基因總覽
VSNL1 是一個蛋白質編碼基因，產物名稱為 visinin like 1。其蛋白質屬於 recoverin 家族，長度為 191 個胺基酸，具有四個 EF-hand 結構域，分布於蛋白質序列的不同區段。這些資訊界定了此蛋白的家族歸屬與基本結構；目前提供的功能資料則限於體外觀察，並指出其調節作用與鈣離子有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000295156 ★ | 17,540,696–17,657,018 | 4 |
| ENST00000894184 | 17,539,020–17,657,624 | 4 |
| ENST00000894185 | 17,539,020–17,657,624 | 4 |
| ENST00000913168 | 17,539,020–17,657,624 | 3 |
| ENST00000947071 | 17,539,020–17,657,624 | 3 |
| ENST00000404666 | 17,539,126–17,657,624 | 4 |
| ENST00000913171 | 17,539,664–17,657,624 | 4 |
| ENST00000457525 | 17,539,967–17,649,602 | 3 |
| ENST00000894186 | 17,539,970–17,657,624 | 4 |
| ENST00000913169 | 17,539,970–17,657,624 | 3 |
| ENST00000913170 | 17,539,972–17,657,624 | 4 |
| ENST00000913172 | 17,539,972–17,657,624 | 4 |
顯示 12/52 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
目前提供的功能註解指出，visinin like 1 在體外可調節 rhodopsin 磷酸化的抑制作用，且此調節具有鈣離子依賴性。換言之，資料描述的是該蛋白對「抑制 rhodopsin 磷酸化」這一作用的調節，而不是直接將它表述為磷酸化反應的執行者；鈣離子依賴則是這項體外作用的條件。
這項註解未進一步說明調節方向、作用機制或所用實驗系統，也沒有提供細胞或生物體內的驗證。因此，現有證據僅支持對體外觀察的描述，不能據此擴大推論其在生理環境中的作用，也無法判定該調節對其他生物學過程的影響。
Promoter 與基因調控
>VSNL1 ENST00000295156 GRCh38 chr2:17539696-17540796 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CATCTGGGAATTCTCCTTGCTTTTCTGGTAGGGAAGCGACCGACCAAACATTTATTGGGCACTACTCCTT GCCAAGCCTTCTAGGCTTTGGCAGGCCAATGGGGAGCCGGGGGGAGGGCTGGCAAACCTGTTAGTTGTTC AAGGACACAAAGGGGGCTTTATAAGATGGCCTAATCAGAGCCCTTAAACGTGGGTTCGCAAAATGGTTCA TTCCCGCCCTTTCACCCACCCCCTCCCACCCCAGACGCAAAGCATATGTTAAAAACACTTAAGTGCATAC AGAAGGCGCTTGGCTCAGGGTACACAGGGCAAGAAGCCTCGGATCCCAGCTCCCTTTAACACACATTTTT TCAACGCCGTTCTGGACCGAGACTGTCCGGGGCACTGGGTGCTGCAGGACCCGGCTCCCAGTACTCCTAG CAGAAGACCCTCTGATGAAATGGCCCATGACAAAATGACCACCATAACCGTTCCTTCAGTAAGCCAGGTA GACGTGCTCACAGCTTGCTGGGAAGTCTTCTTTCGGAGATTTCTGCAGTTTTCTCCTTCACCTTACAGCC TAACAAAGGGTGGGCCGGGGGTCGGCTAGGACAGAAAGCAGCGGGAAAAGCGGCTCCACGTGTTCCATCT CTGGCCTCGGCCTTCAGCCCCCAGGTTCGGTAACCACTGGGCGTGGCGAGTCCGGGTAACCCGCAGTCCC TCGCGCCCGTCCAGGTGCGGGTTGCTCCGGTAGCCGGACTCCCTTTTCCTATATACTTTCCTTTTGAGCT TTTGCTAAAATCTGGAGACGTGGAATCCACCCGCGGAAACTCCGAGCCCCTCCGACTGAGCATGCGCCAT CGCCAGGCGGCTTTTGGTCACAGGCTCCCGAGTTCTCCTAGCTGGGGCTGCGGAGCTGGGGGGAGGGAAG AGAGGAAAGGGGAGGGGGTGCCTGGAGAGGCGGAGGCTCGCGCGCCTGCGCATCCAGCTCCAGGGACCCT AGGTTTTCTATGGGATTCCCAATCTGCAGCAGAGATTTACCCGAGCGTGTTGCGGCAGCGGCTGGGCTTG CAAGGCGCGATCCAAGAGGGATTTAAGCAGCCCAGAGCTCCAGAGAAAAAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VSNL1_2 ↗ | 2:17,539,096 | 正股 | 17,539,047–17,539,106 |
| VSNL1_1 ↗ | 2:17,540,706 | 正股 | 17,540,657–17,540,716 |
| VSNL1_3 ↗ | 2:17,580,029 | 正股 | 17,579,980–17,580,039 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_98XXN · enhancer · 17538014–17538288 · regulatory
ENSR2_565DBD · CTCF_binding_site · 17538629–17538650 · regulatory
ENSR2_98XXW · promoter · 17538636–17539136 · regulatory
ENSR2_B5GZP · promoter · 17540206–17541170 · regulatory
ENSR2_732SXC · enhancer · 17541171–17541284 · regulatory
ENSR2_8HX2J · enhancer · 17543461–17543672 · regulatory
ENSR2_8HX2R · enhancer · 17543942–17544144 · regulatory
ENSR2_98Z2J · enhancer · 17544358–17544623 · regulatory
· motif · 17537345–17537354 · motif
· motif · 17538203–17538212 · motif
· motif · 17538631–17538647 · motif
· motif · 17539120–17539129 · motif
· motif · 17540310–17540319 · motif
· motif · 17540310–17540319 · motif
· motif · 17540362–17540372 · motif
· motif · 17540522–17540533 · motif
· motif · 17540522–17540533 · motif
· motif · 17540594–17540604 · motif
· motif · 17540613–17540623 · motif
· motif · 17540646–17540657 · motif
· motif · 17540646–17540657 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：191 aa
Visinin-like protein 1 長 191 個胺基酸，屬於 recoverin 家族。其序列註解列出四個 EF-hand 結構域：第一個位於第 40–58 位，第二個位於第 60–95 位，第三個位於第 96–131 位，第四個位於第 146–181 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 14 個夥伴
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- C1QTNF2Q9BXJ5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COL10A1Q03692 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DTX2Q86UW9 · UniProt INTERACTION · 10 experiments
- ENDOD1O94919 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM131CQ96AQ9 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- LITAFQ99732 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRED1Q7Z699 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SPRED2Q7Z698 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPRY3O43610 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SRLQ86TD4-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TEX13BQ9BXU2 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- TFF1P04155 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- A0A1U9X8X8A0A1U9X8X8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 在體外，visinin like 1 會以鈣離子依賴的方式，調節對 rhodopsin 磷酸化的抑制作用。這項描述指出其調節與鈣離子有關，但未提供調節方向、具體機制或體內證據，因此結論限於體外觀察。 | 推論支持 | 證據與來源Regulates (in vitro) the inhibition of rhodopsin phosphorylation in a calcium-dependent manner |
核酸與蛋白質序列
AATCTGCAGCAGAGATTTACCCGAGCGTGTTGCGGCAGCG40GCTGGGCTTGCAAGGCGCGATCCAAGAGGGATTTAAGCAG80CCCAGAGCTCCAGAGAAAAAGAGAGCGAGAGAGAACCACA120CACAGAGACGGCTTAAGCGTTTACCCGAATTAAATATATA160TTTTTAAAAAGAACTGTTGAGTTTTATCATTTTCGTTAAG200TGACCGTGCGCAGCGCTGTAACTGCAGGATGGGGAAGCAG240AATAGCAAACTGGCCCCTGAAGTGATGGAGGACCTGGTGA280AGAGCACAGAGTTTAATGAGCATGAACTCAAGCAGTGGTA320CAAAGGATTTCTCAAGGACTGTCCAAGTGGGAGGCTAAAT360CTCGAGGAATTTCAGCAGCTCTATGTGAAGTTCTTTCCTT400ATGGAGACGCCTCCAAGTTTGCCCAGCATGCCTTCCGAAC440CTTCGACAAGAATGGGGACGGCACCATTGACTTCCGAGAG480TTCATCTGCGCTCTGTCCATCACCTCCAGGGGCAGCTTTG520AGCAGAAGCTGAACTGGGCCTTCAATATGTATGACCTGGA560TGGTGATGGCAAGATCACCCGAGTGGAGATGCTGGAGATC600ATCGAGGCTATCTACAAAATGGTAGGCACTGTGATCATGA640TGAAAATGAATGAGGATGGCCTGACGCCTGAGCAGCGAGT680AGACAAGATTTTCAGCAAGATGGATAAGAACAAAGATGAC720CAGATTACACTGGATGAATTCAAAGAAGCTGCAAAGAGCG760ACCCTTCCATTGTATTACTTCTGCAGTGCGACATCCAGAA800ATGAGCTGATGTCAATGCTATGGACTGCACAAAAGTCTCA840ATGTTCCATTCAGTCTGCAGCTATTCACACACACACACAC880ACACACACACACACACACACACACACACACAAATATTGCT920TGGACTACCTATAAATGGACTTGCTTCTTGTGTTTGAAAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。