演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

VIPR2VPAC2

vasoactive intestinal peptide receptor 2

VIPR2 編碼 vasoactive intestinal peptide receptor 2,是一種可受 VIP 與 PACAP 活化的 G protein-coupled receptor,並參與 cAMP 依賴性訊號傳遞。

Homo sapiens7q36.3UniProt P41587
OFFICIAL SYMBOL
VIPR2
CHROMOSOME
7
UNIPROT
P41587
PDB / ALPHAFOLD
7VQX
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

VIPR2 是蛋白質編碼基因,產物為 vasoactive intestinal peptide receptor 2,屬於 G protein-coupled receptor 2 family。這種受體位於細胞膜,具有多次跨膜結構;其胞外區可接觸神經胜肽,胞內區則連結細胞內訊號傳遞。受體可由 vasoactive intestinal peptide(VIP)及 pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide(PACAP)活化,是細胞接收這些訊號分子的膜上受體之一。其七段跨膜螺旋構成受體的主要膜內結構。

Official symbol
VIPR2
Gene name
vasoactive intestinal peptide receptor 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12695
UniProt
P41587
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
VPAC2VPAC2R

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77q36.3
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegVIPR2pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:159,027,660–159,144,991
Gene span
117,332 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000262178 ★159,028,175–159,144,86713
ENST00000377633159,028,175–159,097,20410
ENST00000402066159,028,175–159,144,95713
ENST00000865375159,028,175–159,144,95011
ENST00000865376159,028,175–159,144,95013
ENST00000958129159,028,175–159,144,95711
ENST00000958130159,028,175–159,144,95013
ENST00001140918159,028,175–159,144,95013
ENST00001016845159,028,176–159,144,95712
ENST00000865374159,028,178–159,144,95013
ENST00000976294159,030,457–159,144,95012
ENST00001114212159,033,664–159,144,95010

顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

VIPR2 可受神經胜肽 VIP 與 pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide(PACAP)活化。它能結合 VIP,以及 PACAP27、PACAP38 兩種具生物活性的胜肽;來源所列的效力順序為 PACAP38 與 VIP 相同,且高於 PACAP27。這些差異描述的是受體對不同配體的相對效力,來源未進一步提供其數值或比較條件。

配體結合會促使受體構形改變,進而啟動由 guanine nucleotide-binding proteins(G proteins)介導的訊號,並調節下游效應分子的活性。這使 VIPR2 能將細胞外神經胜肽訊號轉換為細胞內反應,而不是僅作為配體結合位點。

已報告的訊號作用包括活化 cAMP 依賴性路徑。此作用將受體的配體辨識與細胞內訊號調節相連,來源所列的研究支持 VIPR2 參與這條路徑。另有資料指出它可能與 phospholipase C 偶聯;此項描述帶有可能性,不能視為已確立的作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 159144867 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>VIPR2 ENST00000262178 GRCh38 chr7:159144767-159145867 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TAAAAAATTAAAACAACACGAACTTAACTTGTATCTCTCATTCCAGTGCTTTCCACTTGCTGGGGAACGC
CGAGCTCTCCTGGGTTGGTCACGCGGGCGCCTTGGGAGGCCGCGCAGTCCCGCGTGGGGCGCGGCGGGGC
GGCCCCAGTGGCACCGCGTGAGTCCCCGCCCAGCGTTCCCCACCCGCCGCCGCGTTTGCGGGGAGAGAAT
GACCCCCGTTTTGCAAACGCAGGACACAAAACCCGCCACCCAGCTGAGGCTGGGACCCACCTATACCCCC
GTCTGCGTTTTTCTCCAGCTTTCTGTTCGACCTGATGTCCTCTTTGAGGCTGCGGGGATCCCCACCAAAA
AGCACTCTGATTTTCTCCATTTTCAGATGCCCCAACCTAGCCCCACTGGCTACAAAGACGGCGCGCCCAC
CCCGGACGGGTCTCTGGCCGCTTTCTTGGGCTTCCGCAGTTGTTTAGAAAGGCAGGTACAGGCGGCCGCA
AAGGCATCCGCCCCTTCCGAGCGCACACCTGGCCCGGTCCTCCTCTCCCGGCCCCGCGCCGGCCGCTCTC
CCCCAGTTCTCTCTACTCGGAGCCGGGCGCGCACTGAGCACCCCGCTTCCCAGCCCCTCCGCCCACAGAT
CGGGGAGGCGCGGCCGGGAGGGGGGCGTGGGCCAGGGAAGAGGGGAGGAGAACGGAGAGAGAGGCTGGGG
GGGTCGAGGAGACCAGAGGGAGCGCGCGCGGCGGGGACAGAGAGCCCAGGGGCGAGGAGAGGGCGCGGGG
CGCAGCGGAAGGGGAAGTGGGGGGCGGTGAGGAGGGGCGCGGAGCGGGGGTTCTCGGGGGAGGAGGGAGA
CGAGGATTGGGGCAGCGCGGGGCGGGGACAGGGGCGGGGGGCGGAGCGGCGGGGCGCGTGGGGGACGGGC
GTGCATTGAGCGCGCTCCAGCTGCCGGGACGGAGGGGGCGGCCCCCGCGCTCGGGCGCTCGGCTACAGCT
GCGGGGCCCGAGGTCTCCGCGCACTCGCTCCCGGCCCATGCTGGAGGCGGCGGAACCGCGGGGACCTAGG
ACGGAGGCGGCGGGCGCTGGGCGGCCCCCGGCACGCTGAGCTCGGGATGCG
VIPR2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
VIPR2_1 ↗7:159,144,867負股159,144,857–159,144,916

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_94C6GZ · enhancer · 159141671–159142050 · regulatory

ENSR7_86NBZL · enhancer · 159142846–159143069 · regulatory

ENSR7_B36KQG · promoter · 159144842–159145357 · regulatory

ENSR7_86NC4H · enhancer · 159147845–159148015 · regulatory

· motif · 159146394–159146407 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:438 aa

1 aa438 aa訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 P41587 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

vasoactive intestinal peptide receptor 2 長 438 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 2 family。序列註解指出其 N 端有訊號胜肽,並包含七段跨膜螺旋;胞外與胞質區段交錯分布,C 端區域位於胞質側。

訊號胜肽1–23 aa
拓樸區域Extracellular24–124 aa
跨膜區Helical; Name=1125–150 aa
拓樸區域Cytoplasmic151–158 aa
跨膜區Helical; Name=2159–180 aa
拓樸區域Extracellular181–203 aa
跨膜區Helical; Name=3204–228 aa
拓樸區域Cytoplasmic229–239 aa
跨膜區Helical; Name=4240–261 aa
拓樸區域Extracellular262–280 aa
跨膜區Helical; Name=5281–304 aa
拓樸區域Cytoplasmic305–325 aa
跨膜區Helical; Name=6326–346 aa
拓樸區域Extracellular347–354 aa
跨膜區Helical; Name=7355–378 aa
拓樸區域Cytoplasmic379–438 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7VQX…

PDB · 7VQX

EM · 2.74 A · R=24-438

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

VIPR2 被註解為細胞膜上的多次跨膜蛋白。 來源未提供其在不同條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
VPAC2VIPR2RAMP1RAMP2RAMP3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

VIPR2 可透過 N 端胞外區與 ADCYAP1/PACAP 互作,並可能受 PACAP27 與 CAPAC38 神經胜肽活化。來源也記載它與 VIP 互作;這項互作可能導致 VIPR1 活化。上述互作及活化描述標示為可能,並非確定結論。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能VIPR2 是可受 VIP 與 ADCYAP1/PACAP 活化的 G protein-coupled receptor,能結合 VIP、PACAP27 與 PACAP38,效力順序為 PACAP38=VIP 高於 PACAP27。配體結合引起構形改變,啟動 G proteins 訊號並調節下游效應分子;可活化 cAMP 依賴性路徑,且可能與 phospholipase C 偶聯。含實驗來源
證據與來源

G protein-coupled receptor activated by the neuropeptides vasoactive intestinal peptide (VIP) and pituitary adenylate cyclase-activating polypeptide (ADCYAP1/PACAP). Binds VIP and both PACAP27 and PACAP38 bioactive peptides with the following order of potency PACAP38 = VIP > PACAP27. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and modulates the activity of downstream effectors. Activates cAMP-dependent pathway. May be coupled to phospholipase C

PMID 35477937 ↗ · PMID 7811244 ↗ · PMID 8933357 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用VIPR2 可能經由 N 端胞外區與 ADCYAP1/PACAP 互作,並受 PACAP27 與 CAPAC38 神經胜肽活化。它也可能與 VIP 互作,而此互作可能導致 VIPR1 活化;這些關係在來源中標示為可能。含實驗來源
證據與來源

Interacts with ADCYAP1/PACAP (via N-terminal extracellular domain); activated by PACAP27 and CAPAC38 neuropeptides (Probable). Interacts with VIP; the interaction results in VIPR1 activation (Probable)

PMID 35477937 ↗ · PMID 8933357 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位VIPR2 被註解為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 35477937 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000262178 · 3,854 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCACTCGCTCCCGGCCCATGCTGGAGGCGGCGGAACCGCG40
41GGGACCTAGGACGGAGGCGGCGGGCGCTGGGCGGCCCCCG80
81GCACGCTGAGCTCGGGATGCGGACGCTGCTGCCTCCCGCG120
121CTGCTGACCTGCTGGCTGCTCGCCCCCGTGAACAGCATTC160
161ACCCAGAATGCCGATTTCATCTGGAAATACAGGAGGAAGA200
201AACAAAATGTGCAGAGCTTCTGAGGTCTCAAACAGAAAAA240
241CACAAAGCCTGCAGTGGCGTCTGGGACAACATCACGTGCT280
281GGCGGCCTGCCAATGTGGGAGAGACCGTCACGGTGCCCTG320
321CCCAAAAGTCTTCAGCAATTTTTACAGCAAAGCAGGAAAC360
361ATAAGCAAAAACTGTACGAGTGACGGATGGTCAGAGACGT400
401TCCCAGATTTCGTCGATGCCTGTGGCTACAGCGACCCGGA440
441GGATGAGAGCAAGATCACGTTTTATATTCTGGTGAAGGCC480
481ATTTATACACTGGGCTACAGTGTCTCTCTGATGTCTCTTG520
521CAACAGGAAGCATAATTCTGTGCCTCTTCAGGAAGCTGCA560
561CTGCACCAGGAATTACATCCACCTGAACCTGTTCCTGTCC600
601TTCATCCTGAGAGCCATCTCAGTGCTGGTCAAGGACGACG640
641TTCTCTACTCCAGCTCTGGCACGTTGCACTGCCCTGACCA680
681GCCATCCTCCTGGGTGGGCTGCAAGCTGAGCCTGGTCTTC720
721CTGCAGTACTGCATCATGGCCAACTTCTTCTGGCTGCTGG760
761TGGAGGGGCTCTACCTCCACACCCTCCTGGTGGCCATGCT800
801CCCCCCTAGAAGGTGCTTCCTGGCCTACCTCCTGATCGGA840
841TGGGGCCTCCCCACCGTCTGCATCGGTGCATGGACTGCGG880
881CCAGGCTCTACTTAGAAGACACCGGTTGCTGGGATACAAA920
921CGACCACAGTGTGCCCTGGTGGGTCATACGAATACCGATT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。