基因總覽
WDR5（WD repeat domain 5）是由蛋白質編碼基因產生的蛋白質，屬於 WD repeat WDR5/wds 家族。其序列含有七個 WD repeat，N 端另有一段預測為無序的區域。WDR5 的主要角色與組蛋白修飾相關，並作為多種組蛋白甲基轉移酶複合體及乙醯轉移酶複合體的組成成員。這些特性使它能參與不同組蛋白修飾相關複合體，但來源未提供其蛋白質結構的進一步描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000358625 ★ | 134,136,082–134,159,968 | 14 |
| ENST00000957642 | 134,134,346–134,159,971 | 14 |
| ENST00001097443 | 134,134,785–134,159,971 | 17 |
| ENST00000907894 | 134,135,140–134,159,971 | 14 |
| ENST00000907895 | 134,135,362–134,159,971 | 14 |
| ENST00000608937 | 134,135,365–134,140,790 | 3 |
| ENST00000608739 | 134,135,377–134,141,974 | 6 |
| ENST00000907896 | 134,136,064–134,159,971 | 14 |
| ENST00000907897 | 134,136,064–134,159,952 | 14 |
| ENST00000924659 | 134,136,064–134,159,971 | 14 |
| ENST00000924660 | 134,136,064–134,159,971 | 15 |
| ENST00000924661 | 134,136,064–134,159,971 | 14 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WDR5 參與組蛋白修飾，並可在不同複合體中協助調節組蛋白的甲基化或乙醯化。作為 MLL1/MLL 複合體的一員，它參與組蛋白 H3 Lys-4 的甲基化與雙甲基化；WDR5 也可能協助定位組蛋白 H3 的 N 端，使 Lys-4 能有效進行三甲基化。組蛋白 H3 Lys-4 甲基化是與表觀遺傳轉錄活化相關的特定標記。
WDR5 與 RBBP5、ASH2L 協同時，可促進 KMT2A、KMT2B、KMT2C、KMT2D、SETD1A 及 SETD1B 的組蛋白甲基轉移酶活性。這些作用說明 WDR5 不僅是相關複合體的成員，也能支持多種組蛋白甲基轉移酶的活性；來源未將此促進作用限定為單一甲基化程度或特定生物情境。
在 NSL 複合體中，WDR5 可能參與核小體組蛋白 H4 多個 lysine 殘基的乙醯化。來源亦指出 WDR5 參與組蛋白 H3、H4 乙醯轉移酶活性的 ATAC 複合體；至於組蛋白 H3 的甲基化，另一個含 WDR5、ZNF335、RBBP5 與 ASH2L 的複合體可能具有 H3 特異性甲基轉移酶活性，但不具備對 H3 Lys-4 的專一性。
此外，WDR5 可能調節成骨細胞分化；此項功能屬於相似性推論，應保留其不確定性。綜合而言，WDR5 涉及多種組蛋白修飾複合體，其功能依所處複合體而異；來源支持其參與轉錄活化相關的組蛋白標記形成，但未提供更廣泛的細胞或生理作用細節。
Promoter 與基因調控
>WDR5 ENST00000358625 GRCh38 chr9:134135082-134136182 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTCCTGTGTCATATTCTGTGTTCCCATTTTTAATTGGAGAATAAGGGACTGTATGTTATTCTACCCACA GGCCTAGCTGAGGGGATAGGGAGGCCATGCCTACCTCCAAGGCTCTAAGAAGTGAAGCAGGCGGCGAGAA TGTGCAGTCGTTGAGGCCAGAGGACCGGGCCTCAGCTTCTCCTTAAGCCCCTGAGTCCTCCTCTGGGGAC CACCCCCTTGTACCTGGAGGTGAAAATGCCCGCCCAGGAGGGAAGGGCTGGCCCCGGGAGAGCCCGCTGC GAAGTGAGTTTGCGCACTGCGGAGCGGGCGCGGGTGACTCCAGAGCGGCCCTGCCAGTCCGCGGGGCTGG CGGGGAGCAGGTTCGTGCACCGCGGGCTCTGTGCATGCAGAGGCGGGAAGAGCCCCCAGCCCGGCAGCCG GCCCCGCGGGAAGGCGCAGCCCGGGCTTCCGAACCCTGTGAACGCGCAGGTTCCTGGTCTTCCAGATGGG CAGGAATCGTCCTGCCCGCCCGGGGTGGGAGGCCACATGGGGGCACTGCGCCCGGGCGCGGCCCCAGGTG CTTTCCAAATGCCCACTGCCGCTCTCATCCGTACCAGCGATGATCAAGAAGGGGCCTGGTCGCCCGGGGA GGTGCCCCGGCCCGAATCGACTCCGGAGACAACGCCGGGCGACGCCACCTGCGCAGGTCCCGGAGGGCCG CTGGTGTCTGTGTACAGGGCGTGCTGTCTGTGGAAACGCGAGGGCACACTAGCACTTTCCTGTATGTATT ATTATACTTCAGTTTTTAGGAAGTGCATTAGAAGGGCCTGCACCAGTCAAATTCGGGGATTAAAGCTTTT AAGCGGGAAGCGCGCGCCCCGTGCTGTCCCTTTAAAGCGTTGGGCCGGCCCGAGGCATTCTGGCCGCTGT CGCTGCCCGTAGCGCTCCTCCGAGAGGCCGGCTTTGTGAGCTCGCCCCGCCCCCCGGACACCGCCCCCTC CCCTCGCGCACGCGCACTGCGCCCCCGCCGCCTGGCGCCCGCCCGAGCTGCCGCCTTGTCGAGCTGAGTC CGCGCTCCCGCCCAGGCGGCGGCCGACGCGACGCCCCGAGCGCCCGGCCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WDR5_1 ↗ | 9:134,136,088 | 正股 | 134,136,039–134,136,098 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_BZLPJ · enhancer · 134130729–134131641 · regulatory
ENSR9_BZLQ4 · enhancer · 134134708–134135274 · regulatory
ENSR9_BZLQ7 · promoter · 134135275–134136092 · regulatory
ENSR9_536JSX7 · CTCF_binding_site · 134135600–134135621 · regulatory
ENSR9_536JSXF · CTCF_binding_site · 134135647–134135668 · regulatory
ENSR9_536JT2F · CTCF_binding_site · 134136083–134136104 · regulatory
ENSR9_CHBD6 · enhancer · 134136093–134137332 · regulatory
ENSR9_93Z8JG · enhancer · 134139048–134139505 · regulatory
· motif · 134131202–134131211 · motif
· motif · 134131322–134131335 · motif
· motif · 134131322–134131335 · motif
· motif · 134135602–134135618 · motif
· motif · 134135634–134135643 · motif
· motif · 134135649–134135665 · motif
· motif · 134136035–134136045 · motif
· motif · 134136049–134136059 · motif
· motif · 134136066–134136077 · motif
· motif · 134136066–134136077 · motif
· motif · 134136085–134136101 · motif
· motif · 134136283–134136292 · motif
· motif · 134136283–134136292 · motif
· motif · 134136285–134136301 · motif
· motif · 134138369–134138384 · motif
· motif · 134138369–134138384 · motif
· motif · 134138370–134138384 · motif
· motif · 134138532–134138547 · motif
· motif · 134139361–134139370 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：334 aa
WDR5 蛋白質長 334 個胺基酸，屬於 WD repeat WDR5/wds 家族。序列註解列出七個 WD repeat：第 1 至第 7 個分別位於胺基酸 43–82、85–126、128–168、169–208、212–253、256–296 與 299–333；胺基酸 1–31 則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WDR5 位於細胞核，也見於細胞質的細胞骨架及紡錘極相關位置。 來源未提供不同定位所對應的條件、異構型差異或定位轉換動態，因此無法進一步判定其定位變化情境。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 45 個夥伴
- AKAP8O43823 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ANAPC2Q9UJX6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATN1P54259 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- ATN1Q86V38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BBC3Q96PG8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BOD1L1Q8NFC6 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- C1orf104A2RRG2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHD8Q9HCK8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DYNC1H1Q14204 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM199XQ6PEV8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- H3C12P68431 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- HCFC1P51610 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- HSF2Q03933 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- KANSL1Q7Z3B3 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
- KANSL2Q9H9L4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- KAT6AQ92794 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KDM6AO15550 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- KLK6Q92876 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KMT2AQ03164 · UniProt INTERACTION · 17 experiments · 2 筆來源紀錄
- KMT2BQ9UMN6 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- KMT2CQ8NEZ4 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- KMT2DO14686 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- MARF1Q9Y4F3 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MAVSQ7Z434-1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MBIPQ9NS73 · UniProt INTERACTION · 9 experiments · 2 筆來源紀錄
WDR5 是 SET1、MLL1/MLL、MLL2/3、MLL4/WBP7、NSL 與 ATAC 等複合體的組成成員，並與 KMT2A、KMT2B、KMT2C、KMT2D、SETD1A、SETD1B、RBBP5 及組蛋白 H3 等分子有直接互作記錄。WDR5 也與 PAXBP1、HCFC1、ZNF335、PER1 等互作；其中部分關係的直接性未明確指定。另在微生物感染情境下，WDR5 與 herpes virus 8/HHV-8 蛋白 LANA1 互作，並調節病毒 DNA 上的 MLL1 組蛋白甲基轉移酶活性。與 oSCRIB/EMBOW、RBM15 或 ZSCAN10 的 WIN site 互作，則涉及 WDR5 與其他互作夥伴結合的調節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WDR5 參與組蛋白修飾；它可能協助定位組蛋白 H3 的 N 端，以利 Lys-4 三甲基化，並在 MLL1/MLL 複合體中參與該位點的甲基化與雙甲基化。H3 Lys-4 甲基化是表觀遺傳轉錄活化的特定標記。WDR5 在 NSL 複合體中可能參與核小體 H4 多個 lysine 殘基的乙醯化；與 RBBP5、ASH2L 協同時，也會促進多種 KMT2 與 SETD1 組蛋白甲基轉移酶活性。它可能調節成骨細胞分化，此項為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Contributes to histone modification. May position the N-terminus of histone H3 for efficient trimethylation at 'Lys-4'. As part of the MLL1/MLL complex it is involved in methylation and dimethylation at 'Lys-4' of histone H3. H3 'Lys-4' methylation represents a specific tag for epigenetic transcriptional activation. As part of the NSL complex it may be involved in acetylation of nucleosomal histone H4 on several lysine residues. May regulate osteoblasts differentiation (By similarity). In association with RBBP5 and ASH2L, stimulates the histone methyltransferase activities of KMT2A, KMT2B, KMT2C, KMT2D, SETD1A and SETD1B PMID 16600877 ↗ · PMID 16829960 ↗ · PMID 18840606 ↗ · PMID 19103755 ↗ · PMID 19131338 ↗ · PMID 19556245 ↗ · PMID 20018852 ↗ · PMID 21220120 ↗ · PMID 22266653 ↗ |
| 交互作用 | WDR5 是 SET1、MLL1/MLL、MLL2/3、MLL4/WBP7、NSL 與 ATAC 等複合體成員，並與多種組蛋白甲基轉移酶及組蛋白 H3 互作；它與 KMT2A、SETD1A 等可透過 WIN motif 直接互作。WDR5 也與 RBBP5、HCFC1、PAXBP1、ZNF335 等有互作記錄；在 ATAC 中可能直接互作 KAT2A、MBIP 與 KAT14。oSCRIB/EMBOW 可透過 WIN site 與 WDR5 互作，並調節 WDR5 對多個互作夥伴的結合，在至少部分情況下與其他夥伴競爭結合；RBM15 和 ZSCAN10 也透過 WIN site 與 WDR5 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PAXBP1; the interaction is direct and links a WDR5-containing histone methyltransferase complex to PAX7 and PAX3 (By similarity). Interacts with HCFC1. Component of the ATAC complex, a complex with histone acetyltransferase activity on histones H3 and H4. Component of the SET1 complex, at least composed of the catalytic subunit (SETD1A or SETD1B), WDR5, WDR82, RBBP5, ASH2L/ASH2, CXXC1/CFP1, HCFC1 and DPY30. Core component of several methyltransferase-containing complexes including MLL1/MLL, MLL2/3 (also named ASCOM complex) and MLL4/WBP7. Each complex is at least composed of ASH2L, RBBP5, WDR5, DPY30, one or more specific histone methyltransferases (KMT2A/MLL1, KMT2D/MLL2, KMT2C/MLL3 and KMT2B/MLL4), and the facultative components PAGR1, BACC1, CHD8, E2F6, HCFC1, HCFC2, HSP70, INO80C, KDM6A, KANSL1, LAS1L, MAX, MCRS1, MEN1, MGA, MYST1/MOF, NCOA6, PAXIP1/PTIP, PELP1, PHF20, PRP31, RING2, RUVB1/TIP49A, RUVB2/TIP49B, SENP3, TAF1, TAF4, TAF6, TAF7, TAF9, TEX10 and alpha- and beta-tubulin. Component of the NSL complex at least composed of MOF/KAT8, KANSL1, KANSL2, KANSL3, MCRS1, PHF20, OGT1/OGT, WDR5 and HCFC1. Interacts with KMT2A/MLL1 (via WIN motif) and RBBP5; the interaction is direct. Component of the ADA2A-containing complex (ATAC), composed of KAT14, KAT2A, TADA2L, TADA3L, ZZ3, MBIP, WDR5, YEATS2, CCDC101 and DR1. In the complex, it probably interacts directly with KAT2A, MBIP and KAT14. Interacts with histone H3. Interacts with SETD1A (via WIN motif). Component of a histone methylation complex composed of at least ZNF335, RBBP5, ASH2L and WDR5; the complex may have histone H3-specific methyltransferase activity, however does not have specificity for 'Lys-4' of histone H3. Interacts with ZNF335. Components of this complex may associate with components of the ZNF335-CCAR2-EMSY nuclear receptor-mediated transcription complex to form a complex at least composed of ZNF335, HCFC1, CCAR2, EMSY, MKI67, RBBP5, ASH2L and WDR5. Interacts with PER1 (By similarity). Interacts with KMT2B (via WIN motif), KMT2C (via WIN motif), KMT2D (via WIN motif) and SETD1B (via WIN motif). Interacts (via WIN site) with oSCRIB/EMBOW (via MRT motif); the interaction regulates the binding of WDR5 to multiple interaction partners; in at least some cases, oSCRIB/EMBOW directly competes with other WDR5 interaction partners for binding to WDR5. Interacts (via WIN site) with RBM15 (via MRT motif). Interacts (via WIN site) with ZSCAN10 (via MRT motif) PMID 12670868 ↗ · PMID 14992727 ↗ · PMID 15199122 ↗ · PMID 15960975 ↗ · PMID 16253997 ↗ · PMID 16600877 ↗ · PMID 16829959 ↗ · PMID 16829960 ↗ · PMID 16946699 ↗ · PMID 17021013 ↗ · PMID 17355966 ↗ · PMID 17500065 ↗ · PMID 17998332 ↗ · PMID 18378692 ↗ · PMID 18829459 ↗ · PMID 18838538 ↗ · PMID 18840606 ↗ · PMID 19103755 ↗ · PMID 19131338 ↗ · PMID 19556245 ↗ · PMID 20018852 ↗ · PMID 21220120 ↗ · PMID 22266653 ↗ · PMID 22665483 ↗ · PMID 23178126 ↗ · PMID 37725512 ↗ · PMID 41135522 ↗ · PMID 41689289 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，WDR5 與 herpes virus 8/HHV-8 蛋白 LANA1 互作；這項互作會調節病毒 DNA 上的 MLL1 組蛋白甲基轉移酶活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with herpes virus 8/HHV-8 protein LANA1; this interaction regulates the MLL1 histone methyltransferase activity on viral DNA PMID 34850113 ↗ |
| 細胞定位 | WDR5 位於細胞核，以及細胞質中的細胞骨架和紡錘極相關位置。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle pole PMID 17355966 ↗ · PMID 20018852 ↗ · PMID 34850113 ↗ · PMID 37725512 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCCCCCGCCGCCTGGCGCCCGCCCGAGCTGCCGCCTTGTC40GAGCTGAGTCCGCGCTCCCGCCCAGGCGGCGGCCGACGCG80ACGCCCCGAGCGCCCGGCCCCGCCGCCGCGGCCCGGCAGA120CTGCCTCTGTCACCGGGTCCCTCCACCCTTGTCTCCTGTG160CGGCCAGCGTCAGAGCCATGGCGACGGAGGAGAAGAAGCC200CGAGACCGAGGCCGCCAGAGCACAGCCAACCCCTTCGTCA240TCCGCCACTCAGAGCAAGCCTACACCTGTGAAGCCAAACT280ATGCTCTAAAGTTCACCCTTGCTGGCCACACCAAAGCAGT320GTCCTCCGTGAAATTCAGCCCGAATGGAGAGTGGCTGGCA360AGTTCATCTGCTGATAAACTTATTAAAATTTGGGGCGCGT400ATGATGGGAAATTTGAGAAAACCATATCTGGTCACAAGCT440GGGAATATCCGATGTAGCCTGGTCGTCAGATTCTAACCTT480CTTGTTTCTGCCTCAGATGACAAAACCTTGAAGATATGGG520ACGTGAGCTCGGGCAAGTGTCTGAAAACCCTGAAGGGACA560CAGTAATTATGTCTTTTGCTGCAACTTCAATCCCCAGTCC600AACCTTATTGTCTCAGGATCCTTTGACGAAAGCGTGAGGA640TATGGGATGTGAAAACAGGGAAGTGCCTCAAGACTTTGCC680AGCTCACTCGGATCCAGTCTCGGCCGTTCATTTTAATCGT720GATGGATCCTTGATAGTTTCAAGTAGCTATGATGGTCTCT760GTCGCATCTGGGACACCGCCTCAGGCCAGTGCCTGAAGAC800GCTCATCGATGACGACAACCCCCCCGTGTCTTTTGTGAAG840TTCTCCCCGAACGGCAAATACATCCTGGCCGCCACGCTGG880ACAACACTCTGAAGCTCTGGGACTACAGCAAGGGGAAGTG920CCTGAAGACGTACACTGGCCACAAGAATGAGAAATACTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。