基因總覽
WWOX 是位於人類第 16 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 WW domain containing oxidoreductase。其產物被歸入短鏈脫氫酶/還原酶(SDR)家族,長 414 個胺基酸,含有兩個 WW 結構域。來源將其描述為可能具有氧化還原酶活性的蛋白質;「putative」表示此酵素功能仍屬推定。WWOX 蛋白與腫瘤抑制及細胞死亡調控有關,也參與正常骨骼發育。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000566780 ★ | 78,099,654–79,212,667 | 9 |
| ENST00000627394 | 78,099,400–78,574,858 | 10 |
| ENST00000402655 | 78,099,400–79,212,667 | 5 |
| ENST00000406884 | 78,099,400–79,212,667 | 6 |
| ENST00000539474 | 78,099,400–79,212,667 | 6 |
| ENST00000355860 | 78,099,400–78,278,696 | 6 |
| ENST00000408984 | 78,099,400–78,780,449 | 10 |
| ENST00001064004 | 78,099,400–78,278,691 | 5 |
| ENST00001064005 | 78,099,400–78,112,061 | 3 |
| ENST00001120146 | 78,099,400–78,260,666 | 6 |
| ENST00001135986 | 78,099,400–79,212,667 | 9 |
| ENST00000569818 | 78,099,675–78,100,199 | 1 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WWOX 被描述為可能的氧化還原酶,並具有腫瘤抑制作用。它參與細胞凋亡;在 DNA 損傷等基因毒性壓力引發的細胞死亡中,WWOX 可能與 p53/TP53 協同調控此反應。這項協同作用是來源所述的可能角色,而非對所有情境均成立的結論。
WWOX 也參與 TGFB1 訊號傳遞及 TGFB1 所介導的細胞死亡;它可能同樣參與腫瘤壞死因子(TNF)介導的細胞死亡。骨骼發育方面,來源指出 WWOX 對正常骨骼發育有必要,但此項資訊標示為依相似性推定。
在 Wnt 訊號調控上,WWOX 會抑制此訊號,可能是藉由將 DVL2 留置於細胞質中。此機制以「可能」描述,來源未將其表述為確定的唯一途徑。整體而言,資料支持 WWOX 涉及細胞死亡、壓力反應、訊號調控及骨骼發育,但未提供足以進一步界定其氧化還原反應機制的細節。
Promoter 與基因調控
>WWOX ENST00000566780 GRCh38 chr16:78098654-78099754 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTCCCCCTTCAGCCTCAATGAGTAGCTGGGACTACCGATGTGCACTACCACGCCCGGCAAACTAAAAAAA TAATTATTTTTGGTAAAGACAGGGGTCTTGCGATGTTGCCCAGGCTGTTCTCAAACTCCTGGCCTCAAGT GATCCTCCTGCCTCAGCCTCCTAATGTGTTTGGATTACAGGCATGAGCCACTGAGCCCGGCCTAGCTACC CTGTCTGAGTTGTGCCCACTACACAAAGGTGTCAGCTACATGTGATGTCTGTGCATTTCTGGCCTGGACC GCACATTAAGTGCTCCGTAAACATCAGTCTCTATTATCAACAGTCTCTATTATCAATCAGTCTCTATTAT CATCAGTCTCTATTATCATGAGTCTCTATTAAACAACAGTCTCTATTATCACAGTCTCTATTATGTGTTT TGGCTGAAAGAAAGTTCTCTAAAACCAGGAAATCAGGAATCAGCAGTTTTAAGTTCTCCAGGTTATATTT TAACATTGTGTTCATATGCAAAACAAAGGTTGTGAATCAGCACGAATGCTGGCAAGCCCTGGAAGGTTTG TGATCACGGACTTTCACGAGACCCCAAGGCAAGGAGAGACAGAAGCCCAGGACAACAGCATGGGCGCCGC TTTTTAGTCGGGCGCCGCTTTTTGGTCAGGCGCCACCTGGACTACATTTCCCATATCCAATTGCCGGGCT CCTGCAGGATTGGCCAGAACAACGCGGAAGTGATTACGGGTCGCCCAGCAACGGGCGGAGTCCTGGCCCG AAACTGGATGCGCACGCCCCTTCCCTGCGGCGGGGAGGCTGACAAGGCTCCGCTCTATCTCTAGCGCCTC GGAGCGCTCTCCGGCTTTGCTGTCTAGCCCGGCGGCAGCGCGATCTCTTAGGCACTTTCACCGCCTTCCT CTCCAGGCCCTGCCCCTTTGACGCCGGCCGTCGCGATATTGCGGAGACTGGATTTCAGCTTCGTGGTCGG CGGAGCGGCCCCTGGAGGGCGCAGTGCGCAGGCGTGAGCGGTCGGGCCCCGACGCGCGCGGGTCTCGTTT GGAGCGGGAGTGAGTTCCTGAGCGAGTGGACCCGGCAGCGGGCGATAGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WWOX_2 ↗ | 16:78,099,429 | 正股 | 78,099,380–78,099,439 |
| WWOX_1 ↗ | 16:78,099,656 | 正股 | 78,099,607–78,099,666 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_BKHH4 · promoter · 78098910–78099704 · regulatory
ENSR16_5NCZML · CTCF_binding_site · 78100102–78100123 · regulatory
· motif · 78099096–78099107 · motif
· motif · 78099112–78099123 · motif
· motif · 78099372–78099385 · motif
