演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

WRAP73WDR8

WD repeat containing, antisense to TP73

WRAP73 與 SSX2IP 形成的複合體被認為參與有絲分裂時紡錘體在中心體的錨定,也與中心粒周圍蛋白定位及纖毛形成相關。

Homo sapiens1p36.32UniProt Q9P2S5
OFFICIAL SYMBOL
WRAP73
CHROMOSOME
1
UNIPROT
Q9P2S5
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

WRAP73(WD repeat containing, antisense to TP73)是人類的蛋白質編碼基因,其產物為 WD repeat-containing protein WRAP73。蛋白質全長 460 個胺基酸,序列中註解有六個 WD 重複區。來源所述的功能涵蓋中心體與中心粒周圍蛋白的定位,以及纖毛形成相關過程;其中部分作用是由 WRAP73 與 SSX2IP 組成的複合體所提出。這些資料將 WRAP73 描述為參與細胞分裂紡錘體組織及纖毛生成的蛋白質。

Official symbol
WRAP73
Gene name
WD repeat containing, antisense to TP73
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12759
UniProt
Q9P2S5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
WDR8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11p36.32
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegWRAP73pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:3,630,767–3,652,761
Gene span
21,995 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000270708 ★3,630,770–3,650,10312
ENST000003783223,630,767–3,650,11211
ENST000010360193,630,767–3,650,11211
ENST000008551263,630,768–3,650,11212
ENST000008551273,630,768–3,650,11211
ENST000008551283,630,768–3,650,10312
ENST000008551293,630,768–3,650,1129
ENST000008551303,630,768–3,650,11211
ENST000009205793,630,768–3,650,11210
ENST000009205803,630,768–3,650,11210
ENST000009205813,630,768–3,650,11210
ENST000009604923,630,768–3,650,11211

顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

WRAP73 與 SSX2IP 形成的複合體被提出可能調節有絲分裂時紡錘體在中心體的錨定。WRAP73 也有助於 SSX2IP 定位至中心體,並是維持正常有絲分裂雙極紡錘體形態所必需的因子。這些作用將 WRAP73 與細胞分裂期間中心體的組織及紡錘體形態維持聯繫起來。

在中心粒周圍蛋白的運送方面,WRAP73 對 PCM1、SSX2IP、CEP290 與 PIBF1/CEP90 等蛋白定位至中心體是必要的。這些蛋白需被定位至中心體,而來源所述的 WRAP73 作用聚焦於此一靶向過程;資料未進一步說明它如何促成運送。

WRAP73 也與纖毛生成有關,並參與從母中心粒移除 CEP97:CCP110 複合體。此外,它參與母中心粒處的纖毛囊泡形成,且是纖毛生成期間囊泡對接至基底體所必需的。來源進一步指出,WRAP73 可能促進含有 RAB8A 或 ARL13B 的囊泡對接;此處的促進作用帶有可能性,並非確定結論。

因此,來源支持 WRAP73 在有絲分裂中心體功能與纖毛生成相關步驟中具有多項作用,但對囊泡對接的具體作用仍以可能性描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 3650103 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>WRAP73 ENST00000270708 GRCh38 chr1:3650003-3651103 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CAGACCCGAGGCTGGGCGCCCGGAGGTACGAGCAGGACCCTGGCCGGCTCTCAGCTCCCAGAACCCAGGG
CCAGGCGGGGATGTCAGGGTCTGCGCGATCTGGGGGGCCCTAGAGGCGCCGGCGGGGCCTGGCGCGGACT
ACTAGCGGCCTGCGGGAGCCAGGGGTGGAGGGGGCCGCTGTCTAGGGAAGAGGACCGGGGTCCGGAGTGG
GGGTGAGAACGAGGCACGCCCCTGAGCCTGCGAAACCTGCGGACCGAGCGCCCGCGCAGGAGCTCGCTCC
CTCTGGGCCCCCAGGTCCCAGACCCGCACGATTCTTCGCCCGGTGCCAGCCCAGATGCGCGCGGGTGATG
AACGGGCGGTGGCCGCGATCCACGCGCTCGCTCTGCCCAGTCAGCGGCAAATTCGTTCTCTCCTTGATCT
CAGTGGCACTGGAGCGTGAGGCAAGGGCCAGGCGGCAGGTAGAGGGGTCGGACTCAGCAAAAGCAAACAA
AACCCCAAGCAAACGAAATAAATACTTATACATTACATACACGATATAATATATGTGCGACAGACACCGT
ATTACTTATTAAAGATATATTTGTAGGTAAACATATATTTACATGTAAACATACATTTACATATAAATAT
AAATATATATATATGCATGTGTACACACACGCAGACACACAGGTCGCTCAATTAAATTTGAATTTCAGAC
TAGCGAGTAATTTTTCCGTATTAGCATGTCCCGTGCAATATTTGGGAACATACTTATAACTAGATTTGTT
GTGAATCTGAAATTCAAATTTTACTGTGCTTTCTACATTTTTATCAGCAGCCCTAGCTGGAGGTGCTCAA
AGGCCTCCCGGCCTTTGAGGTAAGGTTCTCGGGTCGGAAATCCCTGGTCGGAAGAAACGTGGGCGTTTCC
TTTAAAGCCCTGCGGCACAAGAACTACAAGCCCCACAATGCCGCGCGGAAGCCGGCGGCGCTGATAGGCT
GCAGTTCACTTCCGCCTTCTGACTTCCGGCCTCGGAGGCCGGCGTCGGCTGTTGCAGCCTGCTGCGCGCC
CAGGGGTCCCGCGGGTTTTCGGGCGCAGGGTGGCGCCCGCGGCAGGCGGCG
WRAP73 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WRAP73_1 ↗1:3,650,103負股3,650,093–3,650,152

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_5T6T9 · CTCF_binding_site · 3650015–3650036 · regulatory

ENSR1_BPK5 · promoter · 3650048–3650593 · regulatory

ENSR1_BPKD · promoter · 3652026–3652575 · regulatory

ENSR1_BPKH · enhancer · 3652576–3653590 · regulatory

ENSR1_84WC3 · enhancer · 3654693–3654939 · regulatory

· motif · 3649544–3649553 · motif

· motif · 3649574–3649583 · motif

· motif · 3649603–3649612 · motif

· motif · 3649650–3649659 · motif

· motif · 3649680–3649689 · motif

· motif · 3649740–3649749 · motif

· motif · 3649770–3649779 · motif

· motif · 3649800–3649809 · motif

· motif · 3649817–3649826 · motif

· motif · 3650017–3650033 · motif

· motif · 3650092–3650103 · motif

· motif · 3650092–3650103 · motif

· motif · 3650094–3650103 · motif

· motif · 3650104–3650117 · motif

· motif · 3650106–3650117 · motif

· motif · 3650106–3650117 · motif

· motif · 3650108–3650117 · motif

· motif · 3650195–3650205 · motif

· motif · 3650197–3650210 · motif

· motif · 3650382–3650393 · motif

· motif · 3651076–3651085 · motif

· motif · 3651398–3651405 · motif

· motif · 3651784–3651796 · motif

· motif · 3651787–3651794 · motif

· motif · 3652241–3652254 · motif

· motif · 3653205–3653218 · motif

· motif · 3653205–3653218 · motif

· motif · 3653956–3653968 · motif

· motif · 3653958–3653965 · motif

· motif · 3653958–3653973 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:460 aa

1 aa460 aa重複區
依 Q9P2S5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

WD repeat-containing protein WRAP73 長 460 個胺基酸。序列註解標示六個 WD 重複區:WD 1 位於 46–86,WD 2 位於 89–129,WD 3 位於 176–210,WD 4 位於 221–260,WD 5 位於 328–369,WD 6 位於 371–410。

重複區WD 146–86 aa
重複區WD 289–129 aa
重複區WD 3176–210 aa
重複區WD 4221–260 aa
重複區WD 5328–369 aa
重複區WD 6371–410 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9P2S5…

AlphaFold · Q9P2S5

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriole;Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriolar satellite

WRAP73 位於細胞質及中心體相關區域,包括中心粒與中心粒周圍區域;在母中心粒近端富集。 纖毛生成期間,WRAP73 也與相鄰中心粒的基底體相關。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
WDR8WRAP73NUDCSSX2IPSsx2ip
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

WRAP73 與 SSX2IP 有實體交互作用,並形成 SSX2IP:WRAP73 複合體。該複合體被提出可能調節有絲分裂紡錘體在中心體的錨定;這項功能關係不等同於其他已列明的結合夥伴。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SSX2IP:WRAP73 複合體被提出可能調節有絲分裂時紡錘體在中心體的錨定;WRAP73 對 SSX2IP 的中心體定位及正常雙極紡錘體形態是必要的,也協助 PCM1、SSX2IP、CEP290 與 PIBF1/CEP90 定位至中心體。它還參與纖毛生成、母中心粒處纖毛囊泡形成及 CEP97:CCP110 複合體移除,並可能促進含 RAB8A 或 ARL13B 的囊泡對接至基底體。含實驗來源
證據與來源

The SSX2IP:WRAP73 complex is proposed to act as regulator of spindle anchoring at the mitotic centrosome. Required for the centrosomal localization of SSX2IP and normal mitotic bipolar spindle morphology. Required for the targeting of centriole satellite proteins to centrosomes such as of PCM1, SSX2IP, CEP290 and PIBF1/CEP90. Required for ciliogenesis and involved in the removal of the CEP97:CCP110 complex from the mother centriole. Involved in ciliary vesicle formation at the mother centriole and required for the docking of vesicles to the basal body during ciliogenesis; may promote docking of RAB8A- and ARL13B-containing vesicles

PMID 26545777 ↗ · PMID 26675238 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用WRAP73 與 SSX2IP 有交互作用。含實驗來源
證據與來源

Interacts with SSX2IP

PMID 26545777 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位WRAP73 位於細胞質及中心體相關區域,包括中心粒與中心粒周圍區域,並富集於母中心粒近端;纖毛生成期間,也與相鄰中心粒的基底體相關。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriole; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriolar satellite; Enriched in the proximal end of the mother centriole. During ciliogenesis also associated with the basal body of the adjacent centriole

PMID 14654843 ↗ · PMID 26545777 ↗ · PMID 26675238 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000270708 · 1,692 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACTTCCGGCCTCGGAGGCCGGCGTCGGCTGTTGCAGCCT40
41GCTGCGCGCCCAGGGGTCCCGCGGGTTTTCGGGCGCAGGG80
81TGGCGCCCGCGGCAGGCGGCGGCCATGAACTTCTCCGAGG120
121TATTCAAGCTCTCCAGCTTACTCTGCAAGTTCTCCCCGGA160
161CGGCAAGTACCTGGCTTCCTGTGTCCAGTACCGGTTAGTG200
201GTCCGGGATGTGAACACCCTTCAGATCCTTCAGCTGTACA240
241CGTGCCTAGACCAGATCCAGCACATCGAGTGGTCGGCAGA280
281CTCGCTCTTCATCCTGTGCGCCATGTACAAGCGAGGGCTG320
321GTGCAGGTCTGGTCTTTAGAGCAGCCCGAATGGCACTGCA360
361AAATAGACGAGGGCTCAGCCGGGCTGGTGGCCTCGTGCTG400
401GAGCCCGGACGGGCGCCACATTCTCAACACCACGGAATTC440
441CATCTGCGGATAACCGTCTGGTCCTTGTGCACAAAATCCG480
481TGTCTTACATCAAATACCCGAAAGCTTGTCTGCAGGGAAT520
521CACCTTCACCAGGGACGGCCGCTACATGGCGCTGGCAGAA560
561CGGCGCGACTGCAAAGATTACGTGAGCATCTTCGTCTGCA600
601GTGATTGGCAGCTCCTGCGGCATTTTGATACGGACACCCA640
641GGATCTCACAGGGATTGAGTGGGCCCCAAACGGCTGTGTG680
681CTGGCAGTGTGGGACACCTGCTTGGAGTACAAGATTCTGC720
721TGTACTCATTGGATGGCCGGTTGTTGTCCACGTACAGCGC760
761TTACGAGTGGTCCCTGGGCATCAAGTCTGTGGCCTGGAGC800
801CCCAGCAGTCAGTTCCTGGCAGTTGGGAGCTATGATGGAA840
841AGGTGCGCATCCTTAATCACGTGACTTGGAAAATGATCAC880
881GGAGTTTGGGCATCCTGCAGCCATTAATGATCCCAAGATA920
921GTGGTGTATAAGGAGGCCGAGAAGAGCCCACAGCTGGGAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。