基因總覽
WBP1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 WW domain binding protein 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2p13.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000233615 ★ | 74,458,438–74,460,881 | 4 |
| ENST00000393972 | 74,458,400–74,461,077 | 5 |
| ENST00000409737 | 74,458,400–74,461,077 | 4 |
| ENST00000891907 | 74,458,400–74,461,077 | 5 |
| ENST00000891908 | 74,458,400–74,461,077 | 3 |
| ENST00000926553 | 74,458,400–74,461,077 | 6 |
| ENST00000926554 | 74,458,400–74,461,077 | 3 |
| ENST00000926555 | 74,458,400–74,461,077 | 4 |
| ENST00000926556 | 74,458,400–74,461,077 | 3 |
| ENST00000926557 | 74,458,400–74,461,077 | 4 |
| ENST00001104922 | 74,458,400–74,461,077 | 3 |
| ENST00001104923 | 74,458,400–74,461,077 | 2 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>WBP1 ENST00000233615 GRCh38 chr2:74457438-74458538 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCGCGAGGAGCGGGCGCGGAAGCGGCGGCTCCAGGCGGCGCGGCGGGCAGAAGAGCACAAGAACCAGACT ATCGAGCGCCTCACCAAGACTGCGGCGACCAGTGGGCGGGGAGGCCGGGGGGGCGCACGGGGCGAGCGGC GGGGAGGGCGGGCTGCGGCTCCGGCCCCCATGGTGCGCTACTGCAGCGGAGCACAGGGTTCCACCCTTTC CTTCCCACCTGGCGTCCCCGCCCCCACGGCAGTGTCTCAGCGGCCATCCCCCTCAGGCCCGCCGCCGCGC TGCTCTGTCCCCGGCTGTCCCCATCCGCGCCGCTACGCTTGCTCCCGCACAGGCCAGGCACTCTGTAGTC TTCAGTGCTACCGCATCAACCTGCAGATGCGGCTGGGGGGGCCCGAGGGTCCTGGATCCCCCCTTTTGGC TACGTAAGGCCCTTAACCCGGACTCTGCGCCCCGTCCCATGCCCGCTCTTGAGTATCTTCCCCACCCTAT TAAATTACATCCGGTGCTTCGGCTTGTACAGAACTGGGGGAGTGGGATGTTGTGGGCAGACCAGTCTCCG GTATACACGTATTTTGCCCCTGTCGGAGCTTGCGTCGATGCCTGGGGCTTGGAAACCACCGCAAAAAACC AGGCTGCAAACCAGCGGACCGACTTTTGGGACTCCGCCTCTTCCAGCCGGGATTACCTGGCGTGCTTCGG CCTTTGGCGTCATTCCGAAAACATACCGCAAGCCAATCAGCGGCAACCTTGCTCTTCGGGGCGGCTGTTC GTTGGTTGATATGCCAGAGCCTGTTCTGTTGTCTGTATTGGCTATTGCCGCTGTCAGTCAGGGCCGTGGG TCGAACCTTCACCTACTCTTTGTCTGTACAAGCTCTTGTTGTCTGGGTGAGCGGCGGAGGCGCTGCTGTG GATTGGTCACAGGGAGAAACCTCTGATCTGTTCCTATTGGCCCGTCCGTCAAGGGACGATGATGATTGGT AGGGCAGAGCAATCTGAGTCCTAGTTGGTGGAGTTCTGCCCGGATGGAAGCTCCGGCCGCGGAGTGATGG TGGCCTCAGCGAAGATGGGCCGGGCAGGGACCATGGCGGTGGCAGCAGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WBP1_1 ↗ | 2:74,458,438 | 正股 | 74,458,389–74,458,448 |
| WBP1_2 ↗ | 2:74,459,105 | 正股 | 74,459,056–74,459,115 |
| WBP1_3 ↗ | 2:74,459,913 | 正股 | 74,459,864–74,459,923 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_BJQXS · promoter · 74454597–74455112 · regulatory
ENSR2_5MHT26 · CTCF_binding_site · 74457169–74457190 · regulatory
ENSR2_5MHT3H · CTCF_binding_site · 74457461–74457482 · regulatory
ENSR2_BJQZB · promoter · 74457910–74458479 · regulatory
· motif · 74454833–74454841 · motif
· motif · 74454979–74454995 · motif
· motif · 74454979–74454995 · motif
· motif · 74455008–74455019 · motif
· motif · 74455008–74455019 · motif
· motif · 74455010–74455019 · motif
· motif · 74455287–74455302 · motif
· motif · 74455287–74455302 · motif
· motif · 74457171–74457187 · motif
· motif · 74457450–74457461 · motif
· motif · 74457463–74457479 · motif
· motif · 74457583–74457598 · motif
· motif · 74457664–74457677 · motif
· motif · 74457933–74457942 · motif
· motif · 74457963–74457973 · motif
· motif · 74458160–74458168 · motif
· motif · 74458160–74458175 · motif
· motif · 74458279–74458292 · motif
· motif · 74458518–74458528 · motif
· motif · 74458720–74458740 · motif
· motif · 74459645–74459658 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：269 aa
WW domain binding protein 1 長 269 個胺基酸。蛋白質含有兩個 PPxY motif，分別位於第 124–127 與第 137–141 個胺基酸；第 169–203 與第 249–269 個胺基酸區段則註記為無序區域。
蛋白質三維結構
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- EPN2O95208-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMCO4Q9NRQ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WWOXQ9NZC7 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- YAP1P46937 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ZMYND10O75800 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
WW domain binding protein 1 可與 YAP1、WWP1 及 WWP2 的 WW domain 結合，也與 WWOX 互作。另有與 NEDD4 互作的註記，但此項證據為相似性推論（By similarity）。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | WW domain binding protein 1 可與 YAP1、WWP1 及 WWP2 的 WW domain 結合，並與 WWOX 互作；此外，資料亦註記其與 NEDD4 互作，但該項關係是依相似性推論，並非此處明確列出的實驗證據。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with NEDD4 (By similarity). Binds to the WW domain of YAP1, WWP1 and WWP2. Interacts with WWOX PMID 15064722 ↗ · PMID 9169421 ↗ · PMID 9202023 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTAGTTGGTGGAGTTCTGCCCGGATGGAAGCTCCGGCCGC40GGAGTGATGGTGGCCTCAGCGAAGATGGGCCGGGCAGGGA80CCATGGCGGTGGCAGCAGAGGTGGCAGGGGCGGGGCGGCT120GGCGGTAGAGGAGGCTGTGGTCCTCAGGGGGCTGTAGGTG160GAGGTATGGCTCGGGCCAGCAGCGGGAACGGCAGCGAGGA200GGCCTGGGGGGCACTTCGGGCGCCGCAACAGCAGCTTCGA240GAGCTGTGCCCAGGAGTGAACAACCAGCCCTACCTCTGTG280AGAGTGGTCACTGCTGCGGGGAGACTGGCTGCTGCACCTA320CTACTATGAGCTCTGGTGGTTCTGGCTGCTCTGGACTGTC360CTCATCCTCTTTAGCTGCTGTTGCGCCTTCCGCCACCGAC400GAGCTAAACTCAGGCTGCAACAACAGCAGCGGCAGCGTGA440AATCAACTTGTTGGCCTATCATGGGGCATGCCATGGGGCT480GGTCCTTTCCCTACCGGTTCACTGCTTGACCTTCGCTTCC520TCAGCACCTTCAAGCCCCCAGCCTACGAGGATGTGGTTCA560CCGCCCAGGCACACCACCCCCCCCTTATACTGTGGCCCCA600GGCCGCCCCTTGACTGCTTCCAGTGAACAAACCTGCTGTT640CCTCCTCATCCAGCTGCCCTGCCCACTTTGAAGGAACAAA680TGTGGAAGGTGTTTCCTCCCACCAGAGTGCCCCCCCTCAT720CAGGAGGGTGAGCCCGGGGCAGGGGTGACCCCTGCCTCCA760CACCCCCCTCCTGCCGCTATCGCCGTTTAACTGGCGACTC800CGGTATTGAGCTCTGCCCTTGTCCTGCCTCCGGTGAGGGT840GAGCCAGTCAAGGAGGTGAGGGTTAGTGCCACCCTGCCAG880ATCTGGAGGACTACTCCCCGTGTGCACTACCCCCAGAGTC920TGTACCGCAGATCTTTCCCATGGGGCTGTCTTCCAGTGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。