演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

WNK4PRKWNK4

WNK lysine deficient protein kinase 4

WNK4 是一種絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與調節腎臟遠端腎元的離子運輸,並與血壓調控相關。

Homo sapiens17q21.2UniProt Q96J92
OFFICIAL SYMBOL
WNK4
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q96J92
PDB / ALPHAFOLD
4CH9
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

WNK4(WNK lysine deficient protein kinase 4)是蛋白質編碼基因,產物屬於蛋白激酶超家族中的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶 WNK 亞家族。蛋白質全長 1,243 個胺基酸,包含位於第 174 至 432 位胺基酸的蛋白激酶結構域;多處區域被註解為無序區,另有 RFXV motif。這些結構特色與其作為激酶及支架蛋白的不同作用相呼應。WNK4 的主要角色與腎臟離子運輸調節有關,尤其涉及遠端腎元的運輸蛋白與離子通道。其具體的磷酸化調控及運輸效應見功能說明。

Official symbol
WNK4
Gene name
WNK lysine deficient protein kinase 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14544
UniProt
Q96J92
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PRKWNK4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q21.2
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegWNK4pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:42,780,593–42,797,066
Gene span
16,474 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000246914 ★42,780,610–42,797,06619
ENST0000087130942,780,593–42,797,06619
ENST0000087131042,780,593–42,797,06618
ENST0000087131142,780,593–42,797,06619
ENST0000087131242,780,593–42,797,06618
ENST0000087131342,780,593–42,797,06619
ENST0000110595442,780,593–42,789,68411
ENST0000113885442,780,593–42,797,06619
ENST0000058774542,793,715–42,795,7423

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

WNK4 是 WNK4-SPAK/OSR1 kinase cascade 的組成部分,這條級聯反應是遠端腎元離子運輸與血壓調節的重要調控系統;其作為血壓調節者的角色有 By similarity 證據。WNK4 可磷酸化並活化下游激酶 OXSR1/OSR1 與 STK39/SPAK。這些激酶活化後,會進一步磷酸化多種離子共同運輸蛋白,包括 SLC12A1/NKCC2、SLC12A2/NKCC1、SLC12A3/NCC、SLC12A5/KCC2 及 SLC12A6/KCC3,藉此調節其活性。

在腎臟遠端曲細尿管細胞中,WNK4 經由依賴 OXSR1/OSR1 與 STK39/SPAK 的過程活化對噻嗪類利尿劑敏感的 Na-Cl 共同運輸蛋白 SLC12A3/NCC,促進 NaCl 再吸收。WNK4 也被描述為調節腎臟鹽分再吸收與 K(+) 分泌平衡的分子開關,涉及對 SLC12A3/NCC 及 K(+) 通道 KCNJ1/ROMK 活性的調節;這項分子開關功能屬 By similarity 註解。

除了激酶作用,WNK4 亦可作為支架蛋白,以不依賴蛋白激酶活性的方式,透過網格蛋白依賴性內吞,負向調節 CFTR、KCNJ1/ROMK、SLC4A4、SLC26A9 與 TRPV4 在細胞膜上的定位。另有 By similarity 註解指出,WNK4 可透過不依賴激酶活性的機制抑制上皮 Na(+) 通道 ENaC 的 SCNN1A、SCNN1B 與 SCNN1D 活性。來源亦指出 WNK4 可能磷酸化 NEDD4L;此項作用以「可能」描述。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 42780610 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>WNK4 ENST00000246914 GRCh38 chr17:42779610-42780710 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTAAATTACTACAGTACTGGAATGGGGATGGGGAGGGCTGTGAAGTGTTGCCACCTGAGTAAATCCCAG
CCTGGGAGAGGGGAGAGAAAAGAAAGCTTATGGCTTTTGTAGAAGAAAAGGTCCTCCAGGGCCCTGTGGG
CTCCAGTGAGCCTGTGGTTTTACATCTGCTGGGTGGGCTGTGTGGAGGAGTGCTGATGGAACACAGCTTG
GGGACAGACTGCTTTCTCTCTGAATTGGAGTCACTTAAGGGCTCCCCCTTCCCTCACCATCTCCCTCATG
GAAGTCCTGAACTACTCTGAAGCCCCTCCCTCCACCCATCTGGTCTGGGTGGGGTAACTGTGGCCAAGGG
GAGCTGAGGGGGGTAAGCCGGATGTGGACTTTGGTTTATTGGAGACTGGCAAACAGAAGGGGAGGAAGGA
GAGCCCATATAGCAAAAACAGCCACTCTGGCCAGGGTTAGGCTGCGGCCAAGGTGGCCTGGAGGGGATGG
ATGACCGGGCTCTCGGTTTGGGGGAGGGACTTATCCTGGGGAGTACACACCCATTCCCTATGCAGACCAG
AGGGACAACAACGTCAGACCTTTCCACTGACCTCTCCGTTCGGCCTGGGGCTACTCCGGACAGTTAGGAG
GGGGTGGTGCTGCCTTATCTGGGGTGTGCAGGAGGGTGGTAGCCTCCCCCTAAGTAATCCCCCACTAGGG
TCCGGGTGTCGTTCTCTCCTGCCCTCCTCCGCGCACAAACAGGTTTGCTCACTCTTAGTGCGGGAGGATG
CTCCGCGGTCTCCCACTCAGTTCTGGCCTCAGAGTGAGACTGCGGCCGGGGGCTCGGGAAAGAAGGGGAC
GCGGCTGGGCGGGGCGGTGACTAAGGTGAGGGGCTGCTCGCGGGATCCGCACCGCGGGAGCAGCTCGGAG
GGGCGGCCCTGGGGGGCAAGGGCGGGCCGCGGGGCGGCGACGGGGGCGGGGCCAGGCCGAGCTGGGGGCT
GGGGCCGCAGCCGCTCAGCCGGAGCGCAGCGCACCCAGCGAGTCCGTCTGTCAGGCCGCCTCCTCTCCGG
CCGTCTGATTTTCTACCCTTCGGCGCCCTGCTCTTCCTCATGTTGGCATCC
WNK4 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WNK4_1 ↗17:42,780,615正股42,780,566–42,780,625
WNK4_2 ↗17:42,780,755正股42,780,706–42,780,765

