基因總覽
WNT11 是蛋白質編碼基因,產物為 Wnt family member 11,屬於 Wnt 家族。來源將其描述為可能參與發育的蛋白質;其產物可能作為訊號分子,影響組織中特定區域的發育。現有資料未提供更詳細的家族特徵或結構資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000322563 ★ | 76,186,325–76,206,502 | 5 |
| ENST00000864022 | 76,186,325–76,210,762 | 6 |
| ENST00000864023 | 76,186,325–76,209,540 | 6 |
| ENST00000864024 | 76,186,325–76,209,540 | 7 |
| ENST00000961017 | 76,186,325–76,210,760 | 7 |
| ENST00000961018 | 76,186,325–76,210,762 | 6 |
| ENST00000961019 | 76,186,325–76,210,762 | 7 |
| ENST00000961020 | 76,186,325–76,210,762 | 8 |
| ENST00000961021 | 76,186,325–76,210,762 | 6 |
| ENST00000961022 | 76,186,325–76,209,683 | 6 |
| ENST00000961023 | 76,186,325–76,209,540 | 7 |
| ENST00000961024 | 76,186,325–76,209,536 | 7 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Wnt family member 11 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體。資料將它描述為可能參與發育的蛋白質,並指出它可能作為訊號分子,影響組織中特定區域的發育。
這項發育作用仍以可能性表述;來源未進一步說明訊號傳遞的分子機制、受影響的具體組織或發育階段,也未指出特定的 Frizzled 受體成員。因此,現有資訊支持其配體角色與可能的發育相關功能,但不足以界定更細部的作用方式。
來源另指出,Wnt family member 11 的訊號可能只作用於相距數個細胞直徑的範圍,表示其訊號作用距離可能有限。資料沒有提供該距離的精確數值或相關條件。
Promoter 與基因調控
>WNT11 ENST00000322563 GRCh38 chr11:76206402-76207502 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CGCTCCCTAGCTGAACCCCACCTCTGTGCCTCAGTTTCCTCATCTGTGAGATGAGGCAGCGATAGTGCCT ATCTCACGGGGTGCTGGGAGGAGCAGATGCGATCGTGTTAGGGAACTTTTTTTGTTTGTCTGTTTGTTTG AGACGGAGTTTCGCTCTTGTCGCCCAGGCTAGAGTGCAGTGGCGCAATCTCCGCTCGCTGCAACCTCCGC CTCCCGGGTTCAAGCGGTTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCGCCACCACG CCCGGCTAATTTTTTGTATTCGTAGTAGAGACGGGGTTTTGCCATGTTGGGCAGGCTGGTCTCGAGCTCC TGACCTCAGGTGACCCGCCCGCCTCGACCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCCTGCCCG GCCAGGGAACGTTCTTTATAAAAGCGGAATTGTGCCCGAATTGCCCCAGCTTACTGAGGAGGTAAACTGA AACACGTTTGGGAAGGAGAATTGCCGAGGCCCTATTAACTAATGCTCAATATTGCAGGGATAAGCCCCAG CTCCGGGTCCTCGACTCTGCTGCCTCGCCTGGACTCCTGATTCCTCATTCCTCTCCTTTCCGTCCCAGGT TGCGTCTGTCCGGGTTTCCCCCTCTGTCTCCGTGGCTCTCAGCCTTGTCCTCTGAGCGTCCTTCTCCCTC TCGCTGTGTCTGCCCGGTCTCTCCTGGGTCTCCGGTTCTGCCGCCTCCTGTCCCTCCTTCCGGCTGCCCC GGCCAGAGGGGCTCGAAGGCGCGTTGGGGCCCGGGGCCACGCTGGGAGACACGCCTTCGGCCGCGCCTAA TTCGAGCCAGGCGCGGGACGCGTCCCCCGGCCGGGCGGAGCGGGAGGGGACGCCCGCCGCGCTCGGCCTC CCCGGGCCCCGACCCCTCCTTTGTAATTTGAATAAAACGCCTCCCCCGCCCGCGCGCCGCCTTAACCCGC CGCCTCCGCTCTCCCCGGCTGCAGGCGGCGTGCAGGACCAGCGGCGGCCGTGCAGGCGGAGGACTTCGGC GCGGCTCCTCCTGGGTGTGACCCCGGGCGCGCCCGCCGCGCGACGATGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WNT11_1 ↗ | 11:76,206,502 | 負股 | 76,206,492–76,206,551 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_C9K6K · enhancer · 76205243–76206491 · regulatory
ENSR11_5MWXQC · CTCF_binding_site · 76205294–76205315 · regulatory
ENSR11_9358NK · promoter · 76206492–76206992 · regulatory
ENSR11_5MWXZF · CTCF_binding_site · 76206607–76206628 · regulatory
ENSR11_5MWZ23 · CTCF_binding_site · 76206748–76206769 · regulatory
ENSR11_5MWZ6N · CTCF_binding_site · 76207745–76207766 · regulatory
ENSR11_5MWZ7B · CTCF_binding_site · 76207884–76207905 · regulatory
ENSR11_5MWZD9 · CTCF_binding_site · 76208952–76208973 · regulatory
· motif · 76205296–76205312 · motif
· motif · 76206429–76206436 · motif
· motif · 76206511–76206524 · motif
· motif · 76206541–76206554 · motif
· motif · 76206609–76206625 · motif
· motif · 76206750–76206766 · motif
· motif · 76207523–76207534 · motif
· motif · 76207523–76207534 · motif
· motif · 76207747–76207763 · motif
· motif · 76207794–76207809 · motif