· motif · 78099374–78099385 · motif
· motif · 78099374–78099385 · motif
· motif · 78099376–78099385 · motif
· motif · 78099432–78099443 · motif
· motif · 78099434–78099444 · motif
· motif · 78099573–78099588 · motif
· motif · 78099658–78099669 · motif
· motif · 78099658–78099669 · motif
· motif · 78099913–78099922 · motif
· motif · 78100079–78100091 · motif
· motif · 78100081–78100088 · motif
· motif · 78100104–78100120 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:414 aa
WWOX 蛋白長 414 個胺基酸,屬於短鏈脫氫酶/還原酶(SDR)家族。蛋白質含有兩個 WW 結構域,分別位於第 16–49 與第 57–90 個胺基酸;第 50–55 個胺基酸區段註解為核定位訊號。第 125–414 個胺基酸區域與 MAPT 的互作相關,第 209–273 個胺基酸區域則被註解為介導粒線體標靶定位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WWOX 可見於多種細胞區室,並有部分定位於粒線體的記錄。 基因毒性壓力或 TNF 刺激,以及 TGFB1 刺激,均與其轉位至細胞核相關;前兩者的證據標示為依相似性推定。 Isoform 5 與 isoform 6 可能位於細胞核。 WWOX 可能在與 VOPP1 結合後定位至溶酶體。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 120 個夥伴
- DVL2O14641 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ENTREP3P81408 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- LITAFQ99732 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- SHISA5Q8N114 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TP53P04637 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TP73O15350 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 3 筆來源紀錄
- VOPP1Q96AW1 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- WBP1Q96G27 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- Bcl9lQ67FY2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Dvl2Q60838 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Erbb4Q61527 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ABHD11Q8NFV4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ABI2Q9NYB9-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ACAT2Q9BWD1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ACTMAPQ5BKX5-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ACY1Q03154 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ADRA2CP18825 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANAPC11Q9NYG5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANXA11P50995 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARRDC3Q96B67 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- ATN1Q86V38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATOSBQ7L5A3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C10orf55Q5SWW7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C11orf87Q6NUJ2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC24Q8N4L8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
WWOX 與 TP53、p73/TP73、MAPK8、ERBB4、LITAF、WBP1、TNK2、TMEM207,以及 DVL1、DVL2、DVL3 有互作記錄;與 MAPT/TAU、RUNX2、HYAL2 的互作則標示為依相似性推定。WWOX 也與 TP53、MDM2 形成三元複合體。它可能與 FAM189B 及 SCOTIN 互作;另有資料指出 WWOX 透過 WW 結構域與 VOPP1 互作。
疾病與遺傳關聯