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_BBH7M · enhancer · 42775528–42776136 · regulatory

ENSR17_9LZGK · promoter · 42780120–42780620 · regulatory

ENSR17_5D3NRS · CTCF_binding_site · 42782425–42782446 · regulatory

ENSR17_9LZHH · enhancer · 42783396–42783811 · regulatory

· motif · 42775694–42775709 · motif

· motif · 42775694–42775709 · motif

· motif · 42775707–42775720 · motif

· motif · 42775948–42775959 · motif

· motif · 42776002–42776014 · motif

· motif · 42776004–42776011 · motif

· motif · 42776037–42776045 · motif

· motif · 42776072–42776083 · motif

· motif · 42778767–42778781 · motif

· motif · 42782427–42782443 · motif

· motif · 42784620–42784633 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1243 aa

1 aa1243 aa結構域功能區域基序
依 Q96J92 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

WNK4 蛋白全長 1,243 個胺基酸,屬於蛋白激酶超家族、絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶家族的 WNK 亞家族。其蛋白激酶結構域位於第 174 至 432 位胺基酸。多個區段被註解為無序區;另有與 KLHL3 互作的區域(第 557 至 567 位)及位於第 1,016 至 1,019 位的 RFXV motif。

結構域Protein kinase174–432 aa
功能區域Disordered1–142 aa
功能區域Disordered526–564 aa
功能區域Interaction with KLHL3557–567 aa
功能區域Disordered630–683 aa
功能區域Disordered751–871 aa
功能區域Disordered943–1110 aa
功能區域Disordered1166–1243 aa
基序RFXV motif1016–1019 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 4CH9…

PDB · 4CH9

X-ray · 1.84 A · C/D=557-567

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell junction, tight junction

WNK4 是 tight junction complex 的一部分;相關定位資訊標示為 By similarity。 在遠端曲細尿管中,WNK4 僅見於細胞間連接處;在皮質集合管中,則同時位於細胞質與細胞間連接處。

未繪示構造:Cell junction, tight junction。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PRKWNK4WNK4OXSR1YWHAE
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

WNK4 與 KCNJ1 的 C 端區域互作。來源未進一步說明此互作是否形成特定複合體,也未提供互作造成的功能效應。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

WNK4 相關變異被列為可造成假性低醛固酮症 2B(Pseudohypoaldosteronism 2B,PHA2B)的原因。此病為常染色體顯性疾病,特徵包括高血壓、高血鉀、高血氯及輕度高血氯性代謝性酸中毒;使用噻嗪類利尿劑可矯正生理異常。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能WNK4 是 WNK4-SPAK/OSR1 kinase cascade 的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶組成部分,相關調控作用涉及遠端腎元離子運輸與血壓,後者有 By similarity 證據。WNK4 活化 OXSR1/OSR1 和 STK39/SPAK,兩者再磷酸化多種離子共同運輸蛋白以調節其活性。WNK4 也調控腎臟鹽分再吸收與 K(+) 分泌,並可作為支架蛋白促進多種運輸蛋白及通道的網格蛋白依賴性內吞;它亦以不依賴激酶活性的方式抑制 ENaC,並可能磷酸化 NEDD4L。含實驗來源
證據與來源

Serine/threonine-protein kinase component of the WNK4-SPAK/OSR1 kinase cascade, which acts as a key regulator of ion transport in the distal nephron and blood pressure (By similarity). The WNK4-SPAK/OSR1 kinase cascade is composed of WNK4, which mediates phosphorylation and activation of downstream kinases OXSR1/OSR1 and STK39/SPAK. Following activation, OXSR1/OSR1 and STK39/SPAK catalyze phosphorylation of ion cotransporters, such as SLC12A1/NKCC2, SLC12A2/NKCC1, SLC12A3/NCC, SLC12A5/KCC2 or SLC12A6/KCC3, regulating their activity. Acts as a molecular switch that regulates the balance between renal salt reabsorption and K(+) secretion by modulating the activities of renal transporters and channels, including the Na-Cl cotransporter SLC12A3/NCC and the K(+) channel, KCNJ1/ROMK (By similarity). Regulates NaCl reabsorption in the distal nephron by activating the thiazide-sensitive Na-Cl cotransporter SLC12A3/NCC in distal convoluted tubule cells of kidney: activates SLC12A3/NCC in a OXSR1/OSR1- and STK39/SPAK-dependent process (By similarity). Also acts as a scaffold protein independently of its protein kinase activity: negatively regulates cell membrane localization of various transporters and channels (CFTR, KCNJ1/ROMK, SLC4A4, SLC26A9 and TRPV4) by clathrin-dependent endocytosis (By similarity). Also inhibits the activity of the epithelial Na(+) channel (ENaC) SCNN1A, SCNN1B, SCNN1D in a inase-independent mechanism (By similarity). May also phosphorylate NEDD4L

PMID 16832045 ↗ · PMID 20525693 ↗ · PMID 22989884 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)推論支持
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)含實驗來源
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

PMID 16832045 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用WNK4 與 KCNJ1 的 C 端區域互作。推論支持
證據與來源

Interacts with the C-terminal region of KCNJ1

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位WNK4 的定位資訊標示為 By similarity,並指出它是 tight junction complex 的一部分。在遠端曲細尿管中,WNK4 僅出現在細胞間連接處;在皮質集合管中,則同時分布於細胞質與細胞間連接處。推論支持
證據與來源

Cell junction, tight junction; Present exclusively in intercellular junctions in the distal convoluted tubule and in both the cytoplasm and intercellular junctions in the cortical collecting duct (By similarity). WNK4 is part of the tight junction complex (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯WNK4 相關變異可造成假性低醛固酮症 2B(PHA2B),這是一種常染色體顯性疾病,表現包括高血壓、高血鉀、高血氯及輕度高血氯性代謝性酸中毒;噻嗪類利尿劑可矯正其生理異常。含實驗來源
證據與來源

Pseudohypoaldosteronism 2B PHA2B An autosomal dominant disorder characterized by hypertension, hyperkalemia, hyperchloremia, mild hyperchloremic metabolic acidosis, and correction of physiologic abnormalities by thiazide diuretics. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 614491

PMID 11498583 ↗ · PMID 23387299 ↗ · PMID 23453970 ↗ · PMID 23576762 ↗ · PMID 24641320 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000246914 · 4,199 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGAGCGCAGCGCACCCAGCGAGTCCGTCTGTCAGGCCGCC40
41TCCTCTCCGGCCGTCTGATTTTCTACCCTTCGGCGCCCTG80
81CTCTTCCTCATGTTGGCATCCCCGGCCACGGAGACCACCG120
121TCCTCATGTCCCAGACTGAGGCCGACCTGGCCCTGCGGCC160
161CCCGCCTCCTCTTGGCACCGCGGGGCAGCCCCGCCTCGGG200
201CCCCCTCCTCGCCGAGCGCGCCGCTTCTCCGGGAAGGCTG240
241AGCCCCGGCCGCGCTCTTCTCGTCTCAGCCGCCGTAGCTC280
281AGTCGACTTGGGGCTGCTGAGCTCTTGGTCCCTGCCAGCC320
321TCACCCGCTCCGGACCCCCCCGATCCTCCGGACTCCGCTG360
361GTCCTGGCCCCGCGAGGAGCCCACCGCCTAGCTCCAAAGA400
401ACCCCCCGAGGGCACGTGGACCGAGGGAGCCCCTGTGAAG440
441GCTGCGGAAGACTCCGCGCGTCCCGAGCTCCCGGACTCTG480
481CAGTGGGCCCGGGGTCCAGGGAGCCGCTAAGGGTCCCTGA520
521AGCTGTGGCCCTAGAGCGGCGGCGGGAGCAGGAAGAAAAG560
561GAGGACATGGAGACCCAGGCTGTGGCAACGTCCCCCGATG600
601GCCGATACCTCAAGTTTGACATCGAGATTGGACGTGGCTC640
641CTTCAAGACGGTGTATCGAGGGCTAGACACCGACACCACA680
681GTGGAGGTGGCCTGGTGTGAGCTGCAGACTCGGAAACTGT720
721CTAGAGCTGAGCGGCAGCGCTTCTCAGAGGAGGTGGAGAT760
761GCTCAAGGGGCTGCAGCACCCCAACATCGTCCGCTTCTAT800
801GATTCGTGGAAGTCGGTGCTGAGGGGCCAGGTTTGCATCG840
841TGCTGGTCACCGAACTCATGACCTCGGGCACGCTCAAGAC880
881GTACCTGAGGCGGTTCCGGGAGATGAAGCCGCGGGTCCTT920
921CAGCGCTGGAGCCGCCAAATCCTGCGGGGACTTCATTTCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。