演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

WNT2IRP

Wnt family member 2

WNT2 編碼 Wnt family member 2,屬於 Wnt 家族,作為 Frizzled 家族受體的配體參與訊息傳遞,並與胚胎肺部發育有關。

Homo sapiens7q31.2UniProt P09544
OFFICIAL SYMBOL
WNT2
CHROMOSOME
7
UNIPROT
P09544
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

WNT2 是蛋白質編碼基因,其產物 Wnt family member 2 屬於 Wnt 家族。來源將此蛋白描述為 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,並指出它參與典型 Wnt 訊息傳遞,也與胚胎肺部發育相關。其功能描述另提及可能參與胚胎腦部發育;這項作用是依相似性推定。現有資料未提供更完整的蛋白質結構或其他序列特徵,因此不據此延伸描述。

Official symbol
WNT2
Gene name
Wnt family member 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12780
UniProt
P09544
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
IRPINT1L1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q31.2
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegWNT2pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:117,273,513–117,323,392
Gene span
49,880 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000265441 ★117,275,451–117,323,0585
ENST00000950642117,275,451–117,323,2764
ENST00001134104117,275,451–117,323,2765
ENST00001112536117,286,785–117,323,2765
ENST00001112537117,286,789–117,323,2765
ENST00000491214117,297,726–117,323,0413

顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

Wnt family member 2 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體。來源指出,它參與典型 Wnt 訊息傳遞路徑,並可導致 TCF/LEF 家族轉錄因子活化,將細胞外訊息連結至轉錄調控。

WNT2 也被描述為 FGF10 表現的上游調節因子。現有資料未進一步說明此調控的分子步驟或條件,因此不延伸推定其作用方式。

在發育層面,WNT2 對胚胎肺部發育具有重要作用。至於胚胎腦部發育,來源僅指出 WNT2 可能藉由調節多巴胺能前驅細胞與神經元的增殖而有所貢獻;這項描述屬於依相似性推定,並非確定性結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 117323058 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>WNT2 ENST00000265441 GRCh38 chr7:117322958-117324058 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGGGCCCAGGTCCAGGACCGAGGGTCCCTTAACCTCCACAAGGCGCACAGGCTGAGCGCCCAGGCGGCAG
GAGGTGCAAGGGCGCACACCCCCGGCGAACGCCTGGCTGCCTCGGTTCCTCTCTATGTGATCTTTTGCGC
TCCGCAGCTCCGGAGAGGAGCTGGGTGTGCGTAAAAACTGCATCTTTCCTGGGTGCTTTGGCAGATACTG
CTGGGTTAGGTCCCGAGGGTCATGGACCCTCCAAGTTCCCCTCCCTATGGGCTCTGTATTTAAGCCCAGC
ACCAAGGAATCAAAGCCAACAGGTCATTTCGCAGAGGCCTGGCCCCTCCCTAACCTTGCCCTGCATAGAC
GCGGCAGCTCCAAATTTACAAGTGCTAGCTCTTCATCCCAGCTTCAGGGAGAGAAGCGAAGCAATGAGTT
GAGAATCATCTCTGGATTCTTGTATCCCATGCATAGTAATCTCCTTATCCCCTGGCCCCCTTCCTCGTTT
CCTCACATTGCACGCTCAGGGACTTGTTTGCCAGCGGATGGCCTCGGCAATCCGGAACGCACGCTCCGAG
AGCCCACGGATGCTCTTTGGCCTGGAGCTTCCCTAAAGGTTCCTGTATTCGCGTGTGCTCGTAACCATGC
AGCGATGTTCCCCCTTCCCCGCCTCACCTCATCCCCAGACATCTCTTGCCATCATTTCATGCACCCGTGT
CTAAAACCCCGCGTTTCTCCCCACCCCCGCCAGGCGCAGCACCCCCTCCCTCGGCTGCGCCCGGAGGGGA
GCAGAGCGGACGGGGCGCGCGGGAGGCGCGCAGAGCTTTCGGGCTGCAGGCGCTCGCTGCGCCTGGGGAA
TTGGGCTGTGGGCGAGGCGGTCCGGGCTGGCCTTTATCGCTCGCTGGGCCCATCGTTTGAAACTTTATCA
GCGAGTCTCGCCACTCGTCGCAGACGCGAGCGGGGGGCGGGGGCGCGGCGAGGCGCCGGCGGCCGTGACG
AGGCGCTCCCGGAGCTGAGCGCTTCTGCTCTGGGCACGCATGGCGCCCGCACACGGAGTCTGACCTGATG
CAGACGCAAGGGGGTTAATATGAACGCCCCTCTCGGTGGAATCTGGCTCTG
WNT2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WNT2_2 ↗7:117,323,058負股117,323,048–117,323,107
WNT2_1 ↗7:117,323,286負股117,323,276–117,323,335

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_BT9MQ · enhancer · 117322188–117323047 · regulatory

ENSR7_93PKBP · promoter · 117323048–117323548 · regulatory

ENSR7_93PKC5 · enhancer · 117324549–117324922 · regulatory

ENSR7_93PKC8 · enhancer · 117325041–117325323 · regulatory

· motif · 117322916–117322928 · motif

· motif · 117322919–117322926 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:360 aa

1 aa360 aa訊號胜肽
依 P09544 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Protein Wnt-2 為 360 個胺基酸的蛋白質,屬於 Wnt 家族。序列註解標示第 1 至 25 位胺基酸為訊號肽,與其分泌性相符。現有資料未列出其他結構域或功能區域。

訊號胜肽1–25 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P09544…

AlphaFold · P09544

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted, extracellular space, extracellular matrix;Secreted

WNT2 蛋白被註記為分泌至細胞外空間及細胞外基質;資料亦以「分泌」描述其定位。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
IRPWNT2HSPA5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能Wnt family member 2 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,參與可活化 TCF/LEF 家族轉錄因子的典型 Wnt 訊息傳遞;亦為 FGF10 表現的上游調節因子,並對胚胎肺部發育具有重要作用。它可能藉由調節多巴胺能前驅細胞與神經元的增殖,參與胚胎腦部發育;此項腦部發育描述為依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. Functions in the canonical Wnt signaling pathway that results in activation of transcription factors of the TCF/LEF family. Functions as a upstream regulator of FGF10 expression. Plays an important role in embryonic lung development. May contribute to embryonic brain development by regulating the proliferation of dopaminergic precursors and neurons (By similarity)

PMID 20018874 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位WNT2 蛋白被註記為分泌至細胞外空間與細胞外基質;定位資料也另以「分泌」標示其分泌性。含實驗來源
證據與來源

Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Secreted

PMID 20018874 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000265441 · 3,856 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTTCTGCTCTGGGCACGCATGGCGCCCGCACACGGAGTC40
41TGACCTGATGCAGACGCAAGGGGGTTAATATGAACGCCCC80
81TCTCGGTGGAATCTGGCTCTGGCTCCCTCTGCTCTTGACC120
121TGGCTCACCCCCGAGGTCAACTCTTCATGGTGGTACATGA160
161GAGCTACAGGTGGCTCCTCCAGGGTGATGTGCGATAATGT200
201GCCAGGCCTGGTGAGCAGCCAGCGGCAGCTGTGTCACCGA240
241CATCCAGATGTGATGCGTGCCATTAGCCAGGGCGTGGCCG280
281AGTGGACAGCAGAATGCCAGCACCAGTTCCGCCAGCACCG320
321CTGGAATTGCAACACCCTGGACAGGGATCACAGCCTTTTT360
361GGCAGGGTCCTACTCCGAAGTAGTCGGGAATCTGCCTTTG400
401TTTATGCCATCTCCTCAGCTGGAGTTGTATTTGCCATCAC440
441CAGGGCCTGTAGCCAAGGAGAAGTAAAATCCTGTTCCTGT480
481GATCCAAAGAAGATGGGAAGCGCCAAGGACAGCAAAGGCA520
521TTTTTGATTGGGGTGGCTGCAGTGATAACATTGACTATGG560
561GATCAAATTTGCCCGCGCATTTGTGGATGCAAAGGAAAGG600
601AAAGGAAAGGATGCCAGAGCCCTGATGAATCTTCACAACA640
641ACAGAGCTGGCAGGAAGGCTGTAAAGCGGTTCTTGAAACA680
681AGAGTGCAAGTGCCACGGGGTGAGCGGCTCATGTACTCTC720
721AGGACATGCTGGCTGGCCATGGCCGACTTCAGGAAAACGG760
761GCGATTATCTCTGGAGGAAGTACAATGGGGCCATCCAGGT800
801GGTCATGAACCAGGATGGCACAGGTTTCACTGTGGCTAAC840
841GAGAGGTTTAAGAAGCCAACGAAAAATGACCTCGTGTATT880
881TTGAGAATTCTCCAGACTACTGTATCAGGGACCGAGAGGC920
921AGGCTCCCTGGGTACAGCAGGCCGTGTGTGCAACCTGACT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。