演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

WNT8AWNT8D

Wnt family member 8A

WNT8A 編碼 Wnt family member 8A,屬於 Wnt 家族,是 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體,並參與胚胎圖樣形成。

Homo sapiens5q31.2UniProt Q9H1J5
OFFICIAL SYMBOL
WNT8A
CHROMOSOME
5
UNIPROT
Q9H1J5
PDB / ALPHAFOLD
7KC4
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

WNT8A 是蛋白質編碼基因,產物為 Protein Wnt-8a,屬於 Wnt 家族。其蛋白質長 351 個胺基酸,具有位於 N 端的訊號胜肽,註解範圍為第 1 至 24 個胺基酸。來源將它描述為 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體,並指出它與胚胎圖樣形成有關。

Official symbol
WNT8A
Gene name
Wnt family member 8A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12788
UniProt
Q9H1J5
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
WNT8D

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q31.2
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegWNT8Apq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:138,083,990–138,092,365
Gene span
8,376 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000506684 ★138,084,033–138,091,5415
ENST00000504809138,084,015–138,091,4596
ENST00000398754138,084,085–138,091,5416

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

WNT8A 的蛋白質產物是 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體。來源指出這項配體功能與胚胎圖樣形成有關,為其已提供的生物學角色;但未進一步說明它作用於哪些特定 Frizzled 成員、下游分子事件或胚胎發育階段,因此無法據此延伸描述更細的作用機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 138084033 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>WNT8A ENST00000506684 GRCh38 chr5:138083033-138084133 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCATTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGGCTGGCCAACTGGCG
AAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCTGGGTGTGGTGGCTGGCACCTGTAGTCTCAGATACT
TGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCTGAGATTGCACCAC
TGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAGGCATCAG
TCTTCCCAAATATAACCCTGGGTGGCCCTAAGGTTGGTTCTCAGATATATAAAAAATCAACTAACTGGAG
TTGTAACCCTCAGATATAAAAGGATAGATTTGCTAGGAATTAAGGAAATTTCCCAGCAGTTGCTAGAATG
TGGTGGAAGGGACTGTTGCAGAGATGGACTCTGAAGTGTTCCTGCTCCATAGTCCCACAGCTCCATCACC
TCACAGCCTTGAAGGAAGTGGTAGGGATGGCGCACTCACTGGTTTAGGTAAATGAGTAGGAAGCAGCCCC
AGATGGAGTTGCTTTATGATTATTAACACCTTGGGGAGGATGGCAGGACAGAGAGTGGGCTCTCACTGAC
AGATGAGGACACTGTAGCTCCAAGAATAGGTGACCTGCCTTCAGGGTTAAGGACCCAGCCTGCTCTGGCC
TACATGATTCTGAGAAATGGGCCAAAGAAGCAGGAAGAGACAAAATTGACATATAGAAGAAAGAAATCTC
ACGTATAGGAGAAAAGCAGCCTCCTTCTCATTCTGGGAGGGAAGAAGGGCTGGAGGGGCTGGGCAGGGCG
GGGCTTTTGGCGAAAACTGAGTCCCTCCTCCCAGATCCCCCACTGGGCCGGTGGCTCCTGCAGCCCTGCC
AGTTAGGAACAAATGAGAAGAGCTGCTGATTTCCTCCCTTGGACATTCAGAATTTTCTCACATAAATACT
GAGGAAGACCCTGCCCTCTCCTCACTTCTCTGGACTTGGCCCTGAGCTGGACCTGGTCCACTGGGGTAGG
CAGGGCGATGGGGAACCTGTTTATGCTCTGGGCAGCTCTGGGCATATGCTG
WNT8A 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WNT8A_1 ↗5:138,083,914正股138,083,865–138,083,924

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR5_942RR5 · enhancer · 138081274–138081598 · regulatory

ENSR5_863LKN · enhancer · 138082122–138082357 · regulatory

ENSR5_537GWMJ · CTCF_binding_site · 138082206–138082227 · regulatory

· motif · 138082208–138082224 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:351 aa

1 aa351 aa訊號胜肽
依 Q9H1J5 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Protein Wnt-8a 長 351 個胺基酸,序列註解包含位於第 1 至 24 位的訊號胜肽。此蛋白質屬於 Wnt 家族;來源未提供其他結構域或功能區域的序列註解。

訊號胜肽1–24 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7KC4…

PDB · 7KC4

EM · 3.19 A · D=1-351

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted, extracellular space, extracellular matrix;Secreted

Protein Wnt-8a 被註記為分泌蛋白,出現在細胞外空間及細胞外基質。 來源未指出其定位會隨條件或異構型而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
WNT8DWNT8A
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Protein Wnt-8a 可與 AFM 形成可溶性的 1:1 複合體。此複合體可避免寡聚化,且是維持較長時間生物活性所必需;它也可能是體液中的生理形式。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能WNT8A 的產物是 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體,並參與胚胎圖樣形成。來源未提供更具體的受體成員、胚胎階段或作用機制。推論支持
證據與來源

Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. Plays a role in embryonic patterning

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Protein Wnt-8a 與 AFM 形成可溶性的 1:1 複合體;此複合體能防止寡聚化,且為延長生物活性所必需。該複合體可能是體液中的生理形式。資料庫紀錄
證據與來源

Forms a soluble 1:1 complex with AFM; this prevents oligomerization and is required for prolonged biological activity. The complex with AFM may represent the physiological form in body fluids

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Protein Wnt-8a 被註記為分泌蛋白,定位於細胞外空間及細胞外基質。含實驗來源
證據與來源

Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Secreted

PMID 26902720 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000506684 · 1,673 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CTCACTTCTCTGGACTTGGCCCTGAGCTGGACCTGGTCCA40
41CTGGGGTAGGCAGGGCGATGGGGAACCTGTTTATGCTCTG80
81GGCAGCTCTGGGCATATGCTGTGCTGCATTCAGTGCCTCT120
121GCCTGGTAAGTCCTTTCCCAACCCTCACTCCTTGCCAAGG160
161AGGCCCCCATTGTCTCATCCCCATTCACCTCTGCCTCACT200
201TTTTCTCTTTTTGGTAGGTCAGTGAACAATTTCCTGATAA240
241CAGGTCCCAAGGCCTATCTGACCTACACGACTAGTGTGGC280
281CTTGGGTGCCCAGAGTGGCATCGAGGAGTGCAAGTTCCAG320
321TTTGCTTGGGAACGCTGGAACTGCCCTGAAAATGCTCTTC360
361AGCTCTCCACCCACAACAGGCTGAGAAGTGCTACCAGAGA400
401GACTTCCTTCATACATGCTATCAGCTCTGCTGGAGTCATG440
441TACATCATCACCAAGAACTGTAGCATGGGTGACTTCGAAA480
481ACTGTGGCTGTGATGGGTCAAACAATGGAAAAACAGGAGG520
521CCATGGCTGGATCTGGGGAGGCTGCAGCGACAATGTGGAA560
561TTTGGGGAAAGGATCTCCAAACTCTTTGTGGACAGTTTGG600
601AGAAGGGGAAGGATGCCAGAGCCCTGATGAATCTTCACAA640
641CAACAGGGCCGGCAGACTGGCAGTGAGAGCCACCATGAAA680
681AGGACATGCAAATGTCATGGCATCTCTGGGAGCTGCAGCA720
721TACAGACATGCTGGCTGCAGCTGGCTGAATTCCGGGAGAT760
761GGGAGACTACCTAAAGGCCAAGTATGACCAGGCGCTGAAA800
801ATTGAAATGGATAAGCGGCAGCTGAGAGCTGGGAACAGCG840
841CCGAGGGCCACTGGGTGCCCGCTGAGGCCTTCCTTCCTAG880
881CGCAGAGGCGGAACTGATCTTTTTAGAGGAATCACCAGAT920
921TACTGTACCTGCAATTCCAGCCTGGGCATCTATGGCACAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。