基因總覽
WNT1 是蛋白質編碼基因，產物 Wnt family member 1 屬於 Wnt 家族。此蛋白質為訊號配體，可與特定受體或共受體互動，參與發育與骨骼相關生物學過程。其前端具有訊號序列，支持其分泌性質；來源將其描述為可分泌至細胞外的蛋白質。WNT1 的基本特徵是作為細胞間訊號分子，其具體受體作用與生物學影響則依發育或骨骼相關情境而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000293549 ★ | 48,978,322–48,982,620 | 4 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Wnt family member 1 是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體；此受體配體關係標示為可能。它可促進典型 Wnt 訊號途徑中的 β-catenin 依賴性轉錄活化，將細胞外訊號連結至基因轉錄調控。此作用涉及多項研究支持的典型 Wnt 訊號功能。
在部分發育過程中，Wnt family member 1 也可能作為共受體 RYK 的配體，進而觸發 Wnt 訊號。這項描述依據相似性推定，適用範圍限定於某些發育情境，不能據此推論其在所有組織或過程中均透過 RYK 傳遞訊號。
WNT1 對胚胎腦與中樞神經系統的發育具有重要作用；這項功能同樣以相似性證據描述。來源未進一步界定其在各發育階段中的具體分子步驟，因此可確認的重點是其與胚胎神經系統發育相關，而非更細部的機制。
在骨骼生物學方面，Wnt family member 1 參與成骨細胞功能、骨骼發育及骨骼恆定。這些作用使其與骨形成及骨量維持等過程相關，但現有資料未提供可在此進一步描述的細胞層級機制。整體而言，來源支持 WNT1 在典型 Wnt 訊號、特定發育過程及骨骼生物學中具有多重角色；各項功能的證據性質與情境仍應分別看待。
Promoter 與基因調控
>WNT1 ENST00000293549 GRCh38 chr12:48977322-48978422 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTGTAGGCTCGGCTCTCTCCCCCAATGACATGCACTGGTTGACACATACCACAGTGTGACACGCCATAG GATGCCACGAGGTACAAAGGGCAACAGAATGACGCATACACACATATTTAATCTTCCCATGCACATGCTC ATCCACCCACTCCACACACAGTCCAGACACTCTGCATCCCTCAATCATGCTTCTGAGTCTCCTGTCGACA GTTGCCACCTCCTTCCTGACACACTGCCCCAGGCGGTGACTGTGACAAGGTGACTCCATGACCTTTTCTG ACTTGAGCTAAATTCCAAAATTCTTTGGAAAGTTTCCTAACATCCTTCGTCAGAACAAGGAGTTTCTGCA CGTACCAACACACAGGAGGATGCACCCTCAGAACACAGCACATTCTCACTCCCACCCATATTCACGTTGT TCCACTTCACACACACACACACACACACACACACACACAGCCACTTGTGCGCTTCTTCTGGCGCACATGA GCAAACTGCCTGTTGCTTTAGGTTTCTCTCCACCGCTAGGCTCCTTTTGGTTAGCTCACCCCCACAACTC ATCCCCGGGATTTCCCTGACCACAGCCGCACTCACGCCCCCGTCTCCCCTTTTTCCTTCTCTGTCCAGCC ATCGGGGGTTCCTGGGCGGTTAAGCATCTCCCCGGAGTCGCTGCCCAGAACCACAGCTTTCCTTCCGACA CTCAGGATGGGGGAGAGAGGGGACGTCGGAGGGGCCCGGGGTGACGTCGAGGGGACAACCCCACCGCGGG CGGCGAGGCGGGCTGGGCCCCTGGCGGGCTCTCCCCGCAGCACACTCTCGCCGCGCCCCCTGGCGGATGC TAGTCCTCGACGGGCTCCGGACGCTCAGCTGAGTGAGGCGGGCGCGCGTGGGAGGGTGTCCCAAGGGGAG GGGTCCGCGGCCAGTGCAGGCCCGGAGGCGGGGGCCACCGGGCAGGGGGCGGGGGTGAGCCCCGACGGCC AACCCGTCAGCTCTCGGCTCAGACGGGCGGGAACCACAGCCCCGCTCGCTGCCCATTGTCTGCGCCCCTA ACCGGTGCGCCCTGGTGCCACAGTGCGGCCCGGAGGGGCAGCCTCCTCCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WNT1_1 ↗ | 12:48,978,685 | 正股 | 48,978,636–48,978,695 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_C6T7N · enhancer · 48973226–48974529 · regulatory
ENSR12_67QHQB · CTCF_binding_site · 48974230–48974278 · regulatory
ENSR12_5FJ2J8 · CTCF_binding_site · 48974370–48974391 · regulatory
ENSR12_5FJ2N2 · CTCF_binding_site · 48975189–48975210 · regulatory
ENSR12_83FTPZ · enhancer · 48976558–48976755 · regulatory
ENSR12_5FJ324 · CTCF_binding_site · 48977143–48977164 · regulatory
ENSR12_9PFTW · promoter · 48977832–48978332 · regulatory
ENSR12_5FJ36N · CTCF_binding_site · 48978141–48978162 · regulatory
ENSR12_5FJ3LW · CTCF_binding_site · 48980778–48980799 · regulatory
ENSR12_5FJ3N9 · CTCF_binding_site · 48981072–48981093 · regulatory
ENSR12_9PFX4 · promoter · 48982006–48982310 · regulatory
· motif · 48974232–48974248 · motif
· motif · 48974257–48974273 · motif
