基因總覽
VN1R1(vomeronasal 1 receptor 1)是蛋白質編碼基因,產物為 putative pheromone receptor,歸屬於 G protein-coupled receptor 1 家族。其蛋白質具有多次穿膜的結構,包含細胞外區段、細胞質區段與跨膜區段,形成跨越膜的受體架構。現有資料將其受體角色描述為推定性質,未提供特定配體、訊號傳遞方式或生理作用的細節。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000321039 ★ | 57,454,790–57,457,140 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VN1R1 的產物被描述為推定的 pheromone receptor,表示資料將其列為可能負責辨識 pheromone 的受體,但目前提供的資訊未指出已確認的配體,也未詳述其受體活性如何實現。因此,這項功能定位應保留為推定,而不能據此認定其已證實的辨識對象或下游作用。
現有資料僅支持將 VN1R1 與 pheromone receptor 的角色相聯繫,沒有提供受體活化條件、訊號分子、細胞反應或相關生物過程的描述,也未說明此功能是否在特定組織、細胞或生理情境中發生。故目前可掌握的功能資訊限於其推定受體性質,無法進一步界定其分子作用機制或生物學意義。
Promoter 與基因調控
>VN1R1 ENST00000321039 GRCh38 chr19:57457040-57458140 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTTCCCTGATGATAGCAATTCCATAGAGACACCAAAAGAATCTAAATTATGGCCGGGCGAGGTGGCTCA TCCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCT GGCTAACACGGTGCAACCCCGTCTCTACTAAACACACACACACACACACACACACACACACACACACTAG CCGGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCC AGGAGGCTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGCACCACAACACCCAGCTAATTTTTGTATT TTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTTGTAATCCACCCGC CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGAGATTACAAGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCGCAGTTACTATTTCTTTTG TGATTGATATATATGAATATTGTGCAATGAAATTCCCTCCCAATTGAATTATCTTTCCCTAAAAATAAAC CCAAGCTTTCTGGAACATATTGAATTTCCTATTTAACAAGTTTTAAGGATATCTTAGGTGTTTCTGGGAT TAGTATTTATTTTCAGGATCTTTTGCATTTACTTGTGAGAAATGGCATTGAGATAAAAATGTGTGGGCTC AAGGTGGTCATGGTTATTTCTACGGAGTCAATTCACAATCTCTAGACCTGTCCGGTGGAAAATAACAGAA ATATATGTGCTTAAAATAAAATATACCATGATGCAATGTTGATTGTTCCAAAAATTATAGTTTTTAAAAA TTCTTCAAGTTAGCATTTGTACTGTGCTGAAGGCCTTGTTACCAATTGTATTGTAGCGTTTTTTTAATTT CTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGGGCAATGGTTTGATTTCAG CTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTAG CACGCGCCGCCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTATTAGTATTTTGTATTAT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 57452525–57452534 · motif
· motif · 57452525–57452534 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:353 aa
VN1R1 蛋白長 353 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family。序列註解預測其具有七段螺旋型跨膜區,並在細胞外與細胞質側交替分布拓樸區段;這些區段註解依據為序列分析推定,並非此處提供的實驗驗證。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 VN1R1 標示為細胞膜上的多次穿膜蛋白,並未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG40CTGGGACTAGCACGCGCCGCCATGCCCGGCTAATTTTTGT80ATTATTAGTATTTTGTATTATTAGTAGAGACAGGGTTTCA120CCATGTTGGCCAGGATGGTCTCCATCTTGGCCTCCCGAAG160TGCTGGAATTACAGGTGTGAGCCACTGCACCCGGCCTAAA200ATTTGTTTCAATGCATCAATAACAATGGTGTTTACTAAAA240TATTAGTGTGGAAAAGGTTTTATGGTGTATTATTTTTGCT280TTTCATATCTCCAGGCTACTTAATTGAAGGTTTTATTGAA320ATAAGTGTAGACTCACAAGCAGTCATAAGAAATAATACAG360AAAAAGCCCTGTCCATATTACCCAGGGTTCCGTCATGATT400ACATTTTGCAAACTATAGTATAATATCACTCTAATGATAT440TGACTCTTCTGTGTTCTGTTTTTATATATTTCCCTAGTTT480TGCTTGTATTTACTTGTTGCATGTGTGTAAGCCCTGAGTT520TTATAGGTTTGATTTGTGGATCTGTTGTGCGGTTGAGCCC560TCATTCATTCACCTGCTTCTCTGCAGTTGGACACACAAGC600AATTGCCTTTGCACGAACAGGGACAATCTTAATTTCTGTT640TAAGATGAGAAAATATGGTTGGAGACACATTAAAACTTCT680GTCTCCACTGATGACAAGATACTTCTTTCTGCTTTTTTAT720TCTACTGATTCTTCAGACCTCAATGAAAATCAACATCCCC760TAGATTTTGATGAAATGGCTTTTGGAAAAGTAAAATCAGG800GATTAGCTTCCTCATTCAGACTGGAGTTGGGATCCTGGGA840AATTCCTTTCTCCTTTGTTTTTATAACTTAATTTTGTTCA880CTGGACACAAGCTGAGACCCACGGACTTGATTCTCAGCCA920ACTGGCCTTGGCTAACTCCATGGTCCTTTTCTTTAAAGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。