基因總覽
WDR6 的正式名稱為 WD repeat domain 6，屬於蛋白質編碼基因，其產物歸於 WD repeat WDR6 family。蛋白質序列長 1121 個胺基酸，具有多個 WD repeat；資料所列的重複區段分布於序列不同位置。這些資訊界定了 WDR6 的家族歸屬與重複序列特徵。來源亦指出，WDR6 與 FTSJ1、STK11/LKB1 等蛋白質有關聯，其生物學角色包括參與 tRNA 修飾，以及與自噬和細胞生長抑制相關的作用；具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000608424 ★ | 49,007,391–49,015,951 | 6 |
| ENST00000395474 | 49,007,062–49,015,953 | 6 |
| ENST00000873507 | 49,007,062–49,015,953 | 6 |
| ENST00000873508 | 49,007,062–49,015,953 | 6 |
| ENST00000873509 | 49,007,062–49,015,953 | 6 |
| ENST00000873510 | 49,007,062–49,015,953 | 6 |
| ENST00000916085 | 49,007,062–49,015,953 | 6 |
| ENST00000916086 | 49,007,062–49,015,953 | 6 |
| ENST00000969620 | 49,007,062–49,015,953 | 5 |
| ENST00000429900 | 49,007,353–49,011,706 | 3 |
| ENST00001142695 | 49,007,391–49,015,953 | 6 |
| ENST00000438660 | 49,007,393–49,012,251 | 3 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WDR6 與 methyltransferase FTSJ1 一同作用於受質 tRNA，參與 anticodon loop 第 34 位核苷酸核糖的 2'-O 甲基化。WDR6 的作用不只是與 FTSJ1 相互作用；它也有助於將受質 tRNA 正確定位，使其能進行甲基化。這項 tRNA 修飾功能由 WDR6 與 FTSJ1 共同完成，來源指出此修飾發生於受質 tRNA 的特定位置。
在營養壓力相關的細胞反應中，WDR6 是抑制胺基酸飢餓誘導自噬所必需的因子。來源將其功能限定於胺基酸飢餓誘發的自噬抑制，並未進一步說明 WDR6 如何影響自噬過程中的分子步驟。
此外，WDR6 可增強 STK11/LKB1 誘導的細胞生長抑制活性。這表示 WDR6 與 STK11/LKB1 相關的生長抑制作用有所關聯；現有資料未提供足以描述其下游機制的細節。上述功能分別涉及 tRNA 修飾、飢餓條件下的自噬調控，以及 STK11/LKB1 相關的細胞生長抑制，來源未指出它們之間存在直接因果關係。
Promoter 與基因調控
>WDR6 ENST00000608424 GRCh38 chr3:49006391-49007491 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTCCCTGATGCCCCAGCCTTCCTACTCCCTGGGGCTTGGGACACATGTCCCTTGCTAACCCAGGATGGG AAGGGATATGGACAGGCCCAACAGCAAGAAAGCTGGTTTCAGAGGGCCAGTAGTGTTGACTATACATTAG TGGGCTGAGATGAGGAGCCTCCAAGGAAGCTTTAGGTCTGGGTGTTTGCTACACAAGGAATGCATAGCTG GACCCACCTTGGTCATGCTCTTGGTGCCTATGAGGCCAAGCTCTGGCCAGCCCAGCCTAGGATCTCACGT CACCCTCCTCTTCTAGGTTGGGTGGGTGACGTAGACGACTACTCGCTGCACGGGGGCTGCCTGGTCACGC GCGGCACCAAGTGGATTGCCAACAACTGGATTAATGTGGACCCCAGCCGAGCGCGGCAAGCGCTGTTCCA ACAGGAGATGGCCCGCCTTGCCCGAGAAGGGGGCACCGACTCACAGCCCGAGTGGGCTCTGGACCGGGCC TACCGCGATGCGCGCGTGGAACTCTGAGGGAAGAGTTAGCCCCGGTTCCCAGCCGCGGGTCGCCAGTTGC CCAAGATCAGGGGTCCGGCTGTCCTTCTGTCCTGCTGCAGACTAAAGGTCTGGCCAATGTCTTGCCCCAC CCCGCCAGCCGCGATACGGCGCAGTTCCTATATTCATGTTATTTATTGTGTACTGACTCCATCTGCCCCG TCAAATAAAAAACCACAAGGTTCGAGCCGCCGGGCCCGACAAACTCCGGGTCGGCGAAACAGAGTCCGCG ATAGGTGCAGCGGGCTGGCAGCTGGGAGCGCCCCGCAAGCGTCACGTGAGGGGGCGAGGGGCGGGATGCC CCTCCGCGGGCCCCGCCAATGATGAGCTGGATTGCGTGGGACGAAGGGTCGTCATTGGACAACCGCCGCG GGCGCCCTGGTCTCTGCTACCTGTAGCTGAGGGCGCTGTTGATGGGCAGCGCGGCGCGCTGGGAAGGCTC GTTCTCGCGAGAGTTCAGCTCCCTTCTTAGCCGTGGCTGCCTCAGCACCTCGAGGATCGACATGGACGCT CTCGAGGACTACGTTTGGCCGCGGGCAACCTCGGAGCTTATACTCCTCCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WDR6_3 ↗ | 3:49,006,692 | 正股 | 49,006,643–49,006,702 |
| WDR6_2 ↗ | 3:49,007,149 | 正股 | 49,007,100–49,007,159 |
| WDR6_1 ↗ | 3:49,007,399 | 正股 | 49,007,350–49,007,409 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_C6TB3 · promoter · 49006572–49007618 · regulatory
ENSR3_C6TB6 · enhancer · 49007619–49008761 · regulatory
ENSR3_5FJ88J · CTCF_binding_site · 49007696–49007717 · regulatory
ENSR3_5FJ88X · CTCF_binding_site · 49007785–49007806 · regulatory
ENSR3_67QLMH · CTCF_binding_site · 49008003–49008046 · regulatory
ENSR3_5FJ8DC · CTCF_binding_site · 49008523–49008544 · regulatory
· motif · 49004517–49004530 · motif
· motif · 49004605–49004615 · motif
· motif · 49007014–49007024 · motif
· motif · 49007100–49007108 · motif
· motif · 49007201–49007210 · motif
· motif · 49007201–49007210 · motif
· motif · 49007217–49007227 · motif
· motif · 49007404–49007418 · motif
· motif · 49007404–49007418 · motif
· motif · 49007678–49007688 · motif
· motif · 49007698–49007714 · motif
· motif · 49007787–49007803 · motif
· motif · 49007816–49007829 · motif
· motif · 49007822–49007835 · motif
· motif · 49007852–49007865 · motif
· motif · 49007881–49007894 · motif
· motif · 49007921–49007934 · motif
· motif · 49007946–49007959 · motif
· motif · 49007952–49007965 · motif
· motif · 49007998–49008011 · motif
· motif · 49008005–49008021 · motif
· motif · 49008027–49008043 · motif
· motif · 49008525–49008541 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1121 aa
WDR6 蛋白質長 1121 個胺基酸，屬於 WD repeat WDR6 family。序列註解列出 19 個 WD repeat，位置自第 53–97 位延伸至第 1079–1121 位；各重複區段分散於蛋白質序列中。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WDR6 位於細胞質，並與 STK11/LKB1 在細胞質中共定位。 此資料描述的是兩者的共定位，不代表 STK11/LKB1 的定位可直接轉用為 WDR6 的其他定位資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- GRIP1Q9Y3R0-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPN3P26045 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- STK11Q15831 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
WDR6 與 FTSJ1 有直接交互作用，且此交互作用為受質 tRNA 第 34 位 2'-O 甲基化所必需。WDR6 也與 STK11/LKB1 交互作用；另有與 IRS4 交互作用的記載，但屬於相似性推定。資料未將這些關係描述為同一複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WDR6 與 methyltransferase FTSJ1 共同促進受質 tRNA anticodon loop 第 34 位核苷酸核糖的 2'-O 甲基化，並協助正確定位受質 tRNA。此外，WDR6 是抑制胺基酸飢餓誘導自噬所必需的因子，也能增強 STK11/LKB1 誘導的細胞生長抑制活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Together with methyltransferase FTSJ1, methylates the 2'-O-ribose of nucleotides at position 34 of the tRNA anticodon loop of substrate tRNAs. Required for the correct positioning of the substrate tRNA for methylation. Required to suppress amino acid starvation-induced autophagy. Enhances the STK11/LKB1-induced cell growth suppression activity PMID 17216128 ↗ · PMID 22354037 ↗ · PMID 32558197 ↗ · PMID 33771871 ↗ |
| 交互作用 | WDR6 與 FTSJ1 有直接交互作用，此交互作用對受質 tRNA 第 34 位的 2'-O 甲基化是必需的。WDR6 也與 STK11/LKB1 交互作用；與 IRS4 的交互作用則是依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with FTSJ1; the interaction is direct, and required for 2'-O-methylation of position 34 in substrate tRNAs. Interacts with IRS4 (By similarity). Interacts with STK11/LKB1 PMID 17216128 ↗ · PMID 32558197 ↗ · PMID 33771871 ↗ |
| 細胞定位 | WDR6 位於細胞質，並與 STK11/LKB1 在細胞質中共定位。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CCCTTCTTAGCCGTGGCTGCCTCAGCACCTCGAGGATCGA40CATGGACGCTCTCGAGGACTACGTTTGGCCGCGGGCAACC80TCGGAGCTTATACTCCTCCCAGTGACGGGTCTGGAGTGCG120TGGGGGACCGGCTGTTGGCGGGTGAGGGTCCCGATGTCCT160GGTGTACAGCTTGGACTTTGGTGGGCATCTGCGGATGATA200AAGCGAGTGCAGAACCTGCTTGGCCACTATCTTATCCATG240GCTTCCGGGTACGGCCAGAGCCTAATGGAGACCTTGACTT280GGAGGCCATGGTGGCTGTGTTTGGAAGCAAGGGACTCCGA320GTTGTGAAAATTAGCTGGGGACAGGGCCACTTCTGGGAGC360TTTGGCGCTCTGGCCTGTGGAACATGTCTGACTGGATTTG400GGATGCACGCTGGCTTGAGGGAAATATAGCCTTGGCCCTG440GGCCACAACTCAGTGGTGCTATATGACCCTGTAGTAGGGT480GCATCCTGCAAGAGGTGCCCTGCACAGACAGGTGCACCCT520CTCTTCAGCCTGCCTGATTGGAGACGCCTGGAAGGAGCTG560ACCATAGTGGCAGGTGCTGTTTCCAACCAGCTCTTGGTCT600GGTACCCAGCAACTGCCTTAGCAGACAACAAACCTGTAGC640ACCTGACCGACGAATCAGTGGGCATGTGGGCATCATCTTC680AGCATGTCATACCTGGAAAGCAAGGGATTGCTGGCTACAG720CTTCAGAAGACCGAAGCGTTCGTATCTGGAAGGTGGGCGA760CCTGCGAGTGCCTGGGGGTCGGGTGCAGAATATTGGGCAC800TGCTTTGGGCACAGCGCCCGTGTGTGGCAGGTCAAGCTTC840TAGAGAATTACCTTATCAGTGCAGGAGAGGATTGTGTCTG880CTTGGTGTGGAGCCATGAAGGTGAGATCCTCCAGGCCTTT920CGGGGACACCAGGGACGTGGGATCCGGGCCATAGCTGCCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。