基因總覽
WARS1 是蛋白質編碼基因，其產物為 tryptophanyl-tRNA synthetase 1。這種酵素參與蛋白質合成所需的 tRNA(Trp) 充電反應，將 tryptophan 接合至相應的 tRNA。來源也分別記載其具有或不具有血管生成抑制活性，因此這項作用在資料中並非一致描述；其條件與相關細胞反應見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000392882 ★ | 100,333,790–100,375,347 | 11 |
| ENST00000358655 | 100,333,782–100,376,335 | 10 |
| ENST00000355338 | 100,333,782–100,376,805 | 11 |
| ENST00000344102 | 100,333,782–100,375,608 | 10 |
| ENST00000557135 | 100,333,782–100,375,612 | 12 |
| ENST00000556645 | 100,333,782–100,376,251 | 11 |
| ENST00000883283 | 100,333,782–100,376,805 | 12 |
| ENST00000883284 | 100,333,782–100,376,805 | 11 |
| ENST00000883285 | 100,333,782–100,376,805 | 12 |
| ENST00000883286 | 100,333,782–100,376,805 | 13 |
| ENST00000883287 | 100,333,782–100,376,805 | 12 |
| ENST00000883288 | 100,333,782–100,376,805 | 12 |
顯示 12/81 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
tryptophanyl-tRNA synthetase 1 催化 tryptophan 與 tRNA(Trp) 的接合，反應分為兩步：先由 ATP 活化 tryptophan，形成 Trp-AMP；接著將 tryptophan 轉移至 tRNA(Trp) 的受體端。反應式的產物包括 L-tryptophyl-tRNA(Trp)、AMP、diphosphate 與 H⁺。這項酵素反應使 tRNA(Trp) 帶有其對應的胺基酸，來源並未進一步說明其在特定蛋白質合成情境中的作用差異。
來源對 WARS1 的血管生成抑制活性記載不一致：有資料指出它具有此活性，也有資料指出沒有。另有描述指出，具有血管生成抑制活性的形式不具 aminoacylation 活性；這項敘述將兩種功能分開，而非表示催化 tRNA(Trp) 充電的活性本身具有血管生成抑制作用。
在內皮細胞中，WARS1 被記載可抑制流體剪切力所活化的反應，並調節 ERK、Akt 與 eNOS 的活化路徑。這些路徑與血管生成、細胞骨架重組，以及對剪切力有反應的基因表現相關。現有資料指出這些關聯性，但未提供足以進一步界定各路徑變化方向或細胞反應細節的內容。
Promoter 與基因調控
>WARS1 ENST00000392882 GRCh38 chr14:100375247-100376347 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTTGTTCCGTCCGGACGGCGTTTCCACGGACGCCCAGGAGACAGCCGGTTGCTGAGCCGGGAGCGCTGA CTGGCCCGGCTGGGCAGGGTAAGCGAGGGGAGTAAGGCCGGGGCGGAGTGAGGAAACAAGGGAGGGAGTG ATGGAGGGACGCTGGCGCGGCGCCCAGTGGCCTGGCCCTCCCGGGAGTATCCTTAGAGCCCGGCTTGCTG CCCGCCGCGTTCTGGCACTGTGAGGCGCGGAGCCTGCCACCGACCCCTCGCCCCTTTCCTCTGAGCGCCG CCGACCCACCCCGTCTCCCTTTCCCACTGGCACCCTTCATCGTCTCCGCCTGTTCGCTTTTCCCGAGGAG AGAGGCCCCCATTTTTATTTAGCGCCTGCCATGTGCCAGAGGCTTTGCGTAGTGTTGCACTTAGTCCCCT CAACGGTAATGTTAGCAGGCTTCTCCATGCCCATTCCACAGATGAGGAAACCGAAGGGGAAGCAGAAAAG TAATGCGACCCTTGCCCAAGGTTTCGAATAAGTCCAAGCTGGGATTGAAACCCAGGCGTCTGTGACCCCA GAACTCCTGATCTTTCCACTGCACTGTGCCGCCTCGGTGAACAGATGCGGGGAATTTACAGTTTCTCTTT CCACCGCCCACGACTACACAAAATCAGTCACACTGACGCTGAGGGTGGGGAACGGGAAGAGGGTGGGGAG GTTATTTGGAGGCCAGCGGGGGGTGAGGGGTGGCTGATGCAATGACCAGCTAATGGCTCGATTCTCAAGA GGGTTTCATTGGTCTCAACCTGGCCCCCCAGGCAACCCACCCCTGATTGGACAGTCTCATCAAGAAGGTT GGTCAAGAGCTCAAGTGTTTCTGAGAATCTGGGTGATTTATAAGAAACCCTTAGCTGAATGCAGGGTGGG GAGAACGAAAGACAAAAGCATCTTTTTTCAGAAGGGAAACTGAAAGAAAGAGGGGAAGAGTATTAAAGAC CATTTCTGGCTGGGCAGGGCACTCTCAGCAGCTCAACTGCCCAGCGTGACCAGTGGCCACCTCTGCAGTG TCTTCCACAACCTGGGTATGTATTGCCATCTTTGCCAGGCTTAGAGCTTGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| WARS_1 ↗ | 14:100,375,347 | 負股 | 100,375,337–100,375,396 |
| WARS_2 ↗ | 14:100,375,475 | 負股 | 100,375,465–100,375,524 |
| WARS_3 ↗ | 14:100,375,616 | 負股 | 100,375,606–100,375,665 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_84XNC5 · enhancer · 100372712–100372948 · regulatory
ENSR14_93GSNC · enhancer · 100373673–100374042 · regulatory
ENSR14_93GSNP · enhancer · 100374949–100375336 · regulatory
ENSR14_BPWSX · promoter · 100375337–100376098 · regulatory
ENSR14_93GSP4 · promoter · 100376241–100376551 · regulatory
ENSR14_84XNFC · enhancer · 100376552–100376794 · regulatory
ENSR14_93GSP9 · promoter · 100376795–100377295 · regulatory
ENSR14_BPWT9 · enhancer · 100377576–100378296 · regulatory
ENSR14_5TLGKK · CTCF_binding_site · 100377902–100377923 · regulatory
ENSR14_5TLGL3 · CTCF_binding_site · 100378013–100378034 · regulatory
· motif · 100371171–100371186 · motif
· motif · 100373551–100373562 · motif
· motif · 100373793–100373804 · motif
· motif · 100373913–100373926 · motif
· motif · 100374421–100374434 · motif
· motif · 100374831–100374843 · motif
· motif · 100375643–100375658 · motif
· motif · 100375702–100375715 · motif
· motif · 100375787–100375799 · motif
· motif · 100375789–100375796 · motif
· motif · 100375984–100375994 · motif
· motif · 100376083–100376098 · motif
· motif · 100376344–100376353 · motif
· motif · 100376344–100376355 · motif
· motif · 100376344–100376355 · motif
· motif · 100376383–100376393 · motif
· motif · 100376488–100376497 · motif
· motif · 100376491–100376508 · motif
· motif · 100376604–100376613 · motif
· motif · 100376604–100376615 · motif
· motif · 100376604–100376617 · motif
· motif · 100376753–100376768 · motif
· motif · 100377904–100377920 · motif
· motif · 100378015–100378031 · motif
來源記載 WARS1 受 IFNG（IFN-gamma）調控，但未提供調控方向、作用條件或具體機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：471 aa
tryptophanyl-tRNA synthetase 1 長 471 個胺基酸，屬於 class-I aminoacyl-tRNA synthetase 家族。其序列含 WHEP-TRS 結構域（第 8–64 位）、第 59–79 位的無序區，以及 HIGH 區域（第 164–173 位）和 KMSKS 區域（第 349–353 位）兩個基序。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 tryptophanyl-tRNA synthetase 1 定位於細胞質，未提供定位隨條件改變或異構型差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- CDH5P33151 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TERF1P54274 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
tryptophanyl-tRNA synthetase 1 可形成同源二聚體，並與氧化型 GAPDH 互作。另有資料指出，GAPDH 會刺激 isoform 2 的 aminoacylation 活性；此功能影響不等同於來源已證明兩者形成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
WARS1 變異可能與常染色體顯性遺傳的 distal hereditary motor neuronopathy 9（HMND9）相關。此病通常於青少年期開始，特徵為下肢及上肢遠端肌肉逐漸無力與萎縮；來源描述其可由影響該基因的變異造成。
WARS1 變異也可能與常染色體隱性遺傳的 neurodevelopmental disorder with microcephaly and speech delay, with or without brain abnormalities（NEDMSBA）相關。此病自嬰兒早期出現，可有整體發展遲緩、行走延遲或缺失、智能發展受損、語言能力不佳或缺失，以及出生後進行性小頭症；其他表現與腦部異常並非每位患者皆相同。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 10 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | tryptophanyl-tRNA synthetase 1 以兩步反應將 tryptophan 接至 tRNA(Trp)：先由 ATP 活化 tryptophan，形成 Trp-AMP，再將其轉移到 tRNA(Trp) 的受體端。 | 含實驗來源 | 證據與來源Catalyzes the attachment of tryptophan to tRNA(Trp) in a two-step reaction: tryptophan is first activated by ATP to form Trp-AMP and then transferred to the acceptor end of the tRNA(Trp) PMID 1373391 ↗ · PMID 1761529 ↗ · PMID 28369220 ↗ |
| 功能 | 此項功能註記指出，該蛋白質不具有血管生成抑制活性；來源未提供此判斷所適用的其他條件或情境。 | 含實驗來源 | |
| 功能 | 此項註記描述具有血管生成抑制活性的形式不具 aminoacylation 活性，並可抑制流體剪切力活化的內皮細胞反應；它也調節與血管生成、細胞骨架重組及剪切力反應性基因表現相關的 ERK、Akt、eNOS 活化路徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Possesses an angiostatic activity but has no aminoacylation activity. Inhibits fluid shear stress-activated responses of endothelial cells. Regulates ERK, Akt, and eNOS activation pathways that are associated with angiogenesis, cytoskeletal reorganization and shear stress-responsive gene expression PMID 11773625 ↗ · PMID 11773626 ↗ · PMID 14630953 ↗ |
| 功能 | 此項功能註記指出該蛋白質具有血管生成抑制活性；來源未在此筆敘述中提供作用條件或進一步機制。 | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | tRNA(Trp) + L-tryptophan + ATP = L-tryptophyl-tRNA(Trp) + AMP + diphosphate + H(+) | 含實驗來源 | 證據與來源tRNA(Trp) + L-tryptophan + ATP = L-tryptophyl-tRNA(Trp) + AMP + diphosphate + H(+) PMID 1761529 ↗ · PMID 28369220 ↗ |
| 交互作用 | tryptophanyl-tRNA synthetase 1 可形成同源二聚體，並與氧化型 GAPDH 互作；GAPDH 會刺激 isoform 2 的 aminoacylation 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with an oxidized form of GAPDH. GAPDH stimulates the aminoacylation activity of isoform 2 PMID 15628863 ↗ · PMID 28369220 ↗ |
| 細胞定位 | tryptophanyl-tRNA synthetase 1 的定位為細胞質。 | 推論支持 | |
| 調控 | By IFNG/IFN-gamma | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 WARS1 的變異可能與常染色體顯性遺傳的 distal hereditary motor neuronopathy 9 有關。此病通常於青少年期發病，造成下肢及上肢遠端肌肉緩慢進行性無力與萎縮；其疾病群以運動神經元退化為特徵，通常沒有臨床感覺喪失。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neuronopathy, distal hereditary motor, autosomal dominant 9 HMND9 A form of distal hereditary motor neuronopathy, a heterogeneous group of neuromuscular disorders caused by selective degeneration of motor neurons in the anterior horn of the spinal cord, without sensory deficit in the posterior horn. The overall clinical picture consists of a classical distal muscular atrophy syndrome in the legs without clinical sensory loss. The disease starts with weakness and wasting of distal muscles of the anterior tibial and peroneal compartments of the legs. Later on, weakness and atrophy may expand to the proximal muscles of the lower limbs and/or to the distal upper limbs. HMND9 is characterized by juvenile onset of slowly progressive distal muscle weakness and atrophy affecting both the lower and upper limbs. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617721 PMID 28369220 ↗ · PMID 31069783 ↗ · PMID 31321409 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 WARS1 的變異可能與常染色體隱性遺傳的 neurodevelopmental disorder with microcephaly and speech delay 有關。此病自嬰兒早期出現，可有發展遲緩、行走延遲或缺失、智能發展受損、語言障礙及出生後進行性小頭症；視覺、癲癇、肌張力、聽力與腦部異常等表現則不一。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neurodevelopmental disorder with microcephaly and speech delay, with or without brain abnormalities NEDMSBA An autosomal recessive disorder apparent from early infancy and characterized by global developmental delay, delayed or absent walking, impaired intellectual development, poor or absent speech, and postnatal progressive microcephaly. Additional variable features include cortical visual impairment, seizures, hypotonia, spasticity, and sensorineural deafness. Brain anomalies including myelination defects, cortical atrophy, or thin corpus callosum are present in most patients. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 620317 PMID 34585293 ↗ · PMID 35790048 ↗ · PMID 35815345 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACTCTCAGCAGCTCAACTGCCCAGCGTGACCAGTGGCCAC40CTCTGCAGTGTCTTCCACAACCTGGTCTTGACTCGTCTGC80TGAACAAATCCTCTGACCTCAGGCCGGCTGTGAACGTAGT120TCCTGAGAGATAGCAAACATGCCCAACAGTGAGCCCGCAT160CTCTGCTGGAGCTGTTCAACAGCATCGCCACACAAGGGGA200GCTCGTAAGGTCCCTCAAAGCGGGAAATGCGTCAAAGGAT240GAAATTGATTCTGCAGTAAAGATGTTGGTGTCATTAAAAA280TGAGCTACAAAGCTGCCGCGGGGGAGGATTACAAGGCTGA320CTGTCCTCCAGGGAACCCAGCACCTACCAGTAATCATGGC360CCAGATGCCACAGAAGCTGAAGAGGATTTTGTGGACCCAT400GGACAGTACAGACAAGCAGTGCAAAAGGCATAGACTACGA440TAAGCTCATTGTTCGGTTTGGAAGTAGTAAAATTGACAAA480GAGCTAATAAACCGAATAGAGAGAGCCACCGGCCAAAGAC520CACACCACTTCCTGCGCAGAGGCATCTTCTTCTCACACAG560AGATATGAATCAGGTTCTTGATGCCTATGAAAATAAGAAG600CCATTTTATCTGTACACGGGCCGGGGCCCCTCTTCTGAAG640CAATGCATGTAGGTCACCTCATTCCATTTATTTTCACAAA680GTGGCTCCAGGATGTATTTAACGTGCCCTTGGTCATCCAG720ATGACGGATGACGAGAAGTATCTGTGGAAGGACCTGACCC760TGGACCAGGCCTATAGCTATGCTGTGGAGAATGCCAAGGA800CATCATCGCCTGTGGCTTTGACATCAACAAGACTTTCATA840TTCTCTGACCTGGACTACATGGGGATGAGCTCAGGTTTCT880ACAAAAATGTGGTGAAGATTCAAAAGCATGTTACCTTCAA920CCAAGTGAAAGGCATTTTCGGCTTCACTGACAGCGACTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。