WWOX 表現量或部分異構型的表現變化與多種癌症相關,且此基因跨越常在癌症中發生改變的染色體脆弱位點 FRA16D;但目前尚不清楚 WWOX 改變是否直接參與癌症形成,或只是次級效應。食道癌條目指出,影響 WWOX 的變異可能與此病有關,並未在此處確立因果。相較之下,來源將影響 WWOX 的變異列為常染色體隱性脊髓小腦性共濟失調 12(SCAR12)及發育性與癲癇性腦病 28(DEE28)的致病原因。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WWOX 被描述為可能具有氧化還原酶功能,並具有腫瘤抑制作用且參與細胞凋亡。它對正常骨骼發育可能必要,此項依相似性推定;並可能與 p53/TP53 協同控制基因毒性壓力引發的細胞死亡。WWOX 亦參與 TGFB1 訊號與其介導的細胞死亡,可能參與 TNF 介導的細胞死亡,並可能藉由在細胞質中隔離 DVL2 抑制 Wnt 訊號。 | 含實驗來源 | 證據與來源Putative oxidoreductase. Acts as a tumor suppressor and plays a role in apoptosis. Required for normal bone development (By similarity). May function synergistically with p53/TP53 to control genotoxic stress-induced cell death. Plays a role in TGFB1 signaling and TGFB1-mediated cell death. May also play a role in tumor necrosis factor (TNF)-mediated cell death. Inhibits Wnt signaling, probably by sequestering DVL2 in the cytoplasm PMID 11719429 ↗ · PMID 15070730 ↗ · PMID 15548692 ↗ · PMID 16061658 ↗ · PMID 16219768 ↗ · PMID 19366691 ↗ · PMID 19465938 ↗ |
| 交互作用 | WWOX 與 TP53、p73/TP73、MAPK8、ERBB4、LITAF、WBP1、TNK2、TMEM207 及 DVL1、DVL2、DVL3 有互作記錄;與 MAPT/TAU、RUNX2、HYAL2 的互作依相似性推定。WWOX 與 TP53、MDM2 形成三元複合體;它可能與 FAM189B、SCOTIN 互作,並透過 WW domain 與 VOPP1 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with TP53, p73/TP73 and MAPK8. Interacts with MAPT/TAU, RUNX2 and HYAL2 (By similarity). Forms a ternary complex with TP53 and MDM2. Interacts with ERBB4, LITAF and WBP1. Interacts with DVL1, DVL2 and DVL3. May interact with FAM189B and SCOTIN. Interacts with TNK2. Interacts with TMEM207. Interacts (via WW domain) with VOPP1 PMID 12514174 ↗ · PMID 15064722 ↗ · PMID 15070730 ↗ · PMID 15548692 ↗ · PMID 16061658 ↗ · PMID 16219768 ↗ · PMID 16288044 ↗ · PMID 19366691 ↗ · PMID 19465938 ↗ · PMID 22226915 ↗ · PMID 30285739 ↗ |
| 細胞定位 | WWOX 記錄於細胞質、細胞核、粒線體、高基氏體及溶酶體,並有部分定位於粒線體的觀察。基因毒性壓力或 TNF 刺激可伴隨其轉位至細胞核,此項依相似性推定;TGFB1 反應也與核轉位相關。Isoform 5 和 isoform 6 可能位於細胞核;WWOX 可能在結合 VOPP1 後定位至溶酶體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Mitochondrion; Golgi apparatus; Lysosome; Partially localizes to the mitochondria. Translocates to the nucleus upon genotoxic stress or TNF stimulation (By similarity). Translocates to the nucleus in response to TGFB1. Isoform 5 and isoform 6 may localize in the nucleus. Localized to the lysosome probably upon binding to VOPP1 PMID 14695174 ↗ · PMID 15070730 ↗ · PMID 16219768 ↗ · PMID 19366691 ↗ · PMID 19465938 ↗ · PMID 15064722 ↗ · PMID 30285739 ↗ |
| 疾病關聯 | WWOX 缺陷可能涉及多種癌症。此基因跨越第二常見染色體脆弱位點 FRA16D,而該位點常在癌症中改變;WWOX 表現量及部分異構型的表現變化也與癌症相關。然而,這些變化是否直接參與癌症形成,或僅為次級效應,目前仍不清楚。 | 含實驗來源 | 證據與來源Defects in WWOX may be involved in several cancer types. The gene spans the second most common chromosomal fragile site (FRA16D) which is frequently altered in cancers. Alteration of the expression and expression of some isoforms is associated with cancers. However, it is still unclear if alteration of WWOX is directly implicated in cancerogenesis or if it corresponds to a secondary effect PMID 10861292 ↗ · PMID 11572989 ↗ · PMID 15073125 ↗ · PMID 15131042 ↗ · PMID 15266310 ↗ |