· motif · 48974259–48974275 · motif
· motif · 48974372–48974388 · motif
· motif · 48975191–48975207 · motif
· motif · 48977145–48977161 · motif
· motif · 48977400–48977415 · motif
· motif · 48977401–48977414 · motif
· motif · 48977526–48977539 · motif
· motif · 48977581–48977596 · motif
· motif · 48977586–48977598 · motif
· motif · 48977739–48977754 · motif
· motif · 48977866–48977879 · motif
· motif · 48977914–48977927 · motif
· motif · 48978143–48978159 · motif
· motif · 48978204–48978217 · motif
· motif · 48978218–48978231 · motif
· motif · 48978218–48978231 · motif
· motif · 48978277–48978290 · motif
· motif · 48979742–48979751 · motif
· motif · 48979766–48979773 · motif
· motif · 48980171–48980180 · motif
· motif · 48980171–48980182 · motif
· motif · 48980171–48980182 · motif
· motif · 48980171–48980184 · motif
· motif · 48980214–48980226 · motif
· motif · 48980780–48980796 · motif
· motif · 48981074–48981090 · motif
· motif · 48981215–48981224 · motif
· motif · 48981215–48981224 · motif
· motif · 48981215–48981224 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：370 aa
Wnt family member 1 全長為 370 個胺基酸，屬於 Wnt 家族。蛋白質 N 端第 1 至 27 位胺基酸為訊號序列，符合其分泌性質；來源未提供其他結構域或功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Wnt family member 1 為分泌蛋白，定位於細胞外空間及細胞外基質。 來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
Wnt family member 1 與 AFM 形成可溶性的 1:1 複合體；此複合體可防止寡聚化，且對延長其生物活性為必要。該複合體可能是體液中的生理型態。另有資料指出它與 PORCN、WLS 及 RSPO1、RSPO2、RSPO3 互作；其中與 RSPO 蛋白及 WLS 的互作依相似性推定。
疾病與遺傳關聯
WNT1 變異與骨質疏鬆症的疾病易感性相關；骨質疏鬆症涉及骨量降低及骨微結構受損，並增加骨折風險，此處為易感性關聯而非明確因果描述。另一項疾病為常染色體隱性遺傳的成骨不全症 15，來源指出其由影響 WNT1 的變異所致。此病可有早發反覆骨折、骨骼變形、骨密度明顯降低及身材矮小；部分患者有藍鞏膜，也曾觀察到學習或發育遲緩及腦部異常。牙齒發育與聽力正常。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Wnt family member 1 可能是 Frizzled 家族七次跨膜受體的配體，並可促進典型 Wnt 訊號中的 β-catenin 依賴性轉錄活化。在部分發育過程中，它也可能與共受體 RYK 結合並觸發 Wnt 訊號；依相似性資料，它參與胚胎腦與中樞神經系統發育，且與成骨細胞功能、骨骼發育及骨骼恆定有關。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ligand for members of the frizzled family of seven transmembrane receptors (Probable). Acts in the canonical Wnt signaling pathway by promoting beta-catenin-dependent transcriptional activation. In some developmental processes, is also a ligand for the coreceptor RYK, thus triggering Wnt signaling (By similarity). Plays an essential role in the development of the embryonic brain and central nervous system (CNS) (By similarity). Has a role in osteoblast function, bone development and bone homeostasis PMID 23499309 ↗ · PMID 23656646 ↗ · PMID 26902720 ↗ · PMID 28528193 ↗ |
| 交互作用 | Wnt family member 1 與 AFM 形成可溶性 1:1 複合體，可防止寡聚化，且此複合體是延長生物活性所需；它可能是體液中的生理型態。另有互作資料指出其與 PORCN、WLS 及 RSPO1、RSPO2、RSPO3 互作，其中部分關係依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms a soluble 1:1 complex with AFM; this prevents oligomerization and is required for prolonged biological activity. The complex with AFM may represent the physiological form in body fluids. Interacts with PORCN. Interacts with RSPO1, RSPO2 and RSPO3 (By similarity). Interacts with WLS (By similarity) PMID 26902720 ↗ |
