演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

WBP2WBP-2

WW domain binding protein 2

WBP2(WW domain binding protein 2)是蛋白質編碼基因,其產物可在荷爾蒙活化時協助 estrogen receptor 與 progesterone receptor 調控轉錄。

Homo sapiens17q25.1UniProt Q969T9
OFFICIAL SYMBOL
WBP2
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q969T9
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

WBP2(WW domain binding protein 2)是位於人類第 17 號染色體的蛋白質編碼基因。其產物為 261 個胺基酸的蛋白質,含有位於 N 端的 GRAM 結構域;C 端則包含兩個 PPxY motif,並有一段被註解為無序區域的序列。這些序列特徵構成 WBP2 的基本分子架構。資料指出,WBP2 可參與荷爾蒙活化後的受體轉錄調控,也與多種蛋白質發生交互作用;具體作用方式與相關生物學過程見功能說明。

Official symbol
WBP2
Gene name
WW domain binding protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12738
UniProt
Q969T9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
WBP-2GRAMD6

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.1
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegWBP2pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:75,845,699–75,856,507
Gene span
10,809 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000254806 ★75,845,699–75,855,3358
ENST0000062682775,845,699–75,855,4207
ENST0000109436275,845,699–75,855,4202
ENST0000113656475,845,699–75,855,4208
ENST0000102032475,845,700–75,855,4208
ENST0000058546275,845,709–75,855,3228
ENST0000059139975,845,720–75,856,5079
ENST0000102032675,845,744–75,855,4208
ENST0000111363775,845,744–75,855,4208
ENST0000059022175,845,772–75,855,4208
ENST0000058625775,845,837–75,848,6626
ENST0000043352575,846,495–75,855,4207

顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

荷爾蒙活化後,WBP2 可作為 estrogen receptor(ESR1)與 progesterone receptor(PGR)的轉錄共活化因子,協助這些受體調控基因表現。在有 estrogen 的條件下,WBP2 會結合 ESR1 響應型啟動子,顯示其參與受體依賴的轉錄調控;此描述限定於 estrogen 存在時,並未指出其在其他條件下的啟動子結合情形。

WBP2 也能與 YAP1 協同,增強 PGR 活性。這項作用將 WBP2 的共活化功能與 YAP1 及 PGR 的活性調節相連結;來源未進一步說明協同作用的分子步驟或其對特定細胞過程的影響。

此外,WBP2 可透過調節 ESR1、ESR2 與 PGR,影響突觸後支架蛋白的表現。此項功能註記為相似性推論(By similarity),因此應視為依相似性提出的功能描述,而非此處列出的直接實驗驗證。整體而言,資料支持 WBP2 參與荷爾蒙受體相關的轉錄調控,並將受體調節與突觸後支架蛋白表現連結;來源未提供更多下游機制或作用範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 75855335 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>WBP2 ENST00000254806 GRCh38 chr17:75855235-75856335 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AACATTAACGAGTACCGGAACTACCACGTGGGAAGTGCAGCCCCCTCTCTCCGCCTCACGGATTCAGCTC
GGAGGTGCAGGGGTTTGGTGGGGGGCGGTTAGGGAATGACAGCTGCCCCGTGGAGGACGCCCAGGGCTGG
GTCACGAGCTGACAGGAGTCAGCCTTATTCTGTAAATCCTAGTTATCAGGATGCCGGTTTCGCGCCGTGC
CCAGTCCCACTCAGCCTTCAGTCTTCCGGCCGGGACCCCGCTGGGCGCTAAGGGGGGAGCGGCGCCACCG
CGAGGCCGGAGAGGGGGCTGCGAGGGGCGCCCGGCCGGCCTGCGAACGTGGTGGGAGCCAGGCGGGGCAC
ACGGCCTCCCCTTCCCATGAGGGACTCTCCCCGCCCCCCGGGCTCAGCGCTGGGAGTGGTGAGATGGATG
GCGGGGTGATCCGACGCCGCCAGCCCACCGCGTCCCCAAGAGCCGGGGCCTCCGGCTCAGCTAAACGCCC
CAGAGTCACGCATGCGCCCCATAAACGTCTGCTGAGTGAACGAAAGCTCCCCATCCACAAGGGGACAGCT
CGGCGCTCCCACGCCATGTCCAGGTCGCATTCGACCAGCAGGACTTCCCTTAACGCGCTGCCGGAGTCCC
CAAGATCGCGCCCCTGCCAGGAGCGGAACTGTTTATTTCCGTCCGGCTGAAGAGGCGGGGTGGGGATGGC
ACAAGCCGATTGGTTACGCAAAATGTGGAACCAATTCAGGCCTATGATCCAGGAGACTACAAGTTCCAGA
ATGCATCCTTCCTCCAGCATAGGGACAGGCCGAGGCTGCGGGGGCGTTGCCTGCTGGGAATTGTAGTCTT
CATCTTGTTTGTTGCGCAGGAGGAACTGGAAGGAGGGAGTAAACTATTACCACGTGACGTTCGGGTCAGG
TGTTTGGGCCAGCCTCCGCACTCGAGCTTTGATTGGCTGACTCTAATAAGAAGACGCCACTAGGGGCGGG
GCGAAGAGGGGCGCAAGCTCATTGCGTTTTGAGTCTCGGGACCCCTGTTGGAGAGACTATGGCGCTCAAC
AAGAATCACTCGGAGGGCGGCGGAGTGATCGTCAATAACACCGAGAGGTGA
WBP2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
WBP2_1 ↗17:75,855,335負股75,855,325–75,855,384

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_9354WD · enhancer · 75853429–75853786 · regulatory

ENSR17_5MSPHL · CTCF_binding_site · 75853922–75853943 · regulatory

ENSR17_C9J86 · enhancer · 75854037–75855295 · regulatory

ENSR17_BK3GG · promoter · 75855296–75855910 · regulatory

ENSR17_5MSPTG · CTCF_binding_site · 75856047–75856068 · regulatory

ENSR17_8487TH · promoter · 75856497–75856724 · regulatory

ENSR17_BK3GZ · enhancer · 75858707–75859271 · regulatory

ENSR17_5MSQGS · CTCF_binding_site · 75859589–75859610 · regulatory

· motif · 75853924–75853940 · motif

· motif · 75855028–75855041 · motif

· motif · 75855335–75855346 · motif

· motif · 75855354–75855364 · motif

· motif · 75855438–75855447 · motif

· motif · 75855438–75855447 · motif

· motif · 75855516–75855526 · motif

· motif · 75855518–75855531 · motif

· motif · 75855645–75855655 · motif

· motif · 75855828–75855839 · motif

· motif · 75855828–75855839 · motif

· motif · 75856049–75856065 · motif

· motif · 75856217–75856230 · motif

· motif · 75856217–75856230 · motif

· motif · 75858410–75858422 · motif

· motif · 75858637–75858650 · motif

· motif · 75858857–75858870 · motif

· motif · 75858957–75858968 · motif

· motif · 75859591–75859607 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:261 aa

1 aa261 aa結構域功能區域基序
依 Q969T9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

WBP2 蛋白長 261 個胺基酸。其 N 端第 1–84 位含有 GRAM 結構域;第 196–261 位為註解的無序區域,其中第 196–200 位及第 248–252 位分別含有 PPxY motif。這些為序列特徵註解,來源未提供其結構解析細節。

結構域GRAM1–84 aa
功能區域Disordered196–261 aa
基序PPxY motif 1196–200 aa
基序PPxY motif 2248–252 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q969T9…

AlphaFold · Q969T9

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Nucleus

當 WBP2 被磷酸化時,可由細胞質轉位至細胞核;來源未提供其他定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 10 個夥伴 · 最多顯示 50 個
WBP-2WBP2BAG3CCT7EPN2HOMER3LGALS8MAGEA4SMAD5UBE2E3WWTR1YAP1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 10 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

WBP2 可結合 YAP1、WWP1 與 WWP2 的 WW domain;另有資料指出其與 NEDD4 互作,但此項為相似性推論。WBP2 也與 ESR1 及 UBE3A 互作。來源列出的是結合或互作關係,未指出這些蛋白共同形成特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

WBP2 條目列有常染色體隱性耳聾 107(DFNB107),屬非症候群型感音神經性聽力損失。來源描述此疾病可涉及內耳神經受體、通往腦部的神經路徑,或接收聲音資訊的腦區受損,並指出影響該條目所代表基因的變異可造成此病;未提供特定變異細節。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能荷爾蒙活化時,WBP2 可作為 estrogen receptor(ESR1)與 progesterone receptor(PGR)的轉錄共活化因子;有 estrogen 時會結合 ESR1 響應型啟動子,並與 YAP1 協同增強 PGR 活性。另依相似性推論,WBP2 可透過調節 ESR1、ESR2 與 PGR 影響突觸後支架蛋白的表現。含實驗來源
證據與來源

Acts as a transcriptional coactivator of estrogen and progesterone receptors (ESR1 and PGR) upon hormone activation. In presence of estrogen, binds to ESR1-responsive promoters. Synergizes with YAP1 to enhance PGR activity. Modulates expression of post-synaptic scaffolding proteins via regulation of ESR1, ESR2 and PGR (By similarity)

PMID 16772533 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用WBP2 可結合 YAP1、WWP1 與 WWP2 的 WW domain,也與 ESR1 及 UBE3A 互作。WBP2 與 NEDD4 的互作則標示為依相似性推論;來源未描述這些關係是否涉及同一複合體。含實驗來源
證據與來源

Binds to the WW domain of YAP1, WWP1 and WWP2. Interacts with NEDD4 (By similarity). Interacts with ESR1 and UBE3A

PMID 16772533 ↗ · PMID 21642474 ↗ · PMID 9169421 ↗ · PMID 9202023 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位WBP2 可位於細胞質與細胞核;當其被磷酸化時,會由細胞質轉位至細胞核。來源未補充此轉位的其他條件或不同異構型的定位差異。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Nucleus; Translocates from cytoplasm to nucleus when phosphorylated

PMID 21642474 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯WBP2 條目列有常染色體隱性耳聾 107(DFNB107),一種非症候群型感音神經性聽力損失。疾病可涉及內耳神經受體、通往腦部的神經路徑或接收聲音資訊的腦區受損;來源指出,影響該條目所代表基因的變異會造成此病。含實驗來源
證據與來源

Deafness, autosomal recessive, 107 DFNB107 A form of non-syndromic sensorineural hearing loss. Sensorineural deafness results from damage to the neural receptors of the inner ear, the nerve pathways to the brain, or the area of the brain that receives sound information. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617639

PMID 26881968 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000254806 · 1,859 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATTGCGTTTTGAGTCTCGGGACCCCTGTTGGAGAGACTAT40
41GGCGCTCAACAAGAATCACTCGGAGGGCGGCGGAGTGATC80
81GTCAATAACACCGAGAGCATCCTAATGTCCTATGATCACG120
121TGGAACTCACATTCAATGACATGAAGAACGTGCCAGAAGC160
161CTTCAAAGGGACCAAGAAAGGCACTGTCTACCTTACCCCT200
201TACCGGGTCATCTTTCTGTCCAAGGGCAAGGATGCCATGC240
241AGTCCTTCATGATGCCATTTTATCTCATGAAAGACTGTGA280
281GATCAAGCAGCCCGTATTTGGTGCAAACTACATCAAGGGA320
321ACAGTGAAGGCGGAAGCGGGAGGTGGCTGGGAAGGCTCTG360
361CTTCCTACAAGTTGACTTTCACGGCAGGGGGCGCCATTGA400
401GTTCGGACAGCGGATGCTCCAGGTGGCATCTCAAGCCTCC440
441AGAGGTGAAGTCCCCAGTGGAGCCTATGGCTACTCTTACA480
481TGCCCAGCGGGGCCTATGTCTATCCCCCGCCAGTCGCCAA520
521TGGAATGTACCCCTGCCCTCCTGGCTACCCCTATCCACCG560
561CCCCCACCTGAGTTCTATCCAGGACCCCCCATGATGGACG600
601GGGCCATGGGATACGTGCAGCCCCCACCACCGCCCTACCC640
641TGGGCCCATGGAACCTCCGGTCAGCGGCCCCGATGTCCCC680
681TCCACTCCTGCAGCCGAAGCCAAGGCCGCAGAAGCAGCCG720
721CCAGCGCCTATTACAACCCAGGCAATCCTCACAACGTCTA760
761CATGCCCACGAGCCAGCCGCCGCCACCTCCCTACTACCCA800
801CCGGAAGATAAGAAGACCCAGTAGGCCCTCCTGCCTCCCT840
841GCCTCCCACCCTCATCTCTCTACCCTACCCCTCCCATCGG880
881GGCTGTGCTGGGGCTTGGGGAGGGGAGGGGGCGCCTTGTT920
921CTCCCTCCAGGTCTGATCATAAACAATTACCAGGAACTAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。