| 疾病關聯 | 食道癌是食道的惡性腫瘤,常見類型包括食道鱗狀細胞癌與腺癌。由於疾病通常進展至晚期、無法治癒時才被發現,食道癌仍是嚴重疾病。此條目指出,影響 WWOX 的變異可能導致食道癌;其措辭為可能,未在此處確立因果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Esophageal cancer ESCR A malignancy of the esophagus. The most common types are esophageal squamous cell carcinoma and adenocarcinoma. Cancer of the esophagus remains a devastating disease because it is usually not detected until it has progressed to an advanced incurable stage. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 133239 PMID 11956080 ↗ |
| 疾病關聯 | 常染色體隱性脊髓小腦性共濟失調 12(SCAR12)屬於臨床與遺傳表現異質的脊髓小腦性共濟失調。患者會逐漸出現步態不協調,手部、語言及眼球動作也常缺乏協調,與小腦退化有關,腦幹和脊髓受累程度不一。疾病另可於嬰兒期出現全身性癲癇、精神動作發展遲緩及智能障礙,部分患者可能有痙攣;影響 WWOX 的變異可致病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Spinocerebellar ataxia, autosomal recessive, 12 SCAR12 A form of spinocerebellar ataxia, a clinically and genetically heterogeneous group of cerebellar disorders. Patients show progressive incoordination of gait and often poor coordination of hands, speech and eye movements, due to degeneration of the cerebellum with variable involvement of the brainstem and spinal cord. SCAR12 is additionally characterized by onset of generalized seizures in infancy, and delayed psychomotor development with intellectual disability. Some patients may also show spasticity. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614322 PMID 24369382 ↗ · PMID 24456803 ↗ |
| 疾病關聯 | 發育性與癲癇性腦病 28(DEE28)屬於異質性嚴重早發癲癇,特徵包括難治性癲癇發作、神經發育障礙及預後不佳。患者在癲癇發作前發育正常,發作後才逐漸出現認知與動作遲緩。來源指出,影響 WWOX 的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Developmental and epileptic encephalopathy 28 DEE28 A form of epileptic encephalopathy, a heterogeneous group of severe early-onset epilepsies characterized by refractory seizures, neurodevelopmental impairment, and poor prognosis. Development is normal prior to seizure onset, after which cognitive and motor delays become apparent. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616211 PMID 25411445 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCAGTGCGCAGGCGTGAGCGGTCGGGCCCCGACGCGCGCG40GGTCTCGTTTGGAGCGGGAGTGAGTTCCTGAGCGAGTGGA80CCCGGCAGCGGGCGATAGGGGGGCCAGGTGCCTCCACAGT120CAGCCATGGCAGCGCTGCGCTACGCGGGGCTGGACGACAC160GGACAGTGAGGACGAGCTGCCTCCGGGCTGGGAGGAGAGA200ACCACCAAGGACGGCTGGGTTTACTACGCCAATCACACCG240AGGAGAAGACTCAGTGGGAACATCCAAAAACTGGAAAAAG280AAAACGAGTGGCAGGAGATTTGCCATACGGATGGGAACAA320GAAACTGATGAGAACGGACAAGTGTTTTTTGTTGACCATA360TAAATAAAAGAACCACCTACTTGGACCCAAGACTGGCGTT400TACTGTGGATGATAATCCGACCAAGCCAACCACCCGGCAA440AGATACGACGGCAGCACCACTGCCATGGAAATTCTCCAGG480GCCGGGATTTCACTGGCAAAGTGGTTGTGGTCACTGGAGC520TAATTCAGGAATAGGGTTCGAAACCGCCAAGTCTTTTGCC560CTCCATGGTGCACATGTGATCTTGGCCTGCAGGAACATGG600CAAGGGCGAGTGAAGCAGTGTCACGCATTTTAGAAGAATG640GCATAAAGCCAAGGTAGAAGCAATGACCCTGGACCTCGCT680CTGCTCCGTAGCGTGCAGCATTTTGCTGAAGCATTCAAGG720CCAAGAATGTGCCTCTTCATGTGCTTGTGTGCAACGCAGC760AACTTTTGCTCTACCCTGGAGTCTCACCAAAGATGGCCTG800GAGACCACCTTTCAAGTGAATCATCTGGGGCACTTCTACC840TTGTCCAGCTCCTCCAGGATGTTTTGTGCCGCTCAGCTCC880TGCCCGTGTCATTGTGGTCTCCTCAGAGTCCCATCGATTT920ACAGATATTAACGACTCCTTGGGAAAACTGGACTTCAGTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。