基因總覽
WNT6 是蛋白質編碼基因,其產物 Wnt family member 6 屬於 Wnt 家族。來源將此蛋白描述為可能參與發育的蛋白質,並指出它是 Frizzled 家族七次穿膜受體的配體。現有資料未提供更詳細的家族結構或組織表現資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000233948 ★ | 218,859,805–218,874,233 | 4 |
| ENST00001140979 | 218,859,795–218,874,233 | 4 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Wnt family member 6 可作為 Frizzled 家族七次穿膜受體的配體,可能藉由受體傳遞訊號。來源將其描述為可能參與發育的蛋白質,並提出它可能是影響組織中特定區域發育的訊號分子;這項發育作用仍屬可能性描述,未在資料中進一步界定具體組織或過程。其訊號作用範圍可能有限,推測僅跨越數個細胞直徑,而非長距離傳遞。
在胃癌細胞中,Wnt family member 6 與 CAV1 可能共同促進細胞對 DNA 損傷型蒽環類藥物的抗藥性。來源指出,此關聯可能經由活化典型 Wnt 受體訊號途徑而產生;但未提供更具體的下游分子步驟或其他細胞類型中的作用資訊,因此不宜將此結果延伸為普遍的抗藥機制。
Promoter 與基因調控
>WNT6 ENST00000233948 GRCh38 chr2:218858805-218859905 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTCTTCCCCACGGAGCCTTTGATCTCCCCCTCGTGGGGAGGGGGCCAGGGGCATCAAAGACATTTTTGT GGCATTAGAAAATCTGATAAACGCCATCTCACCTGCAGCTGGCTCTCCCACCCCTTCTACCCGGGCCAGG TTGGGGGAGGAACTCGAGGCAGGGACTCTTGGACACGCGAGGCCGGGCTAAAGCGAATTCTGACCCCTCG ATCTCTTGAAAGTCTGCGACCTCCATTCTCCCGCTCGCTTACAAGTGCCAGCGCTTGCGCGCACGCCCTG GAGCGGCTACTCTTGCCCTCTCATTTCCCCCACCTCCCCGCCCTAGAACGCGGGCTTGAGAGGTGGGATG GCTGGGGGAGCGAGAGCGGAGGCCCAGGGCTTCCTCCCTTCTTCAAGGAGAGGCTGACGAAGGGGCATGA GGCATCGAACAGGGACACGGAAAGAGATGACCCCTCCAGCATCCGCCTGTCGGGCGGTCCAGTTTGACAA CCCTCGCCGAAGCACCCCGCGCCCCAGGCCAACTTCCTCTCTTGCCTCCGCGCCAGCATCTCCCTCCGCA CCGCCCCCCGCCCCAAACTCCCTCATTCCTGGGAAGTTTTCTCTCTTTACAGTCAACAAACCTGTCAAAC GTCTCCCTTCCAGCCCGTCCCCCATTCCTCAGCTCCTCTTTCTCCCCCCTCACCCCTCTCTACTCTTCTT CCCAGCCCTTCCTTGCCCCCGACTCCAGGCGGCCGCGAGCGGCGGGGGGCTCCAAGTCCGAGAGAGGCGA GGCGAGGGGGCGAAGCGGGCGGGTCCCACAGCCCGAAGCGCGCTGGGGCCCCGCCCCGGCACCCCGCTCC CGCCCTCCGCTGCGCTCCGCGCCAGCCGCCCCGGGGCGCACGGCTCGCTCCCGAGAGTCCCGCTGCCTGA CTGTCGCAACTGCCACCTCCCTCCGGCCCCCTGCCCCCCGCCCCCGCCTCGGCCCCGCTCCCCTCCCACC TCCGCCCCCGGCTCTGATTTCTTCTCCCGAGCGAGCTCCGCAGGAGACACAGGCGCTGGCTGCCCCGTCC GCTCTCCGCCTCCGCCGCGCCCTCCTCGCCCGGGATGGGCCCCCCCGCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WNT6_1 ↗ | 2:218,859,805 | 正股 | 218,859,756–218,859,815 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_B3LFP9 · enhancer · 218856370–218857001 · regulatory
ENSR2_957TFT · enhancer · 218857392–218857822 · regulatory
ENSR2_957TGF · promoter · 218859315–218859815 · regulatory
ENSR2_CRPCX · enhancer · 218859816–218861492 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:365 aa
Wnt family member 6 長 365 個胺基酸,屬於 Wnt 家族。序列第 1–24 位標註為訊號肽;第 140–164 位則被註記為無序區域。這些資料提供了蛋白質的序列特徵,但未進一步說明各區域的具體作用。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Wnt family member 6 被註記為分泌型蛋白,位於細胞外空間及細胞外基質。 資料未描述其定位是否會隨細胞狀態或異構型而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
Wnt family member 6 與 PORCN 有交互作用的註記;來源未說明此關係是否代表直接結合,也未提供兩者共同組成複合體或其功能後果的資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Wnt family member 6 是 Frizzled 家族七次穿膜受體的配體,可能參與發育並影響組織中特定區域;其訊號可能僅傳遞數個細胞直徑。在胃癌細胞中,它可能與 CAV1 共同透過活化典型 Wnt 受體訊號途徑,促進對 DNA 損傷型蒽環類藥物的抗藥性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. Probable developmental protein. May be a signaling molecule which affects the development of discrete regions of tissues. Is likely to signal over only few cell diameters. Together with CAV1 may promote chemoresistance of gastric cancer cells to DNA-damaging anthracycline drugs through the activation of the canonical Wnt receptor signaling pathway PMID 22370641 ↗ |
| 交互作用 | Wnt family member 6 與 PORCN 有交互作用;此註記未進一步說明交互作用的性質或功能結果。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Wnt family member 6 被註記為分泌型,定位於細胞外空間及細胞外基質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTTCTCCCGAGCGAGCTCCGCAGGAGACACAGGCGCTGGC40TGCCCCGTCCGCTCTCCGCCTCCGCCGCGCCCTCCTCGCC80CGGGATGGGCCCCCCCGCCGCCGCCGGATCCCTCGCCTCC120CGGCCGCCGCCGTTGCGCTCGCCGCGCTCGCACTGAAGCC160CGGGCCCTCGCGCGCCGCGGTTCGCCCCGCAGCCTCGCCC200CCTGCCCACCCGGGCGGCCGTAGGGCGGTCACGATGCTGC240CGCCCTTACCCTCCCGCCTCGGGCTGCTGCTGCTGCTGCT280CCTGTGCCCGGCGCACGTCGGCGGACTGTGGTGGGCTGTG320GGCAGCCCCTTGGTTATGGACCCTACCAGCATCTGCAGGA360AGGCACGGCGGCTGGCCGGGCGGCAGGCCGAGTTGTGCCA400GGCTGAGCCGGAAGTGGTGGCAGAGCTAGCTCGGGGCGCC440CGGCTCGGGGTGCGAGAGTGCCAGTTCCAGTTCCGCTTCC480GCCGCTGGAATTGCTCCAGCCACAGCAAGGCCTTTGGACG520CATCCTGCAACAGGACATTCGGGAGACGGCCTTCGTGTTC560GCCATCACTGCGGCCGGCGCCAGCCACGCCGTCACGCAGG600CCTGTTCTATGGGCGAGCTGCTGCAGTGCGGCTGCCAGGC640GCCCCGCGGGCGGGCCCCTCCCCGGCCCTCCGGCCTGCCC680GGCACCCCCGGACCCCCTGGCCCCGCGGGCTCCCCGGAAG720GCAGCGCCGCCTGGGAGTGGGGAGGCTGCGGCGACGACGT760GGACTTCGGGGACGAGAAGTCGAGGCTCTTTATGGACGCG800CGGCACAAGCGGGGACGCGGAGACATCCGCGCGTTGGTGC840AACTGCACAACAACGAGGCGGGCAGGCTGGCCGTGCGGAG880CCACACGCGCACCGAGTGCAAATGCCACGGGCTGTCGGGA920TCATGCGCGCTGCGCACCTGCTGGCAGAAGCTGCCTCCAT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。