基因總覽
VWF 是人類的蛋白質編碼基因,產物為 von Willebrand factor。此蛋白質以多聚體形式存在,具有多個不同類型的結構域,包括 VWFD、TIL、VWFA、VWFC 與 CTCK。其序列也包含與血小板 glycoprotein Ib 及膠原蛋白結合相關的區域,構成其參與止血的分子基礎。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000261405 ★ | 5,948,877–6,124,670 | 52 |
| ENST00000895679 | 5,948,877–6,124,678 | 53 |
| ENST00000895680 | 5,948,877–6,124,678 | 27 |
| ENST00001139594 | 5,948,877–6,124,678 | 52 |
| ENST00001002509 | 6,057,609–6,124,678 | 14 |
| ENST00001108887 | 6,094,880–6,124,678 | 6 |
| ENST00001114699 | 6,094,880–6,124,678 | 7 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
von Willebrand factor 是止血過程中的重要因子,可促進血管受傷處的血小板黏附。血管損傷後,它在血管內皮下的膠原基質與血小板表面的 GPIb-IX-V 受體複合體之間形成分子橋,使血小板得以附著於損傷部位。這種連接作用有助於血小板聚集於受傷處,是止血反應的一環。
此外,von Willebrand factor 也作為凝血因子 VIII 的伴護蛋白。它將凝血因子 VIII 帶往損傷位置,並穩定其異二聚體結構,同時避免凝血因子 VIII 過早從血漿中清除。這些作用共同支持凝血因子 VIII 在受傷處發揮作用。
因此,von Willebrand factor 同時參與血小板對血管損傷的黏附,以及凝血因子 VIII 的運送與維持;兩者都是其維持止血功能的重要面向。
Promoter 與基因調控
>VWF ENST00000261405 GRCh38 chr12:6124570-6125670 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GTGCCATTTTTCTTCCTTGGGAGTGTGCATCTTCCTCTCCTGGGGCGGTAAAGGGAGTAGCAGAGTGCGA GGTATGTGGGAAGGGAGGAGGTTGGAACCTAGTGGTTTCTCAAAGTCTTAGGGCAGGAGGTATCATGGAG AAGCAGTGAGGAGGTCTTCCATACCCAGACATGCCTCAGGGTGCTTGTCTCAGTGCCTGGAATCCCAGCA CGAGAGTCATCTTCCCCCCACCGCTGCCCATTGCATCAGTTACTTATTTTAGTAGGAATTAGTTTAGCAG ATGGTGTTGAGAATTAGGCTTTTGGGAATGGGAGGCTGGGAAGAAGAATTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTAAGATCAGGGTACCAGAAGTGGGTGGAAATGTCCTTGAGAATTAGAATTA TTAGAATGTAGCAACAGTAGAAGTATTAGACTCAAACCATCACTCCCCACCTTCACCATTTTACAAAGGC TTAGGCTTGTGGCCAAGACCTTCATCTTTAGCCGATCCATTCAACCCTGGCCAGGATCCAAATGGACTGT TTTTGTCAGGGCCAGGACCGGATCCTTCATACCTGGGGTGCATAGGAAGTGTTAGTACTCCCCTTCCTCC AAACACAGCAGCAAAATTGGCTCAGGTTGAGGTGTTTTTCTCAACTTCCCTGGAGTCCAGCCCTGGAAGC TGGATCAGGAAGCTGTGTTGTTCTACTGTGATTCCCCCTGGCCTGTATCAGCTTGCCCTGAAACAACCAG CATTCCTGGTTATCCCACACAGGTGGGGCACTCTAGGAAGACCAGGGATCAAGTGTGGGGGTGTAGGGAT AGGGGGTGTTTGGGGAGGGCAAGGCAGTTAATTAAGGCAGCTGCCAGGAGGTCTCCCTCCAAACTCTACA AAGCTTTATCAGCTTGGAGGTACTTCTAATACCATTTCCTTTCATTGTTTCCTTTTGGTAATTAAAAGGA GGCCAATCCCCTGTTGTGGCAGCTCACAGCTATTGTGGTGGGAAAGGGAGGGTGGTTGGTGGATGTCACA GCTTGGGCTTTATCTCCCCCAGCAGTGGGGACTCCACAGCCCCTGGGCTAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VWF_1 ↗ | 12:6,124,670 | 負股 | 6,124,660–6,124,719 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_94FM5 · enhancer · 6124368–6124659 · regulatory
ENSR12_94FM8 · promoter · 6124660–6125157 · regulatory
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:2813 aa
von Willebrand factor 長 2813 個胺基酸,含有訊號序列,以及多個 VWFD、TIL、VWFA、VWFC 結構域與 C 端 CTCK 結構域。VWFA 1 區域標註有血小板 glycoprotein Ib 結合位點;VWFA 3 則是 I 型與 III 型膠原蛋白的主要結合位點。另有細胞附著位點基序。
蛋白質三維結構
細胞內定位
von Willebrand factor 可被分泌至細胞外空間與細胞外基質,也定位於儲存顆粒。 來源未提供不同異構型或定位變化條件的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- ADAMTS13Q76LX8 · UniProt INTERACTION · 19 experiments
- F8P00451 · UniProt INTERACTION · 2 experiments · 2 筆來源紀錄
- GP1BAP07359 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ASCL4Q6XD76 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EGFL8Q99944 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LIAT1Q6ZQX7-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TP53BP1Q12888 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
von Willebrand factor 以多聚體形式存在,並與 F8 互作。來源未進一步界定此互作是否代表特定複合體,也未提供其他互作關係。
疾病與遺傳關聯
VWF 變異與 von Willebrand disease 相關。第 1 型的特徵是循環中的 von Willebrand factor 部分定量缺乏,但蛋白質結構與功能仍正常;患者可有黏膜皮膚出血及手術或創傷後出血延長。第 2 型屬定性缺陷,伴隨功能異常,分為 2A、2B、2M 與 2N;前三型的突變蛋白血小板依賴功能受損,2N 型則是結合凝血因子 VIII 的能力受損。第 3 型患者血漿及細胞區室中的 von Willebrand factor 全無或近乎全無,並有顯著的血漿凝血因子 VIII 缺乏;出血通常始於嬰兒期,可包括關節出血。這些疾病條目均記載為受影響基因的變異所致。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | von Willebrand factor 有助於維持止血,會在血管受傷處連接內皮下膠原基質與血小板表面的 GPIb-IX-V 受體複合體,促進血小板黏附。它也作為凝血因子 VIII 的伴護蛋白,將其帶至損傷處、穩定其異二聚體結構,並避免其過早從血漿清除。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Important in the maintenance of hemostasis, it promotes adhesion of platelets to the sites of vascular injury by forming a molecular bridge between sub-endothelial collagen matrix and platelet-surface receptor complex GPIb-IX-V. Also acts as a chaperone for coagulation factor VIII, delivering it to the site of injury, stabilizing its heterodimeric structure and protecting it from premature clearance from plasma |
| 交互作用 | von Willebrand factor 以多聚體形式存在,並與 F8 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | von Willebrand factor 可被分泌,並出現在細胞外空間、細胞外基質及儲存顆粒。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted; Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Localized to storage granules PMID 10961880 ↗ |
| 疾病關聯 | von Willebrand disease 1 是常見的出血性疾病,與 von Willebrand factor 缺陷及血小板聚集受損有關。其特徵為循環中的 von Willebrand factor 部分定量缺乏,但蛋白質結構與功能仍正常;臨床表現可包括鼻出血、月經過多等黏膜皮膚出血,以及手術或創傷後出血延長。此病記載為受影響基因的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源von Willebrand disease 1 VWD1 A common hemorrhagic disorder due to defects in von Willebrand factor protein and resulting in impaired platelet aggregation. Von Willebrand disease type 1 is characterized by partial quantitative deficiency of circulating von Willebrand factor, that is otherwise structurally and functionally normal. Clinical manifestations are mucocutaneous bleeding, such as epistaxis and menorrhagia, and prolonged bleeding after surgery or trauma. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 193400 PMID 10887119 ↗ · PMID 11698279 ↗ |
| 疾病關聯 | von Willebrand disease 2 是與 von Willebrand factor 缺陷及血小板聚集改變相關的出血性疾病,具有定性缺乏與功能異常,分為 2A、2B、2M 及 2N(Normandy variant)。2A、2B、2M 型突變蛋白的血小板依賴功能受損;2N 型則是結合凝血因子 VIII 的能力受損。臨床可有黏膜皮膚出血,以及手術或創傷後出血延長;此病記載為受影響基因的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源von Willebrand disease 2 VWD2 A hemorrhagic disorder due to defects in von Willebrand factor protein and resulting in altered platelet aggregation. Von Willebrand disease type 2 is characterized by qualitative deficiency and functional anomalies of von Willebrand factor. It is divided in different subtypes including 2A, 2B, 2M and 2N (Normandy variant). The mutant VWF protein in types 2A, 2B and 2M are defective in their platelet-dependent function, whereas the mutant protein in type 2N is defective in its ability to bind factor VIII. Clinical manifestations are mucocutaneous bleeding, such as epistaxis and menorrhagia, and prolonged bleeding after surgery or trauma. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 613554 PMID 12406074 ↗ · PMID 1409710 ↗ · PMID 1419803 ↗ · PMID 1419804 ↗ · PMID 1420817 ↗ · PMID 1429668 ↗ · PMID 1672694 ↗ · PMID 1673047 ↗ · PMID 1729889 ↗ · PMID 1761120 ↗ · PMID 1832934 ↗ · PMID 1906179 ↗ · PMID 2010538 ↗ · PMID 2011604 ↗ · PMID 21592258 ↗ · PMID 2786201 ↗ · PMID 7620154 ↗ · PMID 7734373 ↗ · PMID 7789955 ↗ · PMID 8011991 ↗ · PMID 8123843 ↗ · PMID 8123844 ↗ · PMID 8338947 ↗ · PMID 8348943 ↗ · PMID 8376405 ↗ · PMID 8435341 ↗ · PMID 8486782 ↗ · PMID 8547152 ↗ · PMID 8622978 ↗ |
| 疾病關聯 | von Willebrand disease 3 是嚴重出血性疾病,患者血漿及細胞區室中的 von Willebrand factor 全無或近乎全無,並因此伴有顯著的血漿凝血因子 VIII 缺乏。出血通常始於嬰兒期,可包括鼻出血、反覆黏膜皮膚出血、輕微創傷後大量出血及關節出血。此病記載為受影響基因的變異所致。 | 含實驗來源 | 證據與來源von Willebrand disease 3 VWD3 A severe hemorrhagic disorder due to a total or near total absence of von Willebrand factor in the plasma and cellular compartments, also leading to a profound deficiency of plasmatic factor VIII. Bleeding usually starts in infancy and can include epistaxis, recurrent mucocutaneous bleeding, excessive bleeding after minor trauma, and hemarthroses. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 277480 PMID 10887119 ↗ · PMID 17190853 ↗ · PMID 7989040 ↗ · PMID 8088787 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGCTCACAGCTATTGTGGTGGGAAAGGGAGGGTGGTTGGT40GGATGTCACAGCTTGGGCTTTATCTCCCCCAGCAGTGGGG80ACTCCACAGCCCCTGGGCTACATAACAGCAAGACAGTCCG120GAGCTGTAGCAGACCTGATTGAGCCTTTGCAGCAGCTGAG160AGCATGGCCTAGGGTGGGCGGCACCATTGTCCAGCAGCTG200AGTTTCCCAGGGACCTTGGAGATAGCCGCAGCCCTCATTT240GCAGGGGAAGATGATTCCTGCCAGATTTGCCGGGGTGCTG280CTTGCTCTGGCCCTCATTTTGCCAGGGACCCTTTGTGCAG320AAGGAACTCGCGGCAGGTCATCCACGGCCCGATGCAGCCT360TTTCGGAAGTGACTTCGTCAACACCTTTGATGGGAGCATG400TACAGCTTTGCGGGATACTGCAGTTACCTCCTGGCAGGGG440GCTGCCAGAAACGCTCCTTCTCGATTATTGGGGACTTCCA480GAATGGCAAGAGAGTGAGCCTCTCCGTGTATCTTGGGGAA520TTTTTTGACATCCATTTGTTTGTCAATGGTACCGTGACAC560AGGGGGACCAAAGAGTCTCCATGCCCTATGCCTCCAAAGG600GCTGTATCTAGAAACTGAGGCTGGGTACTACAAGCTGTCC640GGTGAGGCCTATGGCTTTGTGGCCAGGATCGATGGCAGCG680GCAACTTTCAAGTCCTGCTGTCAGACAGATACTTCAACAA720GACCTGCGGGCTGTGTGGCAACTTTAACATCTTTGCTGAA760GATGACTTTATGACCCAAGAAGGGACCTTGACCTCGGACC800CTTATGACTTTGCCAACTCATGGGCTCTGAGCAGTGGAGA840ACAGTGGTGTGAACGGGCATCTCCTCCCAGCAGCTCATGC880AACATCTCCTCTGGGGAAATGCAGAAGGGCCTGTGGGAGC920AGTGCCAGCTTCTGAAGAGCACCTCGGTGTTTGCCCGCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。