基因總覽
WAS 是位於 X 染色體的蛋白質編碼基因，產物為 WASP actin nucleation promoting factor。這種蛋白質與 Rho-type GTPases 的訊息作用相關，並能與 Arp2/3 complex 互動，是連結細胞訊息調節與 actin 結構變化的因子。其功能範圍不只涉及細胞質中的細胞骨架，也包括細胞核內的 actin 聚合；此外，來源指出它可能調節淋巴球與血小板功能。這些特性使 WASP actin nucleation promoting factor 同時與細胞形態相關的結構重組，以及細胞核內的生物學過程相連。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000376701 ★ | 48,683,799–48,691,427 | 12 |
| ENST00000906191 | 48,676,593–48,691,431 | 14 |
| ENST00000906193 | 48,676,593–48,691,431 | 14 |
| ENST00000450772 | 48,676,596–48,686,871 | 9 |
| ENST00000698625 | 48,676,598–48,691,431 | 13 |
| ENST00000906192 | 48,676,598–48,691,431 | 14 |
| ENST00000906194 | 48,676,598–48,691,431 | 14 |
| ENST00000906196 | 48,676,598–48,691,431 | 14 |
| ENST00000906195 | 48,676,609–48,691,431 | 13 |
| ENST00000906197 | 48,683,036–48,691,431 | 13 |
| ENST00000698635 | 48,683,781–48,691,408 | 12 |
| ENST00000698626 | 48,683,781–48,691,431 | 13 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
WASP actin nucleation promoting factor 是 Rho-type GTPases 的效應蛋白，透過與 Arp2/3 complex 互動調節 actin filament 重組，並有助於有效進行 actin 聚合。這項作用支持細胞骨架中 actin 結構的重新排列；來源也指出，該蛋白可能調節淋巴球與血小板功能，但並未進一步說明其作用方式或具體條件。
在病原性細菌感染時，WASP actin nucleation promoting factor 參與 actin filament 重組，並促成 actin pedestals 的形成。此處所述的細胞骨架改變與感染情境相連，反映其作用不只涉及一般的 actin 聚合，也與感染時局部 actin 結構的建立有關。
該蛋白的功能亦延伸至細胞核。在細胞核內，它可促進 actin 聚合，並因此參與基因轉錄調節及受損 DNA 的修復。DNA 損傷反應中，WASP actin nucleation promoting factor 促進同源重組（HR）修復；來源指出，核內 actin 聚合會帶動 DNA 雙股斷裂（DSBs）的移動，與此修復過程相關。由此可見，WASP actin nucleation promoting factor 的功能涵蓋細胞質細胞骨架重組、感染相關 actin 結構形成，以及細胞核內的轉錄調節和 DNA 修復。
Promoter 與基因調控
>WAS ENST00000376701 GRCh38 chrX:48682799-48683899 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCAGGAGAGTCACTTGAACCCGGGAGGCAAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGTGCCACCGCACTCCAGCC TGGCGACAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGTATGACAAGCAGAAAGTAATTT GGGAGCTGCGGGGAGGCAAGGGTAAGGGATGGGGAAGTGGACCAGAGGCATATGCGTCATTGGCAGTGTC TAAGCACTCACGATAGGCGTGGATCACAGGGGCTCGCTCTGTAATTAAAAGGAAAAGGGTTTTTGTTGTG TTGTTGTTGTTGCTGTTTTTGAGACAAGGGTCTTGCTCTGTCATCATCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCA GTCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGCAGCTA GGACTACAGGTGTGTGCCACCATGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTAGTGGAAATGGGGTTTTGCCATG TTGCCCAGGCTCGTCTTGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACTCGTCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT TACAGGTGTGAGCTATTGTCCCCAGCCAAAAGGAAAAGTTTTACTGTAGTAACCCTTCCGGACTAGGGAC CTCGGGCCTCAGCCTCAGGCTACCTAGGTGCTTTAGAAAGGAGGCCACCCAGGCCCATGACTACTCCTTG CCACAGGGAGCCCTGCACACAGATGTGCTAAGCTCTCGCTGCCAGCCAGAGGGAGGAGGGTCTGAGCCAG TCAGAAGGAGATGGGCCCCAGAGAGTAAGAAAGGGGGAGGAGGACCCAAGCTGATCCAAAAGGTGGGTCT AAGCAGTCAAGTGGAGGAGGGTTCCAATCTGATGGCGGAGGGCCCAAGCTCAGCCTAACGAGGAGGCCAG GCCCACCAAGGGGCCCCTGGAGGACTTGTTTCCCTTGTCCCTTGTGGTTTTTTGCATTTCCTGTTCCCTT GCTGCTCATTGCGGAAGTTCCTCTTCTTACCCTGCACCCAGAGCCTCGCCAGAGAAGACAAGGGCAGAAA GCACCATGAGTGGGGGCCCAATGGGAGGAAGGCCCGGGGGCCGAGGAGCAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WAS_2 ↗ | X:48,676,593 | 正股 | 48,676,544–48,676,603 |
| WAS_1 ↗ | X:48,683,818 | 正股 | 48,683,769–48,683,828 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_9PBPN · promoter · 48683407–48683838 · regulatory
· motif · 48683411–48683422 · motif
· motif · 48683743–48683758 · motif
· motif · 48683750–48683758 · motif
· motif · 48683763–48683772 · motif
· motif · 48683784–48683797 · motif
· motif · 48683786–48683797 · motif
· motif · 48683786–48683797 · motif
· motif · 48683793–48683806 · motif
· motif · 48683937–48683954 · motif
· motif · 48684026–48684039 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：502 aa
WASP actin nucleation promoting factor 長 502 個胺基酸。其註解包含 WH1 domain、CRIB domain 與 WH2 domain，另有兩個 GRSGPLPPXP motif。序列中標示兩段無序區域，分別位於胺基酸 146–240 與 307–502；這些區域註解描述序列特徵，來源未提供其個別作用細節。
蛋白質三維結構
細胞內定位
WASP actin nucleation promoting factor 位於細胞質的細胞骨架，也位於細胞核。 來源並未提供不同條件下定位改變的細節。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- ABI3Q9P2A4 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- APPBP2Q92624 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BTKQ06187 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CDC42P60953 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- CTTNQ14247 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HCKP08631 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- NCK2O43639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNX33Q8WV41 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SNX9Q9Y5X1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SORBS2O94875 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TOP1P11387 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBASH3AP57075-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WIPF1O43516 · UniProt INTERACTION · 25 experiments · 2 筆來源紀錄
- espF(U)P0DJ88 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HckP08103 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
WASP actin nucleation promoting factor 與 Arp2/3 complex 結合，並與 CDC42、RAC、NCK、HCK、FYN、FGR、BTK、ABL1、PSTPIP1、WIP 及 PLC-gamma 的 p85 subunit 有互作註解；另與 ALDOA 互作，且來源指出此互作涉及其 C 端。與 NCK1 的 SH3 domains 互作及與 FCHSD2 互作則標示為相似性推定。微生物感染時，它也與 E. coli effector protein EspF(U) 互作。
疾病與遺傳關聯
WAS 的基因變異與 Wiskott-Aldrich syndrome 相關；此病為 X 連鎖隱性免疫缺陷，特徵包括濕疹、血小板減少、反覆感染及血便，來源記載患者通常在十歲前死亡。WAS 變異也與 Thrombocytopenia 1 相關，該病涉及循環血液中的血小板數減少，可能增加出血風險並降低凝血能力。此外，WAS 變異與 X-linked severe congenital neutropenia 相關，其特徵包括顆粒球生成在早幼粒細胞階段成熟停滯、周邊血液絕對嗜中性球數低於 0.5 x 10(9)/l，以及早發嚴重細菌感染。這些資料描述疾病與基因變異的關聯。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | WASP actin nucleation promoting factor 是 Rho-type GTPases 的效應蛋白，透過與 Arp2/3 complex 互動調節 actin filament 重組，並有助於有效的 actin 聚合。它可能調節淋巴球與血小板功能；病原性細菌感染時參與 actin filament 重組及 actin pedestals 形成。在細胞核中，它促進 actin 聚合，參與基因轉錄調節與受損 DNA 修復；DNA 損傷時也促進 HR 修復，並帶動 DSBs 移動。 | 含實驗來源 | 證據與來源Effector protein for Rho-type GTPases that regulates actin filament reorganization via its interaction with the Arp2/3 complex. Important for efficient actin polymerization. Possible regulator of lymphocyte and platelet function. Mediates actin filament reorganization and the formation of actin pedestals upon infection by pathogenic bacteria. In addition to its role in the cytoplasmic cytoskeleton, also promotes actin polymerization in the nucleus, thereby regulating gene transcription and repair of damaged DNA. Promotes homologous recombination (HR) repair in response to DNA damage by promoting nuclear actin polymerization, leading to drive motility of double-strand breaks (DSBs) PMID 12235133 ↗ · PMID 12769847 ↗ · PMID 16275905 ↗ · PMID 18650809 ↗ · PMID 20574068 ↗ · PMID 29925947 ↗ · PMID 8625410 ↗ · PMID 9405671 ↗ |
| 交互作用 | WASP actin nucleation promoting factor 與 Arp2/3 complex 結合，並與 CDC42、RAC、NCK、HCK、FYN、FGR、BTK、ABL1、PSTPIP1、WIP 及 PLC-gamma 的 p85 subunit 互作。它也透過 C 端與 ALDOA 互作；與 NCK1 的 SH3 domains 互作及與 FCHSD2 互作則是相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Binds the Arp2/3 complex. Interacts with CDC42, RAC, NCK, HCK, FYN, SRC kinase FGR, BTK, ABL1, PSTPIP1, WIP, and to the p85 subunit of PLC-gamma. Interacts (via C-terminus) with ALDOA. Interacts with NCK1 (via SH3 domains) (By similarity). Interacts with FCHSD2 (By similarity) PMID 10360578 ↗ · PMID 12235133 ↗ · PMID 12769847 ↗ · PMID 15235593 ↗ · PMID 16246732 ↗ · PMID 17329259 ↗ · PMID 8643625 ↗ · PMID 9405671 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，WASP actin nucleation promoting factor 與 E. coli effector protein EspF(U) 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | WASP actin nucleation promoting factor 的定位包括細胞質中的細胞骨架，以及細胞核。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | WAS 基因變異與 Wiskott-Aldrich syndrome 相關。此病為 X 連鎖隱性免疫缺陷，特徵包括濕疹、血小板減少、反覆感染與血便；來源記載患者通常在十歲前死亡。 | 含實驗來源 | 證據與來源Wiskott-Aldrich syndrome WAS An X-linked recessive immunodeficiency characterized by eczema, thrombocytopenia, recurrent infections, and bloody diarrhea. Death usually occurs before age 10. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 301000 PMID 10447259 ↗ · PMID 11793485 ↗ · PMID 20574068 ↗ · PMID 7753869 ↗ · PMID 8528198 ↗ · PMID 8528199 ↗ · PMID 8682510 ↗ · PMID 9098856 ↗ · PMID 9126958 ↗ · PMID 9445409 ↗ · PMID 9683546 ↗ · PMID 9713366 ↗ |
| 疾病關聯 | WAS 基因變異與 Thrombocytopenia 1 相關。此血液疾病的特徵是循環血液中的血小板數減少，可能造成出血風險增加及凝血能力降低。 | 含實驗來源 | 證據與來源Thrombocytopenia 1 THC1 A form of thrombocytopenia, a hematologic disorder defined by a decrease in the number of platelets in circulating blood, resulting in the potential for increased bleeding and decreased ability for clotting. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 313900 PMID 10447259 ↗ · PMID 11167787 ↗ · PMID 11877312 ↗ · PMID 7795648 ↗ · PMID 8528199 ↗ |
| 疾病關聯 | WAS 基因變異與 X-linked severe congenital neutropenia 相關。此造血疾病的特徵包括顆粒球生成在早幼粒細胞階段成熟停滯、周邊血液絕對嗜中性球數低於 0.5 x 10(9)/l，以及早發嚴重細菌感染。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neutropenia, severe congenital, X-linked XLN A disorder of hematopoiesis characterized by maturation arrest of granulopoiesis at the level of promyelocytes with peripheral blood absolute neutrophil counts below 0.5 x 10(9)/l and early onset of severe bacterial infections. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 300299 PMID 11242115 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTCTTCTTACCCTGCACCCAGAGCCTCGCCAGAGAAGACA40AGGGCAGAAAGCACCATGAGTGGGGGCCCAATGGGAGGAA80GGCCCGGGGGCCGAGGAGCACCAGCGGTTCAGCAGAACAT120ACCCTCCACCCTCCTCCAGGACCACGAGAACCAGCGACTC160TTTGAGATGCTTGGACGAAAATGCTTGACGCTGGCCACTG200CAGTTGTTCAGCTGTACCTGGCGCTGCCCCCTGGAGCTGA240GCACTGGACCAAGGAGCATTGTGGGGCTGTGTGCTTCGTG280AAGGATAACCCCCAGAAGTCCTACTTCATCCGCCTTTACG320GCCTTCAGGCTGGTCGGCTGCTCTGGGAACAGGAGCTGTA360CTCACAGCTTGTCTACTCCACCCCCACCCCCTTCTTCCAC400ACCTTCGCTGGAGATGACTGCCAAGCGGGGCTGAACTTTG440CAGACGAGGACGAGGCCCAGGCCTTCCGGGCCCTCGTGCA480GGAGAAGATACAAAAAAGGAATCAGAGGCAAAGTGGAGAC520AGACGCCAGCTACCCCCACCACCAACACCAGCCAATGAAG560AGAGAAGAGGAGGGCTCCCACCCCTGCCCCTGCATCCAGG600TGGAGACCAAGGAGGCCCTCCAGTGGGTCCGCTCTCCCTG640GGGCTGGCGACAGTGGACATCCAGAACCCTGACATCACGA680GTTCACGATACCGTGGGCTCCCAGCACCTGGACCTAGCCC720AGCTGATAAGAAACGCTCAGGGAAGAAGAAGATCAGCAAA760GCTGATATTGGTGCACCCAGTGGATTCAAGCATGTCAGCC800ACGTGGGGTGGGACCCCCAGAATGGATTTGACGTGAACAA840CCTCGACCCAGATCTGCGGAGTCTGTTCTCCAGGGCAGGA880ATCAGCGAGGCCCAGCTCACCGACGCCGAGACCTCTAAAC920TTATCTACGACTTCATTGAGGACCAGGGTGGGCTGGAGGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。