| 細胞定位 | Wnt family member 1 被標示為分泌蛋白，存在於細胞外空間及細胞外基質。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | WNT1 受影響變異與骨質疏鬆症的疾病易感性相關。骨質疏鬆症為全身性骨骼疾病，特徵是骨量減少及骨微結構退化，但骨組成未改變；骨骼因而脆弱，輕微創傷也可能造成骨折。此慢性疾病成因多因素，通常在骨折發生前沒有明顯症狀。 | 含實驗來源 | 證據與來源Osteoporosis OSTEOP A systemic skeletal disorder characterized by decreased bone mass and deterioration of bone microarchitecture without alteration in the composition of bone. The result is fragile bones and an increased risk of fractures, even after minimal trauma. Osteoporosis is a chronic condition of multifactorial etiology and is usually clinically silent until a fracture occurs. Disease susceptibility is associated with variants affecting the gene represented in this entry MIM: 166710 PMID 23499309 ↗ · PMID 23656646 ↗ |
| 疾病關聯 | 成骨不全症 15 是常染色體隱性遺傳的骨形成疾病，由影響 WNT1 的變異所致，嚴重程度可從無骨折的極輕型到胎內骨折及周產期致死。患者可有早發反覆骨折、骨骼變形、骨密度顯著降低及身材矮小；部分患者有藍鞏膜，也曾觀察到學習或發育遲緩及腦部異常。牙齒發育與聽力正常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Osteogenesis imperfecta 15 OI15 An autosomal recessive form of osteogenesis imperfecta, a disorder of bone formation characterized by low bone mass, bone fragility and susceptibility to fractures after minimal trauma. Disease severity ranges from very mild forms without fractures to intrauterine fractures and perinatal lethality. Extraskeletal manifestations, which affect a variable number of patients, are dentinogenesis imperfecta, hearing loss, and blue sclerae. OI15 is characterized by early-onset recurrent fractures, bone deformity, significant reduction of bone density, short stature, and, in some patients, blue sclerae. Tooth development and hearing are normal. Learning and developmental delays and brain anomalies have been observed in some patients. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615220 PMID 23434763 ↗ · PMID 23499309 ↗ · PMID 23499310 ↗ · PMID 23656646 ↗ · PMID 28528193 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGACGGGCGGGAACCACAGCCCCGCTCGCTGCCCATTGTC40TGCGCCCCTAACCGGTGCGCCCTGGTGCCACAGTGCGGCC80CGGAGGGGCAGCCTCCTCCCGTCACTTCAGCCAGCGCCGC120AACTATAAGAGGCGGTGCCGCCCGCCGTGGCCGCCTCAGC160CCACCAGCCGGGACCGCGAGCCATGCTGTCCGCCGCCCGC200CCCCAGGGTTGTTAAAGCCAGACTGCGAACTCTCGCCACT240GCCGCCACCGCCGCGTCCCGTCCCACCGTCGCGGGCAACA280ACCAAAGTCGCCGCAACTGCAGCACAGAGCGGGCAAAGCC320AGGCAGGCCATGGGGCTCTGGGCGCTGTTGCCTGGCTGGG360TTTCTGCTACGCTGCTGCTGGCGCTGGCCGCTCTGCCCGC400AGCCCTGGCTGCCAACAGCAGTGGCCGATGGTGGGGTATT440GTGAACGTAGCCTCCTCCACGAACCTGCTTACAGACTCCA480AGAGTCTGCAACTGGTACTCGAGCCCAGTCTGCAGCTGTT520GAGCCGCAAACAGCGGCGTCTGATACGCCAAAATCCGGGG560ATCCTGCACAGCGTGAGTGGGGGGCTGCAGAGTGCCGTGC600GCGAGTGCAAGTGGCAGTTCCGGAATCGCCGCTGGAACTG640TCCCACTGCTCCAGGGCCCCACCTCTTCGGCAAGATCGTC680AACCGAGGCTGTCGAGAAACGGCGTTTATCTTCGCTATCA720CCTCCGCCGGGGTCACCCATTCGGTGGCGCGCTCCTGCTC760AGAAGGTTCCATCGAATCCTGCACGTGTGACTACCGGCGG800CGCGGCCCCGGGGGCCCCGACTGGCACTGGGGGGGCTGCA840GCGACAACATTGACTTCGGCCGCCTCTTCGGCCGGGAGTT880CGTGGACTCCGGGGAGAAGGGGCGGGACCTGCGCTTCCTC920ATGAACCTTCACAACAACGAGGCAGGCCGTACGACCGTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。