基因總覽
WDR3 是蛋白質編碼基因，產物為 WD repeat domain 3，屬於 WD repeat WDR3/UTP12 家族。蛋白質長 943 個胺基酸，序列中標註有多個 WD 重複區，並包含一段預測為無序的區域。其主要角色與核糖體生合成相關：它是小次單位 processome 的一部分，參與真核生物核糖體小次單位前驅物的形成。這些特徵將 WDR3 定位為核糖體生合成過程中的蛋白質組成成員。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000349139 ★ | 117,929,739–117,966,543 | 27 |
| ENST00000880604 | 117,929,063–117,960,060 | 27 |
| ENST00000369441 | 117,929,720–117,941,788 | 10 |
| ENST00000947751 | 117,929,720–117,960,882 | 28 |
| ENST00000947752 | 117,929,720–117,960,053 | 26 |
| ENST00000947753 | 117,929,720–117,960,055 | 28 |
| ENST00001119715 | 117,929,720–117,961,321 | 27 |
| ENST00001145152 | 117,929,720–117,966,543 | 27 |
| ENST00000880605 | 117,929,965–117,960,060 | 27 |
| ENST00000928994 | 117,929,965–117,960,051 | 28 |
| ENST00000947754 | 117,932,894–117,960,054 | 27 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WDR3 是小次單位 processome（SSU processome）的組成成員；此複合體是形成真核生物核糖體小次單位的早期前驅物。其功能脈絡與核仁內的 SSU processome 組裝相連，涉及新生前核糖體 RNA（pre-rRNA）的加工與小次單位前驅物的建立。
在組裝過程中，多種核糖體生合成因子、RNA 分子伴護蛋白及核糖體蛋白會與新生 pre-rRNA 結合，並協同作用。這些因子共同促進 RNA 摺疊、修飾、重排與切割，也參與對前核糖體 RNA 的標的性降解；後者由 RNA exosome 執行。WDR3 所在的 processome 因此處於多項 RNA 加工事件共同進行的環境中。
這些協同步驟將新生 pre-rRNA 的處理與小次單位前驅物的形成連結起來。來源支持 WDR3 作為 SSU processome 成員參與此一生合成脈絡，但未進一步指出 WDR3 單獨負責哪一項 RNA 摺疊、修飾、重排、切割或降解反應，也未描述其特定分子作用方式。
Promoter 與基因調控
>WDR3 ENST00000349139 GRCh38 chr1:117928739-117929839 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTCAAGAAGCGCCGGCAGGATCTTCTTTTGTACAGCTATGTTAGCTTTAATTTTGCACAGCTCTAGACA TCAGAACTCATTTCTAAACACTTCTATGCAGCTCAAGAATAAAAGTAGCAGAAATGCAAGAGAGAAAAGC TAATTCCCACTTGGTGAAAGAGCACTTAAGTCTCAGTGAGCAAACAAGGAGGAGTCAGCCTTGGTCACTT CCCCCTCAAGCGGCCAGAGAGCGGAAACACAAAGCCAGGCCAGTGTCACTCCAGGGATTGCGGGAACCTA GACAACGCACCATCCTGGGCTCAGCGTCTACCCACCCCTCACCCGAGGTGCTCTCGGTTCCGTAGAATGT CCAGTCCACAGGAACGGCAACACGGACTTGTCTTTGGGACTACAACCAGCAAGAGCTCCCGCCTGCCCCA TTTCACCTGCACCCTAGGGCGCCCGCCTCCTTGGCTACAGCACCACTGTTCCTAGTGCCCGCCGACTGCC CACCCTTTCACTTCTCGTAGAGACGGCGTCCCCGACAACGCCTCGGGAAAGAACCTAACCAACATGCGAG GAAGTGGCGCCAGGCTCGTTCTTCAAGAGAAGTGACAGAACTAACCCTCAGCCTGCAATCCTGACCAGGG CCGAGTCCCGAGCGCCTCGGACCGCGCCCCCGGCCCTCTCCGCCCCGCCTTCCCTCCCGGCCTCAGTCCC TCCTCTCACAGCACTCTGGTGGTCCCATCCGGGCGGCGGGCGGCACGGATCAGGCTCCTGGTAGAAGGCG GCCGAGCGACATCTCCGGCGACCCTCAGCAGGAGCGCGCCGAGTACGGCGAGTCAAAGTCCCAGGAGACT GGAGTGACCAGCTGCAAATGCTCTGGGCTGCGAAACACCGGCTTCCGCTCCTGGCCAGAGCTCACCAATC AGCGCCCGGCTTTCTCCGTCATTTCCTCCTAGAAGGCAAAGGGAACCTCTGGCGGAAGAGGCTTCCGGAA CGGACCCGGAAGGGGCAGGTCTTGTGGGCGGGTCCAATCGGCTGGGAGCCTCGTGGAGGCTGAGGTGAGT CCTGGAGGTGCGTGGTTGGGGCGGAGAGCATTATCTGCGGCTCCGATTTTG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WDR3_1 ↗ | 1:117,929,754 | 正股 | 117,929,705–117,929,764 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：943 aa
WD repeat domain 3 長 943 個胺基酸，歸屬於 WD repeat WDR3/UTP12 家族。序列註解列出 13 個 WD 重複區：第 1–5 個位於胺基酸 21–228，第 6 個位於 277–316，第 7–13 個位於 413–712；另有一段胺基酸 326–345 的區域標註為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WD repeat domain 3 定位於細胞核與核仁。 來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
WDR3 是小次單位 processome 的組成部分。此 processome 由 70 多種蛋白質及 RNA 分子伴護蛋白 U3 snoRNA 組成；資料支持 WDR3 與該複合體的成員關係，但未指出其與特定成員直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WDR3 是小次單位 processome 的一部分；該複合體是形成真核生物核糖體小次單位的早期前驅物。在核仁內組裝時，多種核糖體生合成因子、RNA 分子伴護蛋白及核糖體蛋白會與新生 pre-rRNA 結合並協同作用，促進 RNA 摺疊、修飾、重排與切割，也涉及 RNA exosome 對前核糖體 RNA 的標的性降解。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the small subunit (SSU) processome, first precursor of the small eukaryotic ribosomal subunit. During the assembly of the SSU processome in the nucleolus, many ribosome biogenesis factors, an RNA chaperone and ribosomal proteins associate with the nascent pre-rRNA and work in concert to generate RNA folding, modifications, rearrangements and cleavage as well as targeted degradation of pre-ribosomal RNA by the RNA exosome PMID 34516797 ↗ |
| 交互作用 | WDR3 是小次單位 processome 的組成成員。此複合體由 70 多種蛋白質及 RNA 分子伴護蛋白 U3 snoRNA 組成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of the small subunit (SSU) processome, composed of more than 70 proteins and the RNA chaperone small nucleolar RNA (snoRNA) U3 PMID 34516797 ↗ |
| 細胞定位 | WDR3 定位於細胞核與核仁。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
CTTGTGGGCGGGTCCAATCGGCTGGGAGCCTCGTGGAGGC40TGAGATTGCTTCACCTGTGGTATCAGACATCACAACATGG80GGCTCACCAAGCAGTACCTACGCTATGTTGCTAGTGCGGT120CTTTGGCGTTATCGGCAGCCAAAAAGGTAATATTGTCTTT160GTGACACTTCGTGGTGAGAAAGGACGTTATGTGGCAGTAC200CAGCTTGTGAACACGTTTTCATCTGGGACTTAAGGAAAGG240AGAGAAGATTCTTATCCTTCAGGGGCTTAAACAAGAAGTT280ACTTGCTTATGCCCCTCCCCAGATGGGCTACACTTAGCTG320TTGGGTATGAGGATGGGTCGATCCGAATCTTCAGTCTCCT360GAGTGGGGAAGGAAATGTGACCTTCAATGGTCACAAAGCA400GCTATCACTACCTTGAAGTATGATCAGCTAGGAGGCAGAC440TGGCATCTGGGTCCAAGGACACAGATATTATTGTATGGGA480TGTGATCAATGAAAGTGGTCTGTACCGTCTAAAGGGGCAC520AAGGATGCCATCACACAAGCATTGTTTCTACGAGAAAAGA560ACCTGCTAGTTACTAGTGGGAAAGATACCATGGTGAAATG600GTGGGACCTTGATACTCAGCACTGCTTTAAAACAATGGTT640GGCCACCGGACTGAGGTATGGGGGTTGGTTCTGTTGTCAG680AAGAAAAGCGACTCATCACTGGGGCCTCAGACAGTGAACT720GAGGGTATGGGACATAGCTTATCTGCAAGAGATTGAAGAC760CCGGAAGAACCAGACCCCAAGAAAATCAAAGGATCTTCTC800CTGGAATACAAGATACTCTTGAGGCAGAGGATGGTGCCTT840TGAGACGGATGAAGCCCCTGAGGATCGAATCCTTTCATGC880AGAAAAGCTGGTTCCATAATGCGGGAAGGAAGAGACAGAG920TTGTAAACCTTGCAGTCGACAAGACAGGCAGGATTCTTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。