基因總覽
WNT8A 是蛋白質編碼基因,產物為 Protein Wnt-8a,屬於 Wnt 家族。其蛋白質長 351 個胺基酸,具有位於 N 端的訊號胜肽,註解範圍為第 1 至 24 個胺基酸。來源將它描述為 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體,並指出它與胚胎圖樣形成有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000506684 ★ | 138,084,033–138,091,541 | 5 |
| ENST00000504809 | 138,084,015–138,091,459 | 6 |
| ENST00000398754 | 138,084,085–138,091,541 | 6 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WNT8A 的蛋白質產物是 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體。來源指出這項配體功能與胚胎圖樣形成有關,為其已提供的生物學角色;但未進一步說明它作用於哪些特定 Frizzled 成員、下游分子事件或胚胎發育階段,因此無法據此延伸描述更細的作用機制。
Promoter 與基因調控
>WNT8A ENST00000506684 GRCh38 chr5:138083033-138084133 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCATTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGCCCAGGAGTTCAAGACCAGGCTGGCCAACTGGCG AAACCCCTTCTCTACTAAAAATACAAAATTTAGCTGGGTGTGGTGGCTGGCACCTGTAGTCTCAGATACT TGGGAGGCTGAGGTAGGAGAATCACTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGTAGTGAGCTGAGATTGCACCAC TGCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGAGACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAGAAAGGCATCAG TCTTCCCAAATATAACCCTGGGTGGCCCTAAGGTTGGTTCTCAGATATATAAAAAATCAACTAACTGGAG TTGTAACCCTCAGATATAAAAGGATAGATTTGCTAGGAATTAAGGAAATTTCCCAGCAGTTGCTAGAATG TGGTGGAAGGGACTGTTGCAGAGATGGACTCTGAAGTGTTCCTGCTCCATAGTCCCACAGCTCCATCACC TCACAGCCTTGAAGGAAGTGGTAGGGATGGCGCACTCACTGGTTTAGGTAAATGAGTAGGAAGCAGCCCC AGATGGAGTTGCTTTATGATTATTAACACCTTGGGGAGGATGGCAGGACAGAGAGTGGGCTCTCACTGAC AGATGAGGACACTGTAGCTCCAAGAATAGGTGACCTGCCTTCAGGGTTAAGGACCCAGCCTGCTCTGGCC TACATGATTCTGAGAAATGGGCCAAAGAAGCAGGAAGAGACAAAATTGACATATAGAAGAAAGAAATCTC ACGTATAGGAGAAAAGCAGCCTCCTTCTCATTCTGGGAGGGAAGAAGGGCTGGAGGGGCTGGGCAGGGCG GGGCTTTTGGCGAAAACTGAGTCCCTCCTCCCAGATCCCCCACTGGGCCGGTGGCTCCTGCAGCCCTGCC AGTTAGGAACAAATGAGAAGAGCTGCTGATTTCCTCCCTTGGACATTCAGAATTTTCTCACATAAATACT GAGGAAGACCCTGCCCTCTCCTCACTTCTCTGGACTTGGCCCTGAGCTGGACCTGGTCCACTGGGGTAGG CAGGGCGATGGGGAACCTGTTTATGCTCTGGGCAGCTCTGGGCATATGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WNT8A_1 ↗ | 5:138,083,914 | 正股 | 138,083,865–138,083,924 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_942RR5 · enhancer · 138081274–138081598 · regulatory
ENSR5_863LKN · enhancer · 138082122–138082357 · regulatory
ENSR5_537GWMJ · CTCF_binding_site · 138082206–138082227 · regulatory
· motif · 138082208–138082224 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:351 aa
Protein Wnt-8a 長 351 個胺基酸,序列註解包含位於第 1 至 24 位的訊號胜肽。此蛋白質屬於 Wnt 家族;來源未提供其他結構域或功能區域的序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Protein Wnt-8a 被註記為分泌蛋白,出現在細胞外空間及細胞外基質。 來源未指出其定位會隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
Protein Wnt-8a 可與 AFM 形成可溶性的 1:1 複合體。此複合體可避免寡聚化,且是維持較長時間生物活性所必需;它也可能是體液中的生理形式。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WNT8A 的產物是 Frizzled 七次跨膜受體家族成員的配體,並參與胚胎圖樣形成。來源未提供更具體的受體成員、胚胎階段或作用機制。 | 推論支持 | 證據與來源Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. Plays a role in embryonic patterning |
| 交互作用 | Protein Wnt-8a 與 AFM 形成可溶性的 1:1 複合體;此複合體能防止寡聚化,且為延長生物活性所必需。該複合體可能是體液中的生理形式。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Forms a soluble 1:1 complex with AFM; this prevents oligomerization and is required for prolonged biological activity. The complex with AFM may represent the physiological form in body fluids |
| 細胞定位 | Protein Wnt-8a 被註記為分泌蛋白,定位於細胞外空間及細胞外基質。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTCACTTCTCTGGACTTGGCCCTGAGCTGGACCTGGTCCA40CTGGGGTAGGCAGGGCGATGGGGAACCTGTTTATGCTCTG80GGCAGCTCTGGGCATATGCTGTGCTGCATTCAGTGCCTCT120GCCTGGTAAGTCCTTTCCCAACCCTCACTCCTTGCCAAGG160AGGCCCCCATTGTCTCATCCCCATTCACCTCTGCCTCACT200TTTTCTCTTTTTGGTAGGTCAGTGAACAATTTCCTGATAA240CAGGTCCCAAGGCCTATCTGACCTACACGACTAGTGTGGC280CTTGGGTGCCCAGAGTGGCATCGAGGAGTGCAAGTTCCAG320TTTGCTTGGGAACGCTGGAACTGCCCTGAAAATGCTCTTC360AGCTCTCCACCCACAACAGGCTGAGAAGTGCTACCAGAGA400GACTTCCTTCATACATGCTATCAGCTCTGCTGGAGTCATG440TACATCATCACCAAGAACTGTAGCATGGGTGACTTCGAAA480ACTGTGGCTGTGATGGGTCAAACAATGGAAAAACAGGAGG520CCATGGCTGGATCTGGGGAGGCTGCAGCGACAATGTGGAA560TTTGGGGAAAGGATCTCCAAACTCTTTGTGGACAGTTTGG600AGAAGGGGAAGGATGCCAGAGCCCTGATGAATCTTCACAA640CAACAGGGCCGGCAGACTGGCAGTGAGAGCCACCATGAAA680AGGACATGCAAATGTCATGGCATCTCTGGGAGCTGCAGCA720TACAGACATGCTGGCTGCAGCTGGCTGAATTCCGGGAGAT760GGGAGACTACCTAAAGGCCAAGTATGACCAGGCGCTGAAA800ATTGAAATGGATAAGCGGCAGCTGAGAGCTGGGAACAGCG840CCGAGGGCCACTGGGTGCCCGCTGAGGCCTTCCTTCCTAG880CGCAGAGGCGGAACTGATCTTTTTAGAGGAATCACCAGAT920TACTGTACCTGCAATTCCAGCCTGGGCATCTATGGCACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。