基因總覽
WASF3 是蛋白質編碼基因,產物為 Actin-binding protein WASF3,屬於 SCAR/WAVE 家族。其蛋白質長 502 個胺基酸,包含 WH2 結構域,並具有多段被註解為無序的區域。這些基本特徵界定了 WASF3 的家族歸屬與蛋白質組成;其在細胞訊號與骨架調節中的作用,見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000335327 ★ | 26,557,683–26,688,948 | 10 |
| ENST00000887335 | 26,557,661–26,688,948 | 10 |
| ENST00000916504 | 26,557,661–26,688,948 | 10 |
| ENST00000361042 | 26,557,667–26,688,948 | 10 |
| ENST00000887336 | 26,557,667–26,688,948 | 11 |
| ENST00000887337 | 26,557,667–26,688,948 | 11 |
| ENST00000887338 | 26,557,667–26,688,948 | 9 |
| ENST00000887339 | 26,557,667–26,688,948 | 11 |
| ENST00000887340 | 26,557,667–26,688,948 | 8 |
| ENST00000887341 | 26,557,667–26,688,948 | 10 |
| ENST00000916503 | 26,557,667–26,688,948 | 9 |
| ENST00000916505 | 26,557,667–26,688,948 | 11 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WASF3 是訊號傳遞中的下游效應分子,參與將酪胺酸激酶受體與小型 GTPase 的訊號傳至 actin 細胞骨架。來源指出,這項訊號傳遞角色與細胞形態及細胞骨架組織的調節相關;WASF3 因此連結上游訊號與細胞骨架相關的細胞特徵。
在此功能脈絡中,WASF3 的作用涵蓋兩個層面:一方面承接來自酪胺酸激酶受體及小型 GTPase 的訊號,另一方面參與 actin 細胞骨架的組織調節。來源將其描述為調節細胞形態與細胞骨架組織所必需,但未進一步限定不同訊號來源各自對應的作用,也未提供更細部的分子步驟或特定細胞情境。
因此,WASF3 的已知功能重點在於訊號與細胞骨架調節之間的連結,以及其對細胞形態和骨架組織調控的必要性。現有資料支持這一整體功能描述,並未界定其作用在特定細胞類型或生物學條件下的差異。
Promoter 與基因調控
>WASF3 ENST00000335327 GRCh38 chr13:26556683-26557783 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TATTCATTTTTTCCAACTTTTAGTTGTCTCTAGCTAGATGTTGATCATTATTACACATCTGTAAAGAAAA GAGCAAACCAACTTGAATTAGTGTTTCTTGAACTATTCATTAGAATTTAAAATTTTTTCCTAAAAGTTTT TCAATTTAGTGATCCTATTGGTAAATAAAAAGAATAAAGGCATGCAAATTAAAATAAAGGTAACATTTCT ATTAGATGTTTTTAAACCCCTTTCCTTTGTGACCTAGCTTTTCTATCTTGGCTTTTCTATCTTTTCTTCT CTTCCTTTCCTTTCCTCCTTTCTTTTTCTTAAGTTTGTTTATGCCTCAGTCATCTGGTCGCACGTGGCTA TGTTCCACTGTGGCAGGGCTTAGCTGGCAGTTTCAGGGATATCTTAGTTTTAATAAGTATTGTGGATTTC CTCACATCTAGGGTGGAGAGAGATTGGTTATAGGGTGATAAAAACAGAAGAATCTGTGTTGAAGGAGATG GGAAGATTTTAAGAATGCTAACGAATTTGAGCAGGGCATAAAACCAACCCATGAACAGGGCTACAGTCCT CTCAGGGTTGCCTGAAGCCTCAGCCCTGGAGGACGTCTGACACCTTACAGGTAGAGGACCTCTGTGCAGG AGCCCTCAACACCCAGGGAGGATTAGGATATAAGCGCAAACTCAAAGGTACTGTAATGGGCACCTAGCAA TCAGAGGTGATACAAGGGTCTCTTGGCCCGAAGTATCCCCACCTCTCCTCGCTGGAAAGGACGCTGCCTA AGCCTCATCCCGAGCTGGGGGCGGAGGACCAAGGGTGAGAGCCACCGCCTCCGCAATCCCCCGCCCCTCG GCACCGTCGCTCAGCGCGCTCGCCGGCTCCCTATTGGCCGAGGCACTCGCCAATCCTGGTGAAGCGGCCC CGTGAGTTGGCCCTGGTTGGTGGAGCCGGCACTGAGCCCCCCTCCTGCTCCGGCCGAGCCCCCCCGCCGG GAGGGGGCGTGGCCGCGGCCGTGGACGGGCCGGAGGCGGCGTCGCTCGCGCCGCTGCGTGCGGTGTGGTG CGAGGCGGGTGCGCCGGGCGGCCGCGGCGCGGCGGGACCATGGAGCTCAGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WASF3_1 ↗ | 13:26,557,715 | 正股 | 26,557,666–26,557,725 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR13_B79B8 · promoter · 26557193–26557713 · regulatory
ENSR13_588MR6 · CTCF_binding_site · 26557655–26557676 · regulatory
ENSR13_B79BB · enhancer · 26557714–26558697 · regulatory
ENSR13_588MSM · CTCF_binding_site · 26557979–26558000 · regulatory
ENSR13_B79BT · enhancer · 26561584–26562423 · regulatory
ENSR13_73K6MR · enhancer · 26562589–26562701 · regulatory
· motif · 26557469–26557479 · motif
· motif · 26557510–26557520 · motif
· motif · 26557645–26557655 · motif
· motif · 26557657–26557673 · motif
· motif · 26557665–26557675 · motif
· motif · 26557981–26557997 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:502 aa
WASF3 蛋白質長 502 個胺基酸,屬於 SCAR/WAVE 家族。其第 440–457 位胺基酸區段註解為 WH2 結構域;第 169–210 位及第 223–443 位區段則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WASF3 被註記位於細胞質與細胞骨架。 來源未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SMAD4Q13485 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- ABI2Q9NYB9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BYSLQ13895 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CKS1BP61024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KANK2Q63ZY3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KIFC3Q9BVG8-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RASAL3Q86YV0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
WASF3 與 actin 及 Arp2/3 複合體結合。來源未進一步說明這些結合的條件或其與其他分子之間的功能關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WASF3 是下游效應分子,參與將酪胺酸激酶受體與小型 GTPase 傳出的訊號傳至 actin 細胞骨架;此功能對調節細胞形態與細胞骨架組織是必要的。 | 含實驗來源 | 證據與來源Downstream effector molecules involved in the transmission of signals from tyrosine kinase receptors and small GTPases to the actin cytoskeleton. Required for regulation of cell morphology and cytoskeletal organization PMID 17623672 ↗ · PMID 21834987 ↗ |
| 交互作用 | WASF3 與 actin 及 Arp2/3 複合體結合;來源未提供結合條件或進一步的互作細節。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | WASF3 的細胞內定位註記為細胞質與細胞骨架;來源未說明定位是否會隨條件而改變。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GTGGACGGGCCGGAGGCGGCGTCGCTCGCGCCGCTGCGTG40CGGTGTGGTGCGAGGCGGGTGCGCCGGGCGGCCGCGGCGC80GGCGGGACCATGGAGCTCAGAGCGCAGCCCCGGCGCCGGC120GGCGGGACCGCGGACCGTTTTAGTTTTGATTGCTGTTAAC160TACTACTGATAACTGAGCCAAAGTGGTGATGCTACTTGAG200GGGAATTTCTGCAACCCATAGTCAACGATTACATGATTGT240GAACCATGCCTTTAGTGAAGAGGAACATTGAGCCCCGGCA280CTTGTGCCGGGGAGCTCTGCCTGAAGGGATTACCAGCGAA320CTTGAATGTGTAACCAATAGTACTCTTGCCGCTATCATAC360GCCAGCTGAGCAGTCTGAGCAAACATGCTGAAGACATATT400TGGTGAGTTGTTTAATGAGGCTAACAACTTCTACATCAGA440GCAAATTCTCTTCAAGACAGAATTGATCGCCTTGCTGTCA480AAGTCACCCAGCTGGATTCAACAGTGGAAGAGGTCTCACT520ACAGGATATCAACATGAAAAAAGCTTTCAAAAGTTCCACA560GTCCAAGACCAGCAAGTGGTTTCAAAGAACAGCATTCCTA600ATCCTGTTGCTGATATTTACAACCAGAGTGATAAGCCACC640GCCTCTGAACATCCTGACACCATACAGAGATGACAAGAAG680GATGGGCTGAAGTTCTATACTGATCCTTCCTATTTCTTTG720ACCTCTGGAAAGAAAAAATGCTACAGGACACAGAAGACAA760AAGGAAAGAGAAAAGGCGTCAAAAGGAGCAAAAGCGTATA800GATGGCACCACCCGTGAGGTGAAAAAGGTTAGAAAAGCCA840GAAACAGGCGCCAGGAGTGGAATATGATGGCATATGACAA880AGAGCTTAGACCCGACAACAGGTTGTCTCAGAGTGTGTAC920CATGGAGCGTCTTCCGAGGGATCCCTGTCCCCAGATACTA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。