基因總覽
VWA7 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 von Willebrand factor A domain containing 7。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375688 ★ | 31,765,590–31,777,328 | 17 |
| ENST00000999130 | 31,771,262–31,777,328 | 8 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>VWA7 ENST00000375688 GRCh38 chr6:31777228-31778328 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCTAGAACCAGGCATCCTATCTCCCAGCCAGACCCTTCGTACCCCACCCAGCTGCCCAAAATGTGGAAAC CTGCATGCCTGGGGCTGGGCTTGGGGTCCACATGTAGTCGGGGAGCCCTGGGCCTCCCACCACTTACTTT CAAGCCTACTGGGCTGACCCTGGAAGGCCAGTCTTGTTTGTCCCCTGCCTCCTGGGTTCCGCCAGAGAGA AGCAGTGGAGTAAACTGCACAGACACAGAGAAAACCAGTCATGGAGGCCAAGAGCTAGAGAGCCTTGAGT GGACGTGGTTAATCTCACTTGGTTCTCCCAAGAGCCCTGGGAGGGGGGCAATATCATCATCATCATCTGA CAAATGAAGTGACCGGCCTGGGAGACTGTGCTCTCCTGCTTAGGTGGGGACACTGAATGGGGAACACGTA GGCTCTGAGGTTCCTTTGTTCTTGGGGACTCACCACTTGGTGGAAAAAGGCAAGACCCAAGAGGTGGTGG TGGAAGTGGGGGTGCTGGTGGGAATGGGTGGGGAGCCAGGCCAGCCAGGTTCACGCCTCCTCTGAGCTAC TGACCTCCCATGGTCCTCGCTCATCTTTCCAACTTTGTTGTCCTGGGTGTTTGGGGGTCTCTTCACTTGG ACCTGGGTCCTCACCCACCCCCTGGTTCCACTCCAGCTCCAACAGACAGAAGCAGAGCTCAGGAAGGTGG ATGAGGCCATCGCCCTATTCCAGAAGATGCTGTGATCCACCACCCAGCTTCACCCCTCACCCCCAGCGGC TCACCATGGGGATGGCAGCAATAAAATATTTTCCCACAAAATCCTCTTGTCGTCTGTGGTGGGGGCAGAG AGGGGAGCAGAGGGGCTGGGTGCCTGAATCCTTGGGGGCTGCAGGGTGGGAGTGAGGCCCTGGTTCTGGA GGGCAGAGGGGTGCGTCTATCTGGGTCTGTCCCTGGCACTGTGCCAGGCCTGAGTCACGCTGCTTACTCC CTTCCTCCTCCCCAGCTCTCACTCACCTCCGCACTGCAGCCAAGGGAGGCCCGCCCTGGCGTGGGCTGCT GCCTGTGGCTTTGGGCAGGCAGGAGCGAAAGGGCCAGGGGTTGCCTGTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR6_59GR3B · CTCF_binding_site · 31773013–31773034 · regulatory
ENSR6_59GRGC · CTCF_binding_site · 31775396–31775417 · regulatory
ENSR6_9GLJW · promoter · 31777318–31777818 · regulatory
· motif · 31772955–31772968 · motif
· motif · 31773015–31773031 · motif
· motif · 31773049–31773064 · motif
· motif · 31775398–31775414 · motif
· motif · 31776543–31776554 · motif
· motif · 31777144–31777157 · motif
· motif · 31777144–31777157 · motif
· motif · 31777268–31777283 · motif
· motif · 31777280–31777293 · motif
· motif · 31777314–31777327 · motif
· motif · 31777361–31777369 · motif
· motif · 31777449–31777462 · motif
· motif · 31777497–31777512 · motif
· motif · 31777518–31777529 · motif
· motif · 31777566–31777579 · motif
· motif · 31777862–31777873 · motif
· motif · 31778469–31778483 · motif
· motif · 31778469–31778484 · motif
· motif · 31778469–31778484 · motif
· motif · 31781384–31781399 · motif
· motif · 31781716–31781731 · motif
· motif · 31781767–31781782 · motif
· motif · 31781768–31781781 · motif
· motif · 31781773–31781785 · motif
· motif · 31781775–31781788 · motif
· motif · 31781780–31781792 · motif
· motif · 31781782–31781789 · motif
· motif · 31781782–31781795 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:891 aa
VWA7 的蛋白質長度為 891 個胺基酸。其 N 端第 1–28 位胺基酸為訊號肽;第 237–272 位胺基酸區段註解為無序區域,另在第 313–506 位胺基酸包含 VWFA 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
VWA7 的定位註解為分泌至細胞外。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTCACCTCCGCACTGCAGCCAAGGGAGGCCCGCCCTGGC40GTGGGCTGCTGCCTGTGGCTTTGGGCAGGCAGGAGCGAAA80GGGCCAGGGGTTGCCTGTCCTCCCCCACCCTGTTGAGGCC120TTCCTCCCCCTCTGCTGAGCCTCGGTTAATTATAACTCTG160ACCTAAGTGCCCTGTGACGTCAAGCCCGGGCCAGCCCTGC200CCAGGAGACCCAGCAACCAGGTCCATGTCTCAGCCATGCT240CCCCACGGAGGTCCCCCAATCCCACCCGGGCCCCTCAGCG280TTGCTTCTGCTGCAGCTGTTGCTGCCCCCCACATCTGCCT320TCTTCCCCAACATCTGGAGCCTGCTGGCTGCCCCTGGCTC360CATCACCCACCAAGACCTAACTGAGGAGGCAGCGCTCAAC400GTCACCCTGCAGCTCTTCCTGGAGCAGCCACCCCCAGGCC440GCCCCCCTCTTCGTCTTGAGGACTTCCTGGGTCGAACACT480CCTTGCTGATGACCTCTTTGCCGCCTACTTTGGACCTGGT520TCTTCTCGGCGGTTCCGAGCAGCCTTAGGTGAGGTGTCTC560GTGCCAATGCAGCCCAGGACTTCCTGCCAACTTCCAGGAA600TGACCCCGACCTGCACTTTGATGCTGAGCGACTGGGTCAG640GGACGCGCGCGCCTGGTAGGGGCTCTGCGGGAGACCGTGG680TGGCAGCCAGGGCCCTTGACCACACCCTGGCTCGCCAGCG720CCTCGGGGCTGCACTTCATGCCCTGCAGGATTTCTACAGT760CATAGCAACTGGGTGGAGCTGGGCGAGCAGCAGCCACACC800CTCACCTCCTCTGGCCAAGGCAGGAGCTCCAGAACCTGGC840ACAAGTGGCCGATCCTACCTGCTCCGATTGCGAGGAGTTG880AGCTGCCCCAGGAATTGGCTGGGCTTCACACTCCTCACCT920CTGGCTACTTTGGAACTCATCCCCCGAAACCTCCAGGGAA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。