· motif · 76207886–76207902 · motif
· motif · 76208888–76208903 · motif
· motif · 76208896–76208903 · motif
· motif · 76208920–76208933 · motif
· motif · 76208954–76208970 · motif
· motif · 76209021–76209033 · motif
· motif · 76209023–76209030 · motif
· motif · 76209023–76209036 · motif
· motif · 76209023–76209036 · motif
· motif · 76209530–76209537 · motif
· motif · 76209609–76209621 · motif
· motif · 76209612–76209619 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:354 aa
Wnt family member 11 屬於 Wnt 家族。所提供的蛋白質註解記載其長度為 354 個胺基酸,並標示第 1 至第 24 個胺基酸為訊號肽區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Wnt family member 11 被註記為分泌至細胞外空間,並與細胞外基質相關。 資料未提供定位隨條件或異構型而改變的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 17 個夥伴
- CCNDBP1O95273 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYSRT1A8MQ03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FUCA2Q9BTY2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-1Q07627 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-3Q8IUG1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP1-5Q9BYS1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-7P60409 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-8P60410 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP10-9P60411 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP12-3P60328 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP17-1Q9BYP8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KRTAP5-7Q6L8G8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-8O75690 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP5-9P26371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KRTAP9-3Q9BYQ3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MDFIQ99750 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- RASSF10A6NK89 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Wnt family member 11 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體,可能參與發育。它可能作為訊號分子,影響組織中特定區域的發育;其訊號作用範圍可能僅及數個細胞直徑。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors. Probable developmental protein. May be a signaling molecule which affects the development of discrete regions of tissues. Is likely to signal over only few cell diameters |
| 細胞定位 | Wnt family member 11 被註記為分泌蛋白,位於細胞外空間,並與細胞外基質相關。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCAGGCGGCGTGCAGGACCAGCGGCGGCCGTGCAGGCGGA40GGACTTCGGCGCGGCTCCTCCTGGGTGTGACCCCGGGCGC80GCCCGCCGCGCGACGATGAGGGCGCGGCCGCAGGTCTGCG120AGGCGCTGCTCTTCGCCCTGGCGCTCCAGACCGGCGTGTG160CTATGGCATCAAGTGGCTGGCGCTGTCCAAGACACCATCG200GCCCTGGCACTGAACCAGACGCAACACTGCAAGCAGCTGG240AGGGTCTGGTGTCTGCACAGGTGCAGCTGTGCCGCAGCAA280CCTGGAGCTCATGCACACGGTGGTGCACGCCGCCCGCGAG320GTCATGAAGGCCTGTCGCCGGGCCTTTGCCGACATGCGCT360GGAACTGCTCCTCCATTGAGCTCGCCCCCAACTATTTGCT400TGACCTGGAGAGAGGGACCCGGGAGTCGGCCTTCGTGTAT440GCGCTGTCGGCCGCCGCCATCAGCCACGCCATCGCCCGGG480CCTGCACCTCCGGCGACCTGCCCGGCTGCTCCTGCGGCCC520CGTCCCAGGTGAGCCACCCGGGCCCGGGAACCGCTGGGGA560GGATGTGCGGACAACCTCAGCTACGGGCTCCTCATGGGGG600CCAAGTTTTCCGATGCTCCTATGAAGGTGAAAAAAACAGG640ATCCCAAGCCAATAAACTGATGCGTCTACACAACAGTGAA680GTGGGGAGACAGGCTCTGCGCGCCTCTCTGGAAATGAAGT720GTAAGTGCCATGGGGTGTCTGGCTCCTGCTCCATCCGCAC760CTGCTGGAAGGGGCTGCAGGAGCTGCAGGATGTGGCTGCT800GACCTCAAGACCCGATACCTGTCGGCCACCAAGGTAGTGC840ACCGACCCATGGGCACCCGCAAGCACCTGGTGCCCAAGGA880CCTGGATATCCGGCCTGTGAAGGACTCGGAACTCGTCTAT920CTGCAGAGCTCACCTGACTTCTGCATGAAGAATGAGAAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。