基因總覽
WRAP73(WD repeat containing, antisense to TP73)是人類的蛋白質編碼基因,其產物為 WD repeat-containing protein WRAP73。蛋白質全長 460 個胺基酸,序列中註解有六個 WD 重複區。來源所述的功能涵蓋中心體與中心粒周圍蛋白的定位,以及纖毛形成相關過程;其中部分作用是由 WRAP73 與 SSX2IP 組成的複合體所提出。這些資料將 WRAP73 描述為參與細胞分裂紡錘體組織及纖毛生成的蛋白質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000270708 ★ | 3,630,770–3,650,103 | 12 |
| ENST00000378322 | 3,630,767–3,650,112 | 11 |
| ENST00001036019 | 3,630,767–3,650,112 | 11 |
| ENST00000855126 | 3,630,768–3,650,112 | 12 |
| ENST00000855127 | 3,630,768–3,650,112 | 11 |
| ENST00000855128 | 3,630,768–3,650,103 | 12 |
| ENST00000855129 | 3,630,768–3,650,112 | 9 |
| ENST00000855130 | 3,630,768–3,650,112 | 11 |
| ENST00000920579 | 3,630,768–3,650,112 | 10 |
| ENST00000920580 | 3,630,768–3,650,112 | 10 |
| ENST00000920581 | 3,630,768–3,650,112 | 10 |
| ENST00000960492 | 3,630,768–3,650,112 | 11 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WRAP73 與 SSX2IP 形成的複合體被提出可能調節有絲分裂時紡錘體在中心體的錨定。WRAP73 也有助於 SSX2IP 定位至中心體,並是維持正常有絲分裂雙極紡錘體形態所必需的因子。這些作用將 WRAP73 與細胞分裂期間中心體的組織及紡錘體形態維持聯繫起來。
在中心粒周圍蛋白的運送方面,WRAP73 對 PCM1、SSX2IP、CEP290 與 PIBF1/CEP90 等蛋白定位至中心體是必要的。這些蛋白需被定位至中心體,而來源所述的 WRAP73 作用聚焦於此一靶向過程;資料未進一步說明它如何促成運送。
WRAP73 也與纖毛生成有關,並參與從母中心粒移除 CEP97:CCP110 複合體。此外,它參與母中心粒處的纖毛囊泡形成,且是纖毛生成期間囊泡對接至基底體所必需的。來源進一步指出,WRAP73 可能促進含有 RAB8A 或 ARL13B 的囊泡對接;此處的促進作用帶有可能性,並非確定結論。
因此,來源支持 WRAP73 在有絲分裂中心體功能與纖毛生成相關步驟中具有多項作用,但對囊泡對接的具體作用仍以可能性描述。
Promoter 與基因調控
>WRAP73 ENST00000270708 GRCh38 chr1:3650003-3651103 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGACCCGAGGCTGGGCGCCCGGAGGTACGAGCAGGACCCTGGCCGGCTCTCAGCTCCCAGAACCCAGGG CCAGGCGGGGATGTCAGGGTCTGCGCGATCTGGGGGGCCCTAGAGGCGCCGGCGGGGCCTGGCGCGGACT ACTAGCGGCCTGCGGGAGCCAGGGGTGGAGGGGGCCGCTGTCTAGGGAAGAGGACCGGGGTCCGGAGTGG GGGTGAGAACGAGGCACGCCCCTGAGCCTGCGAAACCTGCGGACCGAGCGCCCGCGCAGGAGCTCGCTCC CTCTGGGCCCCCAGGTCCCAGACCCGCACGATTCTTCGCCCGGTGCCAGCCCAGATGCGCGCGGGTGATG AACGGGCGGTGGCCGCGATCCACGCGCTCGCTCTGCCCAGTCAGCGGCAAATTCGTTCTCTCCTTGATCT CAGTGGCACTGGAGCGTGAGGCAAGGGCCAGGCGGCAGGTAGAGGGGTCGGACTCAGCAAAAGCAAACAA AACCCCAAGCAAACGAAATAAATACTTATACATTACATACACGATATAATATATGTGCGACAGACACCGT ATTACTTATTAAAGATATATTTGTAGGTAAACATATATTTACATGTAAACATACATTTACATATAAATAT AAATATATATATATGCATGTGTACACACACGCAGACACACAGGTCGCTCAATTAAATTTGAATTTCAGAC TAGCGAGTAATTTTTCCGTATTAGCATGTCCCGTGCAATATTTGGGAACATACTTATAACTAGATTTGTT GTGAATCTGAAATTCAAATTTTACTGTGCTTTCTACATTTTTATCAGCAGCCCTAGCTGGAGGTGCTCAA AGGCCTCCCGGCCTTTGAGGTAAGGTTCTCGGGTCGGAAATCCCTGGTCGGAAGAAACGTGGGCGTTTCC TTTAAAGCCCTGCGGCACAAGAACTACAAGCCCCACAATGCCGCGCGGAAGCCGGCGGCGCTGATAGGCT GCAGTTCACTTCCGCCTTCTGACTTCCGGCCTCGGAGGCCGGCGTCGGCTGTTGCAGCCTGCTGCGCGCC CAGGGGTCCCGCGGGTTTTCGGGCGCAGGGTGGCGCCCGCGGCAGGCGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WRAP73_1 ↗ | 1:3,650,103 | 負股 | 3,650,093–3,650,152 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_5T6T9 · CTCF_binding_site · 3650015–3650036 · regulatory
ENSR1_BPK5 · promoter · 3650048–3650593 · regulatory
ENSR1_BPKD · promoter · 3652026–3652575 · regulatory
ENSR1_BPKH · enhancer · 3652576–3653590 · regulatory
ENSR1_84WC3 · enhancer · 3654693–3654939 · regulatory
· motif · 3649544–3649553 · motif
· motif · 3649574–3649583 · motif
· motif · 3649603–3649612 · motif
· motif · 3649650–3649659 · motif
· motif · 3649680–3649689 · motif
· motif · 3649740–3649749 · motif
· motif · 3649770–3649779 · motif
· motif · 3649800–3649809 · motif
· motif · 3649817–3649826 · motif
· motif · 3650017–3650033 · motif
· motif · 3650092–3650103 · motif
· motif · 3650092–3650103 · motif
· motif · 3650094–3650103 · motif
· motif · 3650104–3650117 · motif
· motif · 3650106–3650117 · motif
· motif · 3650106–3650117 · motif
· motif · 3650108–3650117 · motif
· motif · 3650195–3650205 · motif
· motif · 3650197–3650210 · motif
· motif · 3650382–3650393 · motif
· motif · 3651076–3651085 · motif
· motif · 3651398–3651405 · motif
· motif · 3651784–3651796 · motif
· motif · 3651787–3651794 · motif
· motif · 3652241–3652254 · motif
· motif · 3653205–3653218 · motif
· motif · 3653205–3653218 · motif
· motif · 3653956–3653968 · motif
· motif · 3653958–3653965 · motif
· motif · 3653958–3653973 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:460 aa
WD repeat-containing protein WRAP73 長 460 個胺基酸。序列註解標示六個 WD 重複區:WD 1 位於 46–86,WD 2 位於 89–129,WD 3 位於 176–210,WD 4 位於 221–260,WD 5 位於 328–369,WD 6 位於 371–410。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WRAP73 位於細胞質及中心體相關區域,包括中心粒與中心粒周圍區域;在母中心粒近端富集。 纖毛生成期間,WRAP73 也與相鄰中心粒的基底體相關。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- NUDCQ9Y266 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SSX2IPQ9Y2D8 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- Ssx2ipQ8VC66 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
WRAP73 與 SSX2IP 有實體交互作用,並形成 SSX2IP:WRAP73 複合體。該複合體被提出可能調節有絲分裂紡錘體在中心體的錨定;這項功能關係不等同於其他已列明的結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SSX2IP:WRAP73 複合體被提出可能調節有絲分裂時紡錘體在中心體的錨定;WRAP73 對 SSX2IP 的中心體定位及正常雙極紡錘體形態是必要的,也協助 PCM1、SSX2IP、CEP290 與 PIBF1/CEP90 定位至中心體。它還參與纖毛生成、母中心粒處纖毛囊泡形成及 CEP97:CCP110 複合體移除,並可能促進含 RAB8A 或 ARL13B 的囊泡對接至基底體。 | 含實驗來源 | 證據與來源The SSX2IP:WRAP73 complex is proposed to act as regulator of spindle anchoring at the mitotic centrosome. Required for the centrosomal localization of SSX2IP and normal mitotic bipolar spindle morphology. Required for the targeting of centriole satellite proteins to centrosomes such as of PCM1, SSX2IP, CEP290 and PIBF1/CEP90. Required for ciliogenesis and involved in the removal of the CEP97:CCP110 complex from the mother centriole. Involved in ciliary vesicle formation at the mother centriole and required for the docking of vesicles to the basal body during ciliogenesis; may promote docking of RAB8A- and ARL13B-containing vesicles PMID 26545777 ↗ · PMID 26675238 ↗ |
| 交互作用 | WRAP73 與 SSX2IP 有交互作用。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | WRAP73 位於細胞質及中心體相關區域,包括中心粒與中心粒周圍區域,並富集於母中心粒近端;纖毛生成期間,也與相鄰中心粒的基底體相關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriole; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome, centriolar satellite; Enriched in the proximal end of the mother centriole. During ciliogenesis also associated with the basal body of the adjacent centriole PMID 14654843 ↗ · PMID 26545777 ↗ · PMID 26675238 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GACTTCCGGCCTCGGAGGCCGGCGTCGGCTGTTGCAGCCT40GCTGCGCGCCCAGGGGTCCCGCGGGTTTTCGGGCGCAGGG80TGGCGCCCGCGGCAGGCGGCGGCCATGAACTTCTCCGAGG120TATTCAAGCTCTCCAGCTTACTCTGCAAGTTCTCCCCGGA160CGGCAAGTACCTGGCTTCCTGTGTCCAGTACCGGTTAGTG200GTCCGGGATGTGAACACCCTTCAGATCCTTCAGCTGTACA240CGTGCCTAGACCAGATCCAGCACATCGAGTGGTCGGCAGA280CTCGCTCTTCATCCTGTGCGCCATGTACAAGCGAGGGCTG320GTGCAGGTCTGGTCTTTAGAGCAGCCCGAATGGCACTGCA360AAATAGACGAGGGCTCAGCCGGGCTGGTGGCCTCGTGCTG400GAGCCCGGACGGGCGCCACATTCTCAACACCACGGAATTC440CATCTGCGGATAACCGTCTGGTCCTTGTGCACAAAATCCG480TGTCTTACATCAAATACCCGAAAGCTTGTCTGCAGGGAAT520CACCTTCACCAGGGACGGCCGCTACATGGCGCTGGCAGAA560CGGCGCGACTGCAAAGATTACGTGAGCATCTTCGTCTGCA600GTGATTGGCAGCTCCTGCGGCATTTTGATACGGACACCCA640GGATCTCACAGGGATTGAGTGGGCCCCAAACGGCTGTGTG680CTGGCAGTGTGGGACACCTGCTTGGAGTACAAGATTCTGC720TGTACTCATTGGATGGCCGGTTGTTGTCCACGTACAGCGC760TTACGAGTGGTCCCTGGGCATCAAGTCTGTGGCCTGGAGC800CCCAGCAGTCAGTTCCTGGCAGTTGGGAGCTATGATGGAA840AGGTGCGCATCCTTAATCACGTGACTTGGAAAATGATCAC880GGAGTTTGGGCATCCTGCAGCCATTAATGATCCCAAGATA920GTGGTGTATAAGGAGGCCGAGAAGAGCCCACAGCTGGGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。