演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

WNT9BWNT14B

Wnt family member 9B

WNT9B 編碼 Wnt family member 9B,屬於 Wnt 家族的分泌型蛋白質,參與典型 Wnt/β-catenin 訊息傳遞,並與胚胎腎臟及泌尿生殖系統發育相關。

Homo sapiens17q21.32UniProt O14905
OFFICIAL SYMBOL
WNT9B
CHROMOSOME
17
UNIPROT
O14905
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

WNT9B 是蛋白質編碼基因,其產物 Wnt family member 9B 屬於 Wnt 家族。此蛋白質為分泌型訊號分子,具有 N 端訊號胜肽;來源將其列為 Frizzled 家族七次跨膜受體的可能配體,並指出它參與典型 Wnt/β-catenin 訊息傳遞。其生物學角色與胚胎發育有關,涉及腎臟及泌尿生殖道等組織的正常形成。

Official symbol
WNT9B
Gene name
Wnt family member 9B
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12779
UniProt
O14905
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
WNT14BWNT15

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q21.32
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegWNT9Bpq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:46,833,201–46,886,730
Gene span
53,530 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000290015 ★46,851,583–46,880,5604
ENST0000057537246,833,201–46,875,1463
ENST0000039346146,851,581–46,886,7305
ENST0000112001846,851,581–46,880,5602
ENST0000113547046,851,581–46,880,5604

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Wnt family member 9B 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的可能配體,並參與典型 Wnt/β-catenin 訊息傳遞。其訊號作用與胚胎腎臟發育有關:在後腎間質中啟動訊號級聯,促進腎小管形成。來源亦指出,WNT9B 位於 WNT4 上游,參與介導腎小管與苗勒氏管發育的訊息路徑。

WNT9B 對正常胚胎腎臟發育具有必要性,也與泌尿生殖道的正常發育相關。相關結構包括女性的子宮、部分輸卵管及上段陰道,以及男性的副睪與輸精管。這些發育作用顯示其訊號參與不同性別的泌尿生殖系統形成;來源未進一步界定各組織中作用的分子細節。

此外,WNT9B 也參與顱顏發育,且胚胎發育期間正常的腭融合需要此蛋白質。這項顱顏功能標註為依據相似性推定,應視為相似性支持的功能資訊,而非此處明確描述的直接實驗證明。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 46851583 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>WNT9B ENST00000290015 GRCh38 chr17:46850583-46851683 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATATTTTGTTTTGCTTGATTTGACCCCGTGTTCGAGACTCTCAAAAACATTTTAAATCTCACTTGGGTCA
TTGGTTGTATGTCTCCTTTCTAGACAGGTACCACGCGCCGCTTTGATCTCTGCACCTTCGCAGCAGAAAT
TGGGGTTAAACTTTAAAAAATAATAAGCAAAACAGAACTTTGGGGCCCAACACTTGAAGTTCCCACCCTA
TCTACCAGAGATTCTGGCATCTACACACCTTGGAAAGTGGGTCCCTCCTCCCGCAGGGCTCTGTCTGCCC
CACTGTCCACTTTGGATTTCTGCGCTGGGGAACATCAGCAGCATTTTGTCAAAAGCCCACGGAGGCCCAC
GCTGCGCGCCTCGCCGGTAACAGTCACTCTCCCGTTTAAAAACAGAGCGCCCTTTCCTCTCTCCCCTCTG
CCCAAGACTCTTTGCCTGGCAACAGGGTCCCCTGAGCCATTGGACATGCATTTCCCCCGCTTCCAGAGAG
CGGTTCTGCACCAGGACCCGGCCCTGCCCTGAGTCTGCGGGCTGCGGCGAAGAGACCGCACTTGCCCGGC
AGGAGGGCGGACAATGACCCGGGTTTTCCACCGACTCCAGATGCGTCCCTCCTCCTACCCCTCCACCTTC
TCTACCTCGGAGAAGCCATTGCGCTTGCCTCCGCCCCATCCCGGAGAGGCAGAATCTCCTCCGTCCCCGC
CTCGTACCCTCCTCCCCGCCTCTCCAGGCCCGGGGGGCTTCACGTTCAGCCACCGCGACCCCGGGCGGGC
GCGGCGCCAGGTGAGCGCTCACCTGGGGCCGGAGGGCGGGGCAATGGGGGAGGGGCGGGGGCGGTCCAGG
GGCGGCTGCCCCACCCGCGACGGGGCGGGGCGAGGGCGGTGGGGCCAATGGGGCGGGGGGCTCGCCGCCC
GGGGCTGGGGAGCCTCCCAATCTCCTCCTTTCCCAGCGCCGCCTGCCCCGCCCCACCCGGGTTTAAAGTC
CCGCGGGCGGGTGGTGGCGGAGCTGCGAGCTTGAGCGGCGCGAGGAGATGCTAGAGGGCGCAGCGCCGCC
AGCACCATGCGCCCCCCGCCCGCGCTGGCCCTGGCCGGGCTCTGCCTGCTG
WNT9B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WNT9B_2 ↗17:46,833,219正股46,833,170–46,833,229
WNT9B_1 ↗17:46,851,584正股46,851,535–46,851,594

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_9NL4J · promoter · 46851093–46851596 · regulatory

ENSR17_BCB3C · enhancer · 46851597–46852409 · regulatory

ENSR17_5F2JJM · CTCF_binding_site · 46851606–46851627 · regulatory

ENSR17_83D78P · enhancer · 46854140–46854347 · regulatory

· motif · 46851551–46851566 · motif

· motif · 46851551–46851566 · motif

· motif · 46851608–46851624 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:357 aa

1 aa357 aa訊號胜肽
依 O14905 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Wnt family member 9B 全長為 357 個胺基酸,屬於 Wnt 家族。蛋白質序列第 1 至 22 位為訊號胜肽,與其分泌型特性相符;來源未提供其他結構域或功能區段註解。

訊號胜肽1–22 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O14905…

AlphaFold · O14905

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted, extracellular space, extracellular matrix;Secreted

Wnt family member 9B 為分泌蛋白,定位於細胞外空間及細胞外基質。 來源未指出其定位會因條件或異構型而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
WNT14BWNT9B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Wnt family member 9B 可與 AFM 形成可溶性的 1:1 複合體;此結合可防止寡聚化,並為延長生物活性所需。此複合體可能是體液中的生理形式。它也是 Wnt-Fzd-LRP5-LRP6 訊號複合體的組成成分,並在該複合體中直接與 LRP6 互作;另有資料指出它透過 PKD1 的細胞外結構域與 PKD1 互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Wnt family member 9B 可能是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,並參與典型 Wnt/β-catenin 訊息傳遞。它對正常胚胎腎臟及泌尿生殖道發育具有必要性,相關組織包括女性子宮、部分輸卵管與上段陰道,以及男性副睪與輸精管;其在後腎間質中啟動促進腎小管形成的訊號級聯,並位於介導腎小管和苗勒氏管發育路徑中的 WNT4 上游。此外,它參與顱顏發育,腭在胚胎期正常融合亦需要此蛋白質;此項顱顏功能為依相似性推定。推論支持
證據與來源

Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors (Probable). Functions in the canonical Wnt/beta-catenin signaling pathway. Required for normal embryonic kidney development, and for normal development of the urogenital tract, including uterus and part of the oviduct and the upper vagina in females, and epididymis and vas deferens in males. Activates a signaling cascade in the metanephric mesenchyme that induces tubulogenesis. Acts upstream of WNT4 in the signaling pathways that mediate development of kidney tubules and the Muellerian ducts. Plays a role in cranofacial development and is required for normal fusion of the palate during embryonic development (By similarity)

PMID 20093360 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Wnt family member 9B 與 AFM 形成可溶性 1:1 複合體,可防止寡聚化,且此複合體為延長其生物活性所需;該複合體可能是體液中的生理形式。它也是含有 WNT 蛋白、FZD 蛋白及 LRP5 或 LRP6 的 Wnt-Fzd-LRP5-LRP6 訊號複合體成分,並在複合體中直接與 LRP6 互作;此外亦透過 PKD1 的細胞外結構域與 PKD1 互作。含實驗來源
證據與來源

Forms a soluble 1:1 complex with AFM; this prevents oligomerization and is required for prolonged biological activity. The complex with AFM may represent the physiological form in body fluids. Component of the Wnt-Fzd-LRP5-LRP6 signaling complex that contains a WNT protein, a FZD protein and LRP5 or LRP6. Interacts directly in the complex with LRP6. Interacts with PKD1 (via extracellular domain)

PMID 20093360 ↗ · PMID 26902720 ↗ · PMID 27214281 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Wnt family member 9B 為分泌蛋白,定位於細胞外空間與細胞外基質。含實驗來源
證據與來源

Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Secreted

PMID 26902720 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000290015 · 4,972 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCTGCGAGCTTGAGCGGCGCGAGGAGATGCTAGAGGGCG40
41CAGCGCCGCCAGCACCATGCGCCCCCCGCCCGCGCTGGCC80
81CTGGCCGGGCTCTGCCTGCTGGCGCTGCCCGCCGCCGCCG120
121CCTCCTACTTCGGCCTGACCGGGCGGGAAGTCCTGACGCC160
161CTTCCCAGGATTGGGCACTGCGGCAGCCCCGGCACAGGGC200
201GGGGCCCACCTGAAGCAGTGTGACCTGCTGAAGCTGTCCC240
241GGCGGCAGAAGCAGCTCTGCCGGAGGGAGCCCGGCCTGGC280
281TGAGACCCTGAGGGATGCTGCGCACCTCGGCCTGCTTGAG320
321TGCCAGTTTCAGTTCCGGCATGAGCGCTGGAACTGTAGCC360
361TGGAGGGCAGGATGGGCCTGCTCAAGAGAGGCTTCAAAGA400
401GACAGCTTTCCTGTACGCGGTGTCCTCTGCCGCCCTCACC440
441CACACCCTGGCCCGGGCCTGCAGCGCTGGGCGCATGGAGC480
481GCTGCACCTGTGATGACTCTCCGGGGCTGGAGAGCCGGCA520
521GGCCTGGCAGTGGGGCGTGTGCGGTGACAACCTCAAGTAC560
561AGCACCAAGTTTCTGAGCAACTTCCTGGGGTCCAAGAGAG600
601GAAACAAGGACCTGCGGGCACGGGCAGACGCCCACAATAC640
641CCACGTGGGCATCAAGGCTGTGAAGAGTGGCCTCAGGACC680
681ACGTGTAAGTGCCATGGCGTATCAGGCTCCTGTGCCGTGC720
721GCACCTGCTGGAAGCAGCTCTCCCCGTTCCGTGAGACGGG760
761CCAGGTGCTGAAACTGCGCTATGACTCGGCTGTCAAGGTG800
801TCCAGTGCCACCAATGAGGCCTTGGGCCGCCTAGAGCTGT840
841GGGCCCCTGCCAGGCAGGGCAGCCTCACCAAAGGCCTGGC880
881CCCAAGGTCTGGGGACCTGGTGTACATGGAGGACTCACCC920
921AGCTTCTGCCGGCCCAGCAAGTACTCACCTGGCACAGCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。