基因總覽
WNT2 是蛋白質編碼基因,其產物 Wnt family member 2 屬於 Wnt 家族。來源將此蛋白描述為 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,並指出它參與典型 Wnt 訊息傳遞,也與胚胎肺部發育相關。其功能描述另提及可能參與胚胎腦部發育;這項作用是依相似性推定。現有資料未提供更完整的蛋白質結構或其他序列特徵,因此不據此延伸描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265441 ★ | 117,275,451–117,323,058 | 5 |
| ENST00000950642 | 117,275,451–117,323,276 | 4 |
| ENST00001134104 | 117,275,451–117,323,276 | 5 |
| ENST00001112536 | 117,286,785–117,323,276 | 5 |
| ENST00001112537 | 117,286,789–117,323,276 | 5 |
| ENST00000491214 | 117,297,726–117,323,041 | 3 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Wnt family member 2 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體。來源指出,它參與典型 Wnt 訊息傳遞路徑,並可導致 TCF/LEF 家族轉錄因子活化,將細胞外訊息連結至轉錄調控。
WNT2 也被描述為 FGF10 表現的上游調節因子。現有資料未進一步說明此調控的分子步驟或條件,因此不延伸推定其作用方式。
在發育層面,WNT2 對胚胎肺部發育具有重要作用。至於胚胎腦部發育,來源僅指出 WNT2 可能藉由調節多巴胺能前驅細胞與神經元的增殖而有所貢獻;這項描述屬於依相似性推定,並非確定性結論。
Promoter 與基因調控
>WNT2 ENST00000265441 GRCh38 chr7:117322958-117324058 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGGGCCCAGGTCCAGGACCGAGGGTCCCTTAACCTCCACAAGGCGCACAGGCTGAGCGCCCAGGCGGCAG GAGGTGCAAGGGCGCACACCCCCGGCGAACGCCTGGCTGCCTCGGTTCCTCTCTATGTGATCTTTTGCGC TCCGCAGCTCCGGAGAGGAGCTGGGTGTGCGTAAAAACTGCATCTTTCCTGGGTGCTTTGGCAGATACTG CTGGGTTAGGTCCCGAGGGTCATGGACCCTCCAAGTTCCCCTCCCTATGGGCTCTGTATTTAAGCCCAGC ACCAAGGAATCAAAGCCAACAGGTCATTTCGCAGAGGCCTGGCCCCTCCCTAACCTTGCCCTGCATAGAC GCGGCAGCTCCAAATTTACAAGTGCTAGCTCTTCATCCCAGCTTCAGGGAGAGAAGCGAAGCAATGAGTT GAGAATCATCTCTGGATTCTTGTATCCCATGCATAGTAATCTCCTTATCCCCTGGCCCCCTTCCTCGTTT CCTCACATTGCACGCTCAGGGACTTGTTTGCCAGCGGATGGCCTCGGCAATCCGGAACGCACGCTCCGAG AGCCCACGGATGCTCTTTGGCCTGGAGCTTCCCTAAAGGTTCCTGTATTCGCGTGTGCTCGTAACCATGC AGCGATGTTCCCCCTTCCCCGCCTCACCTCATCCCCAGACATCTCTTGCCATCATTTCATGCACCCGTGT CTAAAACCCCGCGTTTCTCCCCACCCCCGCCAGGCGCAGCACCCCCTCCCTCGGCTGCGCCCGGAGGGGA GCAGAGCGGACGGGGCGCGCGGGAGGCGCGCAGAGCTTTCGGGCTGCAGGCGCTCGCTGCGCCTGGGGAA TTGGGCTGTGGGCGAGGCGGTCCGGGCTGGCCTTTATCGCTCGCTGGGCCCATCGTTTGAAACTTTATCA GCGAGTCTCGCCACTCGTCGCAGACGCGAGCGGGGGGCGGGGGCGCGGCGAGGCGCCGGCGGCCGTGACG AGGCGCTCCCGGAGCTGAGCGCTTCTGCTCTGGGCACGCATGGCGCCCGCACACGGAGTCTGACCTGATG CAGACGCAAGGGGGTTAATATGAACGCCCCTCTCGGTGGAATCTGGCTCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WNT2_2 ↗ | 7:117,323,058 | 負股 | 117,323,048–117,323,107 |
| WNT2_1 ↗ | 7:117,323,286 | 負股 | 117,323,276–117,323,335 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_BT9MQ · enhancer · 117322188–117323047 · regulatory
ENSR7_93PKBP · promoter · 117323048–117323548 · regulatory
ENSR7_93PKC5 · enhancer · 117324549–117324922 · regulatory
ENSR7_93PKC8 · enhancer · 117325041–117325323 · regulatory
· motif · 117322916–117322928 · motif
· motif · 117322919–117322926 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:360 aa
Protein Wnt-2 為 360 個胺基酸的蛋白質,屬於 Wnt 家族。序列註解標示第 1 至 25 位胺基酸為訊號肽,與其分泌性相符。現有資料未列出其他結構域或功能區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WNT2 蛋白被註記為分泌至細胞外空間及細胞外基質;資料亦以「分泌」描述其定位。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- HSPA5P11021 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Wnt family member 2 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,參與可活化 TCF/LEF 家族轉錄因子的典型 Wnt 訊息傳遞;亦為 FGF10 表現的上游調節因子,並對胚胎肺部發育具有重要作用。它可能藉由調節多巴胺能前驅細胞與神經元的增殖,參與胚胎腦部發育;此項腦部發育描述為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. Functions in the canonical Wnt signaling pathway that results in activation of transcription factors of the TCF/LEF family. Functions as a upstream regulator of FGF10 expression. Plays an important role in embryonic lung development. May contribute to embryonic brain development by regulating the proliferation of dopaminergic precursors and neurons (By similarity) PMID 20018874 ↗ |
| 細胞定位 | WNT2 蛋白被註記為分泌至細胞外空間與細胞外基質;定位資料也另以「分泌」標示其分泌性。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTTCTGCTCTGGGCACGCATGGCGCCCGCACACGGAGTC40TGACCTGATGCAGACGCAAGGGGGTTAATATGAACGCCCC80TCTCGGTGGAATCTGGCTCTGGCTCCCTCTGCTCTTGACC120TGGCTCACCCCCGAGGTCAACTCTTCATGGTGGTACATGA160GAGCTACAGGTGGCTCCTCCAGGGTGATGTGCGATAATGT200GCCAGGCCTGGTGAGCAGCCAGCGGCAGCTGTGTCACCGA240CATCCAGATGTGATGCGTGCCATTAGCCAGGGCGTGGCCG280AGTGGACAGCAGAATGCCAGCACCAGTTCCGCCAGCACCG320CTGGAATTGCAACACCCTGGACAGGGATCACAGCCTTTTT360GGCAGGGTCCTACTCCGAAGTAGTCGGGAATCTGCCTTTG400TTTATGCCATCTCCTCAGCTGGAGTTGTATTTGCCATCAC440CAGGGCCTGTAGCCAAGGAGAAGTAAAATCCTGTTCCTGT480GATCCAAAGAAGATGGGAAGCGCCAAGGACAGCAAAGGCA520TTTTTGATTGGGGTGGCTGCAGTGATAACATTGACTATGG560GATCAAATTTGCCCGCGCATTTGTGGATGCAAAGGAAAGG600AAAGGAAAGGATGCCAGAGCCCTGATGAATCTTCACAACA640ACAGAGCTGGCAGGAAGGCTGTAAAGCGGTTCTTGAAACA680AGAGTGCAAGTGCCACGGGGTGAGCGGCTCATGTACTCTC720AGGACATGCTGGCTGGCCATGGCCGACTTCAGGAAAACGG760GCGATTATCTCTGGAGGAAGTACAATGGGGCCATCCAGGT800GGTCATGAACCAGGATGGCACAGGTTTCACTGTGGCTAAC840GAGAGGTTTAAGAAGCCAACGAAAAATGACCTCGTGTATT880TTGAGAATTCTCCAGACTACTGTATCAGGGACCGAGAGGC920AGGCTCCCTGGGTACAGCAGGCCGTGTGTGCAACCTGACT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。