基因總覽
VTN 是蛋白質編碼基因，產物 vitronectin 存在於血清與組織中，屬於細胞黏附與細胞展開因子。其蛋白質長 478 個胺基酸，具有 SMB 結構域、細胞附著位點及多個 hemopexin 重複序列；另有肝素結合區域與序列註解為無序的區段。來源也將 Somatomedin-B 描述為依賴生長激素的血清因子，具有蛋白酶抑制活性。這些特徵概述了 vitronectin 的基本性質；其分子作用與生物學功能另見下節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000226218 ★ | 28,367,284–28,370,307 | 8 |
| ENST00000886528 | 28,366,414–28,372,494 | 7 |
| ENST00000886529 | 28,366,414–28,371,463 | 9 |
| ENST00000886530 | 28,366,414–28,371,170 | 9 |
| ENST00000886531 | 28,366,414–28,372,494 | 8 |
| ENST00000886532 | 28,366,414–28,372,494 | 8 |
| ENST00000886533 | 28,366,414–28,372,494 | 7 |
| ENST00000886534 | 28,366,414–28,372,494 | 7 |
| ENST00000886535 | 28,366,414–28,372,494 | 8 |
| ENST00000886536 | 28,366,414–28,372,494 | 8 |
| ENST00000886537 | 28,366,414–28,372,494 | 7 |
| ENST00000954238 | 28,366,414–28,371,353 | 9 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
vitronectin 是血清與組織中的細胞黏附及展開因子。它可與 glycosaminoglycans 和 proteoglycans 互作，並受到部分 integrin 家族成員辨識，因此能作為細胞與基質之間的黏附分子。這些描述指出，vitronectin 可透過與細胞表面辨識分子及基質成分的關聯，參與細胞附著與展開；來源未進一步限定涉及的 integrin 成員或具體作用條件。
除細胞黏附相關功能外，vitronectin 也能抑制終末細胞溶解補體路徑造成的膜損傷效應。來源將此功能描述為對該路徑膜損傷作用的抑制，但未提供更詳細的分子機制或實驗條件，因此不延伸推定其作用步驟。
來源另指出，Somatomedin-B 是依賴生長激素的血清因子，具有蛋白酶抑制活性。這項描述提供了 vitronectin 相關功能的另一面向，但未說明其所抑制的蛋白酶種類或具體調控過程。綜合而言，現有資料支持 vitronectin 參與細胞對基質的黏附與展開、抑制補體終末路徑的膜損傷效應，並具有與蛋白酶抑制相關的功能描述；各作用的細節仍以來源所述範圍為限。
Promoter 與基因調控
>VTN ENST00000226218 GRCh38 chr17:28370207-28371307 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAATCATCATAACTCTTAAGGCCCTTTTATGGCTGTTTCTTAGCGAAACCTCACAACATGCCTATGGGG TGGGAATTGATGTTCCATTCCACAGCTGACTCCACTGAAGCCCATGAGGAAGAAATTGGCCCAAATCACA GTCCCCTCTGATTACAGAACAGAAAAAGTCAGCTAAAATCTCAGGATCACTTTTTTCAGGTGATGGGAGG ATTTCAGAAGTTCTGTGGACACCTGAAATTGGGCACAAAATCAGGTGTTTCATGCCAGTGGGCATTTTCC AGGTAGAGGGATCATATTTCTCTCGAGAGTCTAAAAGTGTGTTGAACAAGCCCACTCTTTACAGATGGGG AGACTGAGCCTGGGGACAGGGAGTGGCCTGCTCAGAAAAGACTCAGAAATTAAATCCAGTCCAGTGGGTT GATATTTACCCAAATTTCCAGCCTGGGGAGATTGATGCACCCAAGAGAAGAACCCAGAAATGAAACTTTG TTCTTTTATGCTAAAAAATAAAATTCCCCAGAGTGCTTACAATCTCTCCTCCCACTCCCTTTTTCCTGCC CTAAATAAATAATGGCGAATGAGCACCCAGCCAGGGATGTGTCTGATCAAACAATCATGGATCAATAGCT ATGTTTGGAGAAGGAATTTGTGGCTGCTCCAGCTACTGGGCATTTTGTCTGGTCCAGTTCATGTAATCTC CCAACACCCCATGAAGCAAGGCTTTGTTAATCCTATTTTACTGAAAATGAACTAAGACTCAGAGAGATAA AGCTGTTGCCCAATGAGCCTTCTTTCTGCCCTCCAGATCCACGGTGCTAATTCCCCTTCCGATGACCTAA TGATTCTGAGCTTGGCAAAGGTCTTATCTCCCAGCTCGCCCAGGCCCAGTGTTCCAGGAATGTGACCTTT GCTGCAGCAGCCGCTGGAGGGGGCAGAGGGGATGGGCTGGAGGTTGAGCAAACAGAGCAGCAGAAAAGGC AGTTCCTCTTCTCCAGTGCCCTCCTTCCCTGTCTCTGCCTCTCCCTCCCTTCCTCAGGCATCAGAGCGGA GACTTCAGGGAGACCAGAGCCCAGCTTGCCAGGCACTGAGCTAGAAGCCCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VTN_1 ↗ | 17:28,370,268 | 負股 | 28,370,258–28,370,317 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_8SHZZ · enhancer · 28366717–28366896 · regulatory
ENSR17_58N6J4 · CTCF_binding_site · 28369878–28369899 · regulatory
ENSR17_9F933 · promoter · 28370297–28370797 · regulatory
ENSR17_9F93B · promoter · 28371204–28371704 · regulatory
ENSR17_58N6WG · CTCF_binding_site · 28372125–28372146 · regulatory
ENSR17_9F942 · enhancer · 28373654–28374060 · regulatory
· motif · 28368241–28368254 · motif
· motif · 28368250–28368260 · motif
· motif · 28368252–28368262 · motif
· motif · 28368260–28368270 · motif
· motif · 28368288–28368298 · motif
· motif · 28368322–28368337 · motif
· motif · 28368404–28368419 · motif
· motif · 28368769–28368782 · motif
· motif · 28369114–28369129 · motif
· motif · 28369728–28369740 · motif
· motif · 28369730–28369737 · motif
· motif · 28369730–28369743 · motif
· motif · 28369735–28369747 · motif
· motif · 28369737–28369744 · motif
· motif · 28369880–28369896 · motif
· motif · 28370366–28370379 · motif
· motif · 28370404–28370413 · motif
· motif · 28370728–28370738 · motif
· motif · 28370973–28370983 · motif
· motif · 28371487–28371500 · motif
· motif · 28371544–28371557 · motif
· motif · 28371544–28371557 · motif
· motif · 28371622–28371635 · motif
· motif · 28371622–28371635 · motif
· motif · 28372077–28372087 · motif
· motif · 28372127–28372143 · motif
· motif · 28372398–28372408 · motif
· motif · 28372453–28372469 · motif
· motif · 28372453–28372469 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：478 aa
vitronectin 長 478 個胺基酸，具有位於第 20–63 位的 SMB 結構域，以及第 64–66 位的細胞附著位點。蛋白質還含有 hemopexin 1–4 重複序列，其中 hemopexin 2 位於第 203–250 位；第 362–395 位註解為肝素結合區。第 91–158 位及第 364–398 位被註解為無序區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
vitronectin 為分泌蛋白，位於細胞外空間。 在 P. falciparum 感染的紅血球中，感染早期滋養體階段可偵測到 VTN 內化；裂殖體階段 VTN 與 SERA5 共定位， merozoite 表面則與 SERA5 P47 共定位。 這些定位變化是在感染情境下描述的。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
未繪示構造：Parasitophorous vacuole。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 16 個夥伴
- C1QBPQ07021 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GOPCQ9HD26 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- SERPINE1P05121 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SNTG1Q9NSN8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- gapAP75358 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- gpmIP75167 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ldhP78007 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- lphA0A024A2C9 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- pdhAP75390 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- pdhBP75391 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- pykP78031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- tktP75611 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- Q4KTX9Q4KTX9 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
vitronectin 與 SERPINE1/PAI1、insulin 及 C1QBP 有互作記錄。它存在兩種形式：單鏈 75 kDa 的 V75，以及由 65 kDa 與 10 kDa 兩條鏈組成、以雙硫鍵連接的 V65+V10。感染情境下，VTN 透過 hemopexin repeat 2 與 P. falciparum 的 SERA5 P47 C 端互作；兩者可能形成由兩組異源二聚體構成的異源四聚體。此互作可能保護 merozoites 免於宿主單核球吞噬；VTN 糖基化似乎不是互作所必需。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | vitronectin 存在於血清與組織，是促進細胞黏附及展開的因子；它可與 glycosaminoglycans 和 proteoglycans 互作，並受到部分 integrin 家族成員辨識，因而能作為細胞與基質之間的黏附分子。此外，它可抑制終末細胞溶解補體路徑造成的膜損傷效應。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Vitronectin is a cell adhesion and spreading factor found in serum and tissues. Vitronectin interact with glycosaminoglycans and proteoglycans. Is recognized by certain members of the integrin family and serves as a cell-to-substrate adhesion molecule. Inhibitor of the membrane-damaging effect of the terminal cytolytic complement pathway |
| 功能 | Somatomedin-B 是一種依賴生長激素的血清因子，具有蛋白酶抑制活性；來源未進一步指出其抑制的蛋白酶種類或具體作用條件。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Somatomedin-B is a growth hormone-dependent serum factor with protease-inhibiting activity |
| 交互作用 | vitronectin 有兩種形式：單鏈的 75 kDa V75，以及經切割後由 65 kDa 與 10 kDa 兩條鏈組成的 V65+V10，兩鏈以雙硫鍵連接。另有資料記載 vitronectin 與 SERPINE1/PAI1、insulin 及 C1QBP 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Exists in two forms: a single chain 75 kDa form (V75) and a clipped form composed of two chains (65 kDa and 10 kDa) (V65+V10) which are held together by a disulfide bond. Interacts with SERPINE1/PAI1, insulin and C1QBP PMID 12808446 ↗ · PMID 1704366 ↗ · PMID 1709100 ↗ · PMID 7522053 ↗ · PMID 8900153 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，VTN 透過 hemopexin repeat 2 與 P. falciparum（isolate CDC / Honduras）的 SERA5 P47 C 端互作；兩者可能形成由兩組 VTN–SERA5 P47 異源二聚體組成的異源四聚體。此互作可能保護 merozoites 免於宿主單核球吞噬，而 VTN 糖基化似乎並非互作所必需。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts (via hemopexin repeat 2) with P.falciparum (isolate CDC / Honduras) SERA5 P47 (via C-terminus); may form heterotetramers of two VTN and SERA5 P47 heterodimers; the interaction may protect merozoites from phagocytosis by host monocytes; VTN glycosylation appears to be dispensable for the interaction PMID 29567995 ↗ |
| 細胞定位 | vitronectin 是分泌蛋白，定位於細胞外空間；此項定位描述未提供其他細胞狀態或條件上的差異。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | 在 P. falciparum 感染的紅血球中，感染早期滋養體階段可偵測到 VTN 內化；裂殖體階段 VTN 與 SERA5 共定位，到了 merozoite 表面則與 SERA5 P47 共定位。這些定位描述具有感染階段與伴隨分子上的差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Parasitophorous vacuole; (Microbial infection) In P.falciparum-infected red blood cells, VTN internalization is detected at the early trophozoite stage. Colocalizes with SERA5 at the schizont stage and with SERA5 P47 at the merozoite surface PMID 29567995 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CTCCTTCCCTGTCTCTGCCTCTCCCTCCCTTCCTCAGGCA40TCAGAGCGGAGACTTCAGGGAGACCAGAGCCCAGCTTGCC80AGGCACTGAGCTAGAAGCCCTGCCATGGCACCCCTGAGAC120CCCTTCTCATACTGGCCCTGCTGGCATGGGTTGCTCTGGC160TGACCAAGAGTCATGCAAGGGCCGCTGCACTGAGGGCTTC200AACGTGGACAAGAAGTGCCAGTGTGACGAGCTCTGCTCTT240ACTACCAGAGCTGCTGCACAGACTATACGGCTGAGTGCAA280GCCCCAAGTGACTCGCGGGGATGTGTTCACTATGCCGGAG320GATGAGTACACGGTCTATGACGATGGCGAGGAGAAAAACA360ATGCCACTGTCCATGAACAGGTGGGGGGCCCCTCCCTGAC400CTCTGACCTCCAGGCCCAGTCCAAAGGGAATCCTGAGCAG440ACACCTGTTCTGAAACCTGAGGAAGAGGCCCCTGCGCCTG480AGGTGGGCGCCTCTAAGCCTGAGGGGATAGACTCAAGGCC520TGAGACCCTTCATCCAGGGAGACCTCAGCCCCCAGCAGAG560GAGGAGCTGTGCAGTGGGAAGCCCTTCGACGCCTTCACCG600ACCTCAAGAACGGTTCCCTCTTTGCCTTCCGAGGGCAGTA640CTGCTATGAACTGGACGAAAAGGCAGTGAGGCCTGGGTAC680CCCAAGCTCATCCGAGATGTCTGGGGCATCGAGGGCCCCA720TCGATGCCGCCTTCACCCGCATCAACTGTCAGGGGAAGAC760CTACCTCTTCAAGGGTAGTCAGTACTGGCGCTTTGAGGAT800GGTGTCCTGGACCCTGATTACCCCCGAAATATCTCTGACG840GCTTCGATGGCATCCCGGACAACGTGGATGCAGCCTTGGC880CCTCCCTGCCCATAGCTACAGTGGCCGGGAGCGGGTCTAC920TTCTTCAAGGGGAAACAGTACTGGGAGTACCAGTTCCAGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。