基因總覽
VIPR2 是蛋白質編碼基因,產物為 vasoactive intestinal peptide receptor 2,屬於 G protein-coupled receptor 2 family。這種受體位於細胞膜,具有多次跨膜結構;其胞外區可接觸神經胜肽,胞內區則連結細胞內訊號傳遞。受體可由 vasoactive intestinal peptide(VIP)及 pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide(PACAP)活化,是細胞接收這些訊號分子的膜上受體之一。其七段跨膜螺旋構成受體的主要膜內結構。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000262178 ★ | 159,028,175–159,144,867 | 13 |
| ENST00000377633 | 159,028,175–159,097,204 | 10 |
| ENST00000402066 | 159,028,175–159,144,957 | 13 |
| ENST00000865375 | 159,028,175–159,144,950 | 11 |
| ENST00000865376 | 159,028,175–159,144,950 | 13 |
| ENST00000958129 | 159,028,175–159,144,957 | 11 |
| ENST00000958130 | 159,028,175–159,144,950 | 13 |
| ENST00001140918 | 159,028,175–159,144,950 | 13 |
| ENST00001016845 | 159,028,176–159,144,957 | 12 |
| ENST00000865374 | 159,028,178–159,144,950 | 13 |
| ENST00000976294 | 159,030,457–159,144,950 | 12 |
| ENST00001114212 | 159,033,664–159,144,950 | 10 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
VIPR2 可受神經胜肽 VIP 與 pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide(PACAP)活化。它能結合 VIP,以及 PACAP27、PACAP38 兩種具生物活性的胜肽;來源所列的效力順序為 PACAP38 與 VIP 相同,且高於 PACAP27。這些差異描述的是受體對不同配體的相對效力,來源未進一步提供其數值或比較條件。
配體結合會促使受體構形改變,進而啟動由 guanine nucleotide-binding proteins(G proteins)介導的訊號,並調節下游效應分子的活性。這使 VIPR2 能將細胞外神經胜肽訊號轉換為細胞內反應,而不是僅作為配體結合位點。
已報告的訊號作用包括活化 cAMP 依賴性路徑。此作用將受體的配體辨識與細胞內訊號調節相連,來源所列的研究支持 VIPR2 參與這條路徑。另有資料指出它可能與 phospholipase C 偶聯;此項描述帶有可能性,不能視為已確立的作用。
Promoter 與基因調控
>VIPR2 ENST00000262178 GRCh38 chr7:159144767-159145867 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TAAAAAATTAAAACAACACGAACTTAACTTGTATCTCTCATTCCAGTGCTTTCCACTTGCTGGGGAACGC CGAGCTCTCCTGGGTTGGTCACGCGGGCGCCTTGGGAGGCCGCGCAGTCCCGCGTGGGGCGCGGCGGGGC GGCCCCAGTGGCACCGCGTGAGTCCCCGCCCAGCGTTCCCCACCCGCCGCCGCGTTTGCGGGGAGAGAAT GACCCCCGTTTTGCAAACGCAGGACACAAAACCCGCCACCCAGCTGAGGCTGGGACCCACCTATACCCCC GTCTGCGTTTTTCTCCAGCTTTCTGTTCGACCTGATGTCCTCTTTGAGGCTGCGGGGATCCCCACCAAAA AGCACTCTGATTTTCTCCATTTTCAGATGCCCCAACCTAGCCCCACTGGCTACAAAGACGGCGCGCCCAC CCCGGACGGGTCTCTGGCCGCTTTCTTGGGCTTCCGCAGTTGTTTAGAAAGGCAGGTACAGGCGGCCGCA AAGGCATCCGCCCCTTCCGAGCGCACACCTGGCCCGGTCCTCCTCTCCCGGCCCCGCGCCGGCCGCTCTC CCCCAGTTCTCTCTACTCGGAGCCGGGCGCGCACTGAGCACCCCGCTTCCCAGCCCCTCCGCCCACAGAT CGGGGAGGCGCGGCCGGGAGGGGGGCGTGGGCCAGGGAAGAGGGGAGGAGAACGGAGAGAGAGGCTGGGG GGGTCGAGGAGACCAGAGGGAGCGCGCGCGGCGGGGACAGAGAGCCCAGGGGCGAGGAGAGGGCGCGGGG CGCAGCGGAAGGGGAAGTGGGGGGCGGTGAGGAGGGGCGCGGAGCGGGGGTTCTCGGGGGAGGAGGGAGA CGAGGATTGGGGCAGCGCGGGGCGGGGACAGGGGCGGGGGGCGGAGCGGCGGGGCGCGTGGGGGACGGGC GTGCATTGAGCGCGCTCCAGCTGCCGGGACGGAGGGGGCGGCCCCCGCGCTCGGGCGCTCGGCTACAGCT GCGGGGCCCGAGGTCTCCGCGCACTCGCTCCCGGCCCATGCTGGAGGCGGCGGAACCGCGGGGACCTAGG ACGGAGGCGGCGGGCGCTGGGCGGCCCCCGGCACGCTGAGCTCGGGATGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| VIPR2_1 ↗ | 7:159,144,867 | 負股 | 159,144,857–159,144,916 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR7_94C6GZ · enhancer · 159141671–159142050 · regulatory
ENSR7_86NBZL · enhancer · 159142846–159143069 · regulatory
ENSR7_B36KQG · promoter · 159144842–159145357 · regulatory
ENSR7_86NC4H · enhancer · 159147845–159148015 · regulatory
· motif · 159146394–159146407 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:438 aa
vasoactive intestinal peptide receptor 2 長 438 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 2 family。序列註解指出其 N 端有訊號胜肽,並包含七段跨膜螺旋;胞外與胞質區段交錯分布,C 端區域位於胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
VIPR2 被註解為細胞膜上的多次跨膜蛋白。 來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- RAMP1O60894 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP2O60895 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RAMP3O60896 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
VIPR2 可透過 N 端胞外區與 ADCYAP1/PACAP 互作,並可能受 PACAP27 與 CAPAC38 神經胜肽活化。來源也記載它與 VIP 互作;這項互作可能導致 VIPR1 活化。上述互作及活化描述標示為可能,並非確定結論。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | VIPR2 是可受 VIP 與 ADCYAP1/PACAP 活化的 G protein-coupled receptor,能結合 VIP、PACAP27 與 PACAP38,效力順序為 PACAP38=VIP 高於 PACAP27。配體結合引起構形改變,啟動 G proteins 訊號並調節下游效應分子;可活化 cAMP 依賴性路徑,且可能與 phospholipase C 偶聯。 | 含實驗來源 | 證據與來源G protein-coupled receptor activated by the neuropeptides vasoactive intestinal peptide (VIP) and pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (ADCYAP1/PACAP). Binds VIP and both PACAP27 and PACAP38 bioactive peptides with the following order of potency PACAP38 = VIP > PACAP27. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors. Activates cAMP-dependent pathway. May be coupled to phospholipase C PMID 35477937 ↗ · PMID 7811244 ↗ · PMID 8933357 ↗ |
| 交互作用 | VIPR2 可能經由 N 端胞外區與 ADCYAP1/PACAP 互作,並受 PACAP27 與 CAPAC38 神經胜肽活化。它也可能與 VIP 互作,而此互作可能導致 VIPR1 活化;這些關係在來源中標示為可能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with ADCYAP1/PACAP (via N-terminal extracellular domain); activated by PACAP27 and CAPAC38 neuropeptides (Probable). Interacts with VIP; the interaction results in VIPR1 activation (Probable) PMID 35477937 ↗ · PMID 8933357 ↗ |
| 細胞定位 | VIPR2 被註解為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCACTCGCTCCCGGCCCATGCTGGAGGCGGCGGAACCGCG40GGGACCTAGGACGGAGGCGGCGGGCGCTGGGCGGCCCCCG80GCACGCTGAGCTCGGGATGCGGACGCTGCTGCCTCCCGCG120CTGCTGACCTGCTGGCTGCTCGCCCCCGTGAACAGCATTC160ACCCAGAATGCCGATTTCATCTGGAAATACAGGAGGAAGA200AACAAAATGTGCAGAGCTTCTGAGGTCTCAAACAGAAAAA240CACAAAGCCTGCAGTGGCGTCTGGGACAACATCACGTGCT280GGCGGCCTGCCAATGTGGGAGAGACCGTCACGGTGCCCTG320CCCAAAAGTCTTCAGCAATTTTTACAGCAAAGCAGGAAAC360ATAAGCAAAAACTGTACGAGTGACGGATGGTCAGAGACGT400TCCCAGATTTCGTCGATGCCTGTGGCTACAGCGACCCGGA440GGATGAGAGCAAGATCACGTTTTATATTCTGGTGAAGGCC480ATTTATACACTGGGCTACAGTGTCTCTCTGATGTCTCTTG520CAACAGGAAGCATAATTCTGTGCCTCTTCAGGAAGCTGCA560CTGCACCAGGAATTACATCCACCTGAACCTGTTCCTGTCC600TTCATCCTGAGAGCCATCTCAGTGCTGGTCAAGGACGACG640TTCTCTACTCCAGCTCTGGCACGTTGCACTGCCCTGACCA680GCCATCCTCCTGGGTGGGCTGCAAGCTGAGCCTGGTCTTC720CTGCAGTACTGCATCATGGCCAACTTCTTCTGGCTGCTGG760TGGAGGGGCTCTACCTCCACACCCTCCTGGTGGCCATGCT800CCCCCCTAGAAGGTGCTTCCTGGCCTACCTCCTGATCGGA840TGGGGCCTCCCCACCGTCTGCATCGGTGCATGGACTGCGG880CCAGGCTCTACTTAGAAGACACCGGTTGCTGGGATACAAA920CGACCACAGTGTGCCCTGGTGGGTCATACGAATACCGATT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。