGCATAAAAGAGGT CCTCAAAGAGCCCGATCCTCACTCTCCTTGCACAGCTCAGCAGGACCTCAGCCATGAGACTTCTCATCCT GGCCCTCCTTGGCATCTGCTCTCTCACTGCATACATTGTGGAAGGTAAGTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| XCL1_1 ↗ | 1:168,576,605 | 正股 | 168,576,556–168,576,615 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_86XS5M · enhancer · 168574343–168574578 · regulatory
ENSR1_53GMK4C · CTCF_binding_site · 168574459–168574480 · regulatory
· motif · 168572590–168572610 · motif
· motif · 168572731–168572742 · motif
· motif · 168573060–168573072 · motif
· motif · 168574380–168574389 · motif
· motif · 168574461–168574477 · motif
· motif · 168576143–168576156 · motif
· motif · 168576143–168576158 · motif
· motif · 168576217–168576232 · motif
· motif · 168576406–168576419 · motif
· motif · 168579935–168579946 · motif
· motif · 168579936–168579947 · motif
· motif · 168581458–168581473 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：114 aa
XCL1 蛋白質長 114 個胺基酸，屬於 intercrine gamma family。序列第 1–21 位註解為訊號胜肽；第 91–114 位則標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
XCL1 的定位註解為分泌型；資料未提供其他定位狀態或隨條件變化的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- CCL13Q99616 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL26Q9Y258 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCL5P13501 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CXCL12P48061 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4P02776 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PF4V1P10720 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | XCL1 對淋巴球具有趨化活性，但對單核球或嗜中性球沒有此活性。在胸腺中，XCL1 介導胸腺樹突細胞於髓質區累積，並有助於調節性 T 細胞發育，參與自身耐受的建立。 | 推論支持 | 證據與來源Chemotactic activity for lymphocytes but not for monocytes or neutrophils. In thymus, mediates medullary accumulation of thymic dendritic cells and contributes to regulatoy T cell development, playing a role in self-tolerance establishment |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACTCTCCTTGCACAGCTCAGCAGGACCTCAGCCATGAGAC40TTCTCATCCTGGCCCTCCTTGGCATCTGCTCTCTCACTGC80ATACATTGTGGAAGGTGTAGGGAGTGAAGTCTCAGATAAG120AGGACCTGTGTGAGCCTCACTACCCAGCGACTGCCGGTTA160GCAGAATCAAGACCTACACCATCACGGAAGGCTCCTTGAG200AGCAGTAATTTTTATTACCAAACGTGGCCTAAAAGTCTGT240GCTGATCCACAAGCCACATGGGTGAGAGACGTGGTCAGGA280GCATGGACAGGAAATCCAACACCAGAAATAACATGATCCA320GACCAAGCCAACAGGAACCCAGCAATCGACCAATACAGCT360GTGACTCTGACTGGCTAGTAGTCTCTGGCACCCTGTCCGT400CTCCAGCCAGCCAGCTCATTTCACTTTACACGCTCATGGA440CTGAGTTTATACTCACCTTTTATGAAAGCACTGCATGAAT480AAAATTATTCCTTTGTATTTTTACTTTTAAATGTCTTCTG520TATTCACTTATATGTTCTAATTAATAAATTATTTATTATT560AAGAATAGTTCCCTAGTCTATTCATTATATTTAGGGAAAG600GTAGTGTATCATTGTTGTTTGATTTCTGACCTTGTACCTC640TCTTTGATGGTAACCATAATGGAAGAGATTCTGGCTAGTG680TCTATCAGAGGTGAAAGCTATATCAATCTCTCTTAGAGTC720CAGCTTGTAATGGTTCTTTACACATCAGTCACAAGTTACA760GCTGTGACAATGGCAACAATTTGAGATGTATTTCAACTTG800TCTCTATAATAGAATTCTGTTTATAGAATAAGGGAGAAAA840TAATCCAGTCTTCACTGGGTTCCCATTCTGAGGGTCCACT880ACTCAAAAATTTGCTTCACTCAATTTTTTTCACCTCTTTG920TGTTTTATTTTGGTGTCCTATTAAAGGAATAAAATGACAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。