演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

WNT6

Wnt family member 6

WNT6 編碼 Wnt family member 6,屬於 Wnt 家族,可能參與組織發育;也可能與 CAV1 協同促進胃癌細胞對 DNA 損傷型蒽環類藥物的抗藥性。

Homo sapiens2q35UniProt Q9Y6F9
OFFICIAL SYMBOL
WNT6
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q9Y6F9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

WNT6 是蛋白質編碼基因,其產物 Wnt family member 6 屬於 Wnt 家族。來源將此蛋白描述為可能參與發育的蛋白質,並指出它是 Frizzled 家族七次穿膜受體的配體。現有資料未提供更詳細的家族結構或組織表現資訊。

Official symbol
WNT6
Gene name
Wnt family member 6
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12785
UniProt
Q9Y6F9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q35
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegWNT6pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr2:218,859,795–218,874,233
Gene span
14,439 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000233948 ★218,859,805–218,874,2334
ENST00001140979218,859,795–218,874,2334

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Wnt family member 6 可作為 Frizzled 家族七次穿膜受體的配體,可能藉由受體傳遞訊號。來源將其描述為可能參與發育的蛋白質,並提出它可能是影響組織中特定區域發育的訊號分子;這項發育作用仍屬可能性描述,未在資料中進一步界定具體組織或過程。其訊號作用範圍可能有限,推測僅跨越數個細胞直徑,而非長距離傳遞。

在胃癌細胞中,Wnt family member 6 與 CAV1 可能共同促進細胞對 DNA 損傷型蒽環類藥物的抗藥性。來源指出,此關聯可能經由活化典型 Wnt 受體訊號途徑而產生;但未提供更具體的下游分子步驟或其他細胞類型中的作用資訊,因此不宜將此結果延伸為普遍的抗藥機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 218859805 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>WNT6 ENST00000233948 GRCh38 chr2:218858805-218859905 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCTCTTCCCCACGGAGCCTTTGATCTCCCCCTCGTGGGGAGGGGGCCAGGGGCATCAAAGACATTTTTGT
GGCATTAGAAAATCTGATAAACGCCATCTCACCTGCAGCTGGCTCTCCCACCCCTTCTACCCGGGCCAGG
TTGGGGGAGGAACTCGAGGCAGGGACTCTTGGACACGCGAGGCCGGGCTAAAGCGAATTCTGACCCCTCG
ATCTCTTGAAAGTCTGCGACCTCCATTCTCCCGCTCGCTTACAAGTGCCAGCGCTTGCGCGCACGCCCTG
GAGCGGCTACTCTTGCCCTCTCATTTCCCCCACCTCCCCGCCCTAGAACGCGGGCTTGAGAGGTGGGATG
GCTGGGGGAGCGAGAGCGGAGGCCCAGGGCTTCCTCCCTTCTTCAAGGAGAGGCTGACGAAGGGGCATGA
GGCATCGAACAGGGACACGGAAAGAGATGACCCCTCCAGCATCCGCCTGTCGGGCGGTCCAGTTTGACAA
CCCTCGCCGAAGCACCCCGCGCCCCAGGCCAACTTCCTCTCTTGCCTCCGCGCCAGCATCTCCCTCCGCA
CCGCCCCCCGCCCCAAACTCCCTCATTCCTGGGAAGTTTTCTCTCTTTACAGTCAACAAACCTGTCAAAC
GTCTCCCTTCCAGCCCGTCCCCCATTCCTCAGCTCCTCTTTCTCCCCCCTCACCCCTCTCTACTCTTCTT
CCCAGCCCTTCCTTGCCCCCGACTCCAGGCGGCCGCGAGCGGCGGGGGGCTCCAAGTCCGAGAGAGGCGA
GGCGAGGGGGCGAAGCGGGCGGGTCCCACAGCCCGAAGCGCGCTGGGGCCCCGCCCCGGCACCCCGCTCC
CGCCCTCCGCTGCGCTCCGCGCCAGCCGCCCCGGGGCGCACGGCTCGCTCCCGAGAGTCCCGCTGCCTGA
CTGTCGCAACTGCCACCTCCCTCCGGCCCCCTGCCCCCCGCCCCCGCCTCGGCCCCGCTCCCCTCCCACC
TCCGCCCCCGGCTCTGATTTCTTCTCCCGAGCGAGCTCCGCAGGAGACACAGGCGCTGGCTGCCCCGTCC
GCTCTCCGCCTCCGCCGCGCCCTCCTCGCCCGGGATGGGCCCCCCCGCCGC
WNT6 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WNT6_1 ↗2:218,859,805正股218,859,756–218,859,815

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_B3LFP9 · enhancer · 218856370–218857001 · regulatory

ENSR2_957TFT · enhancer · 218857392–218857822 · regulatory

ENSR2_957TGF · promoter · 218859315–218859815 · regulatory

ENSR2_CRPCX · enhancer · 218859816–218861492 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:365 aa

1 aa365 aa功能區域訊號胜肽
依 Q9Y6F9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Wnt family member 6 長 365 個胺基酸,屬於 Wnt 家族。序列第 1–24 位標註為訊號肽;第 140–164 位則被註記為無序區域。這些資料提供了蛋白質的序列特徵,但未進一步說明各區域的具體作用。

訊號胜肽1–24 aa
功能區域Disordered140–164 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9Y6F9…

AlphaFold · Q9Y6F9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted, extracellular space, extracellular matrix

Wnt family member 6 被註記為分泌型蛋白,位於細胞外空間及細胞外基質。 資料未描述其定位是否會隨細胞狀態或異構型而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
WNT6WNT6
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

Wnt family member 6 與 PORCN 有交互作用的註記;來源未說明此關係是否代表直接結合,也未提供兩者共同組成複合體或其功能後果的資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Wnt family member 6 是 Frizzled 家族七次穿膜受體的配體,可能參與發育並影響組織中特定區域;其訊號可能僅傳遞數個細胞直徑。在胃癌細胞中,它可能與 CAV1 共同透過活化典型 Wnt 受體訊號途徑,促進對 DNA 損傷型蒽環類藥物的抗藥性。含實驗來源
證據與來源

Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. Probable developmental protein. May be a signaling molecule which affects the development of discrete regions of tissues. Is likely to signal over only few cell diameters. Together with CAV1 may promote chemoresistance of gastric cancer cells to DNA-damaging anthracycline drugs through the activation of the canonical Wnt receptor signaling pathway

PMID 22370641 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Wnt family member 6 與 PORCN 有交互作用;此註記未進一步說明交互作用的性質或功能結果。推論支持
證據與來源

Interacts with PORCN

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Wnt family member 6 被註記為分泌型,定位於細胞外空間及細胞外基質。資料庫紀錄
證據與來源

Secreted, extracellular space, extracellular matrix

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000233948 · 1,719 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CTTCTCCCGAGCGAGCTCCGCAGGAGACACAGGCGCTGGC40
41TGCCCCGTCCGCTCTCCGCCTCCGCCGCGCCCTCCTCGCC80
81CGGGATGGGCCCCCCCGCCGCCGCCGGATCCCTCGCCTCC120
121CGGCCGCCGCCGTTGCGCTCGCCGCGCTCGCACTGAAGCC160
161CGGGCCCTCGCGCGCCGCGGTTCGCCCCGCAGCCTCGCCC200
201CCTGCCCACCCGGGCGGCCGTAGGGCGGTCACGATGCTGC240
241CGCCCTTACCCTCCCGCCTCGGGCTGCTGCTGCTGCTGCT280
281CCTGTGCCCGGCGCACGTCGGCGGACTGTGGTGGGCTGTG320
321GGCAGCCCCTTGGTTATGGACCCTACCAGCATCTGCAGGA360
361AGGCACGGCGGCTGGCCGGGCGGCAGGCCGAGTTGTGCCA400
401GGCTGAGCCGGAAGTGGTGGCAGAGCTAGCTCGGGGCGCC440
441CGGCTCGGGGTGCGAGAGTGCCAGTTCCAGTTCCGCTTCC480
481GCCGCTGGAATTGCTCCAGCCACAGCAAGGCCTTTGGACG520
521CATCCTGCAACAGGACATTCGGGAGACGGCCTTCGTGTTC560
561GCCATCACTGCGGCCGGCGCCAGCCACGCCGTCACGCAGG600
601CCTGTTCTATGGGCGAGCTGCTGCAGTGCGGCTGCCAGGC640
641GCCCCGCGGGCGGGCCCCTCCCCGGCCCTCCGGCCTGCCC680
681GGCACCCCCGGACCCCCTGGCCCCGCGGGCTCCCCGGAAG720
721GCAGCGCCGCCTGGGAGTGGGGAGGCTGCGGCGACGACGT760
761GGACTTCGGGGACGAGAAGTCGAGGCTCTTTATGGACGCG800
801CGGCACAAGCGGGGACGCGGAGACATCCGCGCGTTGGTGC840
841AACTGCACAACAACGAGGCGGGCAGGCTGGCCGTGCGGAG880
881CCACACGCGCACCGAGTGCAAATGCCACGGGCTGTCGGGA920
921TCATGCGCGCTGCGCACCTGCTGGCAGAAGCTGCCTCCAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。