基因總覽
WNT7B 是蛋白質編碼基因,產物的正式名稱為 Wnt family member 7B,屬於 Wnt 家族。此蛋白質是可分泌的配體,能與 Frizzled 家族受體作用;其序列包含訊號胜肽,以及一段被註解為無序 linker 的區域。這些特徵構成其作為細胞外訊號分子的基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000339464 ★ | 45,920,366–45,977,162 | 4 |
| ENST00000409496 | 45,920,366–45,972,715 | 4 |
| ENST00000410089 | 45,920,366–45,976,022 | 4 |
| ENST00001131649 | 45,920,366–45,977,260 | 4 |
| ENST00000410058 | 45,927,482–45,977,260 | 4 |
| ENST00000428540 | 45,931,296–45,975,909 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Wnt family member 7B 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,參與典型 Wnt/β-catenin 訊號傳遞。此功能描述指出其作為受體配體的角色,但未進一步交代下游分子步驟,因此不宜據此延伸特定的訊號機制。
在發育方面,WNT7B 被描述為胎盤形成期間絨毛膜與尿囊正常融合所必需;這項資訊標示為依相似性推定,並非此處直接列出的實驗證據。
此外,來源指出 WNT7B 對中樞神經系統的血管新生及血腦屏障調節具有必要性。這些資料將其功能連結至中樞神經系統血管相關過程,但未提供作用細節或其他條件,故不進一步推定其具體調控方式。
Promoter 與基因調控
>WNT7B ENST00000339464 GRCh38 chr22:45977062-45978162 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GAGAAAGCACAGAGCAGGCAGGGAGCCTGGCCTGGACAGCGATCTGGCTGTGGGTCTGGGTCTTGCCCAC TGAGGACAGACCAGGCTTGGCGCAGCAGGGTCTGCGGGACTCTGGCGCTCGTTCGCCCTGAATCAGGCTA GCCGAATCAGGCTAGATGGGCTTTGGGTGTGCGCGGCACCGAGTCAATCTGACTTCGGGCTCTCCTCAGG GAAACTGAACACAGCTGGGCGCTGCAGAGGAAGCCACGAAAACCATGGCGCAGGGGCAGGGACTCTGGGG GCCAGGAGCCTCCCCCAGTGCCGGGGAAGCCCCTCAACCTCCTTCCACAGGCCTCCATCACGGCGCTTGG CCAATGGGTTCTGCAGGAGGTCACGCATGCCATCTCCCTGCATGTGGCCAGGTTAGCCCGTCTGTCATCT TTCAGGTCCCAAAGCTGGGCTAGCGCAGGTGGCAGCAGTGCTGGGACCTGGGGTTGTGGGAATCTCCCAT TGAGGTTTGCTGGAGTGGCAGCGATGCCTGGACTAAAAGGATGGCCCCAGAGTACCCCATGCGGATAATT TTTGGGGGTCAGGGAAGTGCACTCGGAGAGGCAATGGGAGTGGGTGGTCTCTCCCTCCCCCACCGGAAAC TGGAAGCCAAGTGGCACCGCGACCTGTACCAGTAGTTTCCCGCCCCCACCTGTACCCCCGCCCCTACCCC CGCGTGCGCGGAGGAGCGCAGGTGTCTCTTCCGAGCCGCACCCTCCCCGCACCCCCACCACTCGTCACCC AAGCCCTCTTCCCCCGCCCAGTCCCCGGAGGGCAATCGGAAGGGAGCTGGCCTGGGGAGGGGGGGCCGGG GGGTAGATGCGTTTGTGTGTCACGGGGGAGGGAGGAGAAAAGGGAGGGGAGAGCCAGGGAGCGAGGGAGA GAGCGCGCGGCGAGCGAGGAGGGCGGGCGGGAGGCGGATCCTCCTACCTGGGGCGCGCTCGCTCGCTCGC GGCTCGCTTGCCGGGGCCGCGAGTCACCTGGGGCGGCCGACAAGTGCGGACACATTGGCCGCCGCGGCGC TCGGCGAGGCGCTCACGGCCTCAGGCGGCTGCGCCTAGTGCAGGCTGCACC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WNT7B_1 ↗ | 22:45,977,162 | 負股 | 45,977,152–45,977,211 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_9N8N8 · enhancer · 45972318–45972704 · regulatory
ENSR22_83CHCL · promoter · 45972705–45972880 · regulatory
ENSR22_74NZPL · enhancer · 45973054–45973177 · regulatory
ENSR22_BC5CF · enhancer · 45974371–45974971 · regulatory
ENSR22_BC5CK · enhancer · 45975130–45976011 · regulatory
ENSR22_9N8PB · promoter · 45976012–45976512 · regulatory
ENSR22_BC5CR · promoter · 45976795–45977652 · regulatory
ENSR22_C6K73 · enhancer · 45978653–45980255 · regulatory
ENSR22_5DRZXR · CTCF_binding_site · 45979214–45979235 · regulatory
· motif · 45978264–45978273 · motif
· motif · 45978541–45978561 · motif
· motif · 45978938–45978955 · motif
· motif · 45979216–45979232 · motif
· motif · 45979563–45979578 · motif
· motif · 45979616–45979633 · motif
· motif · 45979837–45979854 · motif
· motif · 45979971–45979986 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:349 aa
Wnt family member 7B 長 349 個胺基酸,N 端第 1 至 24 位為訊號胜肽;第 238 至 266 位則註解為無序 linker。來源指出此 linker 區域參與與 RECK 的互作,但未提供其他結構域或功能區域資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Wnt family member 7B 為分泌蛋白,定位於細胞外空間及細胞外基質。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- ReckQ9Z0J1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
Wnt family member 7B 與 AFM 形成可溶性 1:1 複合體;此複合體可防止寡聚化,且與延長生物活性有關,但是否為體液中的生理形式僅以可能性描述。它也與 FZD1、FZD10、GPC3 及 PORCN 互作,並在體外與 FZD4 互作。WNT7B 透過無序 linker 區域與 RECK 互作;在腦內皮細胞中,此關係賦予 Wnt7 配體選擇性,使細胞能選擇性地回應 Wnt7。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WNT7B 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,參與典型 Wnt/β-catenin 訊號傳遞。依相似性推定,它也是胎盤發育期間絨毛膜與尿囊正常融合所必需;來源另指出其對中樞神經系統血管新生及血腦屏障調節具有必要性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors that functions in the canonical Wnt/beta-catenin signaling pathway. Required for normal fusion of the chorion and the allantois during placenta development (By similarity). Required for central nervous system (CNS) angiogenesis and blood-brain barrier regulation PMID 30026314 ↗ |
| 交互作用 | WNT7B 與 AFM 形成可溶性 1:1 複合體,可避免寡聚化並維持較長的生物活性;該複合體可能是體液中的生理形式。WNT7B 也與 FZD1、FZD10、GPC3、PORCN 互作,並在體外與 FZD4 互作。它透過無序 linker 區域與 RECK 結合;在腦內皮細胞中,這種互作使細胞對 Wnt7 具配體選擇性並能選擇性回應。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a soluble 1:1 complex with AFM; this prevents oligomerization and is required for prolonged biological activity. The complex with AFM may represent the physiological form in body fluids. Interacts with FZD1 and FZD10. Interacts with FZD4 (in vitro). Interacts with PORCN (By similarity). Interacts with glypican GPC3. Interacts (via intrinsically disordered linker region) with RECK; interaction with RECK confers ligand selectivity for Wnt7 in brain endothelial cells and allows these cells to selectively respond to Wnt7 PMID 16227623 ↗ · PMID 26902720 ↗ · PMID 30026314 ↗ |
| 細胞定位 | WNT7B 是分泌蛋白,定位於細胞外空間與細胞外基質;來源未提供其他定位條件或異構型差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGTCACCTGGGGCGGCCGACAAGTGCGGACACATTGGCC40GCCGCGGCGCTCGGCGAGGCGCTCACGGCCTCAGGCGGCT80GCGCCTAGTGCAGGCTGCACCCGCCCGCCAGCCGCGCCCG120GGCCCCCGGCCCGCGCTTGCAGGGGTCCACGGTCGCTCAA160CCGGGCTTCGAGGTCGCGGCCCCCAGCCTGGGTCAATTCC200CCGGGCTCACGCGGCGGTGGCGGCGGCGGCATCCCGGGCT240CACCATGGTGGCAGCGCGCGCCGAGTGCCCGCGCGTCGCC280GGCCGCCCGAGCCGCAGCGCGGGCTGAGCGCAGTCTGCCC320GCAGCCCCCTGGCCCCTGCCCGGCCCTGCCGGGCCCGCGC360GTCCCCTCCGGCCGCCGCTGTCTATGGCGCAGCCCCCCTC400CCTGGATCATGCACAGAAACTTTCGCAAGTGGATTTTCTA440CGTGTTTCTCTGCTTTGGCGTCCTGTACGTGAAGCTCGGA480GCACTGTCATCCGTGGTGGCCCTGGGAGCCAACATCATCT520GCAACAAGATTCCTGGCCTAGCCCCGCGGCAGCGTGCCAT560CTGCCAGAGTCGGCCCGATGCCATCATTGTGATTGGGGAG600GGGGCGCAGATGGGCATCAACGAGTGCCAGTACCAGTTCC640GCTTCGGACGCTGGAACTGCTCTGCCCTCGGCGAGAAGAC680CGTCTTCGGGCAAGAGCTCCGAGTAGGGAGCCGTGAGGCT720GCCTTCACGTACGCCATCACCGCGGCTGGCGTGGCGCACG760CCGTCACCGCTGCCTGCAGCCAAGGGAACCTGAGCAACTG800CGGCTGCGACCGCGAGAAGCAGGGCTACTACAACCAAGCC840GAGGGCTGGAAGTGGGGCGGCTGCTCGGCCGACGTGCGTT880ACGGCATCGACTTCTCCCGGCGCTTCGTGGACGCTCGGGA920GATCAAGAAGAACGCGCGGCGCCTCATGAACCTGCATAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。