基因總覽
WASL 的正式名稱為 WASP like actin nucleation promoting factor，屬於蛋白質編碼基因。其產物為 505 個胺基酸的蛋白質，含有 WH1、CRIB 與兩個 WH2 結構域，並有數段被註記為無序的區域。這些結構特色與其可和多種蛋白質互作的性質相符。來源所述的角色涵蓋細胞質中的肌動蛋白調控，以及細胞核內的轉錄調節；具體作用方式與相關生物過程見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000223023 ★ | 123,681,943–123,749,003 | 11 |
| ENST00000924343 | 123,681,938–123,749,003 | 11 |
| ENST00000924344 | 123,681,943–123,749,003 | 10 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WASL 調節肌動蛋白聚合，方式之一是刺激 Arp2/3 complex 的肌動蛋白成核活性。這項作用與多種細胞過程相關，包括有絲分裂與胞質分裂；來源指出，WASL 是透過調節肌動蛋白聚合參與這些過程，但未進一步界定其在各過程中的具體步驟。
WASL 也與 CDC42 一同參與絲狀偽足的形成，並涉及這些細長、富含肌動蛋白的細胞表面突起之延伸與維持。這將其肌動蛋白調控功能連結至細胞形態相關的結構變化。
WASL 的功能不限於細胞質。在細胞核中，它也參與基因轉錄調節，可能是藉由促進核內肌動蛋白聚合而發揮作用；這項機制帶有推測性。另有相似性推論指出，WASL 可與 HSF1/HSTF1 結合，並在熱休克啟動子元件 HSE 上形成複合體，負向調節 HSP90 表現。
相似性推論亦指出 WASL 參與樹突棘形態發生。另在培養的腸上皮細胞中，以反義 RNA 降低 DNMBP 的量會改變頂端連接形態，使連接呈彎曲，而非接近線性的形狀；此觀察描述的是 DNMBP 降低後的結果，不能據此改寫為 WASL 的直接作用。
Promoter 與基因調控
>WASL ENST00000223023 GRCh38 chr7:123748903-123750003 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGACGTCTTAACATGAATTTACGCAACAAAAATATGTTTAATGTGGAGAACAGTGAGATGCATATTTGAT AATTCACTGCAGTCTGCATCATCATCTCTATATTCCAAAATTTCGTCTTAAGCCGTTTAGTATTTAACTT ACAGAAGAAAGGGGGTTATCTTAGATAACTTTTAATATCCTAAGGTATTTTCCAATTCACGATACAGGGA GAAAAGAAATGTGTCCAGGCCCTTAGAAGAAAATACTTTGAATTTAAATGTGACACATACATTAAACCCG CGTGACACGCCAGGCAGGCGGTGGAAGTCAAGTGCATTTGTTTTTGTTTCATCCACCAGGGCGATCTCTT TCACAATTCTGGGAGAGGCCTGTTTGTTCCTCCACTCCCACAGCTGAAGTTTGGGACAAAGTTTGAGAAA ATCCCAGGCACCTGCGGCTCCTATCGAAGCCGGCGAGGAGCACAGGGTAGAGCGTCTCTTCCCAGTTTTC AGTCTTCAGATCGCAGGCCTCTCGGACCCGCAGAGCGAGCTTCACGCTGCAGCGCTTGAGAAATAAGAGC TATTCCAAGGAGGGGCCCTGGGTCCTCACTGACGCTTCGCAAAGGTGTACGTCCGCCCAGGGAAGGCCGG CGGCGCAGCGACGGCGAGGAGTCCCCATCCATCTTCTCTTCAAGCAGCAGTAGCTGGGTTCGGGTACCCA ACCGACGAGCCGAGACGCCAGAGGCCAGAGTACGAAGTTGGAAGCCTGCGCCCCAAGCCAACCGGGATTC CACTTAGCTCCGCGCGGTCCGCGCCTCGGCCGGAAGGGGGCGTGGCTTCGGGCCCGCGCCGCGAGGCCCG CCGCCGAGTGGGGGGGTTTCTCCCGGGCCGCAGCCGCGCGTTTCCGGCGCGCTCCCCCGCGCCCTCCGTC CTGTGGTCTCGCCCGCCCCCGCTGCCATGTTGGATTGTGCGGCCGCCGCCGCCGCTGCGGGAGGGTTGGG GGAGGAGTTGGGAGTTTAGCGCAGTCGCCGGAGTGCGAGGACAACGACCATCCGGCCCTAGCCTGGCCGG GCGGGTGCCGGGAGCTTCCCTTTCTCAGCGCGGCGCGAAGGTGGCTCGCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WASL_1 ↗ | 7:123,749,001 | 負股 | 123,748,991–123,749,050 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR7_85M8BD · enhancer · 123746140–123746326 · regulatory
ENSR7_D85QS · enhancer · 123746706–123748992 · regulatory
ENSR7_5344TX5 · CTCF_binding_site · 123748792–123748813 · regulatory
ENSR7_85M8D3 · promoter · 123748993–123749239 · regulatory
ENSR7_5344TZX · CTCF_binding_site · 123749188–123749209 · regulatory
ENSR7_BWK4K · enhancer · 123749240–123749975 · regulatory
ENSR7_799GR7 · promoter · 123749976–123750098 · regulatory
ENSR7_93S57T · enhancer · 123751818–123752219 · regulatory
· motif · 123747053–123747064 · motif
· motif · 123747175–123747187 · motif
· motif · 123747598–123747609 · motif
· motif · 123747598–123747609 · motif
· motif · 123747684–123747692 · motif
· motif · 123747731–123747746 · motif
· motif · 123747749–123747759 · motif
· motif · 123747863–123747878 · motif
· motif · 123747962–123747972 · motif
· motif · 123747965–123747976 · motif
· motif · 123747975–123747986 · motif
· motif · 123748523–123748537 · motif
· motif · 123748541–123748555 · motif
· motif · 123748794–123748810 · motif
· motif · 123749016–123749026 · motif
· motif · 123749036–123749049 · motif
· motif · 123749069–123749082 · motif
· motif · 123749074–123749084 · motif
· motif · 123749085–123749100 · motif
· motif · 123749101–123749114 · motif
· motif · 123749116–123749125 · motif
· motif · 123749144–123749154 · motif
· motif · 123749146–123749156 · motif
· motif · 123749188–123749198 · motif
· motif · 123749190–123749206 · motif
· motif · 123749196–123749205 · motif
· motif · 123749262–123749276 · motif
· motif · 123749587–123749602 · motif
· motif · 123749588–123749602 · motif
· motif · 123749977–123749986 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：505 aa
WASL 蛋白長 505 個胺基酸，包含 WH1（第 34–141 位）、CRIB（第 203–216 位）及兩個 WH2 結構域（第 405–422 位與第 433–450 位）。另有四段區域被註記為無序，分別位於第 138–163、184–205、266–406 與 476–505 位；部分區段與結構域範圍相接或重疊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WASL 位於細胞質、細胞骨架相關區域及細胞核。 依相似性推論，磷酸化時較偏向細胞質，未磷酸化時較偏向細胞核；它也可透過依賴核輸出訊號（NES）的機制由細胞核輸出至細胞質。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 33 個夥伴
- ABI2Q9NYB9-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ARHGAP12Q8IWW6-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARPC3O15145 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ARPC4P59998 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDC42P60953 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CIB1Q99828 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- DNMBPQ6XZF7-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 13 experiments
- NCK1A0A0S2Z4D7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK1P16333 · UniProt INTERACTION · 5 experiments · 2 筆來源紀錄
- NCK2E7ERP6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- PACSIN2Q9UNF0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PACSIN3Q9UKS6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PAK4O96013 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- PTK6Q13882 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RHOJQ9H4E5 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- RNF8O76064 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- SNX9Q9Y5X1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SORBS2O94875-10 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SORBS3O60504-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIP10Q15642-2 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- UBASH3AP57075-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBASH3BQ8TF42 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
WASL 可結合 actin 與 Arp2/3 complex，並與 CDC42、GRB2、DNMBP、NONO 等蛋白質互作；來源亦列出多種其他互作對象。它與 NONO 的直接互作使 WASL 成為含 NONO 與 SFPQ 的多蛋白複合體成員。微生物感染情境下，WASL 與 Escherichia coli 效應蛋白 EspF(U) 形成含 BAIAP2L1 的複合體；也會與 Shigella flexneri 蛋白 IcsA 互作。IcsA 可提高 WASL 對 Arp2/3 的親和力，組成在肌動蛋白組裝上具最大活性的緊密複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WASL 透過刺激 Arp2/3 complex 的肌動蛋白成核活性調節肌動蛋白聚合，並藉此參與有絲分裂與胞質分裂；它也與 CDC42 一同促進絲狀偽足的延伸和維持。WASL 可能透過促進核內肌動蛋白聚合調節轉錄，並可與 HSF1/HSTF1 在 HSE 形成複合體，負向調節 HSP90 表現；另涉及樹突棘形態發生。 | 含實驗來源 | 證據與來源Regulates actin polymerization by stimulating the actin-nucleating activity of the Arp2/3 complex. Involved in various processes, such as mitosis and cytokinesis, via its role in the regulation of actin polymerization. Together with CDC42, involved in the extension and maintenance of the formation of thin, actin-rich surface projections called filopodia. In addition to its role in the cytoplasm, also plays a role in the nucleus by regulating gene transcription, probably by promoting nuclear actin polymerization. Binds to HSF1/HSTF1 and forms a complex on heat shock promoter elements (HSE) that negatively regulates HSP90 expression (By similarity). Plays a role in dendrite spine morphogenesis (By similarity). Decreasing levels of DNMBP (using antisense RNA) alters apical junction morphology in cultured enterocytes, junctions curve instead of being nearly linear PMID 16767080 ↗ · PMID 19366662 ↗ · PMID 19487689 ↗ · PMID 19767742 ↗ · PMID 22847007 ↗ · PMID 22921828 ↗ · PMID 9422512 ↗ |
| 交互作用 | WASL 結合 actin 與 Arp2/3 complex，並與 CDC42、FCHSD1、FCHSD2、GRB2、DNMBP、SNX9、PRPF40A/FBP11、PTK2/FAK1、PACSIN1–3、NOSTRIN、TNK2、SNX33 及 NONO 互作。WASL 與 NONO 直接結合，並透過 NONO 成為含 NONO 和 SFPQ 的多蛋白複合體成員。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds actin and the Arp2/3 complex. Interacts with CDC42. Interacts with FCHSD1 (By similarity). Interacts with FCHSD2. Binds to SH3 domains of GRB2. Interacts with the C-terminal SH3 domain of DNMBP. Interacts with SNX9 (By similarity). Interacts with the WW domains of PRPF40A/FBP11 (By similarity). Interacts with PTK2/FAK1 (By similarity). Interacts with PACSIN1, PACSIN2 and PACSIN3 (By similarity). Interacts with NOSTRIN. Binds to TNK2. Interacts with SNX33. Interacts with NONO (via second RRM domain); the interaction is direct. Component of a multiprotein complex with NONO and SFPQ; associates with the complex via direct interaction with NONO PMID 16234328 ↗ · PMID 16246732 ↗ · PMID 16257963 ↗ · PMID 16767080 ↗ · PMID 17015620 ↗ · PMID 19487689 ↗ · PMID 19767742 ↗ · PMID 22847007 ↗ · PMID 24332715 ↗ · PMID 29887380 ↗ · PMID 9422512 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，WASL 與 Escherichia coli 效應蛋白 EspF(U) 互作；另有研究在一個至少含 WASL、BAIAP2L1 與 EspF(U) 的複合體中辨識到 WASL。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with E.coli effector protein EspF(U). Identified in a complex containing at least WASL, BAIAP2L1 and E.coli EspF(U) PMID 19366662 ↗ · PMID 22921828 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，WASL 與 Shigella flexneri 蛋白 IcsA 互作。IcsA 會提高 WASL 對 Arp2/3 的親和力，促成緊密複合體形成；此複合體在肌動蛋白組裝上具有最大活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Shigella flexneri protein IcsA. The interaction with IcsA enhances the affinity of WASL for Arp2/3, thus assembling a tight complex which has maximal activity in actin assembly PMID 10491394 ↗ · PMID 9582270 ↗ |
| 細胞定位 | WASL 位於細胞質、細胞骨架相關區域及細胞核。依相似性推論，磷酸化的 WASL 較偏向細胞質，未磷酸化時較偏向細胞核；它也能透過依賴核輸出訊號（NES）的機制由細胞核輸出至細胞質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm, cytoskeleton; Nucleus; Cytoplasm; Preferentially localized in the cytoplasm when phosphorylated and in the nucleus when unphosphorylated (By similarity). Exported from the nucleus by an nuclear export signal (NES)-dependent mechanism to the cytoplasm (By similarity) PMID 9422512 ↗ · PMID 16767080 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCAGTCGCCGGAGTGCGAGGACAACGACCATCCGGCCCTA40GCCTGGCCGGGCGGGTGCCGGGAGCTTCCCTTTCTCAGCG80CGGCGCGAAGGTGGCTCGCCGTCAGCGCCTGCTTCCCTCG120ACCTCGTCCTCCTCCCCGCTCCGGAGGAGCTGCGAGATGT160GGCGCCTCTGACTCCACTTCTCCCCGCCCCTGTCACCGAG200AGGGGGAACGAGCTCTCGCCCACTCGCCGGAGGAGACGGC240CCTGGACTCCCAACCCCGCCGGCGAAACCATGAGCTCCGT280CCAGCAGCAGCCGCCGCCGCCGCGGAGGGTCACCAACGTG320GGGTCCCTGTTGCTCACCCCGCAGGAGAACGAGTCCCTCT360TCACTTTCCTCGGCAAGAAATGTGTGACTATGTCTTCAGC400AGTGGTGCAGTTATATGCAGCAGATCGGAACTGTATGTGG440TCAAAGAAGTGCAGTGGTGTTGCTTGTCTTGTTAAGGACA480ATCCACAGAGATCTTATTTTTTAAGAATATTTGACATTAA520GGATGGGAAACTATTGTGGGAACAAGAGCTATACAATAAC560TTTGTATATAATAGTCCTAGAGGATATTTTCATACCTTTG600CTGGAGATACTTGTCAAGTTGCTCTTAATTTTGCCAATGA640AGAAGAAGCAAAAAAATTTCGAAAAGCAGTTACAGACCTT680TTGGGCCGTCGACAAAGGAAATCTGAGAAAAGACGAGATC720CCCCAAATGGTCCTAATCTACCCATGGCTACAGTTGATAT760AAAAAATCCAGAAATCACAACAAATAGATTTTATGGTCCA800CAAGTCAACAACATCTCCCATACCAAAGAAAAGAAGAAGG840GAAAAGCTAAAAAGAAGAGATTAACCAAGGCAGATATAGG880AACACCAAGCAATTTCCAGCACATTGGACATGTTGGTTGG920GATCCAAATACAGGCTTTGATCTGAATAATTTGGATCCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。