基因總覽
WNT8B 是蛋白質編碼基因,其產物為 Wnt family member 8B,屬於 Wnt 家族。這種蛋白質作為 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體,並可能在前腦部分結構的發育與分化中發揮重要作用,相關結構中特別提及海馬。現有資料未提供其更詳細的序列、結構或作用機制資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343737 ★ | 100,463,009–100,483,744 | 6 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Wnt family member 8B 是 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體。這項配體關係構成來源所述的主要分子功能,但資料沒有進一步說明與受體結合的具體方式,也未提供下游反應或其他參與分子的資訊,因此不能據此延伸描述更細部的訊號機制。
在生物發育方面,WNT8B 可能對某些前腦結構的發育與分化具有重要作用;海馬是來源中特別指出的例子。這項描述表示其可能參與特定腦部結構形成或分化相關過程,但目前資訊沒有界定作用發生的時間、細胞類型或發育階段,也未說明其作用是否直接影響這些結構。
因此,現有資料支持的功能重點,是 Wnt family member 8B 作為 Frizzled 家族受體配體的角色,以及它可能參與部分前腦結構、尤其是海馬的發育與分化。對其分子作用如何連結至這些發育結果,來源未提供進一步機制;相關發育角色亦應保留「可能」的限定。
Promoter 與基因調控
>WNT8B ENST00000343737 GRCh38 chr10:100462009-100463109 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGATCCCCAGTGCTGTGGCTGAGGCCACCCTCCTCCCTAGGGAACAGAAGGAGCAGAGTCCCAGAGAAGT GTGAGCGAGGGCCTGGGTGCCCTCCTGGCTCCGCCACCTGAGTTTAAGAAAGTAGGGATTTTGAGATCAC CTTTGTGTGCCTATTGAAATCTCTTTCCTTCTTCGAAACTCAAATTCTACCTTCTTCAGAAAACCTCCCC TAAATAAGCCTACACTATTATAGGCAGTTTGTAGCTTTCTAATACTTTATTAAACTGCGTTATTTTATTG TCACCTTACTAGGCTGTAAATGTTGTTAGGGCAGAAATCATGTTTTGGTTTTTAAAAATTTCCACAATGC CTAGGGTGGTGTTGAGAATAAAATAGGCATTTGGTAAGTAATTGTGTGATGAAAAAGTTGAAAGGAAGAA AAAACCATCGGGCTTCCTGAAGTTTCTAGCCTTTCTAACTTAGACAGAGAATACACTAGATGGTAGGACT GCATCCCCACATTCTCAAATCAGAGGGTGGAGGTTCACCTGCACCTGGTGTATTTTTTTCTGAAAAAACA AAACAAACAAAAAAATGCTATCCTGAATGCAAATTCAGTCTCAAAGTGCTACAGAGGACAACCAGGAAAG CACAGTCCTTTCTGGATCCCTTTTGGGGACCAGGCTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGTGTGTGTGTGTGTG TGTAAGTGTGCATAGGTGGGAAAAGGTTGTGGTGTGATGGGAGGGGATAGGCAAGAGGGAGGAAAGAGAC TCCATGCAGTGATTATGTGGAGGGGATTTGCTATGTCTCTTCCCCCCGCTTCTTTCTTTGTCCTCTTTCT CCTGGTCCCCTTCTTCTGCATTTGTCTGGGAGGATCCTGGAGTGTTCTTTTGATCGACTCAATCTTTCTC TGGCACTTGAGTTCTGATTGGCTGAAGGACTTAGAGGGGAAAAAAAACTTTAATTAAGTAGATAATCTCT TCTTTGGACGTTTGGCAGCTCCATTTCACCTCCCCTTAACTCTGTTTGGGATCGCTTACACACCAAGGAA GTTGGGCTTTGAGAATTCCATCCCACTGGCACTGAGGAGAATATTTCTCCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:351 aa
Wnt family member 8B 屬於 Wnt 家族,蛋白質長度為 351 個胺基酸。序列註解標示其第 1 至 22 位胺基酸為訊號肽區域;資料未提供其他功能區域的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Wnt family member 8B 被註記為分泌蛋白,定位於細胞外空間及細胞外基質。 來源未提供不同條件下定位變化或異構型差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Wnt family member 8B 是 Frizzled 家族七次跨膜受體成員的配體。它可能在某些前腦結構的發育與分化中具有重要作用,特別包括海馬;來源未進一步說明這些作用的機制或條件。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. May play an important role in the development and differentiation of certain forebrain structures, notably the hippocampus PMID 9536085 ↗ |
| 細胞定位 | Wnt family member 8B 被註記為分泌至細胞外,並定位於細胞外空間及細胞外基質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CCATTTCACCTCCCCTTAACTCTGTTTGGGATCGCTTACA40CACCAAGGAAGTTGGGCTTTGAGAATTCCATCCCACTGGC80ACTGAGGAGAATATTTCTCCGTCTTGCTTACCCATCTCCC120AGTTTTTTGGAATTTTCTCTAGCTGTTACTCCAGAGGATT160ATGTTTCTTTCAAAGCCTTCTGTGTACATCTGTCTTTTCA200CCTGTGTCCTCCAACTCAGCCACAGCTGGTCGGTGAACAA240TTTCCTGATGACTGGTCCAAAGGCTTACCTGATTTACTCC280AGCAGTGTGGCAGCTGGTGCCCAGAGTGGTATTGAAGAAT320GCAAGTATCAGTTTGCCTGGGACCGCTGGAACTGCCCTGA360GAGAGCCCTGCAGCTGTCCAGCCATGGTGGGCTTCGCAGT400GCCAATCGGGAGACAGCATTTGTGCATGCCATCAGTTCTG440CTGGAGTCATGTACACCCTGACTAGAAACTGCAGCCTTGG480AGATTTTGATAACTGTGGCTGTGATGACTCCCGCAACGGG520CAACTGGGGGGACAAGGCTGGCTGTGGGGAGGCTGCAGTG560ACAATGTGGGCTTCGGAGAGGCGATTTCCAAGCAGTTTGT600CGATGCCCTGGAAACAGGACAGGATGCACGGGCAGCCATG640AACCTGCACAACAACGAGGCTGGCCGCAAGGCGGTGAAGG680GCACCATGAAACGCACGTGCAAGTGCCACGGCGTGTCTGG720CAGCTGCACCACGCAGACCTGTTGGCTGCAGCTGCCCGAG760TTCCGCGAGGTGGGCGCGCACCTGAAGGAGAAGTACCACG800CAGCACTCAAGGTGGACCTGCTGCAGGGTGCTGGCAACAG840CGCGGCCGGCCGCGGCGCCATCGCCGACACCTTTCGCTCC880ATCTCTACCCGGGAGCTGGTGCACCTGGAGGACTCCCCGG920ACTACTGCCTGGAGAACAAAACGCTAGGGCTGCTGGGCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。