演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
基因索引
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Human Gene Atlas›VTRNA1-2
HUMAN NON-CODING RNA GENE

VTRNA1-2hvg-2

vault RNA 1-2

VTRNA1-2 的基因身分與分類資料已收錄，功能註解尚待補充。

Homo sapiens5q31.3
OFFICIAL SYMBOL
VTRNA1-2
CHROMOSOME
5
RNA TYPE
vault_RNA
TRANSCRIPTS
1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

VTRNA1-2 是人類非蛋白質編碼 RNA 基因，正式名稱為 vault RNA 1-2。登錄類型為 RNA, vault。此基因座位於 5q31.3。

Official symbol
VTRNA1-2
Gene name
vault RNA 1-2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Non-coding RNA
HGNC ID
HGNC:12655
RNA type
RNA, vault
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
hvg-2HVG2VR2VAULTRC2

異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 55q31.3
chr5 · 181,538,259 bp · GRCh38chr5p15.33 · 1–4400000 · gnegchr5p15.32 · 4400001–6300000 · gpos25chr5p15.31 · 6300001–9900000 · gnegchr5p15.2 · 9900001–15000000 · gpos50chr5p15.1 · 15000001–18400000 · gnegchr5p14.3 · 18400001–23300000 · gpos100chr5p14.2 · 23300001–24600000 · gnegchr5p14.1 · 24600001–28900000 · gpos100chr5p13.3 · 28900001–33800000 · gnegchr5p13.2 · 33800001–38400000 · gpos25chr5p13.1 · 38400001–42500000 · gnegchr5p12 · 42500001–46100000 · gpos50chr5p11 · 46100001–48800000 · acenchr5q11.1 · 48800001–51400000 · acenchr5q11.2 · 51400001–59600000 · gnegchr5q12.1 · 59600001–63600000 · gpos75chr5q12.2 · 63600001–63900000 · gnegchr5q12.3 · 63900001–67400000 · gpos75chr5q13.1 · 67400001–69100000 · gnegchr5q13.2 · 69100001–74000000 · gpos50chr5q13.3 · 74000001–77600000 · gnegchr5q14.1 · 77600001–82100000 · gpos50chr5q14.2 · 82100001–83500000 · gnegchr5q14.3 · 83500001–93000000 · gpos100chr5q15 · 93000001–98900000 · gnegchr5q21.1 · 98900001–103400000 · gpos100chr5q21.2 · 103400001–105100000 · gnegchr5q21.3 · 105100001–110200000 · gpos100chr5q22.1 · 110200001–112200000 · gnegchr5q22.2 · 112200001–113800000 · gpos50chr5q22.3 · 113800001–115900000 · gnegchr5q23.1 · 115900001–122100000 · gpos100chr5q23.2 · 122100001–127900000 · gnegchr5q23.3 · 127900001–131200000 · gpos100chr5q31.1 · 131200001–136900000 · gnegchr5q31.2 · 136900001–140100000 · gpos25chr5q31.3 · 140100001–145100000 · gnegchr5q32 · 145100001–150400000 · gpos75chr5q33.1 · 150400001–153300000 · gnegchr5q33.2 · 153300001–156300000 · gpos50chr5q33.3 · 156300001–160500000 · gnegchr5q34 · 160500001–169000000 · gpos100chr5q35.1 · 169000001–173300000 · gnegchr5q35.2 · 173300001–177100000 · gpos25chr5q35.3 · 177100001–181538259 · gnegVTRNA1-2pq1 bp181,538,259 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr5:140,718,925–140,719,013
Gene span
89 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000365241 ★140,718,925–140,719,0131

顯示 1/1 個RNA轉錄本；canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用；有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準：負數為上游、正數為下游，包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 140718925 · 正股
查看轉錄本與 TSS ↗
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>VTRNA1-2 ENST00000365241 GRCh38 chr5:140717925-140719025 strand=1 5′→3′
相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter
CTTGGCCACATAGGAAGACTCCGTCTCCGACAACAACAACAAAAAAGGCTGGGCCCGATGGCTGAAGCCT
GTAATCCCAGCCATTTGGAAGGCCAAGTCAAGTGGATCACTTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGTC
CAAAATGGTGAAACCTCGCCTCTATTAAAAAATACAGAAATTAGATGGGTGTGGTGGCGCGTGCCTGTAG
TCTCAGCTACTTGGGAGGGAGAGGCATGAGAATCACTTCAACCCGGGAGGCGGAGGCTGCAGTGAGCTGA
GGTGGTACCACTGCAGTCCAGCTTGGGCAACAGAGTGGAGACTCCATCTCAAAAAAATAAATAAATAAAA
TAAATAAATAAATGAAAAGAAAAGAAAAAACATTAGTTAGGCATGGTGGCCTATGCCTGTAGTCCTAGCC
ACTCGCGAGGCTAAGAGGGGCGTATGGGTTAAGCCTAGATGGGGCCATTGCACTCCAGACTGGGTGACAG
AGGGAGAGTCTGTCTCTAACAAAAAAAATTTAAAAAGCATAACAGGAAGTTTCACCTGGGCCGGGGTTGG
AAGGTTTATCTAGTTTAGCAGCGAAGTTCTAAGATAAGGTCTGAAATACAATTTACACCTTGTAAAGACG
CCACTCCCCTGGCCCAAGCACTAGTTGTAAAAGTCGATTTGATCACAAAGTGACCCTGCGTGGTTGTTTT
GGGAGCGCAGTGGCTGAAGGCGAAGGAGGTGGGGGTGTGTCGAGACTTGTGGACCAGGTGACTGCTGAGA
AGGAGAAAATAAGCCAGGTACACAACTGCGGAAGAGCTCTCCAGGGTTAGGGGAAGGCTGTGTCCTTGTC
ACTGCTGTGTGTCCCTGGCTGTACACTCCAATTGTCTGGAGGCGGTGGCGTGTTGGACAGTCCTGGTTGC
TGAGTCATGCTAAAACACTGTTGTTTTGACTCACTTTGTGACGTAGGTCTTTCTCACCAGTCAAGAAAAT
ATAATCCGGAGATAGCCTCTGGGCTGGCTTTAGCTCAGCGGTTACTTCGAGTACATTGTAACCACCTCTC
TGGGTGGTTCGAGACCCGCGGGTGCTTTCCAGCTCTTTTACTGCTGAAGTT
VTRNA1-2 位於正股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。

EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控／motif 註解

ENSR5_CHZ2B · enhancer · 140718237–140719659 · regulatory

ENSR5_CHZ2F · enhancer · 140719830–140720866 · regulatory

ENSR5_5384N28 · CTCF_binding_site · 140720372–140720393 · regulatory

· motif · 140714383–140714398 · motif

· motif · 140714385–140714400 · motif

· motif · 140714385–140714400 · motif

· motif · 140716980–140716993 · motif

· motif · 140716980–140716993 · motif

· motif · 140718808–140718819 · motif

· motif · 140718834–140718842 · motif

· motif · 140719344–140719355 · motif

· motif · 140719387–140719398 · motif

· motif · 140720173–140720182 · motif

· motif · 140720173–140720182 · motif

· motif · 140720374–140720390 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / RNA TRANSCRIPTS

RNA 轉錄本與序列

Non-coding RNA

VTRNA1-2 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000365241 ★vault_RNA89 nt1

拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。

0 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000365241 · 89 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1GGGCTGGCTTTAGCTCAGCGGTTACTTCGAGTACATTGTA40
41ACCACCTCTCTGGGTGGTTCGAGACCCGCGGGTGCTTTCC80
81AGCTCTTTT89

cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。

13 / DATA PROVENANCE

資料來源與研究連結

HGNC ↗NCBI Gene ↗Ensembl ↗EPDnewNC v001 · UCSC ↗RNAcentral ↗

HGNC · CC0 ↗ · Ensembl · 資料使用說明 ↗ · EPD team／SIB · CC BY 4.0 ↗ · NCBI／RefSeq · 資料政策與免責聲明 ↗

資料更新：2026